唐 敏,王咸壽,鄭 琳,馮秋芳,王小英,黃東愛,蔡望偉,顏冬菁
(海南醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,海南 ???571199)
基因工程與蛋白質(zhì)工程實(shí)驗(yàn)技術(shù)是生物技術(shù)專業(yè)的核心課程之一,理論知識(shí)涉及生化與分子生物學(xué)、發(fā)酵工程與細(xì)胞生物學(xué)等多門學(xué)科,實(shí)驗(yàn)內(nèi)容包括目的片段的獲取、片段與載體的連接、轉(zhuǎn)化、重組蛋白的表達(dá)、分離純化與鑒定等。在當(dāng)前實(shí)驗(yàn)課程的教改背景下,國(guó)內(nèi)各高校生物技術(shù)專業(yè)的實(shí)驗(yàn)課由基礎(chǔ)性驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)與綜合性實(shí)驗(yàn)或設(shè)計(jì)性實(shí)驗(yàn)組成,旨在結(jié)合基礎(chǔ)知識(shí)和基本實(shí)驗(yàn)技能,提高實(shí)驗(yàn)教學(xué)的質(zhì)量,培養(yǎng)學(xué)生的綜合應(yīng)用能力[1-2]。我校自2007年生物技術(shù)招生以來(lái),已連續(xù)培養(yǎng)9屆畢業(yè)生,在基因工程與蛋白質(zhì)工程實(shí)驗(yàn)技術(shù)實(shí)驗(yàn)課的設(shè)置與實(shí)踐中積累了一些經(jīng)驗(yàn),現(xiàn)將該課程的綜合實(shí)驗(yàn)教學(xué)改進(jìn)經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行探討。
基因工程與蛋白質(zhì)工程實(shí)驗(yàn)技術(shù)課程總共90學(xué)時(shí),其中綜合性實(shí)驗(yàn)40學(xué)時(shí),每周10學(xué)時(shí),連續(xù)4周,占總課時(shí)的44.4%。盡管已經(jīng)建立過(guò)程性評(píng)價(jià)體系[3-4],但依然存在以下問(wèn)題:(1)實(shí)驗(yàn)案例內(nèi)容單一,僅有1個(gè)案例,學(xué)生分組后容易互相抄襲實(shí)驗(yàn)方案,不利于培養(yǎng)學(xué)生的綜合分析與解決問(wèn)題能力,且實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的蛋白表達(dá)沒有活性,沒有形成完整的原核表達(dá)體系。(2)過(guò)程性考核內(nèi)容[3]雖然細(xì)化,但忽略分子克隆重在設(shè)計(jì)的重要性,如實(shí)驗(yàn)開始前應(yīng)對(duì)目的片段與載體的序列以及酶切位點(diǎn)進(jìn)行設(shè)計(jì),且手寫的實(shí)驗(yàn)報(bào)告不利于學(xué)生將設(shè)計(jì)思路與結(jié)果在報(bào)告中展示出來(lái)。
參考文獻(xiàn)的方法[5],在原來(lái)實(shí)驗(yàn)案例(人G6PD基因的原核表達(dá)載體構(gòu)建、表達(dá)與純化)基礎(chǔ)上優(yōu)化設(shè)計(jì),表達(dá)有活性的G6PD蛋白;同時(shí)增加1個(gè)新的實(shí)驗(yàn)案例(人堿性磷酸酶的原核構(gòu)建與表達(dá))。
鑒于往年教師在指導(dǎo)學(xué)生的過(guò)程中,僅注重實(shí)驗(yàn)操作與結(jié)果,在優(yōu)化教學(xué)過(guò)程中我們更側(cè)重教師分階段進(jìn)行點(diǎn)評(píng)與指導(dǎo),側(cè)重培養(yǎng)學(xué)生獲取信息能力、動(dòng)手能力和分析解決問(wèn)題能力,特別是使用軟件分析基因序列、設(shè)計(jì)引物、分析產(chǎn)物大小等前期工作,因?yàn)榉肿涌寺?shí)驗(yàn)?zāi)芊癯晒ΓQ于前期準(zhǔn)備工作。
從實(shí)驗(yàn)方案準(zhǔn)備與實(shí)驗(yàn)操作(30分)、實(shí)驗(yàn)記錄(25分)、PPT匯報(bào)(15分)、實(shí)驗(yàn)報(bào)告(15分)、組內(nèi)互評(píng)(5分)、知識(shí)點(diǎn)測(cè)評(píng)(10分)共6個(gè)方面對(duì)學(xué)生進(jìn)行考核。除注重過(guò)程性評(píng)價(jià),還增加方案準(zhǔn)備的分?jǐn)?shù)比例與實(shí)驗(yàn)記錄,考查學(xué)生是否具備尊重原始實(shí)驗(yàn)記錄,不篡改數(shù)據(jù)的嚴(yán)謹(jǐn)精神。另外,增加對(duì)知識(shí)點(diǎn)的測(cè)評(píng)一項(xiàng),考查學(xué)生是否能理論聯(lián)系實(shí)際。
我們?cè)?014級(jí)、2015級(jí)與2016級(jí)生物技術(shù)學(xué)生中進(jìn)行教學(xué)實(shí)踐。使用兩個(gè)優(yōu)化后的綜合實(shí)驗(yàn)案例:野生型、突變型人G6PD基因的原核表達(dá)載體構(gòu)建、純化與活性比較;人堿性磷酸酶基因的原核表達(dá)載體構(gòu)建與表達(dá)。以6~10名學(xué)生為一組完成綜合性實(shí)驗(yàn)。以人G6PD基因的原核表達(dá)載體構(gòu)建與純化為例,采用傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)流程:獲得基因、酶切、連接、轉(zhuǎn)化、鑒定重組質(zhì)粒、表達(dá),在40學(xué)時(shí)內(nèi)一組學(xué)生很難完成整個(gè)實(shí)驗(yàn),可由兩組學(xué)生分工完成,一組構(gòu)建重組質(zhì)粒,另一組直接從重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化表達(dá)菌開始,誘導(dǎo)表達(dá)并測(cè)定酶活。加上增加的案例,不同組學(xué)生之間實(shí)驗(yàn)不一樣,減小大家互相抄襲的范圍。
在教學(xué)過(guò)程中發(fā)現(xiàn)學(xué)生的基礎(chǔ)知識(shí)對(duì)綜合實(shí)驗(yàn)操作非常重要,早進(jìn)實(shí)驗(yàn)室跟著教師做課題的學(xué)生動(dòng)手能力強(qiáng),建議鼓勵(lì)學(xué)生早進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室學(xué)習(xí),或積極參加大學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目,有利于培養(yǎng)科學(xué)思維與動(dòng)手能力,避免出現(xiàn)一些很低級(jí)的錯(cuò)誤,如瓊脂糖凝膠沒有煮透就灌膠,導(dǎo)致電泳條帶不清晰等。再如很多學(xué)生沒有看說(shuō)明書的習(xí)慣,對(duì)英文說(shuō)明有恐懼,而中文說(shuō)明書也懶得看,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)過(guò)程中酶與buffer拿錯(cuò),例如pyrobest酶的buffer與rTag酶一起用,擴(kuò)增無(wú)條帶,可在專業(yè)英語(yǔ)課程中引入對(duì)實(shí)驗(yàn)步驟英文說(shuō)明書的解讀。
新增的實(shí)驗(yàn)案例優(yōu)選活性容易測(cè)定的酶蛋白,例如堿性磷酸酶的活性測(cè)定是生物化學(xué)課程的一個(gè)基礎(chǔ)性實(shí)驗(yàn),簡(jiǎn)單易操作。該案例與人G6PD基因的原核載體構(gòu)建與表達(dá)的區(qū)別在于基因序列的查找,可考查學(xué)生生物信息學(xué)查找序列與分子設(shè)計(jì)的能力以及建立體系測(cè)定酶活的能力。除了教學(xué)實(shí)驗(yàn)室增加的案例外,可借鑒科研成果,讓科研成果反哺教學(xué),引入哺乳動(dòng)物的表達(dá)體系等實(shí)驗(yàn)內(nèi)容。
目前綜合實(shí)驗(yàn)的克隆都采用傳統(tǒng)的分別酶切PCR產(chǎn)物與載體后連接、轉(zhuǎn)化,篩選陽(yáng)性克隆的設(shè)計(jì),傳統(tǒng)方法比較耗時(shí),在教學(xué)經(jīng)費(fèi)充裕的前提下,可考慮用無(wú)縫連接的方法做克隆,該方法1天之內(nèi)可完成傳統(tǒng)方法3天的實(shí)驗(yàn),即PCR、膠回收、酶切、連接。使用新的方法,跟上科技發(fā)展的腳步,有助于擴(kuò)大學(xué)生的知識(shí)面。
該課程的綜合實(shí)驗(yàn)前安排35學(xué)時(shí)的分子克隆實(shí)驗(yàn),即人β珠蛋白基因片段的克隆,初衷是讓學(xué)生掌握基因克隆的操作,有利于綜合實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行,但在綜合實(shí)驗(yàn)的教學(xué)過(guò)程中發(fā)現(xiàn)學(xué)生依然沒有辦法獨(dú)自完成實(shí)驗(yàn),甚至需要教師手把手教,說(shuō)明沒有達(dá)到教學(xué)效果,可能是因?yàn)轵?yàn)證性實(shí)驗(yàn)都是實(shí)驗(yàn)室的教師準(zhǔn)備好試劑,而綜合實(shí)驗(yàn)中是學(xué)生自己配置試劑,很多學(xué)生不清楚如何配置溶液。將這35學(xué)時(shí)的內(nèi)容換成綜合實(shí)驗(yàn),讓學(xué)生從一開始就做綜合實(shí)驗(yàn)的克?。?5學(xué)時(shí)),接著做綜合實(shí)驗(yàn)的誘導(dǎo)表達(dá)與酶活的測(cè)定(40學(xué)時(shí)),讓參與綜合實(shí)驗(yàn)的學(xué)生能完成構(gòu)建到表達(dá)的全過(guò)程。再如在課時(shí)的安排上,基因克隆實(shí)驗(yàn)需要過(guò)夜培養(yǎng)菌,實(shí)驗(yàn)的學(xué)時(shí)應(yīng)連續(xù),而不是每周一次課,且學(xué)生在實(shí)驗(yàn)課的前一天和后一天都在上別的課程,其無(wú)法分身,也無(wú)法一氣呵成,所以一個(gè)組的學(xué)生在40學(xué)時(shí)內(nèi)無(wú)法完成所有實(shí)驗(yàn)內(nèi)容。由于授課計(jì)劃的更改需要涉及課程負(fù)責(zé)人、專業(yè)負(fù)責(zé)人與教務(wù)之間的溝通,過(guò)程比較復(fù)雜,不是任課教師能決定的,而授課時(shí)間的安排是由教務(wù)處來(lái)安排,這些都需要互相協(xié)調(diào)。