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        基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)在腫瘤診斷及微生物鑒定中的應(yīng)用

        2020-12-27 16:28:38管明秀張文成王寶占陳寶穎
        實(shí)用醫(yī)藥雜志 2020年12期
        關(guān)鍵詞:胃癌血清檢測(cè)

        管明秀,張文成,王寶占,崔 喆,陳寶穎,張 霞

        基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrixassisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)是目前臨床診斷中一項(xiàng)創(chuàng)新技術(shù),因其具有操作簡(jiǎn)單、快速、高靈敏度、高特異性等優(yōu)點(diǎn),越來越多地被臨床實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可, 已成為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)不可缺少的分子診斷技術(shù)。血清腫瘤標(biāo)志物可早期篩查無癥狀癌癥患者,已經(jīng)成為近年來蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)注的熱點(diǎn)之一,對(duì)于癌癥患者的早期篩查、早期診斷、早期治療,以及預(yù)測(cè)癌癥患者的預(yù)后具有不可估量的重要價(jià)值。

        1 MALDI-TOF MS 在癌癥診斷中的應(yīng)用

        傳統(tǒng)的2D 凝膠電泳技術(shù)操作復(fù)雜,耗時(shí)費(fèi)力,重復(fù)性差,對(duì)于小分子的低豐度蛋白的分離效果不好[1],不適用于臨床診斷。 MALDI-TOF MS 與磁珠技術(shù)聯(lián)合可以篩選出血清低分子量蛋白/多肽,建立癌癥蛋白標(biāo)志物的指紋圖譜診斷預(yù)測(cè)模型[2,3]。

        1.1 MALDI-TOF MS 在食管癌診斷中的應(yīng)用食管癌是發(fā)生于食管上皮組織的惡性腫瘤,是臨床上比較常見的消化道腫瘤。 全世界每年大約有30多萬人死于食管癌[4]。我國(guó)是食管癌高發(fā)地區(qū),病死率僅次于胃癌。 罹患食管癌的患者中,大約有80%是食管鱗狀細(xì)胞癌 (esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)。 食管癌早期癥狀不明顯,70%的患者發(fā)現(xiàn)時(shí),已經(jīng)處于晚期[5]。

        張婷等[6]研究發(fā)現(xiàn),利用弱陽(yáng)離子交換磁珠(WCX-MB)提取血清蛋白/多肽后,經(jīng)MALDI-TOF MS 檢測(cè)59 例食管鱗癌患者及57 例健康體檢者血清,可以篩選出差異表達(dá)蛋白/肽,從而構(gòu)建了食管癌診斷預(yù)測(cè)模型。 該研究通過磁珠聯(lián)合MALDITOF MS 技術(shù),運(yùn)用遺傳算法(GA),監(jiān)督神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法(SNN)以及快速分類算法(QC)建立了三種食管癌診斷預(yù)測(cè)模型,準(zhǔn)確性分別為93.1%、89.7%和89.7%。 其中運(yùn)用GA 建立的模型診斷效能最佳,特異性和敏感性分別為93.3%和92.9%。 該研究對(duì)食管癌診斷的敏感性遠(yuǎn)高于Nakamura 等[7]研究證明食管癌的血清腫瘤標(biāo)志物癌胚抗原(CEA)的診斷敏感性為12.5%;細(xì)胞角蛋白19 片段(CYFRA21-1)的診斷敏感性 33.9%。 張等[6]研究還發(fā)現(xiàn)食管鱗癌組多肽峰m/z 2660.84 和m/z 5336.49 表達(dá)上調(diào),兩個(gè)峰的AUCROC 值分別為0.95 和0.91, 較比健康對(duì)照組具有顯著性差異。

        通過MALDI-TOF MS 建立的食管癌診斷預(yù)測(cè)模型,具有較高的敏感性和特異度,適用于食管鱗癌高危人群的篩查和輔助診斷。 多肽峰m/z 2660.84 和m/z 5336.49 有望成為新食管鱗癌診斷標(biāo)志物。

        1.2 MALDI-TOF MS 在胃癌診斷中的應(yīng)用 胃癌是來自胃黏膜上皮細(xì)胞的惡性腫瘤。 全球每年胃癌的發(fā)病率約100 萬[8],我國(guó)的胃癌發(fā)病率占全球的50%以上[9]。在我國(guó)的癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中,胃癌的發(fā)病率位列第 2,病死率位居第 3 位[10]。目前胃癌的早期診斷存在很大的局限性[11],糖類抗原CA19-9、糖類抗原CA72-4、CEA 等血清腫瘤標(biāo)志物診斷胃癌的敏感性和特異性比較低[12]。目前MALDI-TOF MS聯(lián)合磁珠技術(shù)進(jìn)行低豐度蛋白/肽檢測(cè)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究成為關(guān)注的熱點(diǎn)[13]。

        王娜娜等[14]利用 WCX-MB 聯(lián)合 MALDI-TOF MS 檢測(cè)60 例胃癌患者和60 例健康體檢者的血清,建立了相應(yīng)蛋白表達(dá)指紋圖譜,篩選出差異表達(dá)蛋白/肽峰m/z 2952.57 和m/z 5904.36,兩個(gè)峰的AUCROC值分別為0.93 和0.81。運(yùn)用GA 建立了胃癌診斷預(yù)測(cè)模型,該模型診斷靈敏度為93.3%,特異性為 90.0%。 YANG 等[15]利用 MALDI-TOF MS 檢測(cè)70 例胃癌患者和健康體檢者的血清,篩選出差異表達(dá)蛋白/肽峰m/z 5335.08 和m/z 1546.02,這與王娜娜等[14]篩選出的多肽峰具有相似性。 LIU 等[16]對(duì) 28例胃癌患者和16 例健康體檢者進(jìn)行血清檢測(cè),篩選出差異表達(dá)蛋白/肽峰m/z 5904.83。 以上進(jìn)一步說明MALDI-TOF MS 檢測(cè)的可靠性。 WCX-MB 聯(lián)合MALDI-TOF MS 技術(shù)具有操作簡(jiǎn)單、靈敏度高、快速等優(yōu)點(diǎn), 適用于臨床診斷。 m/z 5904.36,m/z 5335.08 和m/z 5904.83 有望成為診斷胃癌的血清標(biāo)志物。

        1.3 MALDI-TOF MS 在甲狀腺微小結(jié)節(jié)良惡性診斷中的應(yīng)用 中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)于2016年發(fā)布了首個(gè)《甲狀腺微小乳頭狀癌診斷與治療專家共識(shí)》,認(rèn)為甲狀腺微小乳頭狀癌經(jīng)手術(shù)治療可根除,5年生存率能夠達(dá)到98.5%[17],部分患者發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和腫瘤復(fù)發(fā)[18],因此,對(duì)于甲狀腺微小結(jié)節(jié)的早期良惡性鑒別、合理規(guī)范治療,以及后期隨訪都有著重大的意義。 因甲狀腺微小結(jié)節(jié)體積小,超聲檢查誤診率高,診斷符合率僅為78.8%[19],超聲引導(dǎo)下的細(xì)針穿刺雖然有比較高的敏感性和特異性, 但是也有因診斷可疑或取材不滿意而延誤診斷的情況發(fā)生[20]。 磁珠聯(lián)合 MALDI-TOF MS 能夠捕獲小分子蛋白/多肽,詹宇紅等[21]通過磁珠聯(lián)合MALDI-TOF MS 技術(shù), 對(duì)65 例甲狀腺微小惡性結(jié)節(jié)和50 例微小良性結(jié)節(jié)進(jìn)行血清檢測(cè), 篩選出差異蛋白峰 m/z 3320.19、m/z 8127.39、m/z 4302.35,構(gòu)建了甲狀腺微小惡性結(jié)節(jié)診斷預(yù)測(cè)模型。 盲法監(jiān)測(cè)該診斷預(yù)測(cè)模型的敏感性為80%, 特異度為86.7%, 高于超聲檢查診斷[20]。 與盧秀波等[22]用MALDI-TOF MS 建立的甲狀腺惡性結(jié)節(jié)的診斷模型的敏感度88.0%,特異度83.0%具有一致性。 m/z 3320.19、m/z 8127.39、m/z 4302.35 有望成為甲狀腺微小惡性結(jié)節(jié)的診斷血清標(biāo)志物。

        2 MALDI-TOF MS 在微生物鑒定中的應(yīng)用

        近年來MALDI-TOF MS 在微生物鑒定領(lǐng)域表現(xiàn)出了獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。 較比微生物鑒定傳統(tǒng)的檢測(cè)方法檢測(cè)周期長(zhǎng), 不能滿足臨床診療時(shí)效性的需要,尤其是針對(duì)菌血癥等重癥感染的患者,MALDI-TOF MS 可以直接使用臨床樣本, 或經(jīng)過分離培養(yǎng)出單菌落進(jìn)行檢測(cè),獲得蛋白質(zhì)譜圖,與微生物數(shù)據(jù)庫(kù)參考圖譜進(jìn)行比對(duì),進(jìn)行菌屬、菌種的鑒定,縮短了鑒定時(shí)間[23,24]。 與傳統(tǒng)檢測(cè)微生物表型和生理生化反應(yīng)的方法相比,MALDI-TOF MS 具有快速、準(zhǔn)確、高通量和低成本的優(yōu)勢(shì)[25,26]。 現(xiàn)將 MALDI-TOF MS在微生物領(lǐng)域鑒定中的應(yīng)用闡述如下。

        2.1 細(xì)菌 最近研究證明,MALDI-TOF MS 在細(xì)菌鑒定方面具有顯著的優(yōu)勢(shì),除了常見細(xì)菌[27,28],還能 鑒定 出厭 氧菌[29]、分 枝桿 菌[30]等。 MALDI-TOF MS 對(duì)細(xì)菌進(jìn)行鑒定的主要是依據(jù)對(duì)細(xì)菌生物標(biāo)志物的分子量及分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行測(cè)定來完成。 細(xì)菌的生物標(biāo)志物包括蛋白質(zhì)、核酸和脂類[31]。 由于細(xì)菌蛋白質(zhì)含量較高,具有高度保守性[32],多樣性和豐富性,且易于提取和分離等特點(diǎn),目前利用蛋白質(zhì)作為細(xì)菌鑒定的生物標(biāo)志物得到廣泛應(yīng)用。 Camara等[33]利用 MALDI-TOF MS 檢測(cè)大腸埃希菌的菌體蛋白,鑒定出了野生型大腸埃希菌和抗氨芐西林大腸埃希菌。

        利用MALDI-TOF MS 對(duì)分枝桿菌進(jìn)行鑒定時(shí),需要通過特殊的蛋白提取步驟,萃取蛋白,進(jìn)行分枝桿菌蛋白標(biāo)志物數(shù)據(jù)庫(kù)的建立,通過比對(duì)結(jié)果達(dá)到對(duì)分枝桿菌鑒定的目的[34]。

        Zarate[35]研究證實(shí),用 MALDI-TOF MS 通過低分子量蛋白譜的建立,對(duì)厭氧菌的鑒定結(jié)果與傳統(tǒng)細(xì)菌鑒定技術(shù)的一致率達(dá)到95.3%。 MALDI-TOF MS 在提高厭氧菌導(dǎo)致的內(nèi)源性感染疾病的快速診斷率方面具有更高的價(jià)值。

        2.2 真菌 MALDI-TOF MS 鑒定臨床常見真菌如酵母菌的準(zhǔn)確性比較高[36]。 Becker 等[37]研究顯示MALDI-TOF MS 診斷絲狀真菌的準(zhǔn)確率達(dá)到95.4%。 黃艷飛等[38]研究顯示使用“水平震蕩培養(yǎng)法”配合改良磁珠提取法提取蛋白,利用質(zhì)譜鑒定絲狀真菌鑒定到屬的準(zhǔn)確率可以達(dá)到99%。 目前已經(jīng)建立了龐大的MALDI-TOF 絲狀真菌數(shù)據(jù)庫(kù),這對(duì)于絲狀真菌鑒定具有可觀的臨床應(yīng)用價(jià)值。

        2.3 病毒 由于病毒具有細(xì)胞內(nèi)寄生的特點(diǎn),所以分離培養(yǎng)很困難,而且耗時(shí)長(zhǎng)。 MALDI-TOF MS 憑借快速、高通量的特點(diǎn),在病毒鑒定方面具有明顯的優(yōu)勢(shì)。 萬敏等[39]研究顯示利用 MALDI-TOF MS 對(duì)人乳頭瘤病毒(HPV)進(jìn)行分型診斷的敏感性88.2%,特異度88.9%;對(duì)高危型HPV 診斷的準(zhǔn)確率達(dá)到了100%。 MALDI-TOF MS 對(duì)于病毒的診斷與傳統(tǒng)技術(shù)相比具有很高的一致性[40],同時(shí)又具備高通量、快速等特點(diǎn),對(duì)于未來廣泛應(yīng)用于病毒檢測(cè)具有廣闊的前景。

        2.4 放線菌 放線菌是一類具有絲狀分枝細(xì)胞的原核微生物。 它的細(xì)胞構(gòu)造、細(xì)胞壁的化學(xué)成分和對(duì)噬菌體的敏感性與細(xì)菌相同,但在菌絲形成以及外生孢子繁殖方面與絲狀真菌相似。 大多數(shù)放線菌是條件致病菌,可以導(dǎo)致放線菌病,造成皮膚軟組織、頭頸部、以及生殖器官膿腫[41]。 孫銘艷等[42]研究顯示來自患者膿腫皮膚的菌株,培養(yǎng)72 h 后,可見白色、細(xì)小、無溶血環(huán)的菌落,經(jīng)過革蘭氏染色涂片可以見到革蘭氏染色陽(yáng)性桿菌, 但是未見明顯菌絲,VITEK2 Compact 鑒定結(jié)果為肺炎鏈球菌和雙歧桿菌屬, 與染色鏡檢結(jié)果不符。 使用MALDITOF MS 進(jìn)行鑒定結(jié)果為歐洲放線菌。 該研究還對(duì)菌株 DNA 進(jìn)行提取,選用 16S rRNA[43]基因測(cè)序進(jìn)行鑒定,鑒定結(jié)果也為歐洲放線菌,與MALD-TOF MS 鑒定結(jié)果一致。 因MALDI-TOF MS 具有高通量、快速的診斷優(yōu)勢(shì),所以其對(duì)放線菌病的及時(shí)診斷具有非常重要的意義。

        3 MALDI-TOF MS 面臨的挑戰(zhàn)

        MALDI-TOF MS 雖然具有快速、高通量、敏感、特異等優(yōu)點(diǎn),但是在臨床應(yīng)用過程中還存在很多挑戰(zhàn),缺乏操作的規(guī)范標(biāo)準(zhǔn)化要求,例如質(zhì)量控制、樣品的前處理流程、鑒定流程、報(bào)告及審核流程、報(bào)告解釋、生物安全標(biāo)準(zhǔn)、儀器操作的標(biāo)準(zhǔn)化、數(shù)據(jù)庫(kù)的質(zhì)量都會(huì)影響最終的鑒定結(jié)果。 目前大腸埃希菌和志賀菌運(yùn)用MALDI-TOF MS 還不能嚴(yán)格區(qū)分,需要附加試驗(yàn)才能加以鑒定[44];對(duì)于變形桿菌的鑒定,MALDI-TOF MS 也只能鑒定到屬, 無法進(jìn)行種的鑒定[45]。

        MALDI-TOF MS 雖然存在一定的局限性,但通過規(guī)范標(biāo)準(zhǔn)化操作規(guī)程,完善建立的數(shù)據(jù)庫(kù),該技術(shù)定能以高效、快速、廣泛的優(yōu)勢(shì)在腫瘤診斷領(lǐng)域和臨床微生物診斷領(lǐng)域中更好地服務(wù)于臨床,服務(wù)于患者。

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