中科院上海巴斯德研究所和北京大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員，合作分析了新冠病毒的起源與持續(xù)演化。研究發(fā)現(xiàn)，雖然基因組分析表明，新冠病毒最接近云南中菊頭蝠攜帶的RaTG13，但它們?cè)谥行晕稽c(diǎn)上的差異遠(yuǎn)高于此前的認(rèn)識(shí)，而且新冠病毒分化出了兩個(gè)亞型。相關(guān)論文刊登于《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》。

研究人員調(diào)查了新冠病毒和其他相關(guān)冠狀病毒的分子差異程度。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，雖然新冠病毒和蝙蝠SARS 相關(guān)冠狀病毒（RaTG13）之間的基因組核苷酸只有4%的變異，但兩者中性位點(diǎn)的差異為17%，表明這兩種病毒之間的差異比之前估計(jì)的要大得多。

該研究結(jié)果表明，新冠病毒和穿山甲SARS 冠狀病毒突刺蛋白的受體結(jié)合域功能位點(diǎn)之所以出現(xiàn)新變異，除了重組外，還可能是由突變和自然選擇引起的。

研究人員還對(duì)103 個(gè)新冠病毒基因組進(jìn)行了群體遺傳分析。研究人員發(fā)現(xiàn)這些病毒株已發(fā)生了149 個(gè)突變點(diǎn)，而且大多數(shù)衍生突變是單基因突變，這表明它們要么是最近發(fā)生的，要么是種群增長(zhǎng)的結(jié)果。

此外，新冠病毒可能進(jìn)化成了兩種主要亞型——L 型和S 型，這兩種類型由兩個(gè)不同的單核苷酸多態(tài)性（SNP）明確定義，這表明到目前為止已測(cè)序的病毒株之間幾乎完全有聯(lián)系。

雖然L 型（占比約70%）比S 型（約30%）更普遍，但是研究人員發(fā)現(xiàn)S 型是原始版本。雖然L 型在武漢新冠肺炎暴發(fā)的早期階段更為流行，但在2020 年1 月初之后，L 型的出現(xiàn)頻率有所下降。

研究人員猜測(cè)，人類的干預(yù)可能對(duì)L 型施加了更嚴(yán)重的選擇壓力，因?yàn)長(zhǎng) 型可能更具侵略性、傳播速度更快。另一方面，S 型的進(jìn)化時(shí)間更長(zhǎng)、攻擊性更弱，可能由于受到的選擇壓力相對(duì)較弱而增加了相對(duì)出現(xiàn)頻率。

專家認(rèn)為，這些發(fā)現(xiàn)表明，有必要對(duì)新冠病毒感染者的臨床癥狀、基因組數(shù)據(jù)、流行病學(xué)數(shù)據(jù)等進(jìn)行進(jìn)一步的、即時(shí)的、全面的研究。