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        MMCA 技術(shù)分析廣西苗族婦女葉酸代謝通路關(guān)鍵酶基因MTHFR 677C>T、1298A>C 和MTRR 66A>G 的多態(tài)性

        2020-11-10 01:46:10楊芳華王捷韋笑寶石美蓮羅世強鐘鑫嚴(yán)提珍通訊作者
        醫(yī)藥前沿 2020年20期
        關(guān)鍵詞:土家族

        楊芳華 王捷 韋笑寶 石美蓮 羅世強 鐘鑫 嚴(yán)提珍(通訊作者)

        (1 柳州市婦幼保健院婦女康復(fù)科 廣西 柳州 545001)

        (2 融水苗族自治縣婦幼保健院 廣西 柳州 545300)

        (3 柳州市婦幼保健院醫(yī)學(xué)遺傳科,柳州市出生缺陷預(yù)防與控制重點實驗室 廣西 柳州 545001)

        出生缺陷嚴(yán)重危害人類的健康,其預(yù)防工作非常重要。葉酸代謝過程中亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)基因677C>T、1298A>C 和甲硫氨酸合成酶還原酶(MTRR)的基因66A>G 多態(tài)性與出生缺陷發(fā)生有密切關(guān)系[1]。葉酸多態(tài)性位點的分布存在地區(qū)和種族差異性。MTHFR 和MTRR 基因單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)的分型方法主要包括限制性片段長度多態(tài)性技術(shù)、Taqman-MGB 技術(shù)、焦磷酸測序技術(shù)等。多色探針熔解曲線法(multicolor melting curve analysis,MMCA)是近幾年來新建立的基因分型技術(shù)[2],該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于單基因遺傳病基因突變檢測和多發(fā)疾病易感SNP 分型[3]。本研究以廣西苗族女性為研究對象,采用MMCA 法對 MTHFR 677C>T、1298A>C 和MTRR 66A>G 多態(tài)性位點進(jìn)行基因分型,并與其它地區(qū)不同民族的遺傳分布特征進(jìn)行比較。

        1.對象與方法

        1.1 對象

        2019 年1 月—12 月在融水婦幼保健院進(jìn)行婚育檢查的苗族婦女500 例,平均年齡23.05±5.82 歲。本研究經(jīng)柳州市婦幼保健院倫理委員會批準(zhǔn)并征得被檢對象知情同意。采集口腔黏膜細(xì)胞應(yīng)用MMCA 法進(jìn)行檢測。

        1.2 方法

        1.2.1 DNA 提取和濃度測定

        嚴(yán)格按照說明書采用柱式提取試劑盒提取樣本口腔黏膜細(xì)胞DNA,并檢測其質(zhì)量和濃度(ND-1000-UV-VIS 紫外/可見光掃描分光光度計)。

        1.2.2 MMCA 法進(jìn)行MTRR 和MTHFR 基因分型

        利用“葉酸代謝相關(guān)基因多態(tài)性檢測試劑盒(熒光PCR 熔解曲線法)”進(jìn)行檢測,嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行操作。通過CFX96實時熒光PCR 儀進(jìn)行檢測和結(jié)果分析。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)分析

        應(yīng)用HaploView4.2 軟件對研究人群進(jìn)行MTHFR 677C>T、MTHFR 1298A>C、MTRR 66A>G 多態(tài)性位點的Hardy-Weinberg 遺傳平衡檢驗。采用SPSS22.0 軟件對獲得數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析,各地區(qū)各民族之間的基因型和等位基因型頻率的差異比較采用χ2檢驗。計量資料采用±s 表示,用t 檢驗。以P <0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2.結(jié)果

        2.1 Hardy-Weinberg 平衡分析

        對廣西苗族女性MTHFR 677C>T、MTHFR 1298A>C、MTRR 66A>G 三個SNP 位點分別進(jìn)行平衡檢驗,經(jīng)擬合優(yōu)度χ2檢驗,三個SNP 位點的基因型頻率和基因頻率處于遺傳平衡狀態(tài)(χ2分別為0.005、0.002 和3.186,P 均>0.05),表明本研究取樣是隨機的。

        2.2 苗族女性MTHFR、MTRR 基因型和等位基因頻率分布情況

        500 例廣西苗族女性MTHFR 677 CC、CT、TT 的分布頻率依次為:72.2%、25.6%、2.2%;MTHFR 1298 AA、AC、CC 的基因型頻率分別為54.4%、38.6%和7.0%;MTRR 66 AA、AG、GG 的分布頻率依次為49.2%、43.4%和7.4%。MTHFR 677C>T 的C 和T 等位基因頻率分別為73.3%和26.7%,MTHFR 1298A>C 的A 和C 等位基因的頻率分別73.7%和26.3%,MTRR 66A>G 的A 和C 等位基因頻率分別為70.9%和29.1%。

        2.3 不同民族女性MTHFR、MTRR 基因多態(tài)性位點基因型和等位基因頻率比較

        不同民族女性MTHFR 677C>T、MTHFR 1298A>C、MTRR 66A>G 基因型及等位基因頻率比較見表1 ~3。廣西苗族MTHFR 677C>T 的基因型頻率與海南黎族[4]、新疆哈薩克族[5]、貴州土家族[6]、貴州苗族[6]、湖南土家族[7]、云南阿昌族[8]、云南傈僳族[8]、西藏藏族[9]女性比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。廣西苗族677T 等位基因頻率與海南黎族、貴州土家族、貴州苗族、湖南土家族女性比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P均<0.05),與新疆哈薩克族、云南阿昌族、云南傈僳族、西藏藏族比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P 均>0.05)。廣西苗族MTHFR 1298A>C 的基因型頻率與貴州土家族、貴州苗族、海南黎族、湖南土家族女性比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P 均<0.05),而與新疆哈薩克族、云南阿昌族、西藏藏族比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P 均>0.05)。廣西苗族1298C 等位基因頻率與貴州土家族、貴州苗族、湖南土家族、云南傈僳族女性比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P 均<0.05),與海南黎族、新疆哈薩克族、云南阿昌族、西藏藏族差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P 均>0.05)。廣西苗族MTRR 66A>G 的基因型頻率與海南黎族、新疆哈薩克族、貴州土家族、貴州苗族、西藏藏族女性比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P <0.05),而與湖南土家族、云南阿昌族、云南傈僳族比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P >0.05)。廣西苗族66G等位基因頻率與海南黎族、新疆哈薩克族、貴州土家族、貴州苗族、西藏藏族女性比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P <0.05),與湖南土家族、云南阿昌族、云南傈僳族比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P 均>0.05)。

        表1 不同民族女性MTHFR 677C>T 基因型及等位基因頻率比較(%)

        表2 不同民族女性MTHFR 1298A>C 基因型及等位基因頻率比較(%)

        表3 不同民族女性MTRR 66A>G 基因型及等位基因頻率比較(%)

        3.討論

        2019 年柳州市圍產(chǎn)兒出生缺陷總發(fā)生率為14.00‰,主要類型包括先天性心臟病、多指(多趾)、外耳其他畸形、尿道下裂、并指(并趾)、唇裂、小耳、腭裂、馬蹄內(nèi)翻足、直腸肛門閉鎖、胎兒水腫綜合征等。研究表明引起出生缺陷發(fā)生的因素主要包括環(huán)境因素、遺傳因素和營養(yǎng)因素,隨著分子遺傳學(xué)技術(shù)的發(fā)展,遺傳因素的作用顯得越來越重要。葉酸和同型半胱氨酸代謝途徑的關(guān)鍵酶是MTHFR 和MTRR,其基因多態(tài)性與出生缺陷關(guān)系密切[1],此外,這些多態(tài)性位點在不同地區(qū)分布存在差異,與所在民族居住地的氣候、環(huán)境、飲食習(xí)慣等因素相關(guān)[7]。

        本研究對廣西柳州500 例苗族女性進(jìn)行了MTHFR 677C>T、MTHFR 1298A>C、MTRR 66A>G位點分布情況調(diào)查,并與海南黎族[4]、新疆哈薩克族[5]、貴州土家族[6]、貴州苗族[6]、湖南土家族[7]、云南阿昌族[8]、云南傈僳族[8]、西藏藏族[9]數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較。本文發(fā)現(xiàn)廣西苗族677T 等位基因頻率高于海南黎族、云南阿昌族、新疆哈薩克族,低于貴州土家族、貴州苗族、湖南土家族、云南傈僳族,不完全遵循由南到北呈現(xiàn)遞增趨勢,與國內(nèi)已報道的其它地區(qū)和民族情況不太一致[6],與部分亞洲國家(如約旦和印度)MTHFR 基因677T 等位基因頻率分布規(guī)律存在差異[6],提示這種分布規(guī)律的原因可能是由紫外線照射強度和飲食習(xí)慣引發(fā)[6]。MTRR 基因66G 等位基因在少數(shù)民族中呈現(xiàn)由南向北逐漸遞減的趨勢,這一結(jié)果與國內(nèi)學(xué)者對部分地區(qū)漢族人所做的研究結(jié)果相似[6]?;诓煌貐^(qū)、不同民族的遺傳特征差異[10],在制定相關(guān)孕期保健方案時,我們需要人性化指導(dǎo)用藥。通過開展廣西苗族女性 MTHFR 和MTRR 基因多態(tài)性的分子流行病學(xué)研究,了解本地區(qū)少數(shù)民族人群的遺傳特征,將為當(dāng)?shù)爻錾毕菀患夘A(yù)防和公共衛(wèi)生政策提供科學(xué)依據(jù)。

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