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        耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌耐藥率及同源性分析

        2020-09-11 07:33:32張倩茹
        蚌埠醫(yī)學院學報 2020年8期
        關(guān)鍵詞:耐藥檢測

        張倩茹,李 甲,鄭 嵐

        肺炎克雷伯菌是臨床常見的一種革蘭陰性菌,CHINET監(jiān)測數(shù)據(jù)顯示其僅次于大腸埃希菌居于臨床分離細菌的第二位,但耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistantK.pneumoniae,CRKP)在耐碳青霉烯腸桿菌科細菌中所占比率最大,且近年來有迅速增加的趨勢,給臨床治療和感染控制工作帶來了很大的困難[1]。本研究收集2018年1-8月蚌埠市第三人民醫(yī)院臨床分離的14株CRKP,同時將其進行藥敏試驗、耐藥表型篩查、基因檢測和同源性分析,旨在為臨床科室使用抗菌藥物和醫(yī)院感染防控部門提供實驗依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 菌株來源 14株CRKP分離自本院臨床送檢標本(去除同一病人重復分離的菌株),其中ICU病房5株,新生兒病房4株,神經(jīng)外科3株,普外科和呼吸內(nèi)科各1株。標本類型為痰液9例,尿液2例,血液1例,支氣管和切口分泌物各1例。菌株的分離培養(yǎng)均嚴格參照《全國臨床檢驗操作規(guī)程》(第三版)操作,菌株的鑒定使用生物梅里埃公司(法國)的VITEK Compact型全自動微生物分析儀鑒定分析至種。質(zhì)控菌株(大腸埃希菌ATCC25922)購于衛(wèi)生部臨檢中心,產(chǎn)KPC-2型肺炎克雷伯菌的陽性對照菌株由安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院微生物實驗室惠贈。

        1.2 藥敏試驗 應用VITEK Compact型全自動微生物分析系統(tǒng)作藥敏試驗,參照美國臨床實驗室標準化研究所(CLSI)2016年標準判斷檢測結(jié)果,藥敏數(shù)據(jù)用WHONET 5.6軟件比對分析。

        1.3 產(chǎn)碳青霉烯酶表型篩查 參照2016年CLSI標準操作改良Hodge試驗,配制0.5麥氏濃度的大腸埃希菌ATCC25922菌液,用無菌0.9%氯化鈉溶液作10倍稀釋后涂布于M-H平板,平板正中貼10 μg的厄他培南藥敏紙片,待測菌呈放射狀從藥敏紙片的邊緣向平板邊緣作劃線,于35 ℃溫箱中孵育,過夜。結(jié)果觀察以抑菌圈處出現(xiàn)被檢測菌生長增強者(矢狀)為陽性,表示該檢測菌株產(chǎn)碳青霉烯酶。將已知產(chǎn)KPC-2型肺炎克雷伯菌株作陽性對照菌株,ATCC25922作陰性對照菌株。

        1.4 耐藥基因檢測 挑取MH平板上適量菌落,用煮沸法提取細菌的DNA,應用PCR技術(shù)擴增blaKPC-2耐藥基因。引物和擴增條件參照文獻方法[2-3]。KPC-2引物:F5′-TCG CTA AAC TCG AAC AGG-3′,R5′-TTA CTG CCC GTT GAC GCC CAA TCC-3′。PCR 反應體系:10 μmol/L上游和下游引物各1 μL,PCR Mix 12.5 μL,模板2.5 μL,加入雙蒸水到25 μL。反應的條件:94 ℃預變性,時間5 min;94 ℃變性,時間15 s;55 ℃退火,時間30 s;72 ℃延伸,時間35 s;進行30個循環(huán)。最后72 ℃再延伸10 min。PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳后置于成像系統(tǒng)觀察、拍照并記錄檢測結(jié)果。

        1.5 菌株同源性分析 對14株CRKP應用腸桿菌科基因間重復序列聚合酶鏈反應(ERIC-PCR)進行同源性分析,參考文獻[3-4]設計引物:R5′-ATG TAA GCT CCT GGG GAT TCA C-3′,F(xiàn)5′-AAG TAA GTG ACT GGG GTG AGC G-3′。擴增條件:94 ℃預變性,時間3 min;然后94 ℃,時間60 s;55 ℃,時間60 s;72 ℃,時間90 s,進行35個循環(huán),最后72 ℃再延伸10 min。產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析。檢測結(jié)果判斷標準:擴增條帶數(shù)目和位置完全相同者為同一克隆株,主條帶的位置相同,副帶相差1~2條者為亞型或者密切相關(guān),不符合以上條件者為不同基因型菌株。

        2 結(jié)果

        2.1 藥敏試驗結(jié)果 14株CRKP對臨床多種抗菌藥物均表現(xiàn)耐藥,耐藥率見表1。

        2.2 改良Hodge試驗結(jié)果 14株CRKP中改良Hodge試驗11株陽性,陽性率為 78.57%。改良Hodge試驗的陽性待測菌株見圖1。

        2.3 耐藥基因KPC-2檢測結(jié)果 以已知產(chǎn)KPC-2型的肺炎克雷伯菌為陽性對照,雙蒸水為陰性對照,PCR擴增產(chǎn)物電泳結(jié)果顯示有12株CRKP經(jīng)基因擴增后與陽性對照的電泳條帶位置相同,表明檢出KPC-2基因,其陽性率為85.71%,擴增產(chǎn)物電泳圖見圖2。

        表1 14株耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌對常用抗菌藥物的耐藥率(%)

        2.4 同源性分析結(jié)果 14株CRKP的指紋圖譜見圖3,其擴增條帶數(shù)多為3~7條,根據(jù)ERIC-PCR產(chǎn)物電泳指紋圖譜將其分為3個亞型,其中A型11株(ICU病房5株,神經(jīng)外科3株,新生兒病房2株,普外科1株),B型2株(新生兒病房2株),C型1株(呼吸內(nèi)科1株)。

        3 討論

        CRKP是一種常見的多重耐藥菌,屬于醫(yī)院感染監(jiān)測的目標細菌之一。CRKP的出現(xiàn)常造成臨床抗菌藥物治療的失敗和病人醫(yī)療費用及病死率的增加。本研究14株CRKP的藥敏結(jié)果顯示,菌株對包括一至四代頭孢、酶抑制劑復合物及碳青霉烯類在內(nèi)的所有β-內(nèi)酰胺類藥物耐藥率都比較高,對頭孢替坦及氨曲南的耐藥率稍低。對氟喹諾酮類及氨基糖苷類藥物的耐藥率也比較高,僅對磺胺類稍為敏感,表明本院分離的CRKP均表現(xiàn)為高水平耐藥的多重耐藥菌。肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類藥物最常見的耐藥機制是產(chǎn)KPC酶,主要為KPC-2型。繼浙江地區(qū)最早報道后全國多個地區(qū)均有陸續(xù)發(fā)現(xiàn)[5]。改良Hodge試驗(MHT)是CLSI推薦檢測碳青霉烯酶表型的方法,本文中11株MHT陽性的菌株在后續(xù)的PCR實驗中均檢測到表達blaKPC-2基因。本研究中尚有2株菌未檢測到KPC-2基因,接下來的研究我們將增加檢測除KPC-2以外的碳青霉烯酶如金屬酶NDM-1、IMP、VIM及OXA-48的基因,編碼這些酶的基因多通過質(zhì)粒介導,可依靠轉(zhuǎn)座子、插入序列等多種基因元件在不同菌株間轉(zhuǎn)移,引起菌株間耐藥基因的水平傳播,易導致耐藥菌引起的醫(yī)院感染暴發(fā)流行[6]。

        由于多重耐藥菌株的耐藥表型、基因型及流行分布情況會因時間、地域的不同而變化,故了解本醫(yī)院CRKP菌株的分子流行病學特征對阻斷此類多重耐藥菌傳播和防控醫(yī)院感染具有重要意義。ERIC-PCR方法快速簡便,可作為實驗室菌株同源性分析的方法[7]。本研究顯示本院內(nèi)有產(chǎn)KPC-2型的克隆菌株流行趨勢,主要集中在ICU、神經(jīng)外科和新生兒病房,涉及到的臨床科室應積極做好消毒隔離和防護措施,對醫(yī)務工作者加強培訓,增強一線工作人員對多重耐藥菌醫(yī)院感染控制工作的重視,可以有效防止CRKP的進一步傳播和擴散。

        綜上所述,在檢驗科微生物室準確鑒定耐碳青霉烯類菌株并深入研究其相關(guān)耐藥機制,臨床醫(yī)生規(guī)范使用碳青霉烯類抗生素的前提下,醫(yī)院感染控制部門還應建立更全面的干預機制,開展相關(guān)的感染控制措施:盡可能減少對病人不必要的侵襲性操作;規(guī)定在使用抗菌藥物治療前必須做藥敏試驗;保持環(huán)境的清潔和消毒;強化醫(yī)務工作者手衛(wèi)生意識;制訂嚴格的接觸隔離預防措施,為CRKP感染的病人提供單獨的隔離空間;同時在高危病房建立積極有效的監(jiān)控機制等??傊t(yī)院感染管理科、微生物室和臨床科室應加強聯(lián)系,共同監(jiān)測、聯(lián)合督查,才能力爭盡早發(fā)現(xiàn)和阻斷CRKP在院內(nèi)的傳播,預防多重耐藥菌導致醫(yī)院感染的流行。

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