杜晶輝, 李 莎, 劉 旭
(天津中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,天津 300193)
2019 年12月發(fā)現(xiàn)于我國武漢的新型冠狀病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)目前已成全球蔓延趨勢,在COVID-19的診治中,實(shí)驗室檢測起到了至關(guān)重要作用。在這一新發(fā)傳染病的救治過程中,各醫(yī)療機(jī)構(gòu)結(jié)合診治實(shí)踐,總結(jié)出COVID-19的重要實(shí)驗室檢驗指標(biāo),并編制了臨床路徑[1-2],包括確診、鑒別診斷和輔助診斷3部分。目前,關(guān)于鑒別診斷檢測技術(shù)的研究相對較少,確定診斷檢測技術(shù)中病毒核酸檢測是重要手段,血清抗體檢測也可作為確診指標(biāo)。輔助診斷檢測技術(shù)主要是在疾病治療中發(fā)揮作用。我們對COVID-19的確定診斷、鑒別診斷和輔助診斷相關(guān)實(shí)驗室檢測技術(shù)進(jìn)行概述。
病原學(xué)診斷主要包括病毒的分離培養(yǎng)和核酸檢測。病毒分離培養(yǎng)是實(shí)驗室診斷病毒的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但是由于該方法檢測時間長(體外分離培養(yǎng)需要6 d)、生物安全等級要求高(P4實(shí)驗室),因此在臨床上的開展受到限制[3]。嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸檢測方法較多,包括逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcriptionpolymerase chain reaction,RT-PCR)、等溫核酸擴(kuò)增(recombinase polymerase amplification,RPA)技術(shù)、依賴核酸序列擴(kuò)增(nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)技術(shù)、環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術(shù)、基于成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列/及其相關(guān)蛋白(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein,CRISPR/Cas)基因核酸檢測技術(shù)、基因芯片技術(shù)、基因測序等。其中,實(shí)時熒光RT-PCR及基因測序為相關(guān)部門推薦的檢測方法[4]。
1.1.1 實(shí)時熒光RT-PCR SARS-CoV-2的基因組為單鏈正RNA,需先通過反轉(zhuǎn)錄酶合成互補(bǔ)的cDNA鏈,再以cDNA鏈為基礎(chǔ)進(jìn)行PCR擴(kuò)增[5]。截至2020年4月27日,我國國家藥品監(jiān)督管理局(the National Medical Products Administration,NMPA)共批準(zhǔn)了19個SARS-CoV-2核酸檢測試劑(表1)。熒光RT-PCR主要分為二重實(shí)時熒光RT-PCR和三重實(shí)時熒光RT-PCR(均為Taqman探針法)。二重檢測的靶基因主要是RdRp基因[位于開放讀碼框1a/b(open reading frame 1ab,ORF1ab)、核衣殼蛋白(nucleocapsid protein,N)];三重檢測的靶基因是RdRp基因、N基因和包膜蛋白(envelope protein,E)基因。有研究團(tuán)隊已經(jīng)對6種不同品牌的試劑盒進(jìn)行了比較,得出了部分試劑的準(zhǔn)確性、靈敏度及重復(fù)性欠佳的結(jié)論[6]。
表1 NMPA批準(zhǔn)的SARS-CoV-2核酸檢測試劑(截至2020年4月27日)
實(shí)時熒光RT-PCR檢測核酸的方法具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、相對基因測序速度快、可批量化和成本低的優(yōu)點(diǎn),但相對血清抗體檢測,其對實(shí)驗場所及人員要求高、操作繁瑣、耗時長,檢測人員感染風(fēng)險高,結(jié)果受樣本質(zhì)量、實(shí)驗條件及人員操作等因素影響較大[7],特別是假陰性問題,使核酸檢測的作用一度被質(zhì)疑。假陰性結(jié)果主要由樣本質(zhì)量、樣本采集時間與病毒含量、樣本的保存、運(yùn)輸和處理及試劑盒本身的局限性、檢驗操作等因素導(dǎo)致,已有許多研究針對這些因素提出了對策:(1)樣本質(zhì)量。下呼吸道樣本(深部痰、肺泡灌洗液或支氣管灌洗液等)較上呼吸道樣本(鼻咽拭子)更易檢出病毒,但COVID-19患者一般為干咳無痰,灌洗液樣本采集難度大、危險系數(shù)高;采集下呼吸道樣本一般可在插管的患者中進(jìn)行,上呼吸道樣本建議采集鼻拭子,或同時采集鼻拭子和咽拭子,放入同一個采集管中,采集拭子宜采用植絨拭子[8-9]。(2)樣本采集時間與病毒含量。隨著病程的進(jìn)展,不同部位的病毒含量是不同的,因此不同病程應(yīng)采用不同方法采集不同部位的樣本[10]。(3)樣本的保存、運(yùn)輸和處理。RNA病毒核酸穩(wěn)定性較差,樣本采集后應(yīng)該盡快進(jìn)行檢測,24 h內(nèi)檢測可置于4 ℃保存,無法24 h內(nèi)檢測,應(yīng)-70 ℃或以下保存。樣本的運(yùn)輸應(yīng)在4 ℃進(jìn)行,運(yùn)輸容器應(yīng)有病毒保存液[11]。(4)試劑盒本身的局限性。應(yīng)急研發(fā)生產(chǎn)的試劑盒缺少完整的臨床應(yīng)用和方法學(xué)驗證,實(shí)驗室在使用不同批號試劑前應(yīng)做相應(yīng)的性能驗證[6]。選擇至少包含最為保守及特異的ORF1ab區(qū)域以及N基因的試劑盒[12]。(5)檢驗操作。磁珠法是較為常用的核酸提取方法,具有簡便、高效、提取濃度及純度較高等優(yōu)點(diǎn)[11],實(shí)驗室應(yīng)參加室間質(zhì)評并做好室內(nèi)質(zhì)控,指派專業(yè)人員進(jìn)行檢測。針對核酸檢測的假陰性問題,大多學(xué)者建議以血清抗體檢測作為SARS-CoV-2核酸檢測陰性疑似病例的補(bǔ)充檢測,或在疑似病例確診時與核酸檢測協(xié)同應(yīng)用[13]。結(jié) 果判讀應(yīng)結(jié)合各品牌試劑說明書(表2)。
表2 SARS-CoV-2的實(shí)時熒光PT-PCR檢測結(jié)果判讀
1.1.2 基因測序 基因測序可對樣本中未知基因組序列進(jìn)行全新測定和鑒定,以確認(rèn)未知病原體基因組信息。我國學(xué)者利用二代測序的宏基因組學(xué)技術(shù),于2020年1月7日從患者體內(nèi)分離出SARS-CoV-2并進(jìn)行了基因組測序,并于2020年1月12日向世界衛(wèi)生組織上報了相關(guān)信息?;驕y序技術(shù)可用于未知感染性疾病宏基因組學(xué)分析和傳染病監(jiān)控,快速應(yīng)對新型傳染性疾病的暴發(fā),提高對疾病發(fā)生和傳播的理解,并進(jìn)行數(shù)據(jù)共享,指導(dǎo)核酸檢測產(chǎn)品的設(shè)計等[14]。還可幫助了解病毒的遺傳信息,對病毒進(jìn)行追蹤和溯源,為臨床診斷及治療提供科學(xué)依據(jù),并為病原學(xué)、免疫學(xué)和流行病學(xué)研究奠定基礎(chǔ)[15]。
基因測序技術(shù)的高敏感性、高準(zhǔn)確性特點(diǎn)較適用于最初病毒的鑒定和后期病毒的進(jìn)一步研究,以及對疑難病例的診斷與鑒別診斷[16],但由于對實(shí)驗室環(huán)境、設(shè)備和人員素質(zhì)的要求較高(專業(yè)人員對序列的解讀),且耗時長、成本高,不適合用于SARS-CoV-2的快速、大批量的常規(guī)檢測[17]。
人體感染SARS-CoV-2后,病毒會作為抗原刺激人體免疫細(xì)胞產(chǎn)生抗體,因此可以通過檢測人體內(nèi)是否產(chǎn)生特異性的抗體來間接判斷是否感染SARS-CoV-2。檢測的抗體主要分為IgM和IgG 2類。IgM抗體是機(jī)體初次免疫應(yīng)答產(chǎn)生的抗體,產(chǎn)生速度快,但濃度低、維持時間短、親和力差,主要提示現(xiàn)階段被感染的狀態(tài),可作為早期感染的指標(biāo);IgG抗體在感染晚期出現(xiàn),濃度高、維持時間長、親和力好,可提示既往感染。SARS-CoV-2進(jìn)入人體后到產(chǎn)生IgM抗體約為1周時間,但目前暫無針對COVID-19的抗體檢測窗口期及2次檢測間隔時間的研究,因此何時進(jìn)行第1次和第2次血清抗體檢測,目前尚無共識。
抗體檢測的樣本主要是血清、血漿或全血,檢測技術(shù)主要分為3類:化學(xué)發(fā)光法、膠體金免疫層析法和酶聯(lián)免疫吸附試驗。截至2020年4月27日,NMPA共批準(zhǔn)11個SARS-CoV-2抗體檢測試劑,其中膠體金法6個,化學(xué)發(fā)光法5個。目前,對COVID-19血清抗體檢測的研究主要集中在膠體金免疫層析法,但是相關(guān)文件中提出需要進(jìn)行IgG抗體4倍升高的檢測[4],我們認(rèn)為只使用定性的膠體免疫層析法是不能完全滿足要求的。
化學(xué)發(fā)光法靈敏度高、特異性強(qiáng)、檢測范圍寬,操作自動化高,檢測速度快,但容易檢測出低值的抗體量,假陽性偏高,且需要化學(xué)發(fā)光儀,成本較高。使用化學(xué)發(fā)光法測定IgM和IgG臨床特異度可以高達(dá)96.20%和92.41%[18]?;瘜W(xué)發(fā)光法測定總抗體優(yōu)于膠體金免疫層析法,化學(xué)發(fā)光法檢測IgM適用于疾病的各個階段[19]。膠體金免疫層析法檢測樣本采集易標(biāo)準(zhǔn)化(全血樣本)、操作簡單、報告時間快(約15 min)[13],適用于快速篩查,特異性較高,無需特殊設(shè)備(目視判定結(jié)果),有輔助診斷的價值[20],然而其檢測靈敏度和準(zhǔn)確度相對化學(xué)發(fā)光法和酶聯(lián)免疫吸附試驗低,容易出現(xiàn)假陰性結(jié)果,建議與其他方法聯(lián)用。酶聯(lián)免疫吸附試驗具有特異性強(qiáng)、靈敏度高(較膠體金免疫層析法)的特點(diǎn),載體標(biāo)準(zhǔn)化難度較低,成本相對化學(xué)發(fā)光法低,但檢測速度慢(1~2 h)、易污染、步驟較為繁瑣,檢測通量相對較小[21],截至3月16日,尚無NMPA批準(zhǔn)的試劑。ZHANG等[22]采用酶聯(lián)免疫吸附試驗試劑盒檢測IgG和IgM,連續(xù)監(jiān)測15例COVID-19患者IgG和IgM的滴度變化,發(fā)現(xiàn)采樣第5天,IgG的陽性率(81%~100%)和IgM的陽性率(50%~81%)都大幅增加,這與核酸檢測相對較低的陽性檢出率(50%)相反。由于酶聯(lián)免疫吸附試驗的性能介于化學(xué)發(fā)光法和膠體金免疫層析法之間,但檢測時間較長,在COVID-19診斷中未見優(yōu)勢,故相關(guān)研究較少。
核酸檢測聯(lián)合抗體檢測結(jié)果判讀見表3。
表3 SARS-CoV-2核酸檢測聯(lián)合血清抗體檢測結(jié)果判讀
抗體檢測操作簡單,對實(shí)驗環(huán)境及人員要求較低,且僅需采集血液標(biāo)本(相對核酸樣本采集風(fēng)險較低)。有研究結(jié)果表明,56 ℃ 30 min滅活處理血液樣本對免疫層析法及化學(xué)發(fā)光免疫分析法(熒光免疫層析法除外)檢測SARS-CoV-2抗體結(jié)果幾乎無影響,因此可在檢測前先進(jìn)行滅活以降低檢驗人員感染風(fēng)險[23],可用于COVID-19的早期診斷、流行病學(xué)篩查和臨床轉(zhuǎn)歸預(yù)測,是快速篩查和核酸輔助診斷的重要方法[13]。但樣本溶血或紅細(xì)胞、纖維蛋白未離心去除、細(xì)菌污染、患者自身抗體、嗜異性抗體引起假性非特異性反應(yīng)會造成假陽性結(jié)果[24]。采用防腐劑、抗凝劑等處理樣本,樣本在冰箱中保存過久,試劑使用前未平衡至室溫,用量不足,溫育時間或溫度不足,受到污染或失效(酶聯(lián)免疫吸附試驗),層析過快(膠體金免疫層析法)等,都會導(dǎo)致假陽性結(jié)果。單獨(dú)使用SARS-CoV-2特異性IgM和IgG抗體在早期診斷與篩查COVID-19時存在較大的漏診和一定的誤診風(fēng)險,同時檢測IgM、IgG抗體可以提高檢測的準(zhǔn)確性,減少漏診[25]。有研究結(jié)果表明,血清學(xué)檢測SARS-CoV-2陽性率比較高,將核酸檢測和血清學(xué)檢測結(jié)果綜合分析,可能提高檢出率[26]。
SARS-CoV-2感染所致COVID-19的臨床特征與普通病毒性肺炎相似,需要與其他病原體引起的社區(qū)獲得性肺炎進(jìn)行鑒別診斷[27],進(jìn)行呼吸道病原體檢測是將COVID-19與其他呼吸道病毒(流感病毒、副流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒等)及肺炎支原體、肺炎衣原體、肺炎鏈球菌等引起的肺炎進(jìn)行區(qū)分的必要措施。當(dāng)患者在非疫區(qū),且無明顯流行病學(xué)接觸史時,應(yīng)酌情篩查上述病原體,排除這些病原體引起的肺炎,從而做到疾病的早期鑒別診斷[28]。
由于COVID-19疑似患者首先于發(fā)熱門診就診,為更好地做到早發(fā)現(xiàn)、早隔離,在檢測項目的選擇上應(yīng)該首先考慮膠體金技術(shù)、微流控芯片技術(shù)等快速、集成化、高通量的檢測技術(shù)[29-30]。四川大學(xué)華西醫(yī)院實(shí)驗室推薦檢測甲/乙型流感病毒抗原篩查、13種常見呼吸道病毒核酸檢測、肺炎支原體抗體、肺炎衣原體抗體和呼吸道樣本細(xì)菌培養(yǎng)等[2]。首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院張國軍團(tuán)隊對出現(xiàn)流感樣癥狀且經(jīng)胸部影像學(xué)檢查證實(shí)存在下呼吸道感染的發(fā)熱門診就診患者進(jìn)行膠體金甲/乙型流感病毒抗原抗體檢測,從而快速與SARS-CoV-2感染患者進(jìn)行鑒別診斷[31]。針對社區(qū)獲得性肺炎常見的肺炎鏈球菌檢測,有學(xué)者建議使用肺炎鏈球菌尿抗原檢測的方法實(shí)現(xiàn)快速檢測[32]。
在結(jié)果判讀時,呼吸道病原體檢測全部為陰性,臨床表現(xiàn)具有病毒性肺炎特征,即使SARS-CoV-2核酸檢測陰性,也應(yīng)重新取陽性率更高的樣本進(jìn)行核酸檢測,或結(jié)合血清學(xué)抗體檢測進(jìn)一步判讀結(jié)果。對COVID-19確診患者也應(yīng)酌情增加呼吸道病原體檢測,根據(jù)是否合并其他病原感染[17]來調(diào)整治療方案。
輔助診斷相關(guān)的實(shí)驗診斷技術(shù)包括血液炎性指標(biāo)(血常規(guī)、C反應(yīng)蛋白、降鈣素原和血清淀粉樣蛋白A等)、生化指標(biāo)(肝功能、腎功能、心功能、血?dú)夥治龅龋?、免疫指?biāo)(促炎細(xì)胞因子、趨化因子及淋巴細(xì)胞亞群)等。血液炎性指標(biāo)可用于COVID-19的初步鑒別診斷,張國軍團(tuán)隊確證了幾類血常規(guī)標(biāo)志物的鑒別屬性,可以作為核酸檢測的一個有效補(bǔ)充。但是SARS-CoV-2引起的感染較為復(fù)雜,單純依靠血液炎性指標(biāo)進(jìn)行鑒別診斷較困難[31]。生化指標(biāo)檢測技術(shù)主要是通過器官功能檢測判斷和機(jī)體損傷情況,進(jìn)而調(diào)整治療方案,SARS-CoV-2與器官損傷具有一定相關(guān)性,對肝功能、腎功能等器官功能進(jìn)行檢測,可有效判斷病情變化。但對患者進(jìn)行肝、腎、心功能檢測并不能判斷SARS-CoV-2直接損傷組織器官的嚴(yán)重程度,應(yīng)考慮治療藥物是否對這些組織器官造成了損傷。由于SARS-CoV-2主要侵害肺組織,因此血?dú)夥治鰧τ贑OVID-19肺功能的監(jiān)測尤為重要,可作為判斷病情的標(biāo)準(zhǔn)之一[33]。針對COVID-19患者免疫反應(yīng)進(jìn)行監(jiān)測,對促炎細(xì)胞因子、趨化因子等進(jìn)行檢測可為臨床免疫干預(yù)提供更加準(zhǔn)確的切入點(diǎn),從而充分控制免疫失衡,更好地發(fā)揮人體免疫功能。已經(jīng)有學(xué)者分析了中藥在遏制COVID-19引起的免疫過激、細(xì)胞因子風(fēng)暴及抗急性肺損傷中的潛在應(yīng)用價值[34]??偠灾o助診斷相關(guān)檢測技術(shù)可以為COVID-19的嚴(yán)重程度判斷、治療方案調(diào)整、預(yù)后情況判斷、危險因素分析提供幫助,在疾病的診治中,主要是在“治”中發(fā)揮重要作用。
COVID-19需要與常見的社區(qū)獲得性肺炎進(jìn)行鑒別診斷,針對這些社區(qū)獲得性肺炎病原體的檢測方法已經(jīng)較為成熟,包括核酸、抗原抗體等檢測技術(shù)。采取何種檢測方法,除考慮其本身的性能外,還需要考慮鑒別診斷的檢測速度與生物安全。我們認(rèn)為,由于COVID-19具有潛伏期長、可無癥狀傳播等特點(diǎn),對其進(jìn)行鑒別診斷有更高的要求,因此在發(fā)熱門診中除采用快速、準(zhǔn)確的檢測方法,如多聯(lián)檢測的膠體金方法外,更需要充分結(jié)合流行病史、臨床表現(xiàn)、影像學(xué)表現(xiàn)等綜合考慮。
COVID-19確定診斷中,核酸檢測具有多種優(yōu)勢,但是其主要問題是易受采樣、運(yùn)輸、試劑質(zhì)量及檢測技術(shù)等因素的影響出現(xiàn)假陰性結(jié)果。有學(xué)者認(rèn)為呼吸道樣本檢出率為肺組織>支氣管肺泡灌洗液>抽吸痰或鼻咽吸取物>鼻咽拭子或口咽拭子>鼻拭子[35],但我們認(rèn)為樣本取材部位應(yīng)該結(jié)合患者臨床情況及病程進(jìn)行分析,如患者臨床表現(xiàn)為明顯的病毒血癥,建議采集乙二胺四乙酸抗凝全血進(jìn)行核酸檢測,如病程尚在感染前期,尚未發(fā)展到病毒性肺炎,肺泡灌洗液樣本的檢出率未必高于鼻咽拭子,或者同步采集鼻咽拭子,以提高檢測的陽性率。由于SARS-CoV-2核酸檢測試劑為應(yīng)急審批,性能驗證可能尚不完善,應(yīng)對比多家試劑,并進(jìn)行性能驗證,各地臨床檢驗中心應(yīng)組織開展SARSCoV-2核酸檢測的實(shí)驗室間比對。COVID-19的治療還處于探索階段,各種抗病毒藥物(如抗人類免疫缺陷病毒藥物)的使用,對核酸檢測結(jié)果可能也有影響。
血清抗體檢測技術(shù)具有快速、簡便、操作性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),對于其抗原抗體交叉反應(yīng)等引起的假陽性問題,可在結(jié)果判讀時結(jié)合患者臨床表現(xiàn)盡量避免,COVID-19血清抗體檢測主要的問題應(yīng)該是窗口期的假陰性問題,即何時進(jìn)行血清抗體檢測,何時進(jìn)行第2次檢測,判斷4倍升高是亟需解決的問題,其IgM抗體、IgG抗體產(chǎn)生時間是否與其他病毒類似,目前也尚無有效方法加以判斷。
COVID-19明確診斷后,需要根據(jù)疾病嚴(yán)重程度選擇不同的治療方案,在疾病的治療過程中需要對組織臟器進(jìn)行功能監(jiān)測,從而不斷調(diào)整治療方案,治療過程中需要對疾病的風(fēng)險因素進(jìn)行評估,對患者預(yù)后進(jìn)行判斷。整個治療過程中都需要輔助診斷檢測技術(shù)給予幫助。
綜上所述,不同的實(shí)驗室檢測技術(shù)各有利弊,在COVID-19診斷中應(yīng)該聯(lián)合使用,取長補(bǔ)短,同時應(yīng)該綜合考慮患者的流行病學(xué)特征、病程、病史、用藥情況、臨床表現(xiàn)、影像學(xué)表現(xiàn)等,早發(fā)現(xiàn)、早治療。