裴宏亮 蔣蕰莙 樊慶文
【摘要】目前肺穿刺手術(shù)主要是醫(yī)生參考CT圖像信息憑借臨床經(jīng)驗(yàn)和主觀判斷進(jìn)行“盲穿”。在肺部穿刺過程中,穿刺針需要避開肺部大氣管、血管,否則會(huì)引起氣胸、肺出血等并發(fā)癥,嚴(yán)重時(shí)會(huì)導(dǎo)致病人死亡,而通過建立人體胸部器官和組織三維模型可以有效的解決上述問題,本文研究重點(diǎn)為肺氣管樹的提取。以華西醫(yī)院提供的人體斷層CT掃描切片集為源數(shù)據(jù),基于區(qū)域生長算法提取肺部大氣管。在包含主氣道的CT圖像中選擇氣道中心點(diǎn)作為種子像素點(diǎn),并設(shè)定閾值生長準(zhǔn)則將種子像素鄰域中與種子像素有相似性質(zhì)的像素歸并到種子像素所在的區(qū)域中,分割肺部大氣管。在雙線性插值后CT圖像的基礎(chǔ)上,使用直方圖均衡化原理,改進(jìn)區(qū)域生長算法,突出肺氣管壁邊界信息,提取肺氣管。改進(jìn)后的區(qū)域生長算法可以較好的解決區(qū)域生長算法普遍存在的生長泄漏現(xiàn)象,可以快速、完整地提取6級(jí)以下的肺氣管。為醫(yī)生進(jìn)行肺穿刺手術(shù)提供三維可視化的參考依據(jù),保證穿刺手術(shù)時(shí)可以有效的避開肺部大氣管,降低肺穿刺手術(shù)引發(fā)起的并發(fā)癥發(fā)病率與死亡率,具有重要的理論價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義。
【關(guān)鍵詞】肺穿刺;肺氣管樹;三維重建;區(qū)域生長
【中圖分類號(hào)】R32 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】ISSN.2095.6681.2020.21..03
根據(jù)國際癌癥研究機(jī)構(gòu)的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)[1-2]:2018年全球因肺癌死亡的人數(shù)高達(dá)180萬,占癌癥總死亡人數(shù)的18.4%,而且肺癌的發(fā)病人數(shù)還在逐年增加;由于工業(yè)發(fā)展、環(huán)境破壞和人口基數(shù)過大等一系列原因,全球超過半數(shù)的癌癥死亡人數(shù)和接近一半的癌癥發(fā)病人數(shù)出現(xiàn)在亞洲地區(qū),其中肺癌仍是該地區(qū)癌癥患者中的頭號(hào)殺手,對(duì)肺癌的檢查和預(yù)防在國內(nèi)逐漸被人們重視起來。用于判斷肺占位性質(zhì)是否為惡性腫瘤(肺癌)的方法[3-4]主要包括:放射學(xué)檢查、痰細(xì)胞學(xué)檢查、支氣管鏡檢查、縱隔鏡檢查以及病理檢查等。其中準(zhǔn)確判斷是否為肺癌最直接、最常用的方法依然是病理檢查,也就是肺部穿刺手術(shù)[5-8]。肺穿刺手術(shù)時(shí),穿刺針需要穿透肌肉組織、肺部組織達(dá)到病灶位置,提取出病變組織。目前,肺部穿刺手術(shù)主要依靠醫(yī)生參考CT圖片的信息憑借臨床經(jīng)驗(yàn)和主觀判斷進(jìn)行“盲穿”。在肺部穿刺手術(shù)過程中,穿刺針需要避開肋骨、肺部大氣管、肺部血管、否則會(huì)引起氣胸、肺出血等嚴(yán)重并發(fā)癥,嚴(yán)重時(shí)會(huì)導(dǎo)致病人死亡。
利用CT圖像對(duì)人體肺部器官和組織進(jìn)行三維重建[9-11],特別是重建肺部的氣管,為醫(yī)生進(jìn)行肺穿刺手術(shù)提供三維可視化的參考依據(jù),指導(dǎo)醫(yī)生從三維角度對(duì)病情進(jìn)行全面準(zhǔn)確的觀察分析,以設(shè)計(jì)精確的治療方案,保證穿刺手術(shù)時(shí)可以有效的避開肺部大氣管,降低肺穿刺手術(shù)引發(fā)起的并發(fā)癥發(fā)病率與死亡率,具有重要的理論價(jià)值和現(xiàn)實(shí)意義。
1 基于區(qū)域生長算法提取肺氣管
區(qū)域生長算法是提取肺氣管時(shí)最常用的圖像處理方法[12-14],其原理是根據(jù)圖像像素及其空間鄰域像素之間的關(guān)系來進(jìn)行肺氣管提取;利用傳統(tǒng)的區(qū)域生長算法對(duì)肺氣管進(jìn)行提取時(shí),可以有效地避免其他圖像提取算法不能利用圖像空間信息的缺點(diǎn),區(qū)域生長算法提取肺氣管的流程圖如圖1所示,該算法的兩個(gè)關(guān)鍵步驟為:生長種子點(diǎn)選擇與生長準(zhǔn)則制定。
1.1 生長種子點(diǎn)選擇
區(qū)域生長種子點(diǎn)是氣管區(qū)域生長起始位置,一般選取氣管特征明顯區(qū)域的某一個(gè)像素作為種子點(diǎn)。我們選擇氣管半徑較大,顯示效果較好的某一層主氣道的中心點(diǎn)作為為生長種子點(diǎn)。
1.2 生長準(zhǔn)則制定
區(qū)域生長的準(zhǔn)則就是根據(jù)圖像像素值之間的連續(xù)性制定的一些相似性(灰度值、紋理以及顏色等信息)生長準(zhǔn)則,決定將哪些像素納入到生長區(qū)域中,若生長準(zhǔn)則制定過于寬松,會(huì)將圖像中其他器官圖像像素納入到生長區(qū)域,導(dǎo)致生長泄露;若生長準(zhǔn)則制定的過于嚴(yán)謹(jǐn),則會(huì)出現(xiàn)欠生長情況。由于肺氣道內(nèi)充盈著空氣,閾值較小,與氣管壁之間存在相對(duì)較高的對(duì)比度,故而采用閾值范圍作為氣管提取的生長準(zhǔn)則,滿足設(shè)定閾值范圍的像素為氣管像素,否則認(rèn)為是其他組織像素。
由于原CT圖像的分辨率較低(512×512),使用區(qū)域生長算法只能將原CT圖像中4級(jí)以下較大氣管完整的提取出來,丟失了很多支氣管細(xì)節(jié),如圖2所示。
當(dāng)生長閾值范圍過大時(shí),會(huì)出現(xiàn)嚴(yán)重的生長泄漏現(xiàn)象,導(dǎo)致提取失敗,如圖3所示。為了解決上述問題,采用以下幾種圖像處理方法對(duì)區(qū)域生長算法進(jìn)行改進(jìn)。
2 基于區(qū)域生長算法改進(jìn)
2.1 圖像雙線性插值改進(jìn)算法
由于原CT圖像分辨率較低(512×512),高級(jí)數(shù)支氣管所占的像素個(gè)數(shù)過少,有的位置甚至占不到一個(gè)像素,導(dǎo)致使用區(qū)域生長算法對(duì)原CT圖像進(jìn)行氣管提取時(shí),提取的支氣管數(shù)量較少,更小的細(xì)節(jié)提取不出來。為了能提取到更高級(jí)數(shù)的氣管,使用雙線性插值法[15-16]將原CT圖像轉(zhuǎn)為高分辨率圖像(1024×1024),增加高級(jí)數(shù)肺氣管氣道所占有的像素個(gè)數(shù)。
在Matlab軟件中對(duì)高分辨率圖像進(jìn)行氣管提取實(shí)驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn):使用區(qū)域生長算法對(duì)插值細(xì)化后的CT圖像進(jìn)行氣管提取時(shí),可以有效的提高細(xì)小支氣管的數(shù)量與氣管提取級(jí)數(shù),但由于噪聲、偽影以及部分容積作用的影響,使得在細(xì)小的支氣管壁處會(huì)出現(xiàn)模糊甚至斷裂情況(如圖4所示),導(dǎo)致在提取到該位置時(shí)依然會(huì)發(fā)生生長泄漏現(xiàn)象(提取到肺實(shí)質(zhì)區(qū)域)。
經(jīng)過多組氣管提取實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:不同范圍的生長閾值,導(dǎo)致的泄漏位置與泄漏范圍大小不同。閾值范圍選擇25~49時(shí),氣管生長泄漏如圖5(a)所示;閾值范圍選擇15~49時(shí),氣管的生長泄漏如圖5(b)所示;閾值范圍選擇0~49時(shí),氣管的生長泄漏如圖5(c)所示。使用區(qū)域生長算法對(duì)插值細(xì)化后的高分辨率CT圖像進(jìn)行肺氣管提取實(shí)驗(yàn)時(shí),不管選擇什么范圍的生長閾值,都會(huì)出現(xiàn)生長泄露現(xiàn)象,導(dǎo)致氣管提取失敗。
2.2 直方圖均衡化改進(jìn)算法
通過CT掃描獲得的原始人體CT圖像的灰度分布集中在狹窄的區(qū)間內(nèi),對(duì)比度非常弱,細(xì)小支氣管壁處的細(xì)節(jié)不清楚,且容易發(fā)生氣管壁斷裂現(xiàn)象。細(xì)小支氣管壁薄弱導(dǎo)致的圖像中氣管壁局部斷裂是生長泄漏的主要原因。此時(shí),可以采用圖像直方圖均衡化處理的方法來改進(jìn)區(qū)域生長算法。經(jīng)過直方圖均衡化處理后的CT圖像灰度間距被拉開,圖像反差加大,圖像中氣管壁邊界信息被突出,從而達(dá)到提高圖像對(duì)比度、改善圖像質(zhì)量的目的。CT圖像局部支氣管圖像直方圖均衡化前后的對(duì)比如圖6所示。
從上圖可以看出,經(jīng)過處理后的圖像直方圖分布更為均勻,原圖像中包含像素?cái)?shù)較多的灰度級(jí)間隔被拉大,實(shí)際視覺能夠接收的信息量大大增強(qiáng),圖像中氣管壁與氣道對(duì)比度更高。經(jīng)多組氣管提取實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,使用該方法改進(jìn)域生長算法可有效地防止區(qū)域生長算法在提取肺氣管時(shí)普遍存在在生長泄漏的現(xiàn)象,提取效果較好,提取級(jí)數(shù)可達(dá)到6級(jí),如圖7所示。
3 肺氣管的三維重建
通過上述方法提取得到氣管圖像為軸位掃描CT切片上的400張二維氣管二值圖像。氣管的二維圖像不能直觀的體現(xiàn)出氣管的結(jié)構(gòu),所以需要將這些提取的二維氣管圖像進(jìn)行三維重建,重建方法如下。
首先將提取的400張肺氣管二維圖像構(gòu)造為一個(gè)三維矩陣MAT,得到的數(shù)據(jù)集MAT是一個(gè)x×y×400的矩陣;然后利用find函數(shù)找到三維矩陣中為1(氣管像素)的位置坐標(biāo),并使用函數(shù)plot3對(duì)這些肺氣管像素點(diǎn)進(jìn)行三維點(diǎn)云構(gòu)建,如圖7所示;最后將肺氣管的三維點(diǎn)云坐標(biāo)數(shù)據(jù)導(dǎo)入CATIA軟件的“Digitized Shape Editor”模塊,進(jìn)行去除噪音、數(shù)據(jù)插補(bǔ)、數(shù)據(jù)平滑、網(wǎng)格化、曲面擬合處理,得到肺氣管的三維實(shí)體模型,如圖8所示。
4 結(jié) 論
根據(jù)四川大學(xué)華西醫(yī)院提供的患者胸部CT切片,利用區(qū)域生長原理,提取出了肺部大氣管。使用雙線性差值以及直方圖均衡化原理,改進(jìn)了區(qū)域生長算法,突出肺氣管壁邊界信息,改進(jìn)后的區(qū)域生長算法可以較好的解決了區(qū)域生長算法提取肺氣管時(shí)普遍存在的生長泄漏現(xiàn)象?;趨^(qū)域生長算法運(yùn)算速度快,提取的肺氣管連續(xù)完整,能夠有效地提取6級(jí)以下的肺部大氣管。
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