劉權(quán)偉 李婷婷 勵(lì)建榮*
(1 渤海大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院 生鮮農(nóng)產(chǎn)品貯藏加工及安全控制技術(shù)國(guó)家地方聯(lián)合工程研究中心遼寧省食品安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 遼寧省高等學(xué)校生鮮食品產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究院 遼寧錦州121013 2 大連民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 遼寧大連116600)
抗菌肽(Antimicrobial peptides)是先天免疫系統(tǒng)中至關(guān)重要的一部分, 它是生物體為抵抗病原微生物入侵,從而形成具有抗菌作用的短肽[1-2]。瑞典科學(xué)家Steiner 等[3]早在1981年就從羅賓蛾(Hyalophoracecropia)中得到具有殺菌活性的短肽Cecropin。 之后,人們陸續(xù)從各種生物體中分離出具有抑菌效果的短肽[4]。由于抗菌肽引起細(xì)胞死亡的機(jī)制不是與細(xì)胞膜上的特定受體結(jié)合, 而是與膜磷脂的非特異性相互作用[5],所以抗菌肽產(chǎn)生耐藥性的幾率較小[6-7]。 同時(shí),抗菌肽還具有抗菌譜廣,殺菌活力強(qiáng)等特點(diǎn),被認(rèn)為是能夠替代抗生素的首選藥物,具有良好的應(yīng)用前景[8]。 人們通過(guò)對(duì)已有抗菌肽的探索, 發(fā)現(xiàn)大多數(shù)天然抗菌肽具有兩個(gè)相同的特征,首先基本是陽(yáng)離子類型,其次,它主要是一種對(duì)水和脂類都有親和力的兩親結(jié)構(gòu)[9]。 經(jīng)過(guò)大量研究,雖然抗菌肽的殺菌機(jī)理尚未明確, 但大多數(shù)抗菌肽被認(rèn)為作用于細(xì)菌細(xì)胞膜上,發(fā)揮抑菌作用[10]。 另外,抗菌性與抗菌肽肽鏈形成的二級(jí)結(jié)構(gòu)以及抗菌肽的生物學(xué)特性等方面也有關(guān)系。 例如含α-螺旋的抗菌肽通常會(huì)穿透細(xì)菌細(xì)胞膜的磷脂雙分子層,導(dǎo)致跨膜電位消散,最終殺死細(xì)菌[11]。
鯰魚(yú)(Clarias fuscus)屬于魚(yú)綱鯰形目鯰科,多數(shù)生活在海水的中、下部,適應(yīng)生存環(huán)境能力較強(qiáng)。 與其它類型的魚(yú)相比,當(dāng)周圍環(huán)境惡劣時(shí),鯰魚(yú)的體表黏液和內(nèi)臟會(huì)應(yīng)激形成一些抗菌活性物質(zhì), 尤其是在受傷之后這種活性物質(zhì)的產(chǎn)量顯著增多[12]。 表皮分泌的黏液是魚(yú)類天然免疫的重要部分[13-14],它主要通過(guò)表皮杯狀或黏液細(xì)胞產(chǎn)生的大分子蛋白發(fā)揮作用[15-16]。 早在1988年,Austin 等[17]初次報(bào)道了虹鱒魚(yú)表皮黏液對(duì)傳染性病原體有顯著的抑制作用, 激發(fā)了研究人員對(duì)魚(yú)類表皮黏液的研究熱情。 Park 等[18]發(fā)現(xiàn)鯰魚(yú)受傷后能夠分泌抗菌肽,Su 等[19]在黃鯰魚(yú)體表黏液中也分離到抗菌肽。 本實(shí)驗(yàn)室研究人員前期[20]從鯰魚(yú)體表黏液粗提物中共分離獲得4 個(gè)抗菌肽氨基酸片段,即:片段1:RLKEKNKA;片段2:RIVELTLPRVSVRL;片段3:KQEIILKF;片段4:RQIKIXRR。 使用這4個(gè)氨基酸片段, 通過(guò)固相合成法合成相對(duì)應(yīng)的抗菌肽凍干粉。 試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),4 個(gè)氨基酸片段中,由片段2 氨基酸序列合成的抗菌肽抑菌效果最為顯著,具有繼續(xù)研究的價(jià)值。
本文以此段合成抗菌肽為研究對(duì)象, 以腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌為檢測(cè)菌株, 驗(yàn)證了該新型魚(yú)源抗菌肽的抗菌活性, 并對(duì)其抑菌機(jī)理進(jìn)行研究。
腐敗希瓦氏菌、大腸桿菌,渤海大學(xué)食品安全實(shí)驗(yàn)室保存;抗菌肽(RIVELTLPRVSVRL,純度97.775%),合成于上海生物工程公司;營(yíng)養(yǎng)肉湯、平板計(jì)數(shù)培養(yǎng)基、LB 營(yíng)養(yǎng)瓊脂, 青島海博生物技術(shù)有限公司;GENMED 正苯基萘胺攝入法細(xì)菌膜損傷熒光檢測(cè)試劑盒, 上海杰美基因醫(yī)藥科技有限公司。
PE Victor X3 多功能酶標(biāo)儀, 美國(guó)鉑金埃爾默儀器;970CRT 熒光分光光度計(jì),上海精密科學(xué)儀器有限公司;E-1045 鍍金儀,日本日立公司;S-4800 掃描電鏡,日本日立公司;SW-CJ-2FD 超凈工作臺(tái),蘇景集團(tuán)蘇州安泰技術(shù)有限公司;Biofuge stratus 臺(tái)式高速離心機(jī), 美國(guó)Thermo Fisher 公司。
1.3.1 理化特性預(yù)測(cè) 通過(guò)抗菌肽數(shù)據(jù)庫(kù)APD(http://aps.unmc.edu/AP/main.php)預(yù)測(cè)抗菌肽的理化特性。 進(jìn)入官網(wǎng)后點(diǎn)擊“CalcuLation & Prediction”, 輸入氨基酸序列進(jìn)行預(yù)測(cè)。 使 用HeliQuest 軟件(http://heliquest.ipmc.cnrs.fr/)對(duì)抗菌肽序列進(jìn)行螺旋輪作圖分析。
1.3.2 抗菌肽抗菌活性試驗(yàn) 采用瓊脂平板擴(kuò)散法測(cè)定其抑菌效果[21]。
1.3.2.1 抑菌活性驗(yàn)證試驗(yàn) 采用牛津杯法[22]。將滅過(guò)菌的牛津杯置于無(wú)菌平板上, 并將15 mL 含測(cè)試菌的瓊脂培養(yǎng)基 (培養(yǎng)基中含菌量約為106CFU/mL)倒入每個(gè)平板中,待培養(yǎng)基凝固后取出牛津杯, 向每個(gè)孔中分別加入體積為100 μL,質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.0%的抗菌肽溶液。 最后將平板置于37°C 的恒溫培養(yǎng)箱孵育,24 h 后觀察并測(cè)量抑菌圈的直徑。 測(cè)量3 次,取平均值。
1.3.2.2 抑菌活性穩(wěn)定性 將1.3.2.1 步驟中的平板置于37°C 恒溫培養(yǎng)箱中,觀察7 d 內(nèi)抑菌圈的變化情況。
1.3.2.3 最小抑菌濃度(MIC)測(cè)定 采用微量稀釋法測(cè)定[23]。 將培養(yǎng)至指數(shù)期的細(xì)菌生長(zhǎng)液按照50 μL/孔的用量添至96 孔細(xì)胞培養(yǎng)板中,并將50 μL 經(jīng)二倍稀釋的抗菌肽添至每個(gè)孔,使各孔中抗菌肽的終質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為0.500%,0.250%,0.125%,0.063%,0.032%,0.016%。 使用50 μg/mL氨芐青霉素作為陽(yáng)性對(duì)照, 將等體積的無(wú)菌去離子水作陰性對(duì)照。 將培養(yǎng)板置于37 ℃孵育10 h,用酶標(biāo)儀測(cè)定OD595值。 通過(guò)比較測(cè)量值,選擇與陽(yáng)性對(duì)照沒(méi)有明顯差異的最低濃度作為抗菌肽針對(duì)細(xì)菌的最小抑菌濃度。 獨(dú)立測(cè)定3 次, 取平均值。
1.3.3 細(xì)菌生長(zhǎng)曲線 將100 μL 活化的腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌接種于LB 肉湯培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至含量為106CFU/mL。 按照2%的接種量,分別將腐敗希瓦氏菌、大腸桿菌接種至新的營(yíng)養(yǎng)肉湯。分別取2 mg 抗菌肽加入適量測(cè)定組菌液中 (60 μL的50%二甲基亞砜中助溶),使最終抗菌肽質(zhì)量為0.5%??瞻捉M加入等量同濃度的二甲基亞砜,搖床培養(yǎng)(37°C,160 r/min),每隔2 h 測(cè)定1 次其在波長(zhǎng)595 nm 處的吸光值。 橫坐標(biāo)為培養(yǎng)時(shí)間,縱坐標(biāo)為OD595測(cè)量值,繪制細(xì)菌生長(zhǎng)曲線。
1.3.4 掃描電鏡觀察 取適量腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌過(guò)夜培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期, 加入抗菌肽使其終質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.5%,于37°C 繼續(xù)培養(yǎng)12 h。將培養(yǎng)完成的細(xì)菌懸浮液置于離心管中, 以4 000 r/min 離心10 min。隨后,先將離心的沉淀部分用無(wú)菌水洗滌,再將其置于2.5%戊二醛磷酸緩沖液中固定12 h,用無(wú)菌水洗滌3 次,每次10 min。 洗滌后,將細(xì)菌沉淀懸浮在無(wú)菌水中, 取適量滴在干凈的蓋玻片上,冷凍干燥處理12 h。通過(guò)電鏡掃描觀察腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌的形態(tài)、結(jié)構(gòu)變化。
1.3.5 細(xì)菌外膜通透性的測(cè)定 根據(jù)GENMED正苯基萘胺攝入法, 研究鯰魚(yú)體表黏液抗菌肽對(duì)細(xì)菌外膜通透性的影響。 參考細(xì)菌膜損傷熒光檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書(shū),步驟如下:
1)移取1 mL 新鮮菌液(OD600= 0.5)到新的1.5 mL 離心管;
2)放入微型臺(tái)式離心機(jī)離心,轉(zhuǎn)速13 000 r/min,離心時(shí)長(zhǎng)1 min,小心抽去上清液;
3)加 入1 mL GENMED 緩沖液(Reagent A),充分混勻;
4)將其置于13 000 r/min 的微型離心機(jī),離心1 min,小心取出上清液;
5)重復(fù)步驟3)~4)1 次;
6)加入1 mL GENMED 緩沖液(Reagent A),充分混勻;
7)抽取150 μL 菌液加入96 孔板中;
8)加入45 μL 0.5%抗菌肽和5 μL GENMED 染色液(Regent B)混勻,放入25 °C 培養(yǎng)箱培養(yǎng)5 min;
9)快速放入熒光分光光度計(jì)測(cè)定熒光單位(設(shè)置激發(fā)波長(zhǎng)355 nm,散發(fā)波長(zhǎng)460 nm);
10)比較不同樣品細(xì)菌的膜損傷程度。
采用970CRT 熒光分光光度計(jì)測(cè)定, 將其參數(shù)設(shè)置為:靈敏度3,掃描速度為高速,EX 縫寬10 nm,EM 縫寬10 nm。
1.3.6 抗菌肽的圓二色譜測(cè)定 將抗菌肽溶解于模擬細(xì)胞膜疏水環(huán)境的PB 緩沖液和2.5%SDS 緩沖液中, 制成一定濃度的抗菌肽溶液。 于室溫測(cè)定,石英樣品池的光程為0.1 cm,帶寬1.0 nm,分辨率0.5 nm, 掃描測(cè)定波長(zhǎng)范圍190~250 nm,掃描速度50 nm/min。圓二色性通過(guò)平均殘基摩爾橢圓率來(lái)表示。
表1 抗菌肽屬性預(yù)測(cè)Table 1 Prediction of the properties of antimicrobial peptides
物性預(yù)測(cè)顯示: 該抗菌肽氨基酸數(shù)為14,疏水率50%,凈電荷2 z,相對(duì)分子質(zhì)量1 651.034,分子式為C74H135N23O19S0, 蛋白結(jié)合勢(shì)為1.83 kcal/mol。 如圖預(yù)測(cè)顯示該序列多肽可以形成α 螺旋,在同一疏水表面的氨基酸殘基不少于2 個(gè)。 綜合理化性質(zhì)預(yù)測(cè)表明所合成的多肽具有與細(xì)胞膜相互作用的潛力, 且和APD 數(shù)據(jù)庫(kù)中的抗菌肽AP00450 相似度高達(dá)40%。
根據(jù)ExPASy (The Expert Protein Analysis System)蛋白質(zhì)組學(xué)分析網(wǎng)站提供的在線服務(wù)軟件進(jìn)行螺旋輪圖分析(http://heliquest.ipmc.cnrs.fr/)結(jié)果表明該抗菌肽7 個(gè)疏水殘基中有4 個(gè)在同一表面,親水殘基在相反的位置,預(yù)測(cè)該抗菌肽可能形成一種兩親性結(jié)構(gòu)。研究表明,在目前已知的抗菌肽中,它們氨基酸序列的同源性較低。在陽(yáng)離子型抗菌肽中,它們通常由12 至45 個(gè)氨基酸組成,相對(duì)分子質(zhì)量在5 ku 以下, 最少具有兩個(gè)凈正電荷,具有陽(yáng)離子特征和兩親性[24]。 本試驗(yàn)合成肽鏈物性預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)均符合抗菌肽理化特性。
圖1 抗菌肽的螺旋輪分布Fig.1 Helix distribution of antimicrobial peptides
2.2.1 抑菌活性驗(yàn)證 圖2 顯示1.0%的抗菌肽水溶液對(duì)腐敗希瓦氏菌及大腸桿菌的抑制效果??梢钥闯?, 抗菌肽對(duì)腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌表現(xiàn)出顯著的抑菌活性, 抑菌圈大小分別為15.15 mm 和16.56 mm。
圖2 抗菌肽對(duì)細(xì)菌的抑制作用Fig.2 The inhibitory effect of antimicrobial peptides on bacteria
2.2.2 抑菌活性穩(wěn)定性 在上述抗菌活性驗(yàn)證試驗(yàn)基礎(chǔ)上,觀察抗菌肽7 d 內(nèi)抑菌圈的變化。 觀測(cè)結(jié)果表明抑菌圈的大小沒(méi)有明顯變化, 表示抗菌肽的殺菌穩(wěn)定性較好。
2.2.3 最小抑菌濃度 分別將經(jīng)抗菌肽處理的腐敗希瓦氏菌及大腸桿菌菌懸液置于酶標(biāo)儀上測(cè)定其在波長(zhǎng)595 nm 處的吸光度值。 結(jié)果腐敗希瓦氏菌、大腸桿菌的最小抑菌質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為0.063%,0.032%。
在不同的生長(zhǎng)階段, 微生物中細(xì)菌懸浮液的吸光度值在一定波長(zhǎng)范圍變化, 并且細(xì)菌懸浮液的濃度與吸光度值成正比。 細(xì)菌生長(zhǎng)可通過(guò)細(xì)菌懸浮液吸光度曲線的趨勢(shì)來(lái)判斷[25]。 圖3 顯示抗菌肽對(duì)細(xì)菌生長(zhǎng)曲線的影響。 兩種指示菌經(jīng)抗菌肽處理后生長(zhǎng)曲線與正常培養(yǎng)的對(duì)照組差異明顯。 對(duì)照組10 h 后呈對(duì)數(shù)增長(zhǎng),20 h 后達(dá)到穩(wěn)定狀態(tài); 而試驗(yàn)組經(jīng)抗菌肽處理, 細(xì)菌未呈對(duì)數(shù)增長(zhǎng),且整體數(shù)量較少,說(shuō)明抗菌肽對(duì)細(xì)菌的生長(zhǎng)抑制作用顯著。
圖3 抗菌肽對(duì)細(xì)菌生長(zhǎng)曲線的影響Fig.3 Effects of antimicrobial peptides on the growth curves of bacteria
通過(guò)觀察圖4 和圖5 可知, 未經(jīng)抗菌肽處理的指示菌形態(tài)飽滿,表面光滑且未變形,菌體無(wú)缺損;而經(jīng)0.5%抗菌肽處理12 h 后,菌體發(fā)生扭曲變形,內(nèi)部出現(xiàn)凹陷,且細(xì)胞膜表面粗糙、皺縮,并出現(xiàn)孔洞,導(dǎo)致內(nèi)容物大量泄漏,失去規(guī)則的形態(tài)結(jié)構(gòu)。 這說(shuō)明該抗菌肽可能是通過(guò)破壞細(xì)菌的細(xì)胞膜,導(dǎo)致細(xì)菌內(nèi)容物外泄,從而達(dá)到殺死細(xì)菌的目的。 魏曉曉等[26]用掃描電鏡觀察,修飾后的牛血紅蛋白源抗菌肽JH-3 可引起金黃色葡萄球菌表面皺縮,在大腸桿菌表面形成通道;而謝海偉等[27]發(fā)現(xiàn)合成的鱟素抗菌肽可使大腸桿菌等細(xì)菌細(xì)胞的微觀結(jié)構(gòu)發(fā)生改變, 細(xì)胞表面可觀測(cè)到坍塌和破裂現(xiàn)象。
圖4 抗菌肽處理腐敗希瓦氏菌的掃描電鏡圖Fig.4 SEM of S. putrefaciens treated with antimicrobial peptides
圖5 抗菌肽處理大腸桿菌的掃描電鏡圖Fig.5 SEM of E. coli treated with antimicrobial peptides
通??咕牡囊志^(guò)程首先是穿過(guò)細(xì)胞壁接觸細(xì)菌細(xì)胞膜, 然后使氨基酸殘基與磷脂雙分子層在靜電作用下發(fā)生結(jié)合, 抗菌肽將疏水端插入細(xì)胞膜的疏水區(qū)域來(lái)改變膜的結(jié)構(gòu), 破壞細(xì)菌細(xì)胞膜的完整性,最終達(dá)到抑菌效果[28]。 革蘭氏陰性細(xì)菌的外膜可防止一些物質(zhì)損害細(xì)胞膜的脂多糖和膜蛋白,對(duì)細(xì)菌細(xì)胞起到保護(hù)作用。正苯基萘胺(1-N-phenyl-naphtylamine,NPN)是一種疏水性(hydrophobic)熒光探針,在磷脂環(huán)境下產(chǎn)生強(qiáng)烈藍(lán)色熒光。 完整的細(xì)菌細(xì)胞外膜對(duì)正苯基萘胺進(jìn)行排斥,一旦膜遭到損害,正苯基萘胺便可進(jìn)入膜磷脂層,從而增強(qiáng)熒光現(xiàn)象,這種熒光現(xiàn)象的強(qiáng)、弱成為常用的評(píng)價(jià)細(xì)胞膜損傷程度的熒光檢測(cè)信號(hào)[29]。 抗菌肽對(duì)兩種指示菌外膜損傷的作用見(jiàn)圖6,與李婷婷等[30]研究結(jié)果類似,添加抗菌肽后,兩組指示菌試驗(yàn)組熒光值比對(duì)照組顯著提高(P<0.05),說(shuō)明指示菌外膜受到損傷,表明抗菌肽通過(guò)損害細(xì)菌細(xì)胞外膜使其死亡。
圖6 抗菌肽對(duì)細(xì)菌外膜通透性的影響Fig.6 Effect of antimicrobial peptides on the permeation of bacteria outer membrane
與抗菌肽的氨基酸殘基排列順序相比, 其二級(jí)或高級(jí)結(jié)構(gòu)在研究它們的生物學(xué)功能方面更加重要。 通過(guò)圓二色譜的測(cè)定獲得抗菌肽二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋(α-helix)、β-折疊(beta-pleated sheet)、轉(zhuǎn)角(turn)和不規(guī)則卷曲(Random coil)比例。
在該試驗(yàn)中,使用JASCO 715 圓二色譜儀鑒定在不同緩沖液中抗菌肽的二級(jí)結(jié)構(gòu)。 與王超煒等[31]測(cè)定結(jié)果相符,圖7a 顯示,在PBS 緩沖液中,抗菌肽在波長(zhǎng)200 nm 附近有負(fù)的譜帶,表面抗菌肽在緩沖液中為無(wú)規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu); 圖7b 顯示,當(dāng)周圍環(huán)境替換為模擬膜環(huán)境時(shí)(2.5% SDS 溶液),在波長(zhǎng)192 nm 附近,抗菌肽有正的譜帶,而在波長(zhǎng)208 nm 和222 nm 附近有兩個(gè)負(fù)的譜帶, 表面抗菌肽在模擬膜環(huán)境時(shí)出現(xiàn)典型的α-螺旋結(jié)構(gòu)。根據(jù)相關(guān)報(bào)道,二級(jí)結(jié)構(gòu)中具有α-螺旋的抗菌肽多數(shù)以桶形模型對(duì)細(xì)菌細(xì)胞膜進(jìn)行滲透, 進(jìn)而殺死細(xì)菌[32]。 綜合上述結(jié)果推斷鯰魚(yú)體表黏液抗菌肽憑借桶板模型機(jī)制到達(dá)抑菌作用。
圖7 抗菌肽在不同緩沖溶液中的圓二色譜圖Fig.7 Circular dichroism of antimicrobial peptides in different buffer solutions
體外合成的來(lái)源于鯰魚(yú)體表黏液的抗菌肽對(duì)腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌均有較為明顯的殺菌作用。 該新型抗菌肽對(duì)腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌的生長(zhǎng)均有明顯抑制作用, 且最小抑菌質(zhì)量分?jǐn)?shù)分別為0.063%和0.032%。 抑菌機(jī)理研究發(fā)現(xiàn),抗菌肽對(duì)腐敗希瓦氏菌和大腸桿菌的細(xì)胞膜、 細(xì)胞壁造成明顯的損傷, 嚴(yán)重破壞微生物的細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)。 此外, 抗菌肽還通過(guò)增加細(xì)菌細(xì)胞外膜通透性, 使體內(nèi)的物質(zhì)發(fā)生泄漏。 該抗菌肽在2.5%SDS 溶液中呈典型的α-螺旋結(jié)構(gòu)。
該新型鯰魚(yú)體表黏液抗菌肽雖然對(duì)多種細(xì)菌有殺傷作用,但是殺菌效率仍有待提高。以該序列為模板,通過(guò)在特定位置刪減、增添優(yōu)勢(shì)氨基酸或者雜合組成新的抗菌肽, 有望在很大程度上提高抗菌肽的抑菌效率。此外,從自然源分離抗菌肽成本較高, 分離過(guò)程復(fù)雜。 而化學(xué)合成肽的價(jià)格昂貴、安全性低,這些都限制了抗菌肽的發(fā)展。 依靠基因工程技術(shù)實(shí)現(xiàn)抗菌肽的高效生產(chǎn)將成為新的研究熱點(diǎn)。