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        小麥種質(zhì)資源BJ399抗條銹病基因的分子標(biāo)記定位

        2020-08-01 01:21:18周喜旺劉鴻燕魏志平王曉明張耀輝岳維云汪石俊曹世勤宋建榮
        麥類作物學(xué)報(bào) 2020年6期
        關(guān)鍵詞:小種條銹病抗病

        周喜旺,劉鴻燕,王 娜,魏志平,王曉明,張耀輝,岳維云,汪石俊,曹世勤,宋建榮

        (1.天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,甘肅天水 741001; 2.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,甘肅蘭州 730070)

        小麥條銹病是由專性寄生菌條形柄銹菌(Pucciniastriiformisf.sp.tritici)引起的全世界范圍內(nèi)小麥上的最主要病害,小麥條銹菌新小種的出現(xiàn)是導(dǎo)致小麥品種抗銹性喪失的主要原因[1]。目前,新毒性小種CYR34已成為甘肅省的第一流行小種[2-3],使甘肅隴南小麥生產(chǎn)上利用的含有Yr10和Yr26基因的抗源或品種抗病性逐漸喪失[4-5],而新的抗源材料又嚴(yán)重缺乏,因此,發(fā)掘新抗源并加以有效利用,對控制該區(qū)小麥條銹病發(fā)生流行及小麥安全生產(chǎn)具有重要意義。

        迄今為止,國際上已在82個(gè)位點(diǎn)正式命名了85個(gè)抗條銹病基因[6](Yr1~Yr82,其中Yr3有3個(gè)等位基因,Yr4有2個(gè)等位基因),如Yr65[7]、Yr76[8]、Yr78[9]和Yr80[10]等為近年定位的抗病基因。由于小麥條銹病菌的高度變異性, 許多曾在小麥生產(chǎn)上發(fā)揮重大作用的抗病基因已喪失抗性,目前僅有全生育期抗銹基因Yr5、Yr15和Yr61對當(dāng)前條銹菌流行小種CYR32、CYR33和CYR34具有一定的抗病性[11],成株期抗銹基因Yr18具有相對持久的抗條銹性[12-13]。分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,為抗病基因的檢測、標(biāo)記及定位提供了可能,其中SSR標(biāo)記由于其位點(diǎn)豐富、操作簡單、重復(fù)性好、多為共顯性、實(shí)驗(yàn)成本低等諸多優(yōu)點(diǎn)[14],被廣泛應(yīng)用于小麥抗病基因定位和分子標(biāo)記輔助育種。

        小麥種質(zhì)資源BJ399是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物所從歐洲引進(jìn)的普通小麥品種,農(nóng)藝性狀優(yōu)良。在天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所甘谷試驗(yàn)站經(jīng)連續(xù)多年田間抗病性鑒定,發(fā)現(xiàn)該品種整個(gè)生育期對田間自然誘發(fā)的條銹病表現(xiàn)免疫至近免疫,對白粉病表現(xiàn)高抗?;诖?,本研究利用條銹菌生理小種CYR34對其雜交后代群體進(jìn)行遺傳分析和抗條銹病基因染色體定位,旨在明確BJ399的抗條銹病遺傳基礎(chǔ),為該抗源在甘肅隴南地區(qū)的有效利用提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試材料

        利用抗條銹病材料BJ399和感病品種銘賢169配制雜交組合,分別獲得F1、F2和BC1代材料,以上材料均由天水市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所中梁試驗(yàn)站提供;供試菌種為生理小種CYR34的單孢菌系,由甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所小麥病害課題組提供。

        1.2 苗期條銹病抗性鑒定

        將試驗(yàn)材料播于白色塑料缽內(nèi),待幼苗長至2葉1心期,采用抖孢子粉法接種條銹菌單孢菌系CYR34,接種后幼苗置于10 ℃黑暗條件下保濕24 h,之后置于溫室(平均溫度12~18 ℃,光照10~12 h/d,光強(qiáng)5 000~8 000 lx)誘導(dǎo)發(fā)病,待感病對照品種銘賢169充分發(fā)病后,調(diào)查親本和后代材料的反應(yīng)型,反應(yīng)型記載采用0、0;、 1、 2、3、4共6級標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行[15]。用卡方測驗(yàn)進(jìn)行適合度檢測,以明確BJ399對生理小種CYR34的抗病基因數(shù)、互作方式及抗病特點(diǎn)。

        1.3 基因組DNA的提取和抗感池的構(gòu)建

        采用改良的CTAB法[16-17]提取兩親本和F2代分離群體單株的基因組DNA。用分離群體分組分析法(bulked segregation analysis,BSA)鑒定與抗病基因連鎖的微衛(wèi)星標(biāo)記。根據(jù)抗病性鑒定結(jié)果,建立抗感池,將10株高抗單株DNA等量混合構(gòu)成抗病池,10株高感單株DNA等量混合構(gòu)成感病池。

        1.4 SSR分析

        小麥SSR引物根據(jù)R?der等[18]、Pestsova等[19]、Song等[20]和Somers等[21]報(bào)道的序列從https://wheat.pw.usda.gov網(wǎng)站查找并由北京賽百盛公司合成,以抗病親本、感病親本、抗病池、感病池的DNA為模板篩選SSR引物,尋找在抗病親本、抗病池、感病親本、感病池間有多態(tài)性的引物,進(jìn)一步將多態(tài)性引物在F2代分離群體中分析驗(yàn)證,檢測SSR標(biāo)記與抗病基因的連鎖程度。初步確定抗病基因所在染色體位置后,再選取其所在基因組區(qū)域的其他SSR引物進(jìn)一步篩選多態(tài)性。

        PCR擴(kuò)增反應(yīng)總體系為10 μL,其中5 μL 2×MasterMix(天根生化科技有限公司)、2 μL ddH2O、上下游引物各1 μL、模板DNA 1 μL(50 ng·μL-1)。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性4 min; 94 ℃變性50 s,58~62 ℃退火50 s(依據(jù)引物的退火溫度),72 ℃延伸50 s,共35個(gè)循環(huán);最后 72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)8%的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳、硝酸銀染色后置于膠片觀察燈上照相。

        1.5 遺傳距離估算和連鎖分析

        用JoinMap 4.0軟件計(jì)算SSR分子標(biāo)記與抗條銹病基因之間的遺傳距離,用MapDraw V2.1軟件繪制該基因的遺傳連鎖圖譜。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 BJ399對條銹病的抗性鑒定結(jié)果和遺傳分析

        表1 BJ399對條銹菌小種CYR34的抗性遺傳分析Table 1 Genetic analysis of resistance to CYR34 in wheat germplasm BJ399

        2.2 抗條銹病基因 YrBJ399的分子標(biāo)記定位 結(jié)果

        隨機(jī)選取分布在整個(gè)小麥基因組上的400對SSR引物分別在抗病親本BJ399、感病親本銘賢169、抗病池和感病池DNA上進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果發(fā)現(xiàn)位于2AS染色體上的SSR標(biāo)記Xgwm425在抗、感親本和抗、感池間存在多態(tài)性,用Xgwm425分別在10株純合抗病株和10株純合感病株上進(jìn)行小群體上驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)標(biāo)記Xgwm425和抗病基因YrBJ399有連鎖關(guān)系。進(jìn)一步選取2AS染色體上的其他SSR標(biāo)記進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)標(biāo)記Xwmc296和Xgwm558均具有多態(tài)性,分別將這3個(gè)SSR標(biāo)記(表2)在F2分離群體上進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)均與YrBJ399存在連鎖關(guān)系,且3個(gè)標(biāo)記都為共顯性標(biāo)記,在F2代群體上的分離均符合1∶2∶1的孟德爾遺傳(表3)。標(biāo)記Xwmc296和Xgwm425在BJ399/銘賢169分離群體部分單株上的擴(kuò)增結(jié)果見圖1和圖2。

        表2 與BJ399抗條銹病基因連鎖的分子標(biāo)記引物序列Table 2 SSR primer sequences linked with stripe rust resistant gene derived from BJ399

        表3 SSR標(biāo)記在(BJ399×銘賢169)F2代群體的分離Table 3 Segregation ratios of SSR markers in(BJ399×Mingxian 169) F2

        M:50 bp ladder; 1:BJ399; 2:銘賢169; 3:抗病池; 4:感病池; 5~9:純合抗病單株; 10~13:雜合單株; 14~18:純合感病單株。

        M:50 bp ladder; 1:BJ399; 2:銘賢169; 3:抗病池; 4:感病池; 5~9:純合抗病單株; 10~14:雜合單株; 15~19:純合感病單株。

        2.3 連鎖分析

        利用JoinMap 4.0軟件對3個(gè)SSR標(biāo)記位點(diǎn)與抗條銹病基因YrBJ399連鎖分析,結(jié)果表明3個(gè)標(biāo)記都位于抗病基因YrBJ399的一側(cè),抗病基因和分子標(biāo)記在染色體上的排列順序?yàn)閅rBJ399-Xwmc296-Xgwm425-Xgwm558,最近標(biāo)記Xwmc296與抗條銹病基因YrBJ399的遺傳距離為9.5 cM,標(biāo)記Xgwm425與抗條銹病基因YrBJ399的遺傳距離為14.3 cM,由于3個(gè)SSR標(biāo)記均位于小麥2AS染色體上,因此,抗病基因YrBJ399被初步定位于2AS染色體上,靠近著絲點(diǎn)。據(jù)此繪制抗條銹基因YrBJ399的遺傳連鎖圖(圖3)。

        圖3 抗條銹基因 YrBJ399 的遺傳連鎖圖譜

        3 討 論

        本研究對種質(zhì)資源BJ399的遺傳分析表明,BJ399對目前中國條銹菌流行小種CYR34具有良好的抗病性,是一個(gè)優(yōu)異的抗病種質(zhì)資源,BJ399對CYR34的抗銹性由1對顯性基因控制,該基因暫命名為YrBJ399, 利用SSR分子標(biāo)記篩選到3個(gè)與目標(biāo)基因連鎖的標(biāo)記Xwmc296、Xgwm425和Xgwm558,初步將抗病基因YrBJ399定位到染色體2AS上,并構(gòu)建了分子標(biāo)記連鎖 圖譜。

        目前定位于小麥2AS染色體上的抗條銹基因有Yr17、YrElm1-4、YrZL16、YrZM175、YrCH5026、YrSph和YrR61等。Yr17[22-23]來源于偏凸山羊草,已被轉(zhuǎn)育到普通小麥品系VPM1中;YrElm1-4來源于柔軟濱麥草,楊敏娜等[24]將YrElm1-4定位到2AS,距其最近的SSR標(biāo)記Xwmc522的遺傳距離為5.9 cM;馬東方等[25]將中梁16中的抗銹基因YrZL16定位到2AS,與SSR標(biāo)記 Xbarc212和Xwmc177緊密連鎖,遺傳距離分別為5.4 cM和6.6 cM,并推測YrZL16來源于水源11;Lu等[26]推測YrZM175來源于BPM27,距其最近的SSR標(biāo)記Xgwm636的遺傳距離為4.9 cM;侯麗媛等[27]在小麥與中間偃麥草滲入系CH5026中發(fā)現(xiàn)抗病基因YrCH5026,并判斷YrCH5026來源于中間偃麥草Z1141,與其緊密連鎖的標(biāo)記為Xwmc382和Xgpw7101;YrSph[28]來源于印度圓粒小麥,為隱性基因;YrR61[29]來源于美國軟紅冬麥,為成株期抗病基因。而種質(zhì)資源BJ399起源于歐洲,屬普通小麥品種(張學(xué)勇,私人通訊)。從抗病基因來源看,YrBJ399是不同于Yr17、YrElm1-4、YrZL16、YrZM175、YrCH5026、YrSph及YrR61的抗病基因。

        從抗病基因所在染色體位置分析,YrElm1-4位于標(biāo)記Xgwm636和Xwmc522區(qū)間,YrZL16位于標(biāo)記 Xbarc212和Xwmc177區(qū)間,YrZM175位于標(biāo)記Xwmc382和Xgwm636區(qū)間,標(biāo)記 Xbarc212和Xwmc177、Xwmc382和Xgwm636都位于2AS中上部,標(biāo)記Xgwm636和Xwmc522位于2AS中部[21]。YrCH5026和YrBJ399雖都位于2AS著絲粒附近,但YrCH5026位于標(biāo)記Xwmc382和Xgpw7101區(qū)間,與標(biāo)記Xwmc382的遺傳距離為6.0 cM,YrBJ399與最近標(biāo)記Xwmc296的連鎖距離為9.5 cM,SSR標(biāo)記Xwmc382與Xwmc296的相對遺傳距離為33.0 cM[21],故YrCH5026與YrBJ399明顯不同。此外,用與YrElm1-4、YrZL16、YrZM175、YrCH5026連鎖的標(biāo)記在本研究的抗感親本、抗感池上進(jìn)行擴(kuò)增,在抗感親本和抗感池間均無多態(tài)性。Yr17單基因系苗期接種CYR34,其抗病性表現(xiàn)為中抗(反應(yīng)型2),而BJ399對CYR34的抗病性表現(xiàn)為免疫或近免疫。綜合以上結(jié)果,推測BJ399所含的2AS上的抗條銹病基因YrBJ399與已知的Yr基因不同,可能為新的抗條銹病基因。

        CYR34對Yr10和Yr26具有聯(lián)合毒性,該小種的發(fā)展對我國各主要麥區(qū)尤其甘肅隴南麥區(qū)的小麥生產(chǎn)構(gòu)成嚴(yán)重威脅[5]。對國外引進(jìn)的重要抗源材料進(jìn)行抗病基因組成和抗病特點(diǎn)研究,是合理利用抗病品種的基礎(chǔ)[30]。在當(dāng)前優(yōu)勢小種CYR34的流行壓力下,BJ399對CYR34表現(xiàn)出良好的抗病性,因此是一個(gè)具有巨大應(yīng)用潛力的抗源材料,在小麥抗條銹病育種中應(yīng)合理利用。由于本研究中所獲得的標(biāo)記與抗病基因的遺傳距離較遠(yuǎn),需繼續(xù)尋找與抗病基因連鎖更為緊密的標(biāo)記,以便更好地應(yīng)用于分子標(biāo)記輔助育種中。

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