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        基因組DNA羥甲基電致化學(xué)發(fā)光生物傳感研究進(jìn)展

        2020-07-04 07:13:30張銀冰

        張銀冰

        摘 ?要:電致化學(xué)發(fā)光分析法兼有電化學(xué)和化學(xué)發(fā)光分析法的雙重優(yōu)勢(shì),具有靈敏度高、線性范圍寬、反應(yīng)可控性強(qiáng)、背景干擾小、選擇性好和儀器簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),己經(jīng)被廣泛應(yīng)用于生物分子的檢測(cè)以及疾病的診斷等方面。生物傳感器是由生物識(shí)別元件和物理化學(xué)信號(hào)傳感系統(tǒng)組成的分析設(shè)備,可方便地進(jìn)行生物分析檢測(cè)。本論文對(duì)基因組DNA羥甲基電致化學(xué)發(fā)光生物傳感研究進(jìn)展現(xiàn)狀,進(jìn)行了綜述。

        關(guān)鍵詞:基因組;DNA羥甲基化;電化學(xué)發(fā)光;生物傳感器

        電化學(xué)發(fā)光(Electrochemiluminescence),它不但有著英文縮寫名稱,還有另外一個(gè)名為電致化學(xué)發(fā)光(Electrogeneratedchemiluminescence)名稱。ECL是將電壓以及電流經(jīng)過(guò)電極施加到化學(xué)發(fā)光物質(zhì)上促進(jìn)某種新物質(zhì)的衍生,該物質(zhì)和發(fā)光物質(zhì)會(huì)產(chǎn)生反應(yīng),供應(yīng)充足的能量來(lái)改變發(fā)光物質(zhì)的狀態(tài),讓其從原本的基態(tài)變成了后來(lái)的激發(fā)態(tài),在重新回到基態(tài),經(jīng)過(guò)這樣的改變,給發(fā)光供應(yīng)足夠的能量;亦或是將電壓以及電流經(jīng)過(guò)電極的方式供應(yīng)能量,讓發(fā)光物質(zhì)可以產(chǎn)生氧化還原反應(yīng),讓中間態(tài)物質(zhì)在不穩(wěn)定的狀態(tài)下出現(xiàn)分解,供應(yīng)能量促使發(fā)光。[1]所以,利用酶切來(lái)刪掉甲基基團(tuán),這是不可缺少的。這一點(diǎn)也是生物學(xué)家最關(guān)注的問題。人體內(nèi)的細(xì)胞有時(shí)為了再次分化,或許會(huì)對(duì)已經(jīng)分化后的細(xì)胞再一次進(jìn)行分化,一直分化到最低的狀態(tài)為止,這個(gè)過(guò)程就是刪除甲基化的環(huán)節(jié),分析這個(gè)過(guò)程,對(duì)于醫(yī)療運(yùn)用來(lái)說(shuō)有著難以言喻的價(jià)值。

        1DNA羥甲基化

        1948年人們第一次從人類DNA中識(shí)別出了被稱為DNA“第五個(gè)堿基”的5-甲基胞嘧啶(5-mC)。在真核生物中,DNA甲基化是在C-5位的胞嘧啶環(huán)上添加一個(gè)甲基后形成的。這個(gè)過(guò)程是在被稱為“CpG島”的y-CG-3^?列中經(jīng)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶催化后發(fā)生的。5-mC是最常見的真核生物DNA修飾,也是許多表觀遺傳(只改變基因表達(dá),而不改變核苷酸序列)現(xiàn)象的一種。[2]雖然甲基化DNA在植物和哺乳動(dòng)物中分布廣泛,但在一些真核生物,比如果蠅和釀酒酵母中并未檢測(cè)到甲基化DNA^-84〗。于是,人們開始懷疑其在正常發(fā)育和特異性基因表達(dá)中的重要性。然而,最近的研宂表明,在敲除轉(zhuǎn)基因小鼠中對(duì)DNA甲基化起重要作用的DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因后,小鼠發(fā)育異常和胚胎致死的表達(dá)水平仍然下降,這就消除了人們之前的懷疑。[3]

        DNA甲基化整體調(diào)控中的一個(gè)關(guān)鍵步驟是DNA去甲基化。用甲基敏感性內(nèi)切酶監(jiān)測(cè)DNA甲基化水平后發(fā)現(xiàn),在胚胎發(fā)育過(guò)程中,移植前的胚胎甲基化水平很低之后許多CPG島殘基發(fā)生再甲基化,但在移植時(shí),剩余的CpG島并未發(fā)生甲基化。胚胎植入后,許多DNA被甲基化,而組織特異性(Tissue-specific)基因在其相應(yīng)的表達(dá)組織中卻發(fā)生去甲基化。因此,對(duì)于生物的整個(gè)基因組DNA來(lái)甲基化模式是表觀遺傳信息的重要組成部分,是區(qū)分細(xì)胞的重要標(biāo)記物。5-甲基胞嘧啶(5-mC)通常被認(rèn)為是DNA的“第五個(gè)堿基”。在受精和胚胎發(fā)育后,大量輸甲基化標(biāo)記物被刪除這使得胚胎干細(xì)胞能分化成任何可能的專職細(xì)胞。在某些情況下,DNA的去甲基化發(fā)生時(shí)沒有細(xì)胞分裂,也就沒有合成新的DNA。因此,甲基基團(tuán)必須通過(guò)酶切主動(dòng)地去除。主動(dòng)去甲基化機(jī)制是人們最感興趣的,因?yàn)橐恍┘?xì)胞為了重新分化,有可能主動(dòng)進(jìn)行DNA去甲基化換句話說(shuō),將己經(jīng)分化的細(xì)胞進(jìn)行再分化,轉(zhuǎn)變?yōu)楦头只癄顟B(tài)的過(guò)程,就是主動(dòng)去甲基化,這在醫(yī)療應(yīng)用方面由很大的研究?jī)r(jià)值。說(shuō),肯定存在一種去除DNA中甲基胞嘧啶的方式。

        2電致化學(xué)發(fā)光

        最近幾年,由于電化學(xué)發(fā)光檢測(cè)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)不斷的顯露,人們開始重視電化學(xué)發(fā)光檢測(cè)方式的運(yùn)用,比如,其有著較高的靈敏性,操作流程簡(jiǎn)單、反應(yīng)迅速、節(jié)省試劑等。這些都是電化學(xué)發(fā)光檢測(cè)技術(shù)最顯著的優(yōu)點(diǎn),它的出現(xiàn)促進(jìn)了生物分析的發(fā)展,大大的提升了檢測(cè)生物分子的效率和質(zhì)量,并且日漸普遍。一直以來(lái),生物學(xué)家都在尋找研究DNA去甲基轉(zhuǎn)移酶活性的問題,也有不少的生物學(xué)家來(lái)不斷的檢測(cè)羥甲基化DNA,自從電化學(xué)發(fā)光檢測(cè)技術(shù)衍生后,生物學(xué)家找到來(lái)一個(gè)合適的分析和檢測(cè)平臺(tái)。

        電致化學(xué)發(fā)光(ECL)分析法無(wú)論是從電化學(xué)的角度來(lái)說(shuō)亦或是從化學(xué)發(fā)光分析法的角度來(lái)說(shuō),都是有著顯著的優(yōu)勢(shì)的,它有著較高的靈敏性,反應(yīng)快,范圍廣,干擾性低,好選擇以及操作便利等等,這些都對(duì)研究有著很大的幫助。如今,電致化學(xué)發(fā)光(ECL)分析法在醫(yī)療領(lǐng)域開始普遍使用,其中運(yùn)用最多的就是檢測(cè)生物分子,診斷患者的病情等等,可是學(xué)者對(duì)ECL分析法分析的成果不多,特別是檢測(cè)5-hmC更是少之又少。

        3電化學(xué)發(fā)光DNA生物傳感器

        生物傳感中的傳感系統(tǒng)涉及各種檢測(cè)器,如壓電,光學(xué),電化學(xué),電化學(xué)發(fā)光等。生物傳感方法近幾十年來(lái)蓬勃發(fā)展,為臨床早期診斷帶來(lái)了重大突破。商業(yè)化和臨床應(yīng)用的生物傳感器應(yīng)該具有穩(wěn)定、快速、高靈敏和廉價(jià)的特點(diǎn)。在對(duì)生物傳感有貢獻(xiàn)的技術(shù)中,電化學(xué)發(fā)光由于具有電勢(shì)可控和靈敏度高的雙重優(yōu)勢(shì),引起了人們的廣泛關(guān)注。電化學(xué)發(fā)光生物傳感是將特異性識(shí)別物質(zhì)如抗體、酶、DNA等固定在電極上而組成的分析元件,通過(guò)目標(biāo)分析物結(jié)合前后電化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度的變化來(lái)進(jìn)行定量檢測(cè),廣泛應(yīng)用于生物分析,免疫分析,食品安全和環(huán)境監(jiān)測(cè)等。其中,DNA是生物體遺傳信息的主要載體,引導(dǎo)生物發(fā)育與生命機(jī)能運(yùn)作,電化學(xué)發(fā)光DNA生物傳感器結(jié)合了生物識(shí)別的特異性及ECL的高靈敏性,為DNA分析提供了一種很有前景的方法,越來(lái)越多的研究者致力于電化學(xué)發(fā)光DNA生物傳感的研究。

        許多DNA檢測(cè)體系基于目標(biāo)DNA與其互補(bǔ)探針的雜交,Li等報(bào)道了一種電化學(xué)發(fā)光生物傳感方法檢測(cè)DNA甲基化,該方法結(jié)合酶聯(lián)反應(yīng)實(shí)現(xiàn)了對(duì)DNA甲基化水平的高靈敏檢測(cè)。[5]然而,該方法需要對(duì)目標(biāo)分析物進(jìn)行標(biāo)記,使得分析過(guò)程比較復(fù)雜。Zhang等使用發(fā)夾DNA作為識(shí)別元件,以釕復(fù)合物作為信號(hào)物質(zhì),構(gòu)建了一種用于檢測(cè)靶單鏈DNA(ss-DNA)的高選擇性ECL生物傳感器。該ECL方法具有較高的靈敏度和很好的選擇性,并且不需要對(duì)目標(biāo)分析物進(jìn)行記。[6]

        結(jié)束語(yǔ)

        電化學(xué)發(fā)光分析法結(jié)合了發(fā)光分析高靈敏度和電化學(xué)電位可控等優(yōu)點(diǎn),引起了諸多分析化學(xué)工作者的關(guān)注。電化學(xué)發(fā)光生物傳感器是將特異性分子識(shí)別物質(zhì)如酶、抗體或DNA等生物分子作為分子識(shí)別物質(zhì)固定在換能器上,以電化學(xué)發(fā)光信號(hào)為檢測(cè)信號(hào)的分析器件,其具有靈敏度髙、線性范圍寬、反應(yīng)可控性強(qiáng)、成本低廉、分析速度快、操作簡(jiǎn)單和易于微型化與集成化等優(yōu)點(diǎn),己經(jīng)被用于一些疾病相關(guān)的生物標(biāo)志物檢測(cè)。但是目前一些低水平的生物標(biāo)志物檢測(cè)仍然是電化學(xué)發(fā)光生物傳感器面臨的一大挑戰(zhàn)。近年來(lái),具有優(yōu)異性質(zhì)的不同結(jié)構(gòu)、組成和形貌的納米材料的引入促進(jìn)了電化學(xué)發(fā)光生物傳感器的發(fā)展,大大提髙了其檢測(cè)的靈敏度和選擇性。

        參考文獻(xiàn)

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        [2] ?DNA步行者分子機(jī)器研究新進(jìn)展[J].汪晶,王東霞,馬嘉懿,孔德明.中國(guó)科學(xué):化學(xué).2019(05)

        [3] ?1種簡(jiǎn)單有效的根際土壤微生物DNA提取方法[J].鄭道君,張冬明,吉清妹,史珍萍,符傳良.江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué).2017(04)

        [4] ?DNA:FromCarrierofGeneticInformationtoPolymericMaterials[J].JiaojiaoZhang,F(xiàn)engLi,DayongYang.TransactionsofTianjinUniversity.2019(04)

        [5] ?超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)在高通量測(cè)序片段化DNA中的應(yīng)用[J].李根亮,盧舒雨,許苡僥,黃捷,黃曉敏,肖娟,農(nóng)嵩.右江民族醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào).2016(05)

        [6] ?DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)探尋路上競(jìng)爭(zhēng)中的合作[J].張翮.自然辯證法通訊.2017(03)

        基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.21575109)

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