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        新疆維吾爾自治區(qū)和田地區(qū)長壽相關GWAS及其與健康狀況的關系

        2020-07-03 07:50:34晉靜靜陳鳳輝古再努爾阿迪力程祖亨邱長春瑪依拉吾甫爾
        醫(yī)學研究雜志 2020年6期
        關鍵詞:研究

        晉靜靜 陳鳳輝 古再努爾·阿迪力 程祖亨 邱長春 瑪依拉·吾甫爾

        衰老是生物體長期進化的結果,由基因和環(huán)境共同作用,揭示衰老調(diào)控機制,實現(xiàn)長壽是生命科學的研究熱點。研究發(fā)現(xiàn)遺傳因素影響壽命的決定度占25%,環(huán)境因素占70%,但由于環(huán)境因素的隨機性,且遺傳因素差異是造成個體對環(huán)境作出不同反應能力的主要因素[1,2]。因此探究遺傳因素有助于揭示基因控制長壽表型,闡明長壽調(diào)控機制,實現(xiàn)長壽。新疆維吾爾自治區(qū)和田地區(qū)長壽人群是目前研究長壽的公認群體,本課題組前期研究表明發(fā)現(xiàn)載脂蛋白E和糖皮質(zhì)激素受體等基因與新疆維吾爾自治區(qū)和田地區(qū)長壽具有顯著相關性[3~5]。然而長壽是由多種基因共同作用的復雜性狀,故針對該地區(qū)長壽群體單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)進行全基因組關聯(lián)分析(genome-wide association study, GWAS),對于篩選長壽相關SNP易感位點具有重要意義。因此本研究針對新疆維吾爾自治區(qū)和田地區(qū)長壽群體進GWAS,旨在探究長壽強相關基因與健康狀況的相關性。

        資料與方法

        1.一般資料:選擇2012年2月~2015年2月新疆維吾爾自治區(qū)和田地區(qū)維吾爾族長壽人群(納入標準[6]:年齡≥90歲者)122例為長壽組,同時納入該地區(qū)同期非長壽人群(納入標準[6]:隨訪3代以內(nèi),家族人群年齡均<90歲者)98例為對照組,兩組研究人群的排除標準:①外地遷移至此的人群;②因人口流動或失聰、失明、失語導致無法有效完成隨訪者;③合并精神疾病或認知障礙者;④未簽署知情同意書者。其中長壽組患者年齡為91~109歲,平均年齡為99.74±8.48歲;長壽組中男性55例,女性67例;飲酒者23例,非飲酒者99例;小學及以下學歷者99例,初中學歷者14例,高中及以上學歷者9例。對照組患者年齡為61~73歲,平均年齡為66.35±7.83歲;99例患者中,男性44例,女性54例;飲酒者16例,非飲酒者80例;小學及以下學歷者81例,初中學歷者11例,高中及以上學歷者6例。兩組患者性別、是否飲酒以及學歷等一般資料比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。

        2.長壽強相關基因的GWAS:為篩選與長壽強相關的SNP位點,本課題組抽取研究對象的靜脈血5ml,采用 pooling DNA 雜交對長壽組/對照組的全基因組掃描差異;通過Affymetrix SNP 6.0 芯片雜交技術完成了基于 pooling DNA 的研究人群SNP 分型分析,篩選出可能與長壽相關的SNP位點;同時應用 Sequenom Mass Array 技術平臺(Sequenom Chipll-G384芯片)對可能與壽命相關的SNP位點進行分型分析,完成對于長壽強相關基因驗證。長壽強相關的SNP的判斷標準參考文獻[7],應用Logistic分析,以OR≥4.00,P<0.05為強正相關。

        3.健康資料統(tǒng)計:測量研究對象的體重指數(shù)(body mass index, BMI)、空腹血糖(fasting blood glucose, FBG)水平、收縮壓(systolic blood pressure, SBP)和舒張壓(diastolic blood pressure, DBP)以及測定血清總膽固醇(total cholesterol, TC)、甘油三酯(triglyceride, TG)、低密度脂蛋白膽固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-C) 以及高密度脂蛋白膽固醇(high density lipoprotein cholesterol, HDL-C)等血脂水平。

        結 果

        1.長壽強相關基因的GWAS的比較:本研究通過Affymetrix SNP 6.0 芯片對研究對象進行GWAS發(fā)現(xiàn)兩組之間有42個SNP位點存在差異(P<0.05),隨后將這42個SNP位點應用 Sequenom Mass Array 技術平臺將進行群體驗證發(fā)現(xiàn)rs4449651 TT基因型(OR=5.168,P=0.026)、rs1718307 TT基因型(OR=5.469,P=0.002)、rs4316818 TT基因型(OR=4.193,P=0.006)以及rs2834384 GG型(OR=4.744,P=0.025)與長壽呈強相關性,詳見表1。

        表1 長壽強相關基因的GWAS[n(%)]

        LAMA2.層粘連蛋白α2;PAH.苯丙氨酸羥化酶;ACE3.血管緊張素轉(zhuǎn)換酶-3;MRPS6.線粒體核糖體蛋白-S6

        2.健康相關指標比較:通過隨訪調(diào)查研究對象的健康相關指標,本研究發(fā)現(xiàn)長壽組人群BMI、FBG、TG、TG以及LDL-C水平降低,而HDL-C水平,與對照組比較差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),兩組人群SBP及DBP比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),詳見表2。

        表2 兩組研究對象的健康相關指標比較

        Δ1mmHg=0.133kPa

        3.健康指標與強相關基因多重線性回歸:將BMI、FBG、TC、TG、HDL-C以及LDL-C健康相關指標分別作為應變量,將rs4449651(基因型設置啞變量:AA=1,AT=2,TT=3)、rs1718307(基因型設置啞變量:AA=1,AT=2,TT=3)、rs4316818(基因型設置啞變量:CC=1,CT=2,TT=3)以及rs2834384(基因型設置啞變量:TT=1,GT=2,GG=3)作為自變量,采用多重線性回歸分析健康相關指標與基因型之間的依存關系。BMI和rs4449651、rs1718307、rs4316818以及rs2834384均具有相關性(P<0.05),F(xiàn)BG水平與rs4449651及rs1718307具有相關性(P<0.05),TC水平則與rs1718307、rs4316818以及rs2834384呈相關性(P<0.05),TG水平與rs2834384呈相關性(P<0.05),而HDL-C以及LDL-C則與ACE基因rs4316818位點以及MRPS6基因rs2834384位點呈相關性(P<0.05),詳見表3。

        表3 健康指標與強相關基因多重線性回歸

        討 論

        揭示長壽基因變異度是目前生命科學研究熱點,然而目前有關長壽基因的研究多局限于單一基因的,而長壽是由遺傳及環(huán)境因素控制的復雜的生物表型,受多基因累積控制,GWAS是在全基因組范圍內(nèi)篩選出與生物表型相關的SNP的檢測手段[8]。因此本課題組采用GWAS進行多基因整合研究,探究了健康表型與SNP位點的相關性,揭示了長壽與多基因效應之間的關系。

        本研究通過Affymetrix SNP 6.0 芯片雜交技術完成研究對象的可疑長壽相關SNP位點篩選,同時應用 Sequenom Mass Array 技術平臺完成驗證確定出與研究人群長壽的強相關SNP易感位點,筆者研究發(fā)現(xiàn),LAMA2基因 rs4449651 TT基因型、PAH 基因rs1718307 TT基因型、ACE3基因rs4316818 TT基因型以及MRPS6基因 rs2834384 GG型共4個基因型存在強相關性,這與國外研究者Karimov等[9]的研究結論較為一致。同時筆者查閱相關文獻發(fā)現(xiàn)LAMA2基因是編碼細胞外基質(zhì)的主要基因,其Alu(I/D) 多態(tài)位點變異同樣影響人群壽命[8,10]。Szpakowicz等[11]研究則表明MRPS6基因SNP位點與心肌梗死的發(fā)生率及預后效果有關,該基因SNP位點變異可導致心肌梗死發(fā)生率增加。而PAH基因可表達苯丙氨酸羥化酶,該基因變異是導致苯丙酮尿癥的主要原因[12]。但目前有關PAH基因與長壽之間關系的報道較少,仍需進一步探究。

        血糖升高是心腦血管疾病的危險因素,本課題組通過采集研究對象的健康相關指標,發(fā)現(xiàn)長壽組人群BMI及FBG水平較低,這提示長壽人群健康狀況優(yōu)于對照組人群,同時筆者采用多重線性回歸發(fā)現(xiàn)上述健康相關指標分別受1種及以上長壽相關基因控制,這不僅提示長壽是多種基因的累積效應,同時也表明GWAS進行多基因整合研究對于揭示長壽機制的重要性。血糖水平升高則引起微血管病變,引起B(yǎng)MI升高,是導致心腦血管及代謝性老年疾病的重要原因[13]。本研究發(fā)現(xiàn)BMI與LAMA2、PAH、ACE3及MRPS6基因均具有相關性,同時FBG與LAMA2及PAH具有相關性。查閱文獻筆者發(fā)現(xiàn),ACE3可通過減輕胰腺細胞氧化應激以及調(diào)節(jié)胰島細胞微環(huán)境,達到提高胰島β細胞功能的作用,而MRPS6則通過調(diào)節(jié)糖脂代謝達到穩(wěn)定血糖的效果[14,15]。因此LAMA2及PAH 可能通過調(diào)節(jié)并優(yōu)化了體內(nèi)血糖代謝系統(tǒng),減少了血糖相關疾病的發(fā)生,進而影響了長壽。

        血脂代謝紊亂導致心腦血管動脈粥樣硬化等疾病,是引起老年群體死亡的重要原因[16,17]。本課題發(fā)現(xiàn)長壽組人群TG、TG以及LDL-C水平降低,而HDL-C水平升高,這提示長壽人群的血脂代謝優(yōu)于對照組,同時本研究結果表明TG、TG、LDL-C以及HDL-C水平與ACE3及MRPS6基因均呈相關性。而國內(nèi)有研究者同樣研究發(fā)現(xiàn),ACE基因SNP位點與長壽現(xiàn)象之間密切相關,與本課題GWAS結果一致。而流行病學研究表明,MRPS6基因可降低心肌梗死等心臟疾病的發(fā)生。而本研究表明MRPS6基因可調(diào)節(jié)血脂系統(tǒng)平衡,這是解釋MRPS6基因可降低心臟相關疾病發(fā)生,延長壽命的潛在機制。

        綜上所述,本研究通過GWAS進行多基因整合研究,發(fā)現(xiàn)LAMA2基因 rs4449651、PAH 基因rs1718307、ACE3基因rs4316818以及MRPS6基因 rs2834384共4個基因型與長壽呈強相關性,同時與研究人群的BMI、血糖以及血脂等健康指標呈相關性。

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