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        產ESBL高毒力肺炎克雷伯菌的耐藥機制及分子流行病學分析

        2020-07-01 03:56:00謝斌云劉媛張偉劉洋
        江西醫(yī)藥 2020年6期
        關鍵詞:克雷伯血清型毒力

        謝斌云 ,劉媛 ,張偉 ,劉洋

        (江西省南昌市第一醫(yī)院,1.創(chuàng)傷急救中心EICU;2.兒科NICU;南昌大學第一附屬醫(yī)院,3.呼吸內科;4.檢驗中心,南昌330000)

        肺炎克雷伯菌 (Klebsiella pneumoniae,KP)是臨床常見腸桿菌科細菌之一依據(jù)細菌毒力和致病特點,可將肺炎克雷伯菌分為普通肺炎克雷伯菌(classic Klebsiella pneumoniae,cKP)和高毒力肺炎克雷伯菌 (hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKP)。hvKP侵襲的宿主大部分為年輕健康的患者,且容易并發(fā)膿毒血癥,導致壞死性筋膜炎、骨髓炎、化膿性肝膿腫、眼內炎等嚴重的侵襲性疾病[1]。同時多臟器感染也因其可繼發(fā)遷徙性播散而存在,臨床致殘率及致死率高,預后差,近年來一直成為研究的熱點[2]。隨著頭孢類抗生素的大量應用及濫用,產超廣譜β-內酰胺酶(ESBL)也相繼出現(xiàn)增多的情況,導致產ESBL的耐藥菌譜出現(xiàn)交叉耐藥問題。細菌耐藥引發(fā)的醫(yī)院感染爆發(fā)流行,感染性疾病治療效果不佳,住院費用高,治療時間長,嚴重影響了人類健康,已經成為21世紀我們不得不面臨的公共衛(wèi)生問題。而集毒力高、耐藥性強于一身的產ESBL高毒力肺炎克雷伯菌或將成為下一個“超級細菌”。本研究對南昌大學第一附屬醫(yī)院2016年6月-2017年12月分離的產ESBL高毒力肺炎克雷伯菌進行分析,探討耐藥機制及分子流行病學等,旨在為抗感染治療合理選用抗生素,預防和控制產ESBL耐藥菌的出現(xiàn)和播散,研制新型、高效的β-內酰胺類抗生素以及流行病學研究提供實驗依據(jù)和指導。

        1 材料與方法

        1.1 一般材料 收集2016年6月-2017年12月南昌大學一附醫(yī)院就診患者分離的KP,若同一位患者多次分離出相同的菌株,只留取首次分離的菌株為標準。采用VITEK-2生物分析儀自動鑒定菌株和藥敏試驗。使用拉絲試驗確定高黏液表型特征,使用紙片法試驗確認ESBL表型。按l:1的比例各收集產ESBL酶hvKP、非產ESBL酶hvKP感染的患者的病歷資料,將上述45例產ESBL酶hvKP感染的患者記為病例組A組。對照組B組為隨機抽取的45例非產ESBL酶hvKP感染的患者。質控菌株為肺炎克雷伯菌ATCC700603和大腸埃希菌ATCC25922,均購買于衛(wèi)生部臨床檢驗中心。

        1.2 黏液絲試驗 將細菌接種在5%綿羊血平板上,37℃培養(yǎng)16h后,用細菌接種環(huán)輕柔向上挑起平板上的肺炎克雷伯菌菌落,重復牽拉兩次或兩次以上,如果挑起的黏液絲長度大于或等于5 mm,判為黏液絲試驗陽性,反之則結果判讀為黏液絲試驗陰性。

        1.3 產ESBL肺炎克雷伯菌進行表型確證試驗 推薦的紙片進行ESBL確證試驗,選取對三代頭孢菌素(頭孢曲松、頭孢噻肟)耐藥作為ESBL初篩標準,并記錄 ESBL陽性菌株分離率。將受試菌配成 0.5麥氏濁度菌液,用無菌棉棒挑取涂于MH瓊脂上,貼上頭孢他啶,頭孢他啶/克拉維酸,頭孢噻肟,頭孢噻肟/克拉維酸紙片在有待測菌的瓊脂培養(yǎng)基上,置于 35℃,16-18h后觀察結果,兩組中任何一組藥物,加克拉維酸與不加克拉維酸的抑菌圈相比,增加5 mm以上者,即判斷為ESBL菌株。

        1.4 藥敏試驗 采用Vitek 2 Compact全自動微生物鑒定及藥敏系統(tǒng)檢測,采用紙片擴散法測定試驗菌株對抗菌藥物的敏感性,抗菌藥物紙片分別為:頭孢噻肟(CTX)、頭孢吡肟(FEP)、頭孢西?。‵OX)、亞胺培南(IPM)、頭孢他啶(CAZ)、氨曲南(ATM)、美羅培南(MEM)和厄他培南(ERT)及ESBL表型鑒定紙片頭孢噻肟/克拉維酸(CTX/CA)、頭孢他啶/克拉維酸(CAZ/CA)。參照CLSI標準進行實驗操作和結果判斷。

        1.5 模板提取及PCR擴增條件 使用煮沸法提取臨床各種標本中分離出的肺炎克雷伯菌菌株DNA,PCR 的反應體系為 25μl: 正反引物各 0.5μl,DNA模板 3μl,mix 反應液 12.5μl,加蒸餾水使反應總體積為25μl,用無菌去離子水作為陰性對照。反應條件 : 預 變 性 95℃ 5min;95℃ 45s,56℃ 90s,72℃90s,30 個循環(huán);延伸 72℃ 10min。

        1.6 產ESBL的高毒力肺炎克雷伯菌PCR鑒定將得到的PCR模板 (高毒力肺炎克雷伯菌DNA)進行擴增,12.5μl擴增體系:Taq Mix:6.25μl, 上游引物:0.25μl,下游引物:0.25μl,模板:1.5μl,ddH20:4.25μl;PCR 的反應條件:95℃預變性 5min,后 94℃變性 40s,52℃退火復性 30s,72℃延伸 1min 進行30個循環(huán),最后72℃延伸10min。移液槍吸取6.5μlPCR擴增產物后加入1%瓊脂糖凝膠上樣孔中,120 V,電泳25 min,電泳液為 1×TAE緩沖液,電泳結束后在凝膠成像儀上觀察結果,記錄結果。

        1.7多位點序列分析 (MLST)引物設計與合成:從PUBMLST 網(wǎng)站(http://pubmlst.org/koxytoca/info/K_oxytoca_primers.pdf)上查詢肺炎克雷伯菌多位點序列分型7對管家基因,引物參照相關文獻[3],引物由上海生工公司合成。

        1.8 脈沖場凝膠電泳 (PFGE)用低熔點瓊脂糖包埋細菌,做成瓊脂糖膠塊;用細胞裂解液和蛋白酶K消化,使得 DNA被釋放到細胞外;大片段的DNA用限制性內切酶消化;制備好的樣品按照設計好的程序電泳;電泳的結果通過染色后被讀取,通過相關軟件進行數(shù)據(jù)的分析。

        2 結果

        2.1 藥敏實驗結果 結果顯示:所有菌株對氨芐西林天然耐藥,產ESBL酶hvKP菌對頭孢他啶、頭孢噻肟、頭孢西丁、哌拉西林/他唑巴坦、頭孢吡肟、厄他培南、亞胺培南、美羅培南、左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、氨芐西林/舒巴坦的耐藥率顯著高于不產ESBL酶hvKP菌株(P<0.05),然而在阿米卡星、慶大霉素、妥布霉素的耐藥率上差異無顯著意義 (P>0.05),見表 1。

        表1 產ESBL hvKP菌株和非產ESBL hvKP菌株對抗菌藥物的耐藥率的比較

        2.2 ESBL的高毒力肺炎克雷伯菌普通PCR鑒定結果 從臨床分離的1263株肺炎克雷伯菌中篩出高毒力肺炎克雷伯菌株124株,其中K1莢膜血清型陽性85株,K2莢膜血清型陽性39株。在124株高毒力肺炎克雷伯菌中,表型試驗顯示45株為ESBL陽性hvKP菌株,79株為ESBL陰性hvKP菌株。經過表型試驗確定出的產ESBL高毒力肺炎克雷伯菌株45株均攜帶ESBL基因,其中 blaTEM基因陽性22株,占48.9%;blaSHV基因陽性13株,占28.9%,其中7株為blaSHV-1型,6株為blaSHV-12型,其中一株同時攜帶blaSHV-1型和blaSHV-12型ESBL基因。bla CTX‐M基因陽性10株,占22.2%,見表 2。

        表2 產ESBL高毒力肺炎克雷伯菌PCR擴增相關基因引物

        此外,我們還發(fā)現(xiàn)部分ESBL相關基因可共存于同一菌株中,如表2.5所示,我們發(fā)現(xiàn)blaCTXM-1和blaTEM共存于一株K1型菌株中,另外還發(fā) 現(xiàn) blaSHV-12+blaCTX-M-2、blaCTX-M-8+blaSHV-1+blaTEM、blaCTX-M-2+blaSHV-1+blaTEM、blaCTX-M-9+blaSHV-12+blaTEM、blaCTX-M-2+blaSHV-1+blaSHV-12共存的菌株各一株,且均為K2莢膜血清分型,這或表明K2型hvKP菌在獲得性耐藥上更具優(yōu)勢。

        2.3 MLST分型結果 產ESBL酶hvKP菌株共45株,其中K1莢膜血清型陽性28株,K2莢膜血清型陽性17株。K1莢膜血清型陽性菌株均為ST23型,而17株K2型產ESBL酶hvKP菌株中10株為ST65型,5株ST86型,2株ST14型。而攜帶ESBL基因的產ESBL酶hvKP則主要為ST23型、ST65型,見表3。

        表3 ESBL陽性hvKP菌株ESBL相關基因的基因型分布

        2.4 PFGE結果 45株產ESBL酶hvKP菌株經PFGE得到電泳圖譜。將具有85%以上相同條帶(相關系數(shù)>0.85)的菌株歸入同一帶型,45株產ESBL酶hvKP菌株被分為6個型別:A型[71.1%(32/45)]、C 型[20.0%(9/45)],B 型、D 型、E 型、F 型各1株。A型、C型為主要型別。其中A型進一步分為 3個亞型,A1型 [31.1%(14/45)]、A2型[35.6%(16/45)]A3 型[4.5%(2/39)]。

        3 討論

        肺炎克雷伯菌 (Klebsiella pneumoniae,KP)廣泛存在于自然界及機體中。人體的皮膚、呼吸道和消化道等部位均寄存著該細菌,當人體抵抗力下降時,免疫力低下,常引起機體出現(xiàn)多種感染,如肺炎、肝膿腫、敗血癥等等。在血瓊脂平板上生長,hvKP菌株可表現(xiàn)出高黏液性,研究[4-6]發(fā)現(xiàn),hvKP表現(xiàn)為高毒力主要是攜帶有黏液表型調節(jié)基因和氣桿菌素。依據(jù)細菌抗原性不同以及莢膜多糖結構的異常,肺炎克雷伯菌可分為至少82個莢膜血清型[6],其中,Kl、K2、K5、K20、K57 和 K54 血清型與人類及動物的各種侵襲性感染密切相關,為高毒力莢膜血清型肺炎克雷伯菌[7-9]。因新的抗生素的大量應用甚至濫用,耐藥問題也隨之凸現(xiàn),產ESBLs是細菌產生多重耐藥的常見表型機制,具體耐藥根因可以從基因層面分析。這其中肺炎克雷伯菌是最常見的產ESBL菌株,常引起醫(yī)院感染暴發(fā)流行,給醫(yī)院管理及疾病診治帶來非常棘手的困難?,F(xiàn)階段,無論是人類還是動物界,抗生素的使用過于頻繁,抗生素耐藥性問題越發(fā)嚴重。特別是頭孢類抗生素的大量應用及濫用,產超廣譜β-內酰胺酶(ESBL)也相繼出現(xiàn)增多的情況,導致產ESBL的耐藥菌譜出現(xiàn)交叉耐藥問題。

        高毒力肺炎克雷伯菌的出現(xiàn)給臨床感染帶來了新的挑戰(zhàn),其改變了對經典肺炎克雷伯菌感染的診治及流行。然而高毒力肺炎克雷伯菌在體外常表現(xiàn)出對除了氨芐西林外的其他抗生素高度敏感,故仍對其有相應的治療對策[10]。但隨著耐藥的廣泛流行,尤其是在各種抗生素濫用的情況下,抗生素耐藥已經成為影響臨床感染治療效果的重要因素。而此時,高毒力肺炎克雷伯菌也無法幸免。超廣譜β內酰胺酶是腸桿菌科細菌最常見的β內酰胺酶,其常常是導致腸桿菌科細菌β內酰胺類抗生素耐藥的重要原因。超廣譜β內酰胺酶根據(jù)同源性可分為TEM型、SHV型和CTX-M型等,其中前兩型最多見,世界范圍流行,我國以CTX-M型為主,而在本試驗中,我們卻發(fā)現(xiàn)hvKP菌株中主要為TEM和SHV型ESBL,這與以往的經典肺炎克雷伯菌報道不一致,或許與高毒力肺炎克雷伯菌獨特的耐藥發(fā)展特點有關。此外我們還發(fā)現(xiàn)hvKP菌株中同常常存在多種β內酰胺酶共存的情況,且多集中在K2型高毒力肺炎克雷伯菌中,這或許與K2型菌株的毒力相對較低有關[11],這也表明K2型高毒力肺炎克雷伯菌或將成為高毒力肺炎克雷伯菌發(fā)展多重耐藥的重要突破口,也為我們監(jiān)測高毒力高耐藥肺炎克雷伯菌形成和發(fā)展提供了重要依據(jù)。由此可見,產ESBL酶的hvKP菌株的出現(xiàn)或給我們敲響了對高毒力肺炎克雷伯菌濫用抗生素治療警鐘,其中部分ESBL基因可通過質粒介導傳播、且集中在流行的克隆株上,也給我們的院感控制敲響了警鐘。加強對產ESBL酶hvKP菌株監(jiān)測及相關研究,為未來控制高毒力高耐藥肺炎克雷伯菌這一“超級細菌”的傳播提供理論依據(jù)。

        與之前的研究文獻觀點有一致性[12-15],本研究中K1血清學肺炎克雷伯菌的MLST分型主要以ST23型為主,K2血清學肺炎克雷伯菌主要以ST65型為主,在分子流行病學上,我們也發(fā)現(xiàn)雖然hvKP菌株的流行相對集中,以MLST分型結果看,K1型hvKP菌株主要集中在ST23型,但也存在少部分ST700型。相反,K2型hvKP菌株則略顯多態(tài)性,主要包括ST65型、ST86型及ST14型。而在耐藥基因攜帶上,我們發(fā)現(xiàn)所有ESBL基因陽性菌株主要集中在ST23型、ST65型及ST14型。本研究結果顯示本院分離出的產ESBL酶hvKP菌株的PFGE帶型相似性表現(xiàn)的比較明顯,提示本院各科室間產ESBL酶hvKP菌株或存在同類細菌的相關性傳播,鑒于此類現(xiàn)象,加強醫(yī)院感染預防措施和嚴格控制感染源及切斷傳播途徑意義重大,按無菌操作流程、接觸感染患者前后加強手衛(wèi)生、強化消毒隔離制度等等措施應嚴格執(zhí)行,最終將醫(yī)院感染的發(fā)生率降到最低。

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