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        遼藁本內(nèi)生細(xì)菌ZHAB63鑒定與拮抗菌篩選

        2020-07-01 10:18:22張芳芳田義新盧寶慧王志清劉桂英
        關(guān)鍵詞:植物

        張芳芳,田義新*,盧寶慧,王志清,劉桂英

        (1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)中藥材學(xué)院,長(zhǎng)春 130118;2.白山市江源區(qū)農(nóng)業(yè)農(nóng)村局,吉林 白山 134700)

        隨著中藥材市場(chǎng)需求擴(kuò)大,東北地區(qū)道地藥材如人參、細(xì)辛、刺五加、防風(fēng)、蒼術(shù)等人工栽培模式不斷完善,但植物病害成為阻礙中藥材健康生長(zhǎng)的關(guān)鍵因素?;瘜W(xué)農(nóng)藥易產(chǎn)生環(huán)境污染,生物農(nóng)藥以其低毒高效無(wú)殘留且使用方便等優(yōu)點(diǎn)備受關(guān)注,利用植物內(nèi)生細(xì)菌開(kāi)發(fā)生物農(nóng)藥成為藥用植物病害防治研究熱點(diǎn)[1-2],植物內(nèi)生細(xì)菌長(zhǎng)期存活于健康植物組織內(nèi)部,可與宿主植物共生而不致其表現(xiàn)明顯病害癥狀[3]。

        自20世紀(jì)90年代,Wei等首次提出“內(nèi)生細(xì)菌”概念后[4],現(xiàn)已分離鑒定內(nèi)生細(xì)菌多達(dá)50余屬120余種[5-6]。其中,解淀粉芽孢桿菌可用于多種植物病害防治,效果較好[7-8]。植物內(nèi)生細(xì)菌作為一種寶貴資源,應(yīng)用前景廣闊[9],但大部分植物組織中內(nèi)生細(xì)菌資源未被分離,仍處于空白階段,亟待深入研究。

        遼藁本(Ligusticum jeholense Nakai et Kitag)是傘形科藁本屬草本植物,以干燥的根及根莖入藥,味辛,性溫,具有祛風(fēng)、散寒、止痛等功效[10]。主要分布在吉林、遼寧、河北等省,是我國(guó)東北地區(qū)常見(jiàn)道地藥材之一[11]。具有一定療效及藥用價(jià)值,但目前有關(guān)遼藁本研究主要集中于化學(xué)成分及生理生化方面[12-13],遼藁本內(nèi)生細(xì)菌研究尚未見(jiàn)相關(guān)報(bào)道。

        本研究以東北地區(qū)道地藥材遼藁本為試驗(yàn)材料,首次開(kāi)展內(nèi)生細(xì)菌相關(guān)研究,從遼藁本2個(gè)吉林主產(chǎn)區(qū)長(zhǎng)春、通化采集根及根莖部組織,分離內(nèi)生細(xì)菌,篩選高效抑制植物病原真菌內(nèi)生細(xì)菌,選取一株分離自遼藁本根部并表現(xiàn)較強(qiáng)拮抗作用ZHAB63菌株,對(duì)其作分子鑒定,優(yōu)化培養(yǎng)基及發(fā)酵條件,旨在填補(bǔ)東北道地藥材遼藁本內(nèi)生細(xì)菌研究領(lǐng)域空白,發(fā)掘廣譜性內(nèi)生細(xì)菌作為生物制劑開(kāi)發(fā)原料,為遼藁本內(nèi)生細(xì)菌開(kāi)發(fā)利用及生物防治新途徑探索提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 供試植物

        健康遼藁本植株分別于2018年6月采自吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)藥用植物示范園、吉林省通化縣富江鄉(xiāng)富裕村種植基地,經(jīng)鑒定均為傘形科植物遼藁本(L.jeholense)。

        1.1.2 供試病原菌

        本研究所用人參病原菌由吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院提供,其他植物病原菌均由吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)中藥材學(xué)院提供。具體見(jiàn)表1。

        表1 供試指示菌株Table 1 Tested indicator microbe

        1.1.3 供試培養(yǎng)基

        病原真菌由馬鈴薯葡萄糖(Potato dextrose agar)培養(yǎng)基保存[14]:去皮馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂18 g、無(wú)菌水1 000 mL;內(nèi)生細(xì)菌純化、培養(yǎng)為牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基:牛肉膏3 g、蛋白胨10 g、NACl 5 g、瓊脂粉20 g、無(wú)菌水1 000 mL、pH 7.4~7.6;牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基:牛肉膏3 g、蛋白胨10 g、NaCl 5 g、無(wú)菌水1 000 mL。培養(yǎng)基滅菌條件均為1×105Pa滅菌30 min。

        1.2 內(nèi)生細(xì)菌分離和純化

        將新鮮遼藁樣本于流水下沖洗,除去表面泥沙及雜物,無(wú)菌紙吸干表面附水,挑選完好根及根莖切成約1.5 cm小段,先用75%乙醇試劑漂洗1 min,無(wú)菌水沖洗5次,再依次浸入0.1%HgCl2消毒試劑處理,無(wú)菌水沖洗5次。接入牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基28℃暗培養(yǎng),15 d無(wú)污染后,除去外表皮,切成約0.5 cm小段,再接入新牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基中,每皿接入6個(gè)樣品,重復(fù)3次,28℃暗培養(yǎng)。取最后1次用于表面清洗的無(wú)菌水涂布在培養(yǎng)基平板上作為對(duì)照組,置于相同環(huán)境下,檢驗(yàn)消毒效果。對(duì)照組若無(wú)菌落生長(zhǎng),表明遼藁本表面消毒徹底,同時(shí)獲得遼藁本內(nèi)生細(xì)菌。劃線法純化多次至單一菌種后,轉(zhuǎn)接至新牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基斜面并編號(hào),于4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 內(nèi)生細(xì)菌拮抗活性檢測(cè)

        首先采用生長(zhǎng)速率法初篩,即在90 mm培養(yǎng)皿中倒入10 mL牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,待溫度40℃左右每個(gè)培養(yǎng)皿倒入1 mL待測(cè)內(nèi)生細(xì)菌菌株發(fā)酵液(取一環(huán)菌體接種于牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基,250 mL三角瓶裝液量為50 mL,28℃恒溫振蕩培養(yǎng),180 r·min-1搖菌2 d),混勻。待培養(yǎng)基凝固后,在中央放置直徑6 mm供試植物病原菌菌餅,28℃暗培養(yǎng),每日定時(shí)觀察培養(yǎng)基中菌株生長(zhǎng)狀況及是否具有抑菌作用,將有拮抗效果菌株4℃斜面保存?zhèn)溆茫瑴?zhǔn)備復(fù)篩。復(fù)篩同樣利用生長(zhǎng)速率法(方法同初篩),對(duì)照組則以1 mL蒸餾水替代內(nèi)生細(xì)菌發(fā)酵液混勻于培養(yǎng)基,當(dāng)對(duì)照組病原菌菌落直徑超過(guò)40 mm時(shí),十字交叉法測(cè)量。

        抑菌率(%)=(對(duì)照菌落直徑-處理菌落直徑)/對(duì)照菌落直徑×100%。

        1.4 菌株ZHAB63鑒定

        1.4.1 形態(tài)特征觀察

        將待測(cè)菌株ZHAB63在牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基平板上劃線,28℃培養(yǎng)48 h,觀察記錄菌落形態(tài)、顏色、透明度、干濕度等特征;采用革蘭氏染色法判斷是否為革蘭氏陽(yáng)性菌。

        1.4.2 分子鑒定

        取一環(huán)ZHAB63菌體接種于牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基(250 mL三角瓶裝液量為50 mL),于28℃恒溫、180 r·min-1搖床中培養(yǎng)15 h,使菌液OD值為1~2,按照離心柱型細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明書(shū)提取ZHAB63內(nèi)生菌株DNA,經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA是否提取成功。對(duì)其16SrDNA基因片段作PCR擴(kuò)增。引物由上海生物工程股份有限公司合成。序列如下:

        正向引物27f:5'AGAGTTTGATCCTGGCTC AG 3'

        反向引物1492r:5'GGTTACCTTGTTACGAC TT 3'

        PCR擴(kuò)增體系為:Template(DNA模板)5 μL,2×Power Taq PCR Master Mix 25 μL,27f和1492r引物均2.5 μL,加ddH2O 15 μL,使擴(kuò)增體系達(dá)50 μL。

        PCR循環(huán)條件:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性40 s(35個(gè)循環(huán)),55℃退火1 min(35個(gè)循環(huán)),72℃延伸90 s(35個(gè)循環(huán)),72℃修復(fù)延伸10 min,4℃復(fù)性(無(wú)限循環(huán))直至終止反應(yīng),

        PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳,送生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。將測(cè)序所得拼接序列用NCBI中Blast檢索,在核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)分析相近序列,MEGA7.0軟件分析,以Neigh?bor-joining方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),使用Bootstrap(1 000次重復(fù))檢驗(yàn),作親緣關(guān)系及系統(tǒng)發(fā)育分析。

        1.5 拮抗菌ZHAB63發(fā)酵條件優(yōu)化

        1.5.1 正交試驗(yàn)

        以牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基為對(duì)照,采用單因素試驗(yàn)法分別研究不同碳源(葡萄糖,蔗糖,可溶性淀粉)、不同氮源(蛋白胨,酵母粉,氯化銨,硝酸銨)、不同無(wú)機(jī)鹽(氯化鈉,氯化鈣,硫酸鋅,硫酸銅,硫酸鎂)在其他條件不變情況下,測(cè)定ZHAB63菌株對(duì)細(xì)辛菌核病菌抑菌率,結(jié)合試驗(yàn)結(jié)果及文獻(xiàn)資料,選擇液體發(fā)酵培養(yǎng)基主要組成成分(A-蔗糖、B-酵母粉、C-蛋白胨、D-硫酸鎂)作正交試驗(yàn),見(jiàn)表2,以確定最佳配方。

        表2 L9(34)正交試驗(yàn)因素水平Table 2 L9 (34) orthogonal test factor level table

        1.5.2 培養(yǎng)條件優(yōu)化

        基于優(yōu)化的培養(yǎng)基,取分離純化后保存的內(nèi)生細(xì)菌ZHAB63,對(duì)培養(yǎng)時(shí)間、培養(yǎng)溫度、轉(zhuǎn)速和pH作單因素條件優(yōu)化,檢測(cè)菌株在不同培養(yǎng)條件下獲得發(fā)酵液抑菌效果。培養(yǎng)時(shí)間:設(shè)置12、24、36、48、60、72、84 h 7個(gè)時(shí)間點(diǎn),在pH為7,28℃、180 r·min-1培養(yǎng)條件下,測(cè)定抑菌率,確定最佳培養(yǎng)時(shí)間;培養(yǎng)溫度:設(shè)置26、27、28、29、30、31、32 ℃,在pH為7,180 r·min-1培養(yǎng)48 h,測(cè)定抑菌率,確定最適培養(yǎng)溫度;轉(zhuǎn)速:設(shè)置 160、170、180、190、200、210、220 r·min-1,在pH為7,28℃培養(yǎng)48 h后,測(cè)定抑菌率,確定最佳轉(zhuǎn)速;pH:設(shè)置5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5,在28 ℃、180 r·min-1培養(yǎng)48 h,測(cè)定抑菌率,確定最適pH。每組3次重復(fù)。測(cè)定不同培養(yǎng)條件下內(nèi)生細(xì)菌ZHAB63對(duì)細(xì)辛菌核病菌抑菌率,確定遼藁本根部?jī)?nèi)生細(xì)菌ZHAB63最佳培養(yǎng)條件。

        1.6 數(shù)據(jù)分析

        用正交設(shè)計(jì)助手Ⅱv3.1設(shè)計(jì)試驗(yàn),Excel 2007計(jì)算統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)和制作圖表,SPSS 25.0作方差分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 內(nèi)生細(xì)菌的分離純化與篩選

        從遼藁本植株中共分離到內(nèi)生細(xì)菌64株,其中根中31株;根莖中33株。發(fā)現(xiàn)23株內(nèi)生細(xì)菌對(duì)11株植物病原菌中至少1種供試植物病原菌產(chǎn)生拮抗作用(見(jiàn)表3),長(zhǎng)春產(chǎn)區(qū)遼藁本根中分離到29株內(nèi)生細(xì)菌,通化產(chǎn)區(qū)遼藁本根中僅分離2株內(nèi)生細(xì)菌,長(zhǎng)春產(chǎn)區(qū)根中分離內(nèi)生細(xì)菌數(shù)量高于通化產(chǎn)區(qū),根中具有拮抗作用株菌占總菌數(shù)17.19%;兩產(chǎn)區(qū)根莖部位分離內(nèi)生細(xì)菌數(shù)量相近,根莖中具有拮抗作用株菌占總菌數(shù)18.75%。

        遼藁本內(nèi)生細(xì)菌采用生長(zhǎng)速率法初篩,對(duì)至少一種植物病原菌存在拮抗作用的內(nèi)生細(xì)菌有23株(見(jiàn)表4)。部分內(nèi)生細(xì)菌復(fù)篩抑菌結(jié)果如圖1所示。

        表3 兩產(chǎn)區(qū)樣品中具有拮抗作用內(nèi)生細(xì)菌分布比例Table 3 Proportion of antagonistic endophytic bacteria in samples from two regions

        表4 內(nèi)生細(xì)菌初篩結(jié)果Table 4 Endophytic bacterial preliminary screening results

        圖1 部分內(nèi)生細(xì)菌復(fù)篩抑菌結(jié)果Fig.1 Partial endophytic bacteria rescreening and bacteriostatic results

        其中對(duì)細(xì)辛菌核病菌、人參灰霉病菌有拮抗作用菌株最多,占有抑菌作用拮抗菌總數(shù)91.30%;其次對(duì)人參根腐病菌有拮抗作用菌株,占有抑菌作用拮抗菌總數(shù)82.61%;對(duì)防風(fēng)灰霉病菌、防風(fēng)根腐病菌及蒼術(shù)立枯病菌有拮抗作用內(nèi)生菌株大致相同,占65.22%;對(duì)細(xì)辛葉枯病病菌具有拮抗作用菌株最少,僅12株,占拮抗菌株52.17%。對(duì)9種以上供試植物病原菌存在拮抗作用內(nèi)生菌株6株,其中分離于根部ZHAB63菌株對(duì)11種供試病原菌均產(chǎn)生明顯抑制作用,且拮抗率均大于50.00%,該內(nèi)生菌菌株在對(duì)供試植物病原菌抑制作用具有廣譜性。抑菌率≥70%內(nèi)生菌株2株,遼藁本內(nèi)生細(xì)菌ZHAB3及ZHAB63菌株分別對(duì)人參疫病病菌及細(xì)辛菌核病菌抑菌率均大于70%,說(shuō)明遼藁本內(nèi)生細(xì)菌對(duì)這2種供試植物病原菌抑制作用具有專一性。就細(xì)辛菌核病菌而言,ZHAB63菌株的抑菌率大于70%,達(dá)極顯著差異(P<0.01);對(duì)人參疫病病菌拮抗篩選中,ZHAB3菌株抑制效果較好,為最高抑菌率,達(dá)顯著差異(P<0.05);其余供試植物病原菌拮抗作用不明顯,拮抗率均未達(dá)到70%。

        對(duì)ZHAB63菌株拮抗11種植物病原菌結(jié)果作方差分析(見(jiàn)表5),對(duì)細(xì)辛菌核病菌抑菌效果達(dá)極顯著(P<0.01),抑菌率在11種供試植物病原菌中最高,故將細(xì)辛菌核病病菌作為測(cè)定ZHAB63條件優(yōu)化抑菌率的供試植物病原菌。

        表5 菌株ZHAB63復(fù)篩結(jié)果Table 5 Rescreening results of strain ZHAB63

        2.2 菌株ZHAB63鑒定

        2.2.1 形態(tài)特征觀察

        菌株ZHAB63接種于牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)48 h后,菌落呈淡黃色無(wú)光澤,表面干燥、粗糙、不透明,培養(yǎng)基上無(wú)色素積累,液體培養(yǎng)基表面形成一層薄膜。通過(guò)光學(xué)顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)菌體呈桿狀,革蘭氏染色為陽(yáng)性。

        2.2.1 分子鑒定

        PCR擴(kuò)增使用通用引物獲得菌株ZHAB63的16SrDNA序列長(zhǎng)度為1 460 bp。將所得16SrDNA序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)作BLAST比對(duì)分析,采用MEGA7.0中NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果表明,內(nèi)生菌株ZHAB63與芽孢桿菌屬(Bacillus)相似度高達(dá)99%,由此判斷ZHAB63菌株為芽孢桿菌屬中一個(gè)種。通過(guò)選取NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中與ZHAB63序列同源性較高的菌株構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(見(jiàn)圖2)。菌株ZHAB63與解淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefa?ciens)(HQ831399.1)聚于同一分支,其序列同源性為99%。結(jié)合形態(tài)學(xué)特征觀察及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析,初步將菌株ZHAB63鑒定為解淀粉芽孢桿菌(B.am?yloliquefaciens)。

        2.3 ZHAB63菌株發(fā)酵條件優(yōu)化

        2.3.1 正交設(shè)計(jì)確定最佳組合

        R值(極差)高低順序(RD>RC>RB>RA)表明,影響菌株ZHAB63發(fā)酵液抑菌活性因子強(qiáng)度由強(qiáng)到弱依次為硫酸鎂、蛋白胨、酵母粉和蔗糖。K值反映每個(gè)因素在3個(gè)不同水平中抑菌能力差異。從4個(gè)因素K1、K2、K3中選擇最大值,即每個(gè)因素最優(yōu)水平;4因素最優(yōu)水平組合即ZHAB63菌株發(fā)酵液最優(yōu)組合。故ZHAB63菌株培養(yǎng)基最優(yōu)組合為A2B2C2D2(如表6所示),即蔗糖(15.0 g·L-1)、酵母粉(20.0 g·L-1)、蛋白胨(20.0 g·L-1)、硫酸鎂(5.0 g·L-1)。

        2.3.2 菌株ZHAB63培養(yǎng)條件優(yōu)化

        結(jié)果見(jiàn)圖3。

        圖2 ZHAB63菌株系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)Fig.2 Phylogenetic tree of strain ZHAB63

        表6 正交試驗(yàn)L9(34)結(jié)果及極差分析Table 6 Analysis of range and result of orthogonal experiment

        圖3 不同培養(yǎng)條件對(duì)ZHAB63菌株抑菌率的影響Fig.3 Effects of different culture conditions on inhibition rate of ZHAB63

        由圖3可知,各因素抑制細(xì)辛菌核病菌生長(zhǎng)。菌株培養(yǎng)48 h時(shí),抑菌率達(dá)84.99%,后緩慢進(jìn)入衰退期,抑菌率呈下降趨勢(shì);菌株在26~32℃均可生長(zhǎng),菌株抑菌率隨溫度升高而增大,但隨溫度升高,拮抗率呈下降狀態(tài),菌株隨溫度變化甚至死亡;轉(zhuǎn)速180 r·min-1時(shí),菌株抑菌率最大,達(dá)83.12%,超過(guò)180 r·min-1后,隨轉(zhuǎn)速增大,抑制率呈下降趨勢(shì);菌株適合在偏弱酸(pH 6.5)環(huán)境下培養(yǎng),強(qiáng)酸或強(qiáng)堿均抑制菌株生長(zhǎng),嚴(yán)重時(shí)甚至導(dǎo)致死亡。

        最佳培養(yǎng)條件為:48 h,30 ℃,180 r·min-1,pH 6.5時(shí)抑菌率最高為84.99%(見(jiàn)圖1A-Ⅰ)。結(jié)果表明,優(yōu)化后ZHAB63菌株等量發(fā)酵液置于相同發(fā)酵條件下抑菌率為84.99%,顯著大于NA培養(yǎng)基發(fā)酵液抑菌率72.22%(見(jiàn)圖1A-Ⅱ),優(yōu)化前后拮抗效果如圖1A所示。

        3 討論與結(jié)論

        3.1 內(nèi)生細(xì)菌分離與拮抗菌株篩選

        內(nèi)生細(xì)菌在植物體內(nèi)普遍存在,但從不同植物體內(nèi)分離到內(nèi)生細(xì)菌種類和數(shù)量存在較大差異,主要與分離方法、培養(yǎng)條件及環(huán)境因素等有關(guān)[15]。在杜仲、連翹、細(xì)葉小檗、明黨參等藥用植物內(nèi)生菌與宿主關(guān)系研究中,不同地區(qū)同一種植物分離的內(nèi)生細(xì)菌會(huì)因植株生長(zhǎng)環(huán)境等因素導(dǎo)致內(nèi)生菌種類、數(shù)量存在明顯差異,同一株植物不同部位內(nèi)生菌種類也存在差異[16-17]。本研究采用傳統(tǒng)組織表面消毒法共分離64株內(nèi)生細(xì)菌,長(zhǎng)春產(chǎn)區(qū)分離得到內(nèi)生細(xì)菌總數(shù)多于通化產(chǎn)區(qū),長(zhǎng)春產(chǎn)區(qū)根中分離內(nèi)生細(xì)菌多于根莖,通化產(chǎn)區(qū)則相反??赡芘c遼藁本栽種環(huán)境及土壤中存活微生物種類有關(guān)。但目前普遍采用的組織表面消毒法可能存在局限性,需進(jìn)一步優(yōu)化內(nèi)生細(xì)菌分離方法加以證實(shí)。

        藥用植物特殊內(nèi)環(huán)境,通過(guò)拮抗活性試驗(yàn),大多數(shù)植物可篩選出具有拮抗活性的內(nèi)生細(xì)菌。饒小莉等從烏拉爾甘草根莖葉組織中分離內(nèi)生細(xì)菌,通過(guò)平板對(duì)峙法篩選6株對(duì)植物病原菌存在拮抗作用菌株[18]。趙智靈等分離篩選吉林省12個(gè)主產(chǎn)區(qū)人參,采用濾紙片法篩選4株對(duì)人參病原真菌具有拮抗活性內(nèi)生細(xì)菌[14]。

        從吉林省2個(gè)主產(chǎn)區(qū)采集遼藁本根、根莖組織分離內(nèi)生細(xì)菌,獲得多株內(nèi)生細(xì)菌,同時(shí)采用生長(zhǎng)速率法獲得一株廣譜性ZHAB63菌株,對(duì)細(xì)辛菌核病菌具有極顯著抑制作用,該研究將豐富藥用植物遼藁本生防菌菌種資源庫(kù),為人參、細(xì)辛、防風(fēng)等植物病害生物防治提供新資源和新途徑。

        3.2 內(nèi)生細(xì)菌ZHAB63鑒定

        物種鑒定是內(nèi)生細(xì)菌研究基礎(chǔ)性工作,遼藁本內(nèi)生細(xì)菌鑒定采用菌株形態(tài)觀察、16SrDNA基因序列測(cè)定以及系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)相結(jié)合方法,與大多植物如人參[14]、水稻[19]等內(nèi)生細(xì)菌鑒定方法一致。16SrDNA序列分析是分子遺傳學(xué)鑒定法中重要鑒定方法之一,可快速準(zhǔn)確鑒定目前尚無(wú)法人工培養(yǎng)微生物,準(zhǔn)確率相對(duì)較高。脂肪酸鑒定廣泛應(yīng)用于植物細(xì)菌鑒定和多樣性研究[20-21],但鑒定方法相對(duì)落后。需有相對(duì)全面基因序列的數(shù)據(jù)庫(kù),否則鑒定結(jié)果準(zhǔn)確率較低,與其他鑒定技術(shù)結(jié)果差異較大,故逐漸被新鑒定技術(shù)替代。16S rDNA序列分析是目前標(biāo)準(zhǔn)微生物鑒定方法。將PCR測(cè)序拼接結(jié)果在基因數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索,查詢相似度最高序列,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)確定菌株種屬地位,可準(zhǔn)確定位植物內(nèi)生細(xì)菌,為遼藁本內(nèi)生細(xì)菌ZHAB63鑒定提供快速有效技術(shù)手段,為后續(xù)深入研究提供基礎(chǔ)。

        芽孢桿菌屬內(nèi)生細(xì)菌對(duì)植物病原真菌多具有抑菌性[22-23]。本研究篩選解淀粉芽孢桿菌ZHAB63,結(jié)合形態(tài)學(xué)特征及16SrDNA序列分析,根據(jù)已報(bào)道解淀粉芽孢桿菌特征描述[22],鑒定ZHAB63菌株為芽孢桿菌屬Bacillus中解淀粉芽孢桿菌B.amylo?liquefaciens。菌株ZHAB63對(duì)11株藥用植物病原真菌均具有高于50%拮抗率,其中對(duì)細(xì)辛菌核病菌拮抗率達(dá)72.22%,且經(jīng)多次驗(yàn)證后抑菌效果均較為穩(wěn)定。可能由于內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)過(guò)程分泌的代謝產(chǎn)物中含有降解植物病原菌酶類,對(duì)細(xì)辛菌核病菌抑制效果比較顯著,因此對(duì)細(xì)辛菌核病菌拮抗作用最明顯,但需進(jìn)一步驗(yàn)證。

        3.3 ZHAB63菌株培養(yǎng)條件優(yōu)化

        研究表明,優(yōu)化生防菌培養(yǎng)液組分及培養(yǎng)條件可提高菌體抗菌活性含量,其中關(guān)于解淀粉芽孢桿菌發(fā)酵條件優(yōu)化較多。章小洪等報(bào)道B.amylo?liquefaciens BW-13菌株以玉米粉、蛋白胨為培養(yǎng)基主要成分,pH 5,28℃,200 r·min-1,發(fā)酵144 h后,菌株拮抗率最高[24];張淑梅等優(yōu)化內(nèi)生菌株TF28液體發(fā)酵條件發(fā)現(xiàn),最優(yōu)培養(yǎng)基配方為葡萄糖、牛肉膏、酵母膏、碳酸鈣,初始pH 7.5,30 ℃,200 r·min-1培養(yǎng)48 h為最佳發(fā)酵條件[25]。本研究通過(guò)不同碳源氮源無(wú)機(jī)鹽篩選優(yōu)化B.amyloliq?uefaciens ZHAB63最佳發(fā)酵培養(yǎng)基成分為蔗糖15.0 g·L-1,酵母粉 20.0 g·L-1,蛋白胨20.0 g·L-1,硫酸鎂5.0 g·L-1,與多數(shù)解淀粉芽孢桿菌生長(zhǎng)所需營(yíng)養(yǎng)成分相似。B.amyloliquefaciens可利用大多數(shù)生物無(wú)法利用的單碳或非C-C鍵多碳化合物,菌株ZHAB63液體發(fā)酵培養(yǎng)基所需最佳碳源為蔗糖,優(yōu)于葡糖糖等其他碳源。ZHAB63菌株對(duì)復(fù)合氮源利用能力較單一氮源強(qiáng),將蛋白胨和酵母粉以同等比例混合作培養(yǎng)基氮源,其抗菌活性較單一氮源高,達(dá)顯著水平。同時(shí),菌株ZHAB63對(duì)無(wú)機(jī)鹽需求較高,加入硫酸鎂對(duì)菌株影響最大,可能與分泌抗菌活性成分有關(guān)。B.amyloliquefaciens ZHAB63最適溫度為30℃,pH 6.5為弱酸性,與張淑梅等報(bào)道溫度結(jié)果一致,但弱堿性適合B.amyloliquefa?ciens菌株生長(zhǎng)存在差異[25]??赡苡捎诮獾矸垩挎邨U菌來(lái)自不同宿主植物,其適宜生長(zhǎng)環(huán)境不同,植株中內(nèi)生細(xì)菌生物學(xué)特性及產(chǎn)生抑菌物質(zhì)能力不同。優(yōu)化后轉(zhuǎn)速為180 r·min-1、發(fā)酵時(shí)間48 h,與張淑梅等發(fā)酵時(shí)間一致[25],轉(zhuǎn)速差異較小。優(yōu)化后抑菌率達(dá)84.99%,比優(yōu)化前72.22%有所提高,表明優(yōu)化后更有利于菌株ZHAB63中抑菌活性物質(zhì)生成。因此,探究?jī)?yōu)勢(shì)內(nèi)生菌株ZHAB63最佳發(fā)酵條件為后續(xù)研究及推廣應(yīng)用提供重要理論依據(jù),為內(nèi)生解淀粉芽孢桿菌應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

        本研究表明,遼藁本中含有豐富內(nèi)生細(xì)菌資源,存在拮抗東北常見(jiàn)藥用植物病原真菌的高活菌株,可作為防治人參、細(xì)辛等東北道地藥材常見(jiàn)植物病原真菌病害新方法,尤其對(duì)細(xì)辛菌核病防治開(kāi)發(fā)前景較好。培養(yǎng)條件優(yōu)化后,菌株ZHAB63對(duì)植物病原菌拮抗作用增強(qiáng)。后續(xù)研究需進(jìn)一步測(cè)定解淀粉芽孢桿菌ZHAB63菌株在遼藁本植株內(nèi)定殖情況及對(duì)遼藁本生長(zhǎng)的影響,評(píng)估其對(duì)細(xì)辛菌核病菌、人參菌核病菌等多種植物病菌生物防治的安全性及田間防病效果,同時(shí)注意提高植物內(nèi)生細(xì)菌在藥用植物病害生物防治中的廣譜性和安全性。

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