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        基于高通量測(cè)序的連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落變化研究

        2020-06-12 02:47:46周柳婷李建鵑趙艷琳吳則焰林文雄
        生態(tài)學(xué)報(bào) 2020年8期
        關(guān)鍵詞:木麻黃桿菌屬根際

        周柳婷,李建鵑,趙艷琳,羅 揚(yáng),白 瑩,陳 軍,吳則焰,3,4,*,林文雄

        1 福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,福州 350002 2 福建農(nóng)林大學(xué)林學(xué)院,福州 350002 3 作物生態(tài)與分子生理學(xué)福建省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福州 350002 4 福建省農(nóng)業(yè)生態(tài)過(guò)程與安全監(jiān)控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福州 350002

        木麻黃(CasuarinaequisetifoliaForst.)是木麻黃屬常綠喬木,20世紀(jì)50年代作為庭院綠化樹(shù)種引入我國(guó)[1- 2],因其良好的適應(yīng)性及抗風(fēng)、耐貧瘠、耐鹽堿等生理特點(diǎn),在維持海岸帶生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定、緩解沿海沙地鹽堿危害、防潮汐侵蝕等方面都起到極其重要的作用[3]。目前濱海沙地的適生樹(shù)種較少,木麻黃作為重要的防護(hù)林樹(shù)種,長(zhǎng)期受到嚴(yán)重的連栽障礙問(wèn)題困擾[4],具體表現(xiàn)為木麻黃平均木生物量、林分生物量及林分凈生產(chǎn)力均呈現(xiàn)逐代下降趨勢(shì),植株生長(zhǎng)緩慢,病蟲(chóng)害嚴(yán)重,造成產(chǎn)量、品質(zhì)下降[5- 6]。如何緩解或消減木麻黃連栽障礙,成為國(guó)內(nèi)外同行研究的前沿?zé)狳c(diǎn)。

        前人研究認(rèn)為,植物連栽障礙是地力衰退[7]、化感物質(zhì)自毒作用[8- 9]、土壤微生態(tài)環(huán)境失衡等諸多方面綜合作用的結(jié)果。在地力衰退研究方面,有學(xué)者指出長(zhǎng)期連栽條件下植物對(duì)土壤礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)元素的片面吸收,使連栽土壤養(yǎng)分不均衡,進(jìn)而導(dǎo)致林分生產(chǎn)力下降、森林防護(hù)效益降低。更有甚者試圖通過(guò)增施肥料的措施來(lái)緩解連栽障礙但收效甚微,反而加劇了環(huán)境污染[10]。在化感物質(zhì)自毒作用研究方面,李鍵[11]、鄧蘭桂[12]等人從木麻黃小枝提取物中分離鑒定出了黃酮類(lèi)、鞣花酸類(lèi)化感物質(zhì),認(rèn)為自毒作用是引起木麻黃連栽障礙的原因。隨著研究的深入,國(guó)內(nèi)外同行逐漸認(rèn)識(shí)到化感物質(zhì)釋放到土壤后勢(shì)必受到微生物的加工、分解、轉(zhuǎn)化等[10,13],其存在只是誘因而不是導(dǎo)致植物連栽障礙形成的直接因素[14],因此土壤微生態(tài)成為連栽障礙研究的關(guān)注焦點(diǎn)。深入研究“植物-土壤-微生物”三者在根際的互作過(guò)程,對(duì)于探索土壤微生物與植物生長(zhǎng)發(fā)育之間的相互調(diào)控關(guān)系、揭示植物連栽障礙機(jī)制至關(guān)重要[15]。例如:Zhao等[16]研究表明,桉樹(shù)多代連栽后根際土壤中真菌多樣性增加;Wu等[17]發(fā)現(xiàn)連栽杉木使根際土壤中真菌/細(xì)菌比例顯著增加,且微生物群落多樣性和代謝活性顯著降低,從而打破了土壤微生態(tài)平衡;葉功富等[18]研究發(fā)現(xiàn),連栽木麻黃林地中細(xì)菌、放線(xiàn)菌、固氮菌與纖維素分解菌數(shù)量分別比一代林地減少22.46%、12.25%、32.66%和29.61%,真菌數(shù)量增加22.39%,微生物總量減少21.07%。目前,雖然已有少量關(guān)于連栽木麻黃土壤微生物數(shù)量變化的研究,但由于傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法的局限性,未能充分揭示連栽條件下土壤微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性的變化規(guī)律[19]。本研究利用空間代替時(shí)間的方法,采用高通量測(cè)序技術(shù)擴(kuò)增細(xì)菌的16S rRNA基因高變區(qū),并對(duì)物種進(jìn)行注釋及相對(duì)豐度分析,探索連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落變化規(guī)律,為揭示木麻黃連栽障礙機(jī)制提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 研究區(qū)概況

        試驗(yàn)樣地選址于福建惠安赤湖國(guó)有防護(hù)林場(chǎng)(118°55′E,24°35′N(xiāo)),該林場(chǎng)占地面積約433 hm2,地處中國(guó)南亞熱帶氣候區(qū)。該地區(qū)夏季多臺(tái)風(fēng)和暴雨,秋冬季盛行東北風(fēng)。年均溫19.8℃,極端低溫1℃,極端高溫35℃,年降雨量1029 mm,年蒸發(fā)量2000 mm[20]。該林場(chǎng)栽植有3個(gè)不同代數(shù)的木麻黃人工林,其中第一代木麻黃林(First rotation plantation,FCP)栽植于1987年,第二代(Second rotation plantation,SCP)栽植于2011年,第三代(Third rotation plantation,TCP)栽植于2014年。不同樣地的伴生樹(shù)種和林下植被基本一致,伴生樹(shù)種均為少量的臺(tái)灣欒樹(shù)(Koelreuteriaelegans)和潺槁木姜子(Litseaglutinosa(Lour.)C. B. Rob.),林下植被均為霍香薊(AgeratumconyzoidesL.)和鬼針草(BidenspilosaL.)。土壤質(zhì)地均為風(fēng)積黃沙土。

        1.2 土壤樣品的采集

        2018年7月,于福建惠安赤湖境內(nèi)的國(guó)有防護(hù)林場(chǎng)內(nèi)設(shè)置樣地:在FCP、SCP和TCP設(shè)立3個(gè)林地概況相近的20 m×20 m實(shí)驗(yàn)樣地,每個(gè)樣地設(shè)3個(gè)重復(fù)樣方,共9個(gè)樣方。采集木麻黃根際土壤方法參考王圳等[21]的“抖落法”:沿“S”形路徑在每個(gè)樣方內(nèi)選擇20株平均胸徑、樹(shù)高相近的木麻黃,去除其落葉層后逐層挖去上層覆土,剪下細(xì)根分枝并輕輕抖動(dòng),仍粘在細(xì)根上的即為根際土壤,用小毛刷收集至自封袋中保存?zhèn)溆?。將每個(gè)樣方內(nèi)取得的20份根際土壤混勻?yàn)?份土樣,共獲得9份土壤樣品。土樣通過(guò)2 mm篩選后其中一部分保存于-80℃冰箱,另一部分土樣4℃冰箱保存用于測(cè)定土壤中微生物多樣性。

        1.3 根際土壤DNA提取及PCR擴(kuò)增

        利用試劑盒BioFast Soil Genomic DNA Extraction Kit(BioFlux公司,中國(guó))提取木麻黃根際土壤微生物基因組總DNA。DNA濃度通過(guò)Nanodrop進(jìn)行測(cè)定,并用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA 的質(zhì)量。再將基因組總DNA用無(wú)菌水稀釋至1 ng/μL。以稀釋后的基因組DNA為模板,采用 Phusion? High-Fidelity PCR Master Mix with GC Buffer和高效高保真酶(New England Biolabs公司,美國(guó))對(duì)細(xì)菌16S rRNA基因的V4區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增引物為515F(5′-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA- 3′)和806R(5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT- 3′)[22]。采用50 μL PCR擴(kuò)增體系,反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃預(yù)變性1 min;30個(gè)循環(huán)包括(98℃,10 sec;50℃,30 sec;72℃,30 sec);72℃,5 min。擴(kuò)增后用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物的質(zhì)量。將PCR產(chǎn)物送至北京諾禾至源科技有限公司進(jìn)行高通量測(cè)序。

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        測(cè)序所得的原始數(shù)據(jù)經(jīng)Fast QC軟件進(jìn)行質(zhì)控后,利用Cutadapt(V1.9.1)軟件去除短序列(<200 bp)及低質(zhì)量序列(q<25)[23]。通過(guò)Mothur方法與SILVA數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)97%相似度的有效序列分配操作分類(lèi)單元(Operational Taxonomic Units,OTUs)[24]。依據(jù)物種分類(lèi)信息繪制物種分類(lèi)條形圖和物種豐度熱圖[25]。再通過(guò)QI-IME 軟件計(jì)算樣品的覆蓋度和多樣性指標(biāo)[26- 28]。運(yùn)用PICRUSt軟件對(duì)菌群的功能和代謝途徑進(jìn)行預(yù)測(cè)分析[29]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落OTU組成及結(jié)構(gòu)

        通過(guò)IonS5TMXL測(cè)序平臺(tái),從3個(gè)林地概況相近的不同連栽代數(shù)木麻黃根際土壤中總共得到338560條有效序列,平均每個(gè)樣品的有效序列為37618條。以97%的序列相似性閾值將有效序列聚類(lèi)為17627個(gè)OTU。其中FCP均值為1905個(gè)OTU,SCP均值為2046個(gè)OTU,TCP均值為1924個(gè)OTU。平均而言,約98.6%的有效序列可聚類(lèi)為門(mén)級(jí),但僅有38.68%以上的有效序列可聚類(lèi)為屬級(jí)。稀釋曲線(xiàn)可直接反映所抽取的優(yōu)化序列深度是否合理,并間接反映樣品中的物種豐富度[30]。由圖1可知,抽取的序列條數(shù)達(dá)到25000條以上,曲線(xiàn)趨于平坦,表明不同處理土壤所測(cè)的序列庫(kù)容都能夠較好地反映細(xì)菌群落種類(lèi)數(shù)量,測(cè)序數(shù)據(jù)量基本合理。

        Venn圖可以直觀(guān)地體現(xiàn)不同代數(shù)木麻黃根際土壤細(xì)菌群落OTU組成的差異性及重疊情況(圖2)。維恩分析結(jié)果表明,在OTU水平上,FCP中特異性細(xì)菌OTU占總OTU序列數(shù)的9.86%(341),SCP中特異性細(xì)菌OTU占14.68%(508),TCP中特異性細(xì)菌OTU占9.62%(333)。此外,FCP與SCP共有的OTU數(shù)量為292(8.44%),SCP與TCP共有的OTU數(shù)量為345(9.97%),FCP與TCP共有的OTU數(shù)量為177(5.12%)。FCP、SCP、TCP根際土壤中共有的細(xì)菌OTU數(shù)量為1464(42.31%)。

        圖1 木麻黃根際土壤樣本微生物群落的稀釋曲線(xiàn)Fig.1 Rarefaction curves of microbial communities in rhizosphere soils samples of C. equisetifolia FCP:第一代First rotation plantation;SCP:第二代Second rotation plantation;TCP:第三代Third rotation plantation

        圖2 基于OTU豐度的不同代數(shù)木麻黃根際土壤細(xì)菌群落維恩圖Fig.2 Venn diagram of bacterial communities in rhizosphere soil of different rotations of C. equisetifolia based on OTUs abundance

        2.2 連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)

        2.2.1連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落多樣性分析

        通過(guò)土壤樣品中細(xì)菌群落多樣性分析指數(shù),對(duì)連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落物種豐富度和均勻度進(jìn)行評(píng)估(cutoff=27075)。由表1可知,隨著連栽代數(shù)增加,Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)均逐代下降,而Observed species、Shannon指數(shù)則呈現(xiàn)先上升后降低的趨勢(shì),但差異均不顯著(P>0.05),Simpson指數(shù)幾乎沒(méi)有發(fā)生變化。Shannon指數(shù)分析顯示,木麻黃根際土壤SCP(8.874)中細(xì)菌多樣性相對(duì)較高,FCP(8.780)最低。從Chao1指數(shù)分析來(lái)看,FCP物種豐富度最高(2086.012),SCP次之(2005.244),TCP最低(2002.447)。

        表1 連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落豐富度和多樣性指數(shù)

        每列不同字母表示差異達(dá)顯著水平(P≤0.05,n=3)

        圖3 不同代數(shù)木麻黃根際土壤樣本間的Weighted Unifrac距離和Unweighted Unifrac距離Fig.3 Weighted and unweighted Unifrac distances between rhizosphere soils samples of different rotations of C. equisetifolia

        通過(guò)Weighted Unifrac距離和Unweighted Unifrac距離來(lái)比較兩個(gè)樣品間物種多樣性的相異程度。FCP和SCP之間的Weighted Unifrac距離和Unweighted Unifrac距離分別為0.181和0.416,FCP和TCP之間分別為0.174和0.405,SCP和TCP之間分別為0.123和0.391。

        圖4 連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落PcoA分析Fig.4 PcoA analysis of bacterial communities from rhizosphere soils of continuous rotations of C. equisetifolia

        2.2.2連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落PCoA分析與UPGMA聚類(lèi)分析

        基于OTU的木麻黃根際土壤細(xì)菌群落主坐標(biāo)分析(Principal Co-ordinates Analysis,PCoA)結(jié)果見(jiàn)圖4,主成分1(PC1)與主成分2(PC2)分別解釋變量方差的30.32%、22.93%,兩者累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)53.25%。PC1將FCP中的細(xì)菌群落與SCP、TCP明顯區(qū)分開(kāi),PC2將SCP中的細(xì)菌群落與FCP、TCP明顯區(qū)分開(kāi)。UPGMA(Unweighted Pair-group Method with Arithmetic Mean)聚類(lèi)分析結(jié)果見(jiàn)圖5,SCP和TCP的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)聚集為一個(gè)群體,再與FCP聚集在一起形成系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),說(shuō)明FCP與SCP、TCP二者存在較大差異。

        2.2.3連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落組成及結(jié)構(gòu)變化

        圖5 連栽木麻黃根際土壤的UPGMA聚類(lèi)分析Fig.5 UPGMA analysis of bacterial communities from rhizosphere soil of continuous rotations of C. equisetifolia

        在木麻黃根際土壤細(xì)菌群落中共檢測(cè)到10個(gè)門(mén),優(yōu)勢(shì)類(lèi)群依次是變形菌門(mén)(Proteobacteria)(30.27%—34.42%)、酸桿菌門(mén)(Acidobacteria)(28.10%—32.21%)、放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria)(14.86%—18.84%)、疣微菌門(mén)(Verrucomicrobia)(3.79%—8.09%)(圖6)。由表2可知,在屬水平上,熱酸菌屬(Acidothermus)、CandidatusSolibacter、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)、根微菌屬(Rhizomicrobium)、酸桿菌屬(Acidibacter)、變桿菌屬(Variibacter)、布氏桿菌屬(Bryobacter)是根際土壤細(xì)菌群落的優(yōu)勢(shì)屬(豐度>1%),其中FCP中最高豐度屬是熱酸菌屬(Acidothermus),而SCP、TCP根際土壤中CandidatusSolibacter相對(duì)豐度最高。隨著木麻黃連栽代數(shù)增加,根際土壤中熱酸菌屬(Acidothermus)、根微菌屬(Rhizomicrobium)、酸桿菌屬(Acidibacter)、布氏桿菌屬(Bryobacter)的相對(duì)豐度大體呈下降趨勢(shì),其中酸桿菌屬(Acidibacter)的相對(duì)豐度在FCP、SCP、TCP之間的下降趨勢(shì)達(dá)顯著水平(P<0.05)。與之相反,慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)的相對(duì)豐度隨連栽代數(shù)的增加而增加。此外,從木麻黃根際土壤中前35個(gè)優(yōu)勢(shì)細(xì)菌在屬水平的群落熱圖分析也可以看出,木麻黃連栽后土壤細(xì)菌群落組成結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著變化(圖7)。

        圖6 連栽木麻黃根際土壤優(yōu)勢(shì)細(xì)菌在門(mén)水平的群落相對(duì)豐度Fig.6 The relative abundance of predominant bacteriain rhizospheric soil samples of continuous rotations of C. equisetifolia at the phylum level

        3 結(jié)論與討論

        植物根系與根際微生物形成的植物-微生物群落綜合體,是“植物-土壤-微生物”三者進(jìn)行根際互作過(guò)程的重要場(chǎng)所[31]。根際微生物是土壤生態(tài)系統(tǒng)能量流動(dòng)、物質(zhì)循環(huán)和信息傳遞最主要的驅(qū)動(dòng)者,對(duì)維持土壤生產(chǎn)力至關(guān)重要[32]。本研究通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落變化進(jìn)行探究。結(jié)果表明連栽后根際土壤細(xì)菌群落的組成與結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著變化。由多樣性分析可知,木麻黃根際土壤細(xì)菌群落的Simpson、Chao1、ACE指數(shù)隨著連栽代數(shù)的增加而下降,Observed species、Shannon指數(shù)呈現(xiàn)先增加后減少的趨勢(shì),變化趨勢(shì)不一致的原因可能是由于土壤理化性質(zhì)不完全一致、林齡差異、森林凋落物等因素導(dǎo)致。這與韓亞飛[33]研究楊樹(shù)土壤細(xì)菌群落多樣性所提出的觀(guān)點(diǎn)相似,但與李延茂等[34]通過(guò)DGGE分析法研究杉木根際土壤細(xì)菌群落的結(jié)果不一致。推測(cè)可能是由于技術(shù)方法不同、樹(shù)種差異、地域差別、土壤異質(zhì)性等因素造成研究結(jié)果不一致。

        進(jìn)一步分析連栽木麻黃根際土壤細(xì)菌群落組成與結(jié)構(gòu)變化。由圖6可知,不同連栽代數(shù)木麻黃根際土壤細(xì)菌在門(mén)水平上的最優(yōu)勢(shì)類(lèi)群是變形菌門(mén)(Proteobacteria),分別占FCP、SCP、TCP根際土壤總細(xì)菌豐度的34.42%、30.27%、32.34%,證實(shí)了變形菌門(mén)是陸地土壤生態(tài)系統(tǒng)細(xì)菌群落的優(yōu)勢(shì)類(lèi)群,與Bazylinski等[35]的研究結(jié)果一致。慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)是變形菌門(mén)α變形菌綱的一種根瘤菌[36],可以與寄主植物形成共生關(guān)系,將大氣中的游離氮固定成寄主生物可以利用的形式,例如氨(NH3)或銨(NH4+)[37]。木麻黃是重要的結(jié)瘤共生固氮樹(shù)種之一[38],可以富集根瘤菌以適應(yīng)貧瘠的濱海沙地環(huán)境。在本研究中,隨著連栽代數(shù)的增加,慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)的相對(duì)豐度隨之增加約132.57%、244.81%,且FCP、SCP兩者與TCP的差異達(dá)顯著水平(P<0.05)。與朱琳等[39]研究大豆連作土壤細(xì)菌群落多樣性所得的結(jié)論一致。與之相反,根際土壤中的熱酸菌屬(Acidothermus)、根微菌屬(Rhizomicrobium)、酸桿菌屬(Acidibacter)、布氏桿菌(Bryobacter)的相對(duì)豐度呈下降趨勢(shì)。變形菌門(mén)下的根微菌屬(Rhizomicrobium)是在土壤氮循環(huán)、解磷過(guò)程以及降解有機(jī)物過(guò)程中發(fā)揮重要作用的有益微生物[40]。在本研究中,隨著連栽代數(shù)的增加,根微菌屬(Rhizomicrobium)的相對(duì)豐度隨之降低約311.49%、282.16%,且FCP與SCP、TCP兩者的差異達(dá)顯著水平(P<0.05)。酸桿菌門(mén)下的酸桿菌屬(Acidibacter)是具有分解蛋白質(zhì)和攝取環(huán)境周?chē)嵝晕镔|(zhì)的有益菌屬[41]。在本研究中,隨著連栽代數(shù)的增加,酸桿菌屬(Acidibacter)的相對(duì)豐度隨之降低約176.07%、284.54%,且FCP、SCP與TCP三者之間的差異達(dá)顯著水平(P<0.05)。由此可見(jiàn),木麻黃連栽后根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變。這種現(xiàn)象可能是由于根系化感物質(zhì)所產(chǎn)生的間接生態(tài)效應(yīng)引起的,從而導(dǎo)致根際微生物發(fā)生惡化偏移。化感物質(zhì)可以直接或間接影響根際微生物的代謝和生長(zhǎng)發(fā)育,進(jìn)而對(duì)根際微生物的種類(lèi)、數(shù)量和分布產(chǎn)生影響[42]。如田給林[43]研究發(fā)現(xiàn),外源添加阿魏酸能顯著促進(jìn)草莓專(zhuān)化型尖孢鐮刀菌的生長(zhǎng)及孢子萌發(fā),從而間接侵染草莓植物,造成連作障礙的發(fā)生。劉金光等[44]研究發(fā)現(xiàn),低濃度的苯甲酸對(duì)曲霉菌屬和鐮刀菌屬有顯著促進(jìn)作用,造成根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)失衡。

        本研究證實(shí)了木麻黃長(zhǎng)期單一化栽植后,根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著變化,導(dǎo)致土壤微生態(tài)失衡,間接造成木麻黃連栽障礙問(wèn)題。然而,連栽障礙形成及加重的原因不是單一孤立的,是眾多因素彼此影響、相互制約的結(jié)果。唯有建立在充分了解“土壤-微生物-根際”相互關(guān)系的基礎(chǔ)上,才能系統(tǒng)地認(rèn)識(shí)連栽木麻黃的根際生態(tài)效應(yīng)。因此,對(duì)于木麻黃根際土壤化感物質(zhì)如何介導(dǎo)土壤微生物區(qū)系定向演變?以及關(guān)鍵的特異微生物如何在木麻黃連栽障礙形成的根際生態(tài)學(xué)中扮演重要角色,仍需實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證討論。

        圖7 連栽木麻黃根際土壤優(yōu)勢(shì)細(xì)菌在屬水平的群落熱圖分析Fig.7 Heat map analysis of the main bacteria in rhizospheric soil of continuous rotations of C. equisetifolia at the genus level

        表2 連栽木麻黃根際土壤在屬水平的細(xì)菌群落信息

        Table 2 Information regarding the bacterial community at the genus level inrhizospheric soil ofC.equisetifoliaunder successive rotations

        屬Genus相對(duì)豐度Relative abundance/%FCPSCPTCP熱酸菌屬Acidothermus5.2841a2.498b3.5629bCandidatus Solibacter3.7661a3.7932a3.9471a慢生根瘤菌屬Bradyrhizobium1.6103b2.1348b3.9421a根微菌屬Rhizomicrobium3.4669a1.1130b1.2287b酸桿菌屬Acidibacter3.6959a2.0991b1.2989c變桿菌屬Variibacter3.6171a2.2727b3.4595ab布氏桿菌屬Bryobacter2.5793a1.5328b1.6707b伯克氏菌屬Burkholderia0.8815b1.3777a1.7593aH161.2533a0.7842b0.7707bTerracidiphilus0.7436b0.9037b1.2213a放線(xiàn)菌屬Actinospica0.1404b0.4481b0.8593a克洛氏菌屬Crossiella0.2425c0.4087b0.9701a地桿菌屬Geobacter0.2622b0.5134ab0.8199a分枝桿菌屬M(fèi)ycobacterium0.4986b0.5368b0.8384a假羅布里斯屬Pseudolabrys0.3804ab0.5405a0.3053b鏈霉菌屬Streptomyces0.2278c0.474b0.6316a埃達(dá)布特屬Edaphobacter0.4666a0.0246b0.0320b乳桿菌屬Acidobacterium0.5392a0.0813b0.1305b苯基桿菌屬Phenylobacterium0.4555a0.1108b0.0874b酸雙酯屬Acidicaldus0.4925a0.3533b0.2979b梭菌屬Clostridium sensu stricto 10.3029b0.4112a0.3977abMizugakiibacter0.3817a0.0111b0.0037b

        每列不同字母表示差異達(dá)顯著水平(P<0.05,n=3)

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