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        無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測在胎兒性染色體疾病篩查中的應(yīng)用

        2020-05-21 03:08:40姚潤斯馬容揭深秋趙衛(wèi)華
        關(guān)鍵詞:檢測

        姚潤斯 馬容 揭深秋 趙衛(wèi)華

        (深圳市第二人民醫(yī)院 產(chǎn)前診斷中心,廣東 深圳 518035)

        1997年,盧煜明[1]教授首次發(fā)現(xiàn)孕婦外周血中存在游離胎兒DNA,隨后各研究機構(gòu)開始競相開發(fā)相關(guān)技術(shù),以鑒定、定量和測序妊娠期孕婦外周血中的游離胎兒DNA,從而篩查染色體非整倍體異常和其他遺傳疾病。2011年10月,無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(non-invasive prenatal genetic testing,NIPT)首次用于21-三體綜合征的商業(yè)化檢測,后來發(fā)展到篩查18-三體、13-三體綜合征以及胎兒性別的鑒定等。最近一項針對37個研究進行的游離胎兒DNA非整倍體篩查的meta分析發(fā)現(xiàn),NIPT對21-三體、18-三體和13-三體的匯總加權(quán)檢測率分別為99.2%、96.3%和91.0%[2],可見NIPT對21-三體、18-三體和13-三體的檢測有很高的準(zhǔn)確性。

        目前有研究表明,NIPT不僅可以檢測常染色體疾病,其對性染色體非整倍體的檢測也有較高的準(zhǔn)確性[3]。值得注意的是,性染色體非整倍體的發(fā)生和孕婦年齡無關(guān),發(fā)生率在人群中為1/500[4],活產(chǎn)率為1/350~1/400[5]。常見的性染色體非整倍體是Turner綜合征(45,XO)、超雌綜合征(47,XXX)、超雄綜合征(47,XYY)和克氏綜合征(47,XXY)。性染色體非整倍體的患者表型差異巨大,到目前為止,尚無方法能準(zhǔn)確預(yù)測患者將出現(xiàn)的臨床癥狀。因此,對性染色體非整倍體患者進行產(chǎn)前篩查和診斷,有利于患者的進一步教育和醫(yī)療護理。目前除NIPT外,尚未發(fā)現(xiàn)其他能檢測出胎兒性染色體非整倍體疾病的方法[6]。

        本文通過統(tǒng)計2016年3月至2019年6月在深圳市第二人民醫(yī)院行NIPT的16119名單胎孕婦中提示21-三體、18-三體、13-三體、性染色體異常和其他染色體異常的患者數(shù)量,同時對因“NIPT提示性染色體異?!钡?7名患者行羊膜腔穿刺術(shù)及染色體核型分析進行確診。從而明確NIPT對染色體疾病的檢出率,以及評價NIPT在性染色體異常中的臨床應(yīng)用價值。

        1 資料與方法

        1.1 基本資料 選取2016年3月至2019年6月在深圳市第二人民醫(yī)院行NIPT的16119例單胎孕婦作為研究對象,所有檢測的孕婦本人近期未接受過異體輸血、移植手術(shù)和干細胞治療等,并簽署知情同意書,統(tǒng)計提示21-三體、18-三體、13-三體、性染色體異常和其他染色體異常的患者數(shù)量。選取2016年3月至2019年6月因“NIPT提示性染色體異?!痹诒驹盒星秩胄援a(chǎn)前診斷的47名患者,追蹤隨訪染色體核型分析結(jié)果。

        1.2 無創(chuàng)基因檢測方法 采集5ml孕婦外周血,經(jīng)離心后取上清血漿,按照核酸提取試劑盒操作說明書從中提取游離DNA,經(jīng)修復(fù)末端、接頭連接、PCR擴增和文庫定量等,依托Ion Proton平臺,使用BioelectronSeq4000高通量測序儀器進行高通量基因測序,測序結(jié)束后,用無創(chuàng)產(chǎn)前管理軟件分析數(shù)據(jù),計算出Z值,根據(jù)每個樣本的Z值預(yù)測胎兒患染色體異常的風(fēng)險比率。

        1.3 羊水/臍血細胞培養(yǎng)和核型分析“NIPT提示性染色體異?!钡幕颊?,在充分告知其羊水/臍血穿刺風(fēng)險的情況下,簽署知情同意書。在超聲定位下行羊膜腔/臍血穿刺術(shù),抽取羊水30ml或臍血3ml,在遺傳實驗室行細胞培養(yǎng),常規(guī)固定、制片和染色處理后,根據(jù)國際人類細胞遺傳學(xué)命名體系(ISCN2009)進行核型分析及計數(shù)。

        2 結(jié)果

        2.1 NIPT對性染色體的篩查情況 16119例在本院行NIPT的單胎妊娠婦女均完成游離胎兒DNA的檢測,結(jié)果共報告異常192例,篩查陽性率為1.19%。包括21-三體68例(篩查陽性率0.42%),18-三體16例(篩查陽性率0.10%),13-三體11例(篩查陽性率0.07%),性染色體異常61例(篩查陽性率0.38%),其他染色體異常36例(篩查陽性率0.22%)。

        2.2 羊水/臍血細胞染色體核型分析結(jié)果 47例因“NIPT提示性染色體異?!痹诒驹盒醒蛩?臍血穿刺的孕婦中,經(jīng)染色體核型分析,有26例被確診為胎兒患有不同類型的性染色體疾病,陽性預(yù)測值為55.32%,假陽性率為44.68%。23例NIPT提示性染色體數(shù)目偏多者中,確診為胎兒性染色體數(shù)目偏多的數(shù)量為21例,陽性預(yù)測值為91.30%,假陽性率為8.70%。其中13例確診為47,XXY,4例確診為47,XXX,1例確診為45X[94]/47,XXX[6],3例確診為47,XYY。20例NIPT提示性染色體數(shù)目偏少者中,有2例確診為45,XO,2例確診為嵌合體,分別為45,X[9]/46,X,i(q10)[42]和45X[9]/46,XN[61]。陽性預(yù)測值為20.0%,假陽性率為80.0%。 NIPT提示性染色體數(shù)目異常者4例,確診為性染色體異常者1例,陽性預(yù)測值為25%,假陽性率為75%。見表1和表2。

        表1 2016年3月至2018年7月NIPT提示性染色體異常的病歷資料

        續(xù)表

        373018+2性染色體數(shù)目偏多47,XXY一致382818性染色體數(shù)目偏多47,XXY一致392618+3性染色體數(shù)目偏少46,XN不一致403722+5性染色體數(shù)目偏少45,X一致412221+6性染色體數(shù)目偏多47,XXY一致422819+3性染色體數(shù)目偏多47,XXY一致432922+3性染色體數(shù)目偏少46,XN不一致442920性染色體數(shù)目偏少46,XN不一致452324+1性染色體數(shù)目偏多46,XXX一致463120+1性染色體數(shù)目偏多45X[94]/47,XXX[6]一致472821性染色體數(shù)目偏多47,XXY一致

        表2 性染色體異常核型陽性情況

        3 討論

        在NIPT應(yīng)用于臨床之前,若唐氏篩查提示異常,侵入性產(chǎn)前診斷便成了唯一的進一步檢查手段,但因侵入性產(chǎn)前診斷可造成流產(chǎn),導(dǎo)致很多孕婦拒絕行侵入性產(chǎn)前診斷。而NIPT可避免胎兒流產(chǎn)的風(fēng)險,并且有較高的準(zhǔn)確性[7],因此成為了越來越多孕婦的選擇。與唐氏綜合征產(chǎn)前篩查相比,NIPT的檢出率更高(96.52%比85.9%),理論上將侵入性產(chǎn)前診斷的數(shù)量減少了60%,理論上也減少了73.5%的正常妊娠丟失率[8]。美國一家醫(yī)院的回顧性研究顯示,在2012年引入NIPT后,羊膜穿刺術(shù)和絨毛穿刺術(shù)分別減少了76%和54%[9]。

        16119名在本院行NIPT的單胎孕婦中,不僅檢測出了68例21-三體(篩查陽性率0.42%)、16例18-三體(篩查陽性率0.10%)、11例13-三體(篩查陽性率0.07%),還檢測出了36例其他常染色體異常(篩查陽性率0.22%)。表明NIPT也可以檢測出除21-三體、18-三體和13-三體以外的其他常染色體疾病,但是本研究缺乏對這部分人群的追蹤隨訪,無法得知確診結(jié)果。從技術(shù)上來說,NIPT可以檢測所有常染色體疾病。國際產(chǎn)前診斷協(xié)會(International Society for Prenatal Diagnosis,ISPD)表示,NIPT可以用于檢測臨床重要且意義明確的其他常染色體三體綜合征。但是美國醫(yī)學(xué)遺傳與基因組學(xué)會(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)并不建議使用NIPT來檢測除21-三體、18-三體和13-三體以外的其他常染色體疾病,美國婦產(chǎn)科醫(yī)師學(xué)會(American Congress of Obstetricians and Gynecologists,ACOG)也沒有提及NIPT是否可以檢測除21-三體、18-三體和13-三體以外的其他常染色體疾病。

        16119名在本院行NIPT的單胎孕婦中,提示性染色體異常者61例(篩查陽性率0.38%),篩查陽性率和國內(nèi)同類研究基本一致[10]。有研究表明,45,XO 在妊娠中的發(fā)生率為1%~1.5%[11],是首次妊娠流產(chǎn)的常見原因(占總流產(chǎn)率23%)[12]。47,XXX和47,XYY核型的個體表型是高度可變的,這種可變性可能是社會或認知方面的不足造成的。而47,XXY有典型的表型且與不孕相關(guān)[13]。性染色體疾病在胎兒期沒有顯性臨床癥狀或超聲異常[14],早期和中期血清學(xué)篩查也不能檢測出性染色體異常。除了NIPT以外,目前沒有其他的方式能夠篩查性染色體疾病,因此,NIPT在對性染色體疾病的篩查中顯示出了越來越重要的地位。

        國外一項前瞻性研究顯示,NIPT對性染色體非整倍體的陽性預(yù)測值為48.4%(根據(jù)特定的性染色體三體,其陽性預(yù)測值的范圍為30%~67%)[15]。47例因“NIPT提示性染色體異?!痹诒驹盒醒蚰で淮┐绦g(shù)或臍靜脈穿刺術(shù)的孕婦中,經(jīng)染色體核型分析確診,有26例被確診為不同的性染色體疾病,陽性預(yù)測值為55.32%,假陽性率為44.68%,和國外的研究基本一致。本研究中,對性染色體數(shù)目偏多的陽性預(yù)測值高達91.30%,表明NIPT對檢測性染色體偏多有很高的準(zhǔn)確性。而對于性染色體數(shù)目異常的陽性預(yù)測值為25.0%,表明NIPT對性染色體數(shù)目異常的檢測準(zhǔn)確性低。而對于性染色體偏少,本研究中的陽性預(yù)測值僅為20.0%。國內(nèi)有研究表明,NIPT對45,XO的陽性預(yù)測值為0[16],另一項研究顯示,NIPT對45,XO的陽性預(yù)測值為40%[17]。可見,不同的研究均顯示對性染色體偏少的陽性預(yù)測值均較低。

        本研究中NIPT對性染色體數(shù)目異常和性染色體數(shù)目偏少的陽性預(yù)測值較低的原因,可能與以下因素有關(guān)。①X染色體上胞嘧啶和胸腺嘧啶含量的偏移;X和Y染色體高度同源,不易分辨,而且Y染色體和其他染色體有較多的相似片段,使測序性噪比降低[17];②游離胎兒DNA的主要來源是胎盤滋養(yǎng)層組織,胎盤的染色體組成可能與胎兒不一樣,這種現(xiàn)象被稱為局限性胎盤嵌合現(xiàn)象,是游離胎兒DNA篩選試驗產(chǎn)生假陽性結(jié)果的常見原因;③母體染色體核型異常:包括先前未知的母體嵌合體(例如低比例嵌合的母親Turner綜合征)和母體拷貝數(shù)變異[18];④母源性腫瘤:2013年發(fā)表了第一篇關(guān)于游離胎兒DNA篩查結(jié)果假陽性,隨后診斷為母親惡性腫瘤的報道[19]。這可能和腫瘤細胞的細胞遺傳學(xué)異常有關(guān);⑤母體的健康狀況,但是目前尚沒有報道指出孕婦健康狀況和NIPT結(jié)果的確切關(guān)系。

        對于NIPT在性染色體非整倍體中的應(yīng)用問題,ACMG在2016年發(fā)表的聲明指出,應(yīng)告知所有孕婦NIPT應(yīng)用可以擴展到性染色體非整倍體篩查,并應(yīng)告知患者NIPT對于性染色體非整倍體篩查假陽性率較高這一情況[20]。而ACOG建議所有孕20周內(nèi)的孕婦,不論年齡,均可行NIPT[21]。

        綜上所述,NIPT不僅可以檢測出常染色體異常,還能檢測出性染色體異常。但是,由于NIPT對性染色體異常檢測的假陽性率較高,因此,當(dāng)NIPT發(fā)現(xiàn)性染色體異常時,需要進一步行侵入性產(chǎn)前診斷。與常染色體三體相比,大多數(shù)性染色體非整倍體患者,除了45,XO外,很少有嚴(yán)重的身體異常,這使得NIPT陽性者的產(chǎn)前咨詢和決策復(fù)雜化。因此,提高NIPT對性染色體篩查的準(zhǔn)確率非常重要。最近,NIPT已經(jīng)擴大了游離胎兒DNA的檢測范圍,包括對性染色體非整倍體、微缺失綜合征,甚至雙胎的21-三體、18-三體、13-三體的檢測[22,23]。隨著數(shù)據(jù)積累,NIPT對性染色體異常的檢測一定會越來越受到重視。

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