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        細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶9 及其抑制劑研究進展

        2020-05-10 03:58:22闞少鑫盧娜
        藥學(xué)進展 2020年3期
        關(guān)鍵詞:平度細(xì)胞周期磷酸化

        闞少鑫,盧娜

        (中國藥科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床藥學(xué)學(xué)院江蘇省腫瘤發(fā)生與干預(yù)重點實驗室,江蘇 南京 210009)

        細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)是一類絲氨酸/蘇氨酸激酶,它們在細(xì)胞轉(zhuǎn)錄、細(xì)胞周期以及神經(jīng)分化過程中發(fā)揮著重要的作用[1]。CDK 按照功能可以分為2 種:一種控制細(xì)胞周期,一種調(diào)節(jié)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄。CDK9 和其他CDK 不同的是,它只在轉(zhuǎn)錄延長階段發(fā)揮作用,不參與細(xì)胞周期的調(diào)節(jié)。CDK9 與細(xì)胞周期蛋白(分別是T1、T2 和K)形成異源二聚體,即正性轉(zhuǎn)錄延長因子b(positive transcription elongation factor b,P-TEFb)。P-TEFb 能夠磷酸化RNA 聚合酶Ⅱ(RNA polymerase II,Pol II)的碳末端結(jié)構(gòu)域上的2 位絲氨酸,激活Pol Ⅱ。

        近來研究證實了CDK9 在許多病理過程中的重要性,如腫瘤、病毒復(fù)制、炎癥反應(yīng)及心血管疾病等。

        CDK9 存在于所有的哺乳動物細(xì)胞中,其能與對應(yīng)的細(xì)胞周期蛋白結(jié)合形成P-TEFb,促進轉(zhuǎn)錄延長。人類免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV1)的轉(zhuǎn)錄主要由反式激活蛋白(transactivating protein,TAT)控制。TAT 直接與P-TEFb的亞基CycT1 結(jié)合,而P-TEFb 由CDK9 和CycT1組成。這些分子對Pol Ⅱ的碳端結(jié)構(gòu)域(carbonterminal domain,CTD)的磷酸化起著重要作用。

        病理性心肌肥大是心肌細(xì)胞和冠狀動脈血管生長不平衡的結(jié)果。心肌細(xì)胞肥大可歸因于細(xì)胞內(nèi)整體RNA 含量升高所導(dǎo)致的蛋白質(zhì)合成增加,而負(fù)責(zé)編碼RNA 轉(zhuǎn)錄的Pol Ⅱ被認(rèn)為是心肌肥大的限制因素[3]。

        越來越多的研究表明,CDK9 與血液腫瘤[4]、肝癌[5]、前列腺癌[6]、成神經(jīng)細(xì)胞瘤[7]等有關(guān)。因此,CDK9 被認(rèn)為是治療腫瘤的一個潛在的藥物靶點。

        本文綜述了CDK9 的功能及CDK9 抑制劑的研究進展,旨在為CDK9 抑制劑類抗腫瘤藥物的研發(fā)提供參考。

        1 CDK9 的生物學(xué)功能

        CDK9 最初因其特征性的氨基酸基序(Pro-Ile-Thr-Ala-Leu-Arg-Glu)被命名為PITALRE,其功能首次在人類免疫缺陷病毒的研究中得到闡明[8]。CDK9 在細(xì)胞中包括CDK942與CDK955這2 種亞型。其中,在結(jié)構(gòu)上CDK955僅在N 端比CDK942多出117 個氨基酸,2 種亞型的磷酸化的方式可能相同,但是二者在細(xì)胞內(nèi)分布的位置、表達(dá)的模式、調(diào)節(jié)的方式,以及在組織中的表達(dá)都有差異[9]。據(jù)報道,CDK942主要在核質(zhì)中,而CDK955在核仁中。在未分化的單核細(xì)胞中,CDK942的表達(dá)水平高于CDK955,而在巨噬細(xì)胞分化時會誘導(dǎo)CDK955的表達(dá)[10]。在原始淋巴細(xì)胞中雖然CDK955與CDK942的基因編碼相同,但二者的啟動子區(qū)域不同。所以2 種亞型的差異性表達(dá)和細(xì)胞信號傳導(dǎo)以及細(xì)胞類型有關(guān)。二者在組織中分布也有差異,CDK942主要分布在睪丸和脾,而CDK955主要分布在肝組織、腦和肺[11]。

        在細(xì)胞中這2 種亞型都可以與細(xì)胞周期蛋白(分別是T1、T2 和K)形成P-TEFb 復(fù)合物。但由于CDK9 的單體不夠穩(wěn)定,所以在與細(xì)胞周期蛋白結(jié)合前,需要與伴侶蛋白(CDC37、HSP70 和HSP90)結(jié)合形成瞬時復(fù)合物。隨后,CDK9 從這個瞬時復(fù)合物釋放出來,再與細(xì)胞周期蛋白結(jié)合。CDK9 與細(xì)胞周期蛋白結(jié)合以后,CDK9T 環(huán)上的第186 位蘇氨酸殘基(T186)發(fā)生磷酸化,從而活化P-TEFb?;罨蟮腜-TEFb 可以磷酸化Pol Ⅱ CTD的2 位絲氨酸(Ser2),從而使得轉(zhuǎn)錄的延伸階段得以正常進行(如圖1 所示)。

        2 CDK9 在腫瘤中的作用機制

        腫瘤被認(rèn)為是一種增殖性疾病,腫瘤細(xì)胞的生存主要依賴于抗凋亡蛋白。研究表明,通過抑制CDK9 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄過程,可以減少抗凋亡蛋白的表達(dá),進而促使腫瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡。

        2.1 急性髓系白血病

        CDK9 作為轉(zhuǎn)錄過程中的重要角色,可以調(diào)控下游Mcl-1、Bcl-2、XIAP 和Myc 等短壽命凋亡蛋白。通過抑制CDK9 的活性,能夠降低這些抗凋亡蛋白的水平,從而誘導(dǎo)癌細(xì)胞的凋亡,尤其是在人類髓系白血病中,以急性髓系白血?。╝cute myeloid leukemia,AML)最為敏感。在由核型定義的AML的不同的亞型的數(shù)據(jù)庫中,研究人員可以直接比較某個基因在白血病細(xì)胞和正常細(xì)胞中的表達(dá)水平。研究者通過該數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),在AML 樣本中CDK9的mRNA 表達(dá)水平增加,且在AML 的不同亞型之間表達(dá)也有所差異[12]。

        AML 占成人急性白血病的80%,患者的主要治療方法是聯(lián)合治療,并且在33% ~ 57%的AML病例中可見多藥耐藥[13],所以需要新的分子靶向療法來更廣泛地改善AML 的治療效果和預(yù)后。在許多血液腫瘤和實體惡性腫瘤中Myc 是過表達(dá)的,它受到多個信號級聯(lián)的調(diào)節(jié),并且調(diào)節(jié)許多細(xì)胞過程(包括增殖、細(xì)胞周期進程、分化和細(xì)胞凋亡)中的轉(zhuǎn)錄因子。因此,Myc 的失調(diào)可能導(dǎo)致不受控制的細(xì)胞增殖,基因組不穩(wěn)定以及逃避免疫監(jiān)視[14]。盡管Myc 在白血病中具有重要作用,但是通過藥理學(xué)途徑直接靶向Myc 較為困難。但通過間接途徑干擾Myc,可以起到抗AML 的療效。

        當(dāng)前的復(fù)雜工程突發(fā)事件的研究仍處于數(shù)據(jù)融合階段?,F(xiàn)有研究主要關(guān)注復(fù)雜工程突發(fā)事件的信息融合問題,缺少面向應(yīng)急決策需求響應(yīng)的深層次整合應(yīng)用。同時,多數(shù)還停留在解決某一局部決策的層面上,缺乏站在復(fù)雜工程突發(fā)事件全生命周期視角的系統(tǒng)性分析。在大數(shù)據(jù)環(huán)境下,建立一套以復(fù)雜工程突發(fā)事件信息需求為基,以知識融合為力,以應(yīng)急決策為標(biāo)的知識融合框架,進而快速響應(yīng)突發(fā)事件。

        CDK9 介 導(dǎo)Mcl-1 和Myc 的 轉(zhuǎn) 錄,而Mcl-1以及Myc 對腫瘤細(xì)胞的生長和存活至關(guān)重要,抑制CDK9 可導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡。其中CDK9通路對Mcl-1 和Myc 的調(diào)節(jié)跟AML 發(fā)病機制有關(guān)。有研究表明,在R/R AML 的病例中,有一半都有Mcl-1 的表達(dá)升高,并且預(yù)后不良[15]。在小鼠模型中,Mcl-1 的高表達(dá)與AML 的發(fā)生有關(guān),同時Mcl-1 對人AML 細(xì)胞的存活和增殖也起著關(guān)鍵作用[16]。研究者發(fā)現(xiàn)混合譜系白血?。╩ixed lineage leukemia,MLL)基因常與11-19 白血病蛋白(eleven-nineteen leukemia,ENL)基因、激活增強子結(jié)合蛋白4(activating enhancer binding protein 4,AF4)基因、AF9基因和AF10基因等伙伴基因形成MLL融合基因[17]。研究表明,ENL 不僅是Pol Ⅱ的延伸因子,也是延伸階段促進轉(zhuǎn)錄的同源核蛋白[18],因此MLL-ENL 融合蛋白可以影響轉(zhuǎn)錄延伸過程。

        圖 1 CDK9 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄過程示意圖Figure 1 Schematic diagram of CDK9-mediated transcription process

        2.2 肝細(xì)胞癌

        從全球的癌癥死亡率來看, 肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)排在第4 位。原發(fā)性肝癌類型中,最常見的是肝細(xì)胞癌,其主要的危險因素是肝硬化,常由慢性病毒性肝炎、酒精濫用和非酒精性肝病引起。在晚期HCC 的患者中,盡管使用多激酶抑制劑進行靶向治療,也只能將預(yù)期壽命從8 個月延長到11 個月[19]。在HCC 發(fā)病的發(fā)病機制研究中,發(fā)現(xiàn)Myc 癌蛋白是HCC 中的驅(qū)動因素之一,Myc 的過表達(dá)可以誘導(dǎo)異常增殖。在小鼠肝癌模型中,抑制Myc 的表達(dá)會誘導(dǎo)腫瘤的退化。Myc 在DNA 復(fù)制、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄延伸中起著重要作用,雖然具體機制尚不清楚。但是研究發(fā)現(xiàn),肝癌中CDK9 介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄延伸對維持Myc 的高表達(dá)有著密切聯(lián)系[5]。

        2.3 前列腺癌

        前列腺癌(prostate cancer,PCa)是男性中最常見的癌癥,在疾病的初始階段具有雄激素依賴性,并響應(yīng)雄激素剝奪療法(androgen deprivation therapy,ADT),80% ~ 90%的患者出現(xiàn)明顯的臨床消退和緩解,但2 ~ 3 年后癌癥會再次復(fù)發(fā),并發(fā)展成為去勢抵抗性前列腺癌(CRPC),此階段ADT 療效較差。最終,癌細(xì)胞會轉(zhuǎn)移到其他器官,如骨骼、肺、腦和肝臟。疾病進入到晚期階段,患者的預(yù)后較差。雄激素受體(androgen receptor,AR)是PCa 存活和進展的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。在一般條件下,AR 被激活并在雄激素誘導(dǎo)后形成同源二聚體,AR 的同源二聚體會在靶基因的啟動子區(qū)域結(jié)合抗氧化反應(yīng)元件(anti-oxidant response element,ARE),從而介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄。當(dāng)PCa 進展為CRPC 后通過持續(xù)激活A(yù)R 才能在雄激素的去勢水平中存活。去勢抵抗機制可大致分為3 個途徑:雄激素依賴性、雄激素非依賴性和旁路。其中旁路途徑由抗凋亡蛋白如Bcl-2 和Mcl-1 的上調(diào)介導(dǎo)。CDK9 可以調(diào)控抗凋亡蛋白的表達(dá),與許多轉(zhuǎn)錄因子相互作用并調(diào)節(jié)它們的活性,其中包括AR。在治療PCa 的過程中AR 是眾所周知的分子靶標(biāo)。CDK9 可以磷酸化AR結(jié)構(gòu)域上第81 位的絲氨酸(Ser81),激活下游通路。盡管CDK1 也可以磷酸化Ser81,但其在AR 轉(zhuǎn)錄活性調(diào)節(jié)中的功能仍值得懷疑[20]。利用CDK9 介導(dǎo)的磷酸化作用調(diào)節(jié)AR 的催化特性。通過抑制CDK9 可以限制AR 的激活,并抑制疾病進展至CRPC 期[21]。研究表明,在小鼠異種移植模型研究和Ⅰ期臨床試驗中均發(fā)現(xiàn)CDK9 抑制劑具有抗腫瘤活性[22]。

        3 具有抗腫瘤活性的CDK9 小分子抑制劑

        近年來,通過分子模型設(shè)計的CDK9 抑制劑在體外顯示出良好的抗腫瘤活性。CDK9 抑制劑按照化學(xué)結(jié)構(gòu)主要可以分為:黃酮類、吡唑并嘧啶類、嘌呤類和氨基噻唑類。

        3.1 黃酮類

        3.1.1 夫拉平度 天然黃酮類化合物夫拉平度(flavopiridol)是第1 個進入臨床試驗的CDK 抑制劑。該化合物的鹽酸鹽形式(alvocidib hydrochloride)目前處于Ⅱ期臨床研究。在2007 年,因治療慢性淋巴細(xì)胞白血?。╟hronic lymphocytic leukemia,CLL)而獲得歐盟孤兒藥資格;2014 年,因治療AML 而在美國獲孤兒藥資格;2015 年,因相同的適應(yīng)證在歐盟獲孤兒藥資格。研究證明,夫拉平度可以通過抑制CDK9 的活性和減少Pol Ⅱ的磷酸化形式,進而促進細(xì)胞凋亡。與其他癌癥相比,AML 一直缺乏有效的治療藥物,并且藥物開發(fā)緩慢。在臨床試驗中發(fā)現(xiàn)當(dāng)以定時序貫療法與阿糖胞苷和米托蒽醌組合時,夫拉平度在AML 中表現(xiàn)出穩(wěn)定的療效。在405 例AML 患者中以定時序貫方案(夫拉平度與米托蒽醌合用,并持續(xù)輸注阿糖胞苷)進行研究,發(fā)現(xiàn)復(fù)發(fā)和難治性AML 的完全緩解率為36%,低風(fēng)險的AML 中,完全緩解率為68%[23]。

        另一項臨床研究顯示,夫拉平度能降低Mcl-1的表達(dá)。同時在對AML 患者使用夫拉平度結(jié)合阿糖胞苷或米托蒽醌的Ⅱ期隨機研究中,58%的AML患者獲得了完全應(yīng)答,但有8%的患者因不良反應(yīng)退出研究,13%患者死亡[24]。在CLL 的Ⅰ期研究中發(fā)現(xiàn),42 例患者中,有19 例獲得部分應(yīng)答;中位應(yīng)答持續(xù)時間為12 個月。12 例17p13 染色體缺失患者中有5 例獲得部分緩解,18 例11q22 染色體缺失患者中有13 例獲得部分緩解[25]。在臨床試驗中發(fā)生了不良反應(yīng),如血小板減少癥、栓塞、中性粒細(xì)胞減少癥等。

        3.1.2 Voruciclib hydrochloride CDK9 抑制劑voruciclib hydrochloride 是一種小分子黃酮類衍生物,由Piramal Life Sciences 研發(fā),目前處于Ⅰ期臨床研究階段。該化合物在結(jié)構(gòu)上類似于夫拉平度,但對CDK9 具有更好的選擇性,可以減少非預(yù)期的脫靶介導(dǎo)的副作用。彌漫性大B 細(xì)胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是常見的非霍奇金淋巴瘤之一,通常對R-CHOP 方案(利妥昔單抗聯(lián)合環(huán)磷酰胺、多柔吡星、長春新堿和潑尼松)有應(yīng)答[26]。然而,仍有約40%的患者繼續(xù)表現(xiàn)出對化療耐藥的DLBCL 或復(fù)發(fā),并最終死于該疾病。Voruciclib hydrochloride 在 多 種DLBCL 模 型中可抑制Mcl-1 的表達(dá),且與Bcl-2 特異性抑制劑venetoclax聯(lián)用可誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞死亡、抑制腫瘤生長,實現(xiàn)協(xié)同的抗腫瘤功效,包括高風(fēng)險的激活B 細(xì)胞亞型(active B cell,ABC)[27]。

        3.2 吡唑并嘧啶類

        3.2.1 Dinaciclib Dinaciclib 是一種小分子CDK 抑制劑,其對CDK1、CDK2、CDK5 及CDK9 均有抑制活性[28]。Dinaciclib 由默沙東公司研發(fā),目前處于Ⅲ期臨床研究,用于治療難治愈的CLL。2011年,F(xiàn)DA 授予dinaciclib 治療CLL 的孤兒藥資格。在骨髓瘤治療方面,dinaciclib 是單獨使用就可發(fā)揮療效的藥物之一,而同類其他許多藥物需聯(lián)用。與夫拉平度比,dinaciclib 具有更高的抗骨髓瘤活

        性和治療指數(shù),并被證明對CLL 具有良好的臨床療效[29]。一項由CLL 患者參加的臨床研究顯示,接受dinaciclib 治療的52 例患者其總體應(yīng)答率為54%;25 例17p13.1 染色體缺失的患者中,有19例獲得應(yīng)答;而21 例沒有這種異常的患者中有12例獲得應(yīng)答。難治性患者在接受dinaciclib 治療后并未出現(xiàn)常見的感染、疲勞和腹瀉。盡管17p13.1染色體缺失的患者比例高達(dá)45%,但應(yīng)答率仍有54%,并且中位無進展生存期接近1 年。與夫拉平度相比,dinaciclib 可以長期給藥,并對大多數(shù)難治性患者有效[30]。

        3.2.2 BS194 BS194 對CDK2、CDK5 及CDK9 的抑制活性的IC50 值達(dá)納摩爾級別。藥動學(xué)研究表明,本品可口服給藥,且能抑制CDK 底物的磷酸化和異種移植瘤的生長,有望成為具有臨床療效的CDK抑制劑[31]。

        3.3 嘌呤類

        3.3.1 Seliciclib Seliciclib 是一種口服有效的CDK2、CDK7 和CDK9 抑制劑,該化合物由法國國家科學(xué)研 究 院、ManRos Therapeutics 與Cyclacel 共 同 研發(fā),目前處于Ⅱ期臨床研究階段。Seliciclib 在鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)和非小細(xì)胞肺癌(non-small-cell lung carcinoma,NSCLC)的Ⅰ期和Ⅱ期臨床研究中作為單一用藥顯示出臨床療效。在鼻咽癌的Ⅰ期臨床研究中,某些患者在治療后出現(xiàn)與腫瘤細(xì)胞增殖和生存相關(guān)的基因轉(zhuǎn)錄下調(diào)。在Ⅰ期臨床研究中,有77 例不同實體瘤患者在多次治療方案失敗后接受seliciclib 治療。其中有10 名患者病情穩(wěn)定,至少持續(xù)4 個月。同時還有2 名晚期NSCLC 患者在4 種治療方案失敗后,病情保持穩(wěn)定,分別持續(xù)14 和18 個月[32]。

        3.3.2 CR8 CR8 是seliciclib 的衍生物[33],其在抑制CDK9、抑制Pol Ⅱ的磷酸化和誘導(dǎo)凋亡方面的活性均要強于seliciclib,但是CR8 的毒性和抗腫瘤活性還需要在動物模型中進行進一步研究。

        3.4 氨基噻唑類

        3.4.1 SNS-032 SNS-032 是一類具有氨基噻唑類結(jié)構(gòu)的化合物,可選擇性抑制CDK2、CDK7 和CDK9。研究顯示,其能在體外有效抑制CLL,其機制是抑制Pol Ⅱ的活性,進而減少相應(yīng)RNA 的合成[34]。

        3.4.2 THAL-SNS-032 THAL-SNS-032 是一種選擇性CDK9 降解劑,由SNS-032 與沙利度胺拼合形成。目前傳統(tǒng)的CDK 抑制劑是可逆的且需要連續(xù)地占據(jù)靶點,而由于ATP 結(jié)合口袋的同源性,開發(fā)高選擇性的CDK 抑制劑更具有挑戰(zhàn)性[35]。THAL-SNS-032以Cereblon 蛋白(CRBN)依賴性方式選擇性誘導(dǎo)CDK9 降解,實現(xiàn)不可逆性抑制細(xì)胞轉(zhuǎn)錄,進而發(fā)揮更有效的抗腫瘤作用。與傳統(tǒng)的CDK9 抑制劑相比,THAL-SNS-032 具有更穩(wěn)定和持久的藥效。

        在實驗中發(fā)現(xiàn),雖然THAL-SNS-032 與另2 種傳統(tǒng)CDK9 抑制劑NVP-2 和SNS-032 都可以迅速誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,但洗脫去除藥物后,只有接受過THAL-SNS-032 處理的細(xì)胞仍處于增殖抑制狀態(tài),這可能是CDK9 被降解的結(jié)果[36]。因此,THALSNS-032 比傳統(tǒng)的CDK9 抑制劑更具有治療優(yōu)勢。這種將底物降解的策略有助于開發(fā)出活性和選擇性良好的其他抑制劑(例如以組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶、組蛋白脫乙酰酶、脫氫酶和磷酸酶等為底物的抑制劑)。雖然降解具有更持久的藥理學(xué)作用,但是傳統(tǒng)抑制劑起效速度更具有優(yōu)勢,因此需要進一步研究THAL-SNS-032 的藥動學(xué)和藥效學(xué)特性。

        4 結(jié)語與展望

        CDK9 和細(xì)胞周期蛋白結(jié)合形成的復(fù)合物,對轉(zhuǎn)錄過程的調(diào)節(jié)至關(guān)重要,一些研究已經(jīng)表明CDK9 在轉(zhuǎn)錄過程中起著重要調(diào)節(jié)作用。CDK9 對維持Mcl-1 等短壽命抗凋亡蛋白的表達(dá)起著重要作用,并且有一部分腫瘤細(xì)胞需要CDK9 才能存活。有研究證明,間接調(diào)節(jié)Mcl-1,可以使腫瘤對BclxL 的直接抑制劑敏感[37]。由于Mcl-1 對CDK9 功能的依賴,并且有報道證明CDK 抑制劑和Bcl-2 同源結(jié)構(gòu)域3(Bcl-2 homology domain 3,BH3)擬合物之間存在著協(xié)同作用[38]。這使得以CDK9 為靶點的藥物更具有研究價值。

        目前為止,已經(jīng)有多個CDK 小分子抑制劑處于臨床研究階段,某些抑制劑通過與傳統(tǒng)化學(xué)療法聯(lián)用產(chǎn)生了較好的療效。但是CDK 家族成員眾多,它們之間的結(jié)構(gòu)相似性、在不同腫瘤之間的表達(dá)差異以及CDK9 與細(xì)胞周期蛋白所組成的復(fù)合物的具體功能等基礎(chǔ)研究尚未完全清楚,使得現(xiàn)有的CDK9 抑制劑存在選擇性差、脫靶等問題。因此,尋找具有高特異性的CDK9 抑制劑,并探索CDK9抑制劑與其他藥物聯(lián)用的可能性及相關(guān)策略,有望推動CDK9 抑制劑在抗腫瘤治療方面的進展。

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