董樹安,余劍波,吳建華
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和線粒體之間的膜接觸位點被稱為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)線粒體結(jié)構(gòu)偶朕(Endoplasmic reticulum–mitochondria contacts,ERMC),是細胞內(nèi)多種信號通路的共同結(jié)構(gòu)平臺,涉及參與調(diào)控Ca2+信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞凋亡、線粒體形態(tài)、脂質(zhì)代謝、炎性反應(yīng)和自噬等[1]。研究發(fā)現(xiàn)ERMC是不同疾病發(fā)生發(fā)展的重要影響因素,因此分離ERMC對于研究其在疾病發(fā)生和發(fā)展中的作用有重要意義[2]。本研究主要探討如何分離和鑒定肺組織內(nèi)ERMC,從而為研究其在內(nèi)毒素急性肺損傷中的作用提供基礎(chǔ)。
1.1 實驗動物 本實驗獲得動物倫理批準(zhǔn)(NKYY-DWLL-2019-027),取C57BL/6雄性小鼠(購自中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院衛(wèi)生學(xué)環(huán)境醫(yī)學(xué)研究所,合格證號: SCXK(軍)2009-003)10只,周齡8~10周,體重25~30 g,于SPF屏障系統(tǒng)下,將小鼠每5只一籠分籠飼養(yǎng)于天津市中西醫(yī)結(jié)合急腹癥研究所動物房,適應(yīng)性飼養(yǎng)一周,飼養(yǎng)室內(nèi)溫度控制在20~25 ℃,濕度控制在65%左右,保持小鼠晝夜節(jié)律規(guī)律,按時攝入食物及水分。
1.2 主要試劑及儀器 超速離心機,貝克曼超速離心機L-100XP,美國;電子分析天平,上海平軒科學(xué)儀器有限公司;兔抗三磷酸肌醇受體-Ⅰ(IP3R-1)抗體、兔抗Sigma-1受體分子伴侶(Sig-1R)抗體、鼠抗蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶(PDI)抗體、鼠抗Cyto C抗體、鼠抗鈣連蛋白抗體購自武漢三鷹生物技術(shù)有限公司;二抗購自天津三箭生物技術(shù)有限公司。
1.3 小鼠肺組織內(nèi)ERMC的分離過程 由于肺組織線粒體提取較為困難,且與其他組織細胞相比,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)含量較少。既往Wieckowski等[3]方法是針對肝臟實體器官的分離提取,因此,在分離肺組織ERMC的過程中,本實驗在預(yù)實驗結(jié)果不理想的基礎(chǔ)上做了相應(yīng)的修改,具體操步驟見圖1。
圖1 小鼠組織內(nèi)ERMC的提取分離和純化流程圖
1.3.1 組織提取 調(diào)整細胞懸液離心條件,將準(zhǔn)備好的肺組織細胞懸液在4 ℃以600 ×g離心10 min。收集上清液,沉淀棄去。收集上清液,將其離心條件調(diào)整為4℃以11 000×g離心10 min。離心后得到的上清液中含有細胞漿蛋白,沉淀中含有線粒體。進一步分離內(nèi)質(zhì)網(wǎng),調(diào)整離心條件為4℃20 000×g離心30 min,離心結(jié)束后沉淀即為膜蛋白,此步分離所得上清繼續(xù)在4℃ 100 000×g離心60 min,最后這一步所得沉淀即為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。將線粒體重懸在預(yù)冷的MRB溶液中。
1.3.2 ERMC的純化 在15 mL離心管中加入8 mL percoll溶液,液面上加入提取好的粗提線粒體溶液2 mL,再加入3.5 mL MRB溶液,保持液面距離管口4~5 mm。將上述混合溶液的離心條件調(diào)整為4 ℃ 100 000 ×g離心30 min。離心結(jié)束后,離心管中間有一層白色條帶層,其內(nèi)含有ERMC,離心管底部沉淀含有純化的線粒體。分別用膠頭滴管小心吸取含有ERMC層溶液,向其中加入10倍體積的線粒體溶解溶液;此外,用另一膠頭滴管吸取含有線粒體層溶液,加入10倍體積的線粒體溶解溶液,調(diào)整離心條件為4 ℃ 100 000×g,將含純化線粒體的溶液離心30 min,沉淀內(nèi)含有純化線粒體。此外,為進一步純化線粒體,可繼續(xù)用20 mL線粒體溶解溶液重懸,繼續(xù)在4 ℃10 000×g離心10 min,沉淀可用線粒體溶解液溶解。對于ERMC的純化,離心結(jié)束后將ERMC上清液取出,在4 ℃100 000×g離心60 min,沉淀即為純化ERMC,可用線粒體溶解液溶解。
1.4 鑒定提取分離的ERMC 將上述分離得到的粗體線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、純線粒體、ERMC各細胞內(nèi)亞結(jié)構(gòu)進行Western blotting。采用BCA法對上述細胞器結(jié)構(gòu)進行總蛋白測定,具體結(jié)果見表1。向每個加樣孔加入的蛋白質(zhì)量(蛋白質(zhì)混合物)為40 μg,進行免疫印跡檢測,陽性條帶以Quantity One 4.62凝膠光密度分析軟件進行分析,測其累積光密度參考值(Integrated optical density,IOD),以各細胞器內(nèi)不同蛋白的表達程度與其在線粒體或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)相應(yīng)蛋白的比值表示。
表1 肺組織內(nèi)各細胞亞結(jié)構(gòu)的蛋白含量 (μg/μL)
1.5 統(tǒng)計學(xué)方法 采用GraphPad Prism8.0軟件處理數(shù)據(jù),計數(shù)資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,多組間比較采用單因素方差分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
小鼠肺臟細胞內(nèi)ERMC提取分離的結(jié)果見圖2A,中間一層白色條帶中含有ERMC,底層白色沉淀物為純化的線粒體。
對分離純化的ERMC和其他組分進行鑒別,結(jié)果發(fā)現(xiàn)PDI主要表達在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和ERMC中,在純化線粒體中幾乎不表達,細胞色素酶C表達于線粒體中,因此在純化線粒體和粗提線粒體內(nèi)其表達量較大;而鈣連蛋白主要表達在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,在線粒體內(nèi)表達量較低。IP3R-1作為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的鈣離子通道,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和ERMC均有表達,而在純化線粒體中幾乎不表達;此外,Sig-1R多表達在ERMC和線粒體中,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中幾乎不表達(圖2B、表 2)。
圖2 小鼠肺組織ERMC分離和鑒定結(jié)果
表2 細胞內(nèi)不同細胞器中不同蛋白分子表達情況的比較(n=10)
1958年,Copeland等[4]首次描述內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和線粒體之間存在聯(lián)系密切。隨后,到70年代早期,越來越多的研究人員在大鼠肝細胞中觀察到線粒體外膜和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)之間連接緊密,但并未對其進行命名[5-6],直到20年后,Vance等[7]首次成功分離了ERMC結(jié)構(gòu)并對其特點進行了分析。研究者們通過免疫印跡法發(fā)現(xiàn)ERMC、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)三者之間的蛋白譜組成存在著明顯的差異性,但又有一定的相似性[1]。
ERMC中的蛋白分子能使內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和線粒體選擇性地釋放和吸收Ca2+[8]。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的IP3R能夠與線粒體上的低親和力Ca2+轉(zhuǎn)運通道(Voltagedependent anion channel 1,VDAC1)組成 Ca2+轉(zhuǎn)移通道,使鈣離子由內(nèi)質(zhì)網(wǎng)轉(zhuǎn)移至線粒體[6]。因此,當(dāng)細胞受到刺激后,線粒體內(nèi)Ca2+濃度會明顯高于細胞質(zhì)[8]。目前研究發(fā)現(xiàn),多種蛋白分子參與線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)之間的相互作用,提示ERMC在生物能量學(xué)、細胞存活和細胞死亡中發(fā)揮重要作用[9]。目前,IP3R及線粒體外膜上與其聯(lián)系緊密的VDAC是近年來研究的熱點,IP3R-VDAC復(fù)合物的裝配過程往往需要多種分子伴侶參與[10-11]。Sig-1R在ERMC中富集,從而招募Ca2+結(jié)合分子GRP78、錨蛋白B和IP3R-3[12]。此外,葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白75(GRP75)是聯(lián)系IP3R和VDAC之間的重要橋梁蛋白分子[10-11]。在ERMC中還發(fā)現(xiàn)了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的能夠與Ca2+結(jié)合的分子伴侶,如鈣連蛋白、鈣網(wǎng)織蛋白和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白44(Endoplasmic reticulum resident protein 44,ERp44) 等[10-11]。PACS-2也是ERMC中的重要組成分子[10-11]。除此之外,ERMC中還包括與線粒體通透性轉(zhuǎn)換孔(Mitochondrial permeability transition pore,MPTP)功能類似的有腺嘌呤核苷酸轉(zhuǎn)位酶(Adenine nucleotide translocase,ANT)和環(huán)磷酰胺D,進而使線粒體對Ca2+信號更加敏感[13]。
為研究ERMC在內(nèi)毒素急性肺損傷小鼠發(fā)病機制中的作用,本研究首先成功分離肺組織細胞內(nèi)的ERMC,為了驗證分離方法的可行性,在預(yù)實驗中,筆者按照Wieckowski等[3]的方法選取0.5 g肺組織,但是在驗證ERMC組成的環(huán)節(jié)上,本研究發(fā)現(xiàn)肺組織中提取的蛋白質(zhì)濃度較少,不能用于后續(xù)的蛋白鑒定過程。因此,為了更好的分離和提純肺組織中的ERMC,本研究稱取的肺組織提高為1 g,按照試驗流程對ERMC提取和純化后,經(jīng)BCA法測定肺組織和肝組織不同組分的蛋白濃度,結(jié)果提示蛋白濃度可用于后續(xù)的Western blotting檢測。而Wieckowski等[3]的方法主要針對肝臟實體臟器進行分離,0.5 g肝組織所提取的蛋白能夠用于后續(xù)的蛋白鑒定過程,可能與肝組織質(zhì)地均勻,能夠提取出較多蛋白有關(guān)。
通過Western blotting檢測發(fā)現(xiàn),本研究采用的分離提純ERMC方法合理可靠,能夠有效分離不同組織細胞中的ERMC;然后對分離純化的ERMC和其他組分進行鑒別,筆者發(fā)現(xiàn)PDI平均分布在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和ERMC,Cyto C主要集中在線粒體內(nèi),而鈣連蛋白主要集中在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi),IP3R-1作為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的鈣離子通道,在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和ERMC中均有表達,此外Sig-1R多集中于ERMC和線粒體中,上述蛋白表達趨勢符合ERMC中相應(yīng)蛋白分布特征。為進一步探討ERMC在內(nèi)毒素所致急性肺損傷過程中的變化提供了技術(shù)支持。