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        腦磁圖腦功能連接網(wǎng)絡(luò)癲癇棘波識別方法研究

        2020-04-24 18:33:42張航宇尹春麗王玉平張軍鵬
        關(guān)鍵詞:特征選擇貝葉斯分類器

        張航宇,李 彬,尹春麗,劉 凱,王玉平,張軍鵬

        1.四川大學(xué) 電氣信息學(xué)院 自動化系,成都610065

        2.首都醫(yī)科大學(xué) 宣武醫(yī)院 神經(jīng)內(nèi)科,北京100053

        1 引言

        癲癇是大腦神經(jīng)元異常放電,導(dǎo)致大腦功能障礙的一種慢性腦部疾患,以腦部神經(jīng)元過度放電所致的突然反復(fù)和短暫的中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能失常為特征[1]。在我國,癲癇的患病率約為3‰ 至6‰ ,難治性癲癇約占20%[1-2],目前全世界患有癲癇疾病的人數(shù)約占總?cè)丝跀?shù)的1%,且每年以0.02%~0.05%的速度增長[3]。

        自發(fā)功能連接(spontaneous Functional Connectivity,sFC)已成為認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)的一個(gè)主要工具[3]。自發(fā)功能連接是基于對腦區(qū)間的自發(fā)波動信號之間的統(tǒng)計(jì)關(guān)系的分析,一些研究提出它能反映腦區(qū)之間的深層神經(jīng)互動[4]。作為神經(jīng)科學(xué)研究的一個(gè)工具,自發(fā)功能連接能夠幫助理解脫離任務(wù)環(huán)境下的大腦是如何工作的[5]。自發(fā)功能連接作為一個(gè)重要且廣泛使用的工具,它可以檢測典型大腦的功能連接并記錄神經(jīng)發(fā)育[6],還可以描繪神經(jīng)學(xué)和精神病學(xué)失調(diào)病癥的異常腦活動的特性,這些病癥包括中風(fēng)、帕金森癥、阿爾茲海默癥、癲癇和自閉癥。

        自發(fā)波動由Biswal 基于功能磁共振數(shù)據(jù)在血液氧合中第一次觀察到,隨后同樣的網(wǎng)絡(luò)在大腦電生理學(xué)記錄腦電圖和腦磁圖中也被觀察到[7]。很多研究出于高空間分辨率的原因使用功能磁共振成像,但是它的低時(shí)間分辨率(0.5~2 Hz)和血管決定的對比度使它不能直接研究被認(rèn)為是腦區(qū)間信息交流機(jī)制的高頻神經(jīng)皮層活動[8]。除此之外,神經(jīng)活動的時(shí)間尺度是典型的遠(yuǎn)遠(yuǎn)快于fMRI的記錄能力的[9]。

        腦磁圖(Magnetoencephalography,MEG)是一種非侵入式的測量神經(jīng)集束樹狀活動所引發(fā)磁場的方法,它的采樣率超過500 Hz,能夠直接用來研究快速神經(jīng)活動[10]。為了獲取多樣的神經(jīng)生理學(xué)相關(guān)頻段,本研究使用MEG,這是由于它的時(shí)間分辨率高。有些研究已經(jīng)證明了使用皮層區(qū)域間相位關(guān)系作為功能連接量度的有效性。特別的,相位鎖定值是衡量兩個(gè)時(shí)間序列間相位同步性的方法,它以前被用于分析MEG 的靜息態(tài)連接,來建立腦功能連接網(wǎng)絡(luò)。腦磁圖檢查是輔助癲癇診斷的一個(gè)非常重要的手段。癲癇在腦磁圖中的主要表現(xiàn)是棘波和尖波,有時(shí)對它們不作區(qū)分,統(tǒng)稱為癲癇瞬變現(xiàn)象[11]或棘波。棘波和尖波突出于背景活動,波幅較高,周期為20~200 ms。

        腦磁信號的分析主要是對大腦異?;顒拥臋z測分析,這些工作目前都是由醫(yī)療工作者根據(jù)經(jīng)驗(yàn)通過對患者腦磁圖的視覺檢測完成的。視覺檢測有許多不利的因素,一般一次檢測要記錄60 min 的數(shù)據(jù),從很長的數(shù)據(jù)中找出棘波非常耗費(fèi)精力,對分析者的判斷力有很高要求,并且醫(yī)生在工作中要接觸大量癲癇病例,在繁重的工作任務(wù)下分類結(jié)果的準(zhǔn)確性無法保證。而且,不同的專家對同一記錄的判斷結(jié)果也不盡相同。因此,對異常大腦電生理信號的自動檢測就顯得十分重要[12]。

        不論選用何種檢測標(biāo)準(zhǔn),通常要求棘波檢測結(jié)果有較高的正確率,較低的漏檢率和誤檢率。本文提出一種基于Desikan-Killiany 腦區(qū)劃分的相位鎖定值腦功能連接網(wǎng)絡(luò)全頻段的機(jī)器學(xué)習(xí)棘波檢測方法,可對大腦棘波放電狀態(tài)進(jìn)行客觀的標(biāo)定,有很大的潛力應(yīng)用于腦磁圖癲癇棘波的自動識別與標(biāo)記的輔助工具,降低醫(yī)生的勞動強(qiáng)度,提升檢測正確率并降低漏檢率和誤檢率。

        2 數(shù)據(jù)與方法

        2.1 數(shù)據(jù)采集

        本文使用的MEG數(shù)據(jù)來自于首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院腦磁圖中心做檢查的20名被確診為島葉及島蓋癲癇的患者,均在手術(shù)前進(jìn)行了MEG檢查,其中男11例,女9例;年齡15~52歲,平均28.7歲。

        MRI 應(yīng)用1.5T 或3.0T 進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的MRI 掃描,包括橫斷位SE 序列T1W1 及TSE 序列T2W1(層厚5 mm);垂直于右側(cè)海馬長軸的斜冠狀位和平行于海馬長軸的橫斷位液體衰減反轉(zhuǎn)恢復(fù)(FLAIR)序列(層厚5 mm)。

        MEG 應(yīng)用芬蘭Elekta Neuromag Oy 公司生產(chǎn)的NM20215A-G 型306 信道全頭型生物磁儀對患者進(jìn)行檢測?;颊哂诎察o狀態(tài)下于磁屏蔽室記錄60 min自發(fā)腦磁圖數(shù)據(jù)。帶通濾波為0.10~330 Hz,采樣率1 000 Hz。腦磁源成像(MSI)采用標(biāo)準(zhǔn)程序306導(dǎo)全頭型腦磁圖系統(tǒng)進(jìn)行采集,對發(fā)作間期癲癇樣波進(jìn)行標(biāo)記、離線分析。腦磁波與病人MRI 圖像進(jìn)行融合,在MRI 上自動生成MSI圖像。

        腦磁圖中心的醫(yī)生根據(jù)經(jīng)驗(yàn)為每位病例挑選出三段含棘波的數(shù)據(jù)區(qū)段,每段各10 s,并標(biāo)出棘波峰值的時(shí)間點(diǎn);作為對比同時(shí)提供每位病例三段正常靜息態(tài)的數(shù)據(jù)區(qū)段,每段各10 s,為了保證本次選出的棘波數(shù)據(jù)與正常靜息態(tài)數(shù)據(jù)的正確性與典型性,特意請不同的醫(yī)生進(jìn)行了交叉檢查確認(rèn),確保了本次研究采用的兩種數(shù)據(jù)均為典型棘波態(tài)與典型正常靜息態(tài)的腦磁圖數(shù)據(jù)。

        2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理

        獲取了醫(yī)生用傳統(tǒng)方法挑選出的全部20例病例的MEG數(shù)據(jù)后,采用基于數(shù)學(xué)軟件矩陣實(shí)驗(yàn)室(MATLAB)平臺下的MEG 分析軟件Brainstorm(brain recordings analysis tool)進(jìn)行數(shù)據(jù)預(yù)處理。首先,對MEG 進(jìn)行濾波得到0.1~500 Hz頻段數(shù)據(jù);然后,去除數(shù)據(jù)中的偽跡,主要包括眼電、眼動等對MEG的干擾。

        所有數(shù)據(jù)均嚴(yán)格按照上述方法依次進(jìn)行處理后,從醫(yī)生提供的10 s 有棘波數(shù)據(jù)段中截取含棘波峰值的數(shù)據(jù)段2 000 ms,從10 s無棘波數(shù)據(jù)段中間截取相同長度的數(shù)據(jù)段;最后共獲得2 000 ms時(shí)長的有棘波數(shù)據(jù)段與無棘波數(shù)據(jù)段各60段,這些數(shù)據(jù)是進(jìn)一步分析的基礎(chǔ)。

        2.3 腦功能網(wǎng)絡(luò)建立

        所有數(shù)據(jù)均通過基于Uhuntu 平臺的工作站,調(diào)用FreeSurfer 軟件包,進(jìn)行自動化分析處理。分析處理過程分為體積處理流程與表面處理流程兩大部分。體積處理流程包括圖像灰度標(biāo)準(zhǔn)化、不均勻磁場的校正、到Talairaeh 空間的配準(zhǔn)、非腦組織的去除和白質(zhì)(White Matter,WM)與灰質(zhì)(Grey Matter,GM)的分割等。表面處理流程包括對白質(zhì)曲面進(jìn)行三維重建,從白質(zhì)曲面出發(fā),沿著灰質(zhì)梯度方向向外膨脹得到灰質(zhì)外表面曲面。定義灰質(zhì)曲面和白質(zhì)曲面間的距離為腦皮層厚度,采用T-average算法計(jì)算皮層厚度?;屹|(zhì)外表面向外膨脹,得膨脹曲面。膨脹曲面經(jīng)過球狀形變后與模板進(jìn)行高維配準(zhǔn),依據(jù)Desikan-Killiany圖譜對皮層進(jìn)行自動分區(qū)。Desikan-Killiany 圖譜將全腦分為70 個(gè)腦區(qū)(左右半腦各35 個(gè)),其中胼胝體沒有灰質(zhì)厚度,因此最后得到68個(gè)腦區(qū)(左右半腦各34個(gè))的皮層厚度。對全部數(shù)據(jù)用Brainstorm軟件中自帶的Dipole方法進(jìn)行求源處理,接著對每位病例每個(gè)波段求源過的數(shù)據(jù)按照Desikan-Killiany圖譜進(jìn)行下采樣。

        腦網(wǎng)絡(luò)最基本和最關(guān)鍵的兩個(gè)組成元素是節(jié)點(diǎn)和邊:節(jié)點(diǎn)代表了大腦的各個(gè)腦區(qū),邊則能反映各個(gè)腦區(qū)之間的聯(lián)系。Desikan-Killiany模板所劃分的68個(gè)腦區(qū)被定義為腦網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn),如圖1 所示,每個(gè)腦區(qū)是一個(gè)節(jié)點(diǎn)。

        圖1 全腦68個(gè)腦區(qū)分區(qū)圖

        腦功能網(wǎng)絡(luò)使用相位鎖定值(Phase Locking Value,PLV)[13-14]構(gòu)建。相位鎖定值是對兩個(gè)時(shí)間序列信號在一段時(shí)間內(nèi)保持恒定相位分離的傾向的度量。對于電生理學(xué)記錄的時(shí)間序列之間靜息態(tài)相位鎖定的測量,可以表征在給定頻率下這些時(shí)間序列之間的相位差隨時(shí)間變化的特性。PLV的計(jì)算公式如下:

        其中,N 是采樣點(diǎn)的個(gè)數(shù),θ1和θ2是采樣點(diǎn)n 處的瞬時(shí)相位值,相位鎖定值為復(fù)數(shù),其模的范圍為0到1,0代表隨機(jī)的相位關(guān)系,1代表固定的相位關(guān)系。相位鎖定是一種無方向的量度方式,因此是對稱的。全腦相位鎖定網(wǎng)絡(luò)是在每一對皮層腦區(qū)時(shí)間序列測量結(jié)果之間計(jì)算出來的,由于相位鎖定的對稱性,只需要在每一對時(shí)間序列測量結(jié)果之間計(jì)算一個(gè)相位鎖定值。

        下采樣之后得到每個(gè)源的數(shù)據(jù),之后對頻率范圍為0.1~500 Hz的全部兩組數(shù)據(jù)中的所有個(gè)體數(shù)據(jù)段分7個(gè)頻段分別求出相位鎖定值(PLV)矩陣。全部7個(gè)頻段從F1低頻到F7高頻的對應(yīng)頻率范圍如表1所示。

        表1 頻段對應(yīng)表

        為了有代表性,隨機(jī)選取單一頻段下相位鎖定值矩陣作為典型展示,在此選取3號病例alpha頻段下2 000 ms時(shí)長數(shù)據(jù)段的相位鎖定值矩陣展示于圖2中。

        圖2 相位鎖定值矩陣

        3 模型設(shè)計(jì)

        本文使用了三種傳統(tǒng)的分類算法,分別是線性邏輯回歸分類、基于線性核函數(shù)和徑向基核函數(shù)的支持向量機(jī)分類與高斯樸素貝葉斯分類算法。以上模型均使用了scikit-learn框架下的函數(shù)實(shí)現(xiàn)。

        3.1 線性分類原理

        本文使用Sigmoid函數(shù)作為線性邏輯回歸(Logistic-Regression)分類器函數(shù)。Sigmoid函數(shù)是使用范圍最廣的一類分類函數(shù),該函數(shù)定義為:

        其中,y 是樣本被判別為正例的概率,1-y 為樣本被判別為負(fù)例的概率。為保證模型的訓(xùn)練精度,損失函數(shù)引入L1正則化項(xiàng),其中設(shè)定正則化系數(shù)倒數(shù)C=1.0,模型預(yù)測值為二分類的概率值,其損失函數(shù)為:

        計(jì)算損失函數(shù)取最小值時(shí)的參數(shù)(w,b),即能得到最優(yōu)的分類模型。

        3.2 支持向量機(jī)分類原理

        支持向量機(jī)在高維度或無窮維度空間中,構(gòu)建一個(gè)超平面或者一系列的超平面,借助超平面去實(shí)現(xiàn)分割,使正負(fù)樣本之間的空白最大。該模型對非線性關(guān)系分類有較好的效果。基本原理如下。

        給定訓(xùn)練向量xi∈RP,i=1,2,…,n 和一個(gè)標(biāo)簽向量y ∈{1,-1}n。在樣本空間存在一個(gè)超平面wTx+b=0 可以實(shí)現(xiàn)對樣本進(jìn)行有效分類,則有:

        使得式(4)等號成立的距離超平面最近的幾個(gè)點(diǎn)構(gòu)成支持向量,正反方向支持向量到超平面的距離之和為使得該距離最小的參數(shù)即為最優(yōu)參數(shù)。用作為式目標(biāo)函數(shù),按照拉格朗日乘子法進(jìn)行優(yōu)化,簡化為對偶問題:

        當(dāng)原始空間超平面不能對數(shù)據(jù)進(jìn)行有效分隔時(shí),需要將數(shù)據(jù)映射到高維空間,即。在對偶問題中,尋找核函數(shù)使得,以便在較低維度空間實(shí)現(xiàn)內(nèi)積計(jì)算。本文采用線性核函數(shù)(kernel:linear)和徑向基核函數(shù)(kernel:rbf)。

        3.3 樸素貝葉斯分類

        樸素貝葉斯分類(Naive Bayesian Classifier,NBC)由于計(jì)算高效、精確度高,并具有堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)而得到廣泛的應(yīng)用。一般情況下在貝葉斯分類中的所有屬性都直接或間接地發(fā)揮作用,即所有的屬性都參與分類,而不是一個(gè)或幾個(gè)屬性決定分類[15]。貝葉斯分類器的分類原理是通過某標(biāo)簽的先驗(yàn)概率,利用貝葉斯公式計(jì)算出其后驗(yàn)概率,選擇具有最大后驗(yàn)概率的類作為該對象所屬的類。簡單地假設(shè)任意兩對特征之間相互獨(dú)立,假設(shè)每個(gè)樣本為獨(dú)立同分布,根據(jù)中心極限定理,標(biāo)準(zhǔn)化之后的每個(gè)特征的數(shù)據(jù)滿足高斯分布的假設(shè),即P(xi|y)~Gaussian,根據(jù)貝葉斯定理,則有:

        根據(jù)每對特征之間相互獨(dú)立的假設(shè),從而有:

        根據(jù)式(7)即可計(jì)算y 的后驗(yàn)分布。

        3.4 原始特征構(gòu)建

        在研究中,先使用作為原始特征空間的PLV復(fù)數(shù)矩陣數(shù)據(jù)本身(plv)、該矩陣數(shù)據(jù)的實(shí)部(plv_real)、虛部(plv_imag)、幅角(plv_angle)和模(plv_abs)分別進(jìn)行了測試。結(jié)果表明,在使用的所有模型中,模數(shù)據(jù)表現(xiàn)最為優(yōu)異。以樸素貝葉斯分類器模型為例,采用五項(xiàng)數(shù)據(jù)分類的準(zhǔn)確率如表2所示。

        表2 基于樸素貝葉斯分類器模型的準(zhǔn)確率分布表

        經(jīng)測試,在本文使用的其他四種分類器模型中以上五種數(shù)據(jù)均有類似表現(xiàn),因此本文所提到的數(shù)據(jù)均為PLV復(fù)數(shù)矩陣的模(plv_abs)數(shù)據(jù),選定該原始特征空間復(fù)數(shù)矩陣的模數(shù)據(jù)作為原始特征數(shù)據(jù)集。

        在實(shí)驗(yàn)中使用以上四種分類器對plv_abs數(shù)據(jù)分別進(jìn)行學(xué)習(xí)分類,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表3所示。

        表3 基于原始數(shù)據(jù)的不同模型分類準(zhǔn)確率和AUC結(jié)果比較

        4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

        4.1 實(shí)驗(yàn)流程

        首先根據(jù)120×15 946的原始特征數(shù)據(jù)集作為輸入,然后對輸入數(shù)據(jù)集做了標(biāo)準(zhǔn)化,最后對標(biāo)準(zhǔn)化后的數(shù)據(jù)集應(yīng)用卡方檢驗(yàn)、F檢驗(yàn)與迭代特征消除三種方法進(jìn)行了特征提?。粦?yīng)用四種分類器分別對上述數(shù)據(jù)進(jìn)行分類實(shí)驗(yàn),對全部實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行了分析與比較。原始特征數(shù)據(jù)集構(gòu)建之后的處理流程如圖3所示。

        圖3 實(shí)驗(yàn)流程圖

        4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        為定性地比較各種不同的方法,本文對比了四種分類器的受試者工作特征曲線(Receiver Operating Characteristic Curve,ROC)圖。ROC 曲線是反映真陽性和假陽性的綜合指標(biāo)。本文的四種分類器對結(jié)果的預(yù)測均為一個(gè)概率值,其中有棘波的標(biāo)注為正例,正常無棘波狀態(tài)標(biāo)注為負(fù)例。按照判別為正例的概率值對測試結(jié)果進(jìn)行排序,再以不同概率值作為正反例判別的閾值,并計(jì)算相應(yīng)閾值下的真陽性率和假陽性率,即可繪制得到分類器的ROC曲線。一般根據(jù)對分類任務(wù)的不同要求,根據(jù)曲線對分類器性能的評判存在不同的標(biāo)準(zhǔn),且本文的分類器ROC曲線存在交叉,因此本文按照通用的AUC(Area Under the ROC Curve)方式對分類器性能進(jìn)行評價(jià)。AUC是ROC曲線與軸所包絡(luò)部分的面積,面積越大,表明該分類器的分類性能越好。

        4.2.1 原始特征數(shù)據(jù)集的實(shí)驗(yàn)比較

        使用plv_abs 數(shù)據(jù)作為原始特征數(shù)據(jù)集輸入,在對四種個(gè)分類模型進(jìn)行訓(xùn)練后,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表3與圖4所示。

        圖4 原始數(shù)據(jù)的ROC圖

        從表3與圖4中可以看出使用樸素貝葉斯分類器模型準(zhǔn)確率為0.875,比其他三種模型都要高,其AUC 值為0.914,也是所有分類器中第二高的,說明對原始數(shù)據(jù)而言使用線性核函數(shù)的支持向量機(jī)分類器性能最好。

        4.2.2 特征標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)驗(yàn)比較

        對原始特征數(shù)據(jù)集的各列特征向量數(shù)據(jù)均按照公式(8)進(jìn)行了標(biāo)準(zhǔn)化處理:

        其中,xi表示第i 個(gè)特征向量,σi表示該列特征的標(biāo)準(zhǔn)差,μi表示第i 個(gè)特征的均值,xstd表示標(biāo)準(zhǔn)化之后的特征向量。

        使用標(biāo)準(zhǔn)化后數(shù)據(jù)作為輸入,在對四種模型進(jìn)行訓(xùn)練后,測試結(jié)果見表4和圖5。

        在對原始訓(xùn)練集的各列數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理后,線性邏輯回歸分類器的準(zhǔn)確率從0.771提升為0.917,使用線性核函數(shù)的支持向量機(jī)分類器的準(zhǔn)確率從0.833提升為0.917,而徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)分類器的準(zhǔn)確率從0.500 提升為0.938,說明提升最高,樸素貝葉斯分類器的準(zhǔn)確率也從0.875小幅提升為0.896,說明對原始訓(xùn)練集的各列數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理有利于提升準(zhǔn)確率,并且四種分類器就準(zhǔn)確率而言性能相差不大,結(jié)合作為分類器性能評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)的AUC 值,徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)分類器的AUC 值為0.951,在四種分類器中值最大,故綜合上述結(jié)果,使用標(biāo)準(zhǔn)化后的特征數(shù)據(jù)集作為輸入,選用徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)分類器進(jìn)行棘波自動分類的效果最好,成功率為93.8%。

        表4 基于標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)的不同模型分類準(zhǔn)確率和AUC結(jié)果比較

        圖5 原始數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的ROC圖

        4.2.3 特征提取

        在現(xiàn)實(shí)的人類識別中,根據(jù)經(jīng)驗(yàn)知識能夠輕易識別棘波的存在及相關(guān)影響,很明顯未能短時(shí)間速實(shí)現(xiàn)對15 946 維數(shù)據(jù)的觀測和判斷,因此推斷,數(shù)據(jù)的維度中必然存在大量的冗余,因此在適當(dāng)容忍模型性能降低的基礎(chǔ)上進(jìn)行了特征選擇,以降低模型的復(fù)雜度。

        (1)基于單變量的特征選擇

        基于單變量的統(tǒng)計(jì)測試,通過過濾的方式選擇特征。本文采用卡方檢驗(yàn)和F檢驗(yàn)方法,逐一對單個(gè)特征與實(shí)驗(yàn)標(biāo)簽進(jìn)行相關(guān)性檢驗(yàn),并根據(jù)相關(guān)性排序選擇部分特征。基于對提取后的特征多次測試,判定選擇32個(gè)特征,即整體特征數(shù)的0.2%時(shí)就能達(dá)到較高的分類準(zhǔn)確率又能大幅度降低特征數(shù)量。F 檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn)所提取的32個(gè)特征并不一致。

        (2)基于模型的循環(huán)特征消除(RFE)

        本文采用Logistic回歸分類模型,并使用了L1進(jìn)行正則化,選擇了32個(gè)特征。

        4.2.4 特征選擇后數(shù)據(jù)的實(shí)驗(yàn)比較

        分別使用3 種特征選擇方法篩選后的32 個(gè)特征向量作為輸入,在對4 種分類模型進(jìn)行訓(xùn)練后,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表5和圖6~8所示。

        表5 不同特征選擇方式下分類器準(zhǔn)確率比較

        圖6 基于卡方檢驗(yàn)提取特征的學(xué)習(xí)分類ROC比較

        圖7 基于F檢驗(yàn)提取特征的學(xué)習(xí)分類ROC比較

        圖8 基于迭代特征消除后特征的學(xué)習(xí)分類ROC比較

        從表5 與表6 中可以看出,經(jīng)過迭代特征消除方法進(jìn)行特征選擇后,在四種分類器下的分類準(zhǔn)確率與分類器的AUC 值均低于其余兩種選擇方法,說明此種特征選擇方法的效果不好,故重點(diǎn)關(guān)注卡方檢驗(yàn)和F檢驗(yàn)特征提取選擇方法。

        與特征標(biāo)準(zhǔn)化后的實(shí)驗(yàn)結(jié)果比較,線性邏輯回歸分類器的準(zhǔn)確率從0.917 降低為0.833 與0.833,線性核函數(shù)支持向量機(jī)分類器的準(zhǔn)確率從0.917 降低為0.896 與0.792,而徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)分類器的準(zhǔn)確率從0.938降低為0.833與0.854,說明經(jīng)過特征選擇后,使用上述三種分類器分類,準(zhǔn)確率會有所降低,而對于樸素貝葉斯分類器,使用卡方檢驗(yàn)和F檢驗(yàn)特征提取后的數(shù)據(jù)作為輸入,其準(zhǔn)確率從0.896 提升為0.917,分類器AUC 值從0.912 提升到0.951,比其余三種分類器均要高,說明針對卡方檢驗(yàn)和F 檢驗(yàn)特征提取,樸素貝葉斯分類器性能最優(yōu),分類效果最好。

        表6 不同特征選擇方式下各模型的AUC比較

        5 結(jié)果討論

        5.1 模型選擇

        在本文的研究中,通過醫(yī)生的精心挑選得到正常靜息態(tài)與棘波態(tài)腦磁圖樣本數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)被適當(dāng)?shù)仡A(yù)處理后,分七個(gè)頻段經(jīng)相位同步的PLV算法計(jì)算,得到68個(gè)腦區(qū)之間的PLV復(fù)數(shù)值矩陣作為特征空間,取該特征空間的模值數(shù)據(jù)作為原始特征數(shù)據(jù)集,然后對原始特征數(shù)據(jù)集做了標(biāo)準(zhǔn)化,最后對標(biāo)準(zhǔn)化后的數(shù)據(jù)集應(yīng)用卡方檢驗(yàn)、F 檢驗(yàn)與迭代特征消除三種方法進(jìn)行特征提取,最終構(gòu)成了五種用于輸入分類器的數(shù)據(jù)集;本研究中,應(yīng)用了機(jī)器學(xué)習(xí)的方法,包括線性邏輯回歸、線性核函數(shù)支持向量機(jī)、徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)與樸素貝葉斯分類算法,構(gòu)建了四種對應(yīng)的分類器,將五種輸入數(shù)據(jù)集依次使用四種分類器進(jìn)行分類實(shí)驗(yàn),得到相應(yīng)的分類準(zhǔn)確率,對分類器本身使用繪制受試者工作特征曲線(ROC)圖并計(jì)算對應(yīng)的AUC值方式對分類器性能進(jìn)行評價(jià),最終得到,在應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)化后特征數(shù)據(jù)集不進(jìn)行特征選擇提取時(shí),徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)分類器的準(zhǔn)確率最高,為93.8%,AUC 值為0.951 所以性能最優(yōu);應(yīng)用卡方檢驗(yàn)、F 檢驗(yàn)進(jìn)行特征提取后的特征數(shù)量大為減少,對應(yīng)此種精簡特征數(shù)據(jù)集時(shí),樸素貝葉斯分類器的準(zhǔn)確率雖與完整特征數(shù)據(jù)集下最高分類準(zhǔn)確率相比稍有降低,也可達(dá)到91.7%,AUC值為0.951,故性能與完整特征數(shù)據(jù)集下的徑向基核函數(shù)支持向量機(jī)分類器相當(dāng)。

        5.2 基于特征選擇的腦區(qū)識別

        根據(jù)特征選擇的結(jié)果,32個(gè)特征基本能夠?qū)崿F(xiàn)對數(shù)據(jù)的較好分類。但基于F 檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn)提取的特征存在較大不同。按照68×68 矩形區(qū)域的上三角部逐行編號,兩類檢驗(yàn)的提取結(jié)果如表7。

        從表7 可以得到,卡方檢驗(yàn)和F 檢驗(yàn)提取特征的分布上存在18個(gè)重疊特征,因此可以斷定,這18個(gè)特征對判別是否是癲癇癥患者具有重要影響。

        表7 卡方檢驗(yàn)和F檢驗(yàn)提取特征編號的分布

        6 結(jié)論和建議

        對本文列出的18 個(gè)關(guān)鍵特征位置還原計(jì)算,得到所處的位置分別為:(1,20)(1,22)(1,60)(9,13)(12,20)(15,31)(15,65)(18,33)(18,48)(18,52)(25,42)(28,38)(30,61)(30,62)(31,38)(32,54)(55,66)(59,65),18個(gè)特征全部處于delta頻段。因此,可以斷定,決定癲癇的腦電信號可以完全由delta頻段的信號完成判別。建議在后續(xù)醫(yī)療實(shí)踐中,對以上18 個(gè)特征所對應(yīng)的18 對大腦皮層區(qū)域之間的信號傳遞加以重點(diǎn)關(guān)注,下一步從臨床實(shí)踐上對以上腦區(qū)開展研究。

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