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        霸王根際解磷細菌的分離與鑒定

        2020-04-12 01:56:51孟建宇喬宇磊李蘅
        安徽農(nóng)學(xué)通報 2020年24期
        關(guān)鍵詞:植物

        孟建宇 喬宇磊 李蘅

        摘 要:以內(nèi)蒙古西鄂爾多斯荒漠灌木霸王為材料,采用傳統(tǒng)分離培養(yǎng)技術(shù),使用無機磷培養(yǎng)基對霸王根際解磷菌進行分離,基于16S rRNA基因序列分析進行分類鑒定。結(jié)果表明:從霸王根際土壤中分離純化得到36株解磷細菌,分別屬于γ-變形菌綱(γ-Proteobacteria)、芽孢桿菌綱(Bacilli)、放線菌綱(Actinobacteria)以及α-變形菌綱(β-Proteobacteria)。第一優(yōu)勢菌綱為放線菌綱(Actinobacteria),占比為44.45%;分別屬于15個屬,其中節(jié)桿菌屬(16.7%)、蒼白桿菌屬(13.9%)、芽孢桿菌屬(11.1%)為優(yōu)勢菌屬。

        關(guān)鍵詞:霸王;根際;解磷菌;16S rRNA

        中圖分類號 S948 文獻標識碼 A 文章編號 1007-7731(2020)24-0060-04

        Isolation and Identification of Phosphorus-solubilizing Bacteria from Rhizosphere of Zygophyllum xanthonylon

        MENG Jianyu et al.

        (Applied and Environmental Microbiology Laboratory of Life Sciences College,Inner Mongolia Agricultural University,Hohhot 010011,China)

        Abstract:Traditional isolation and culture technology and inorganic phosphorus media were used to isolate phosphate-solubilizing bacteria from the rhizosphere of Zygophyllum xanthonylon,which is a desert shrub in the Western Ordos of Inner Mongolia. A preliminary identification was based on the 16S rRNA gene. The results showed that a total of 36 phosphate-solubilizing bacteria were isolated,which belonged to γ-Proteobacteria,Bacilli,Actinobacteria,and α-Proteobacteria,respectively. The first dominant class was Actinobacteria with ratio of 44.45%. The isolates belonged to 15 genera,and Arthrobacter(16.7%),Ochrobactrum(13.9%)and Bacillus(11.1%)are the dominant genera.

        Key words:Zygophyllum xanthonylon; Rhizosphere; Phosphate-solubilizing bacteria; 16S rRNA

        磷是植物生長發(fā)育必需的營養(yǎng)物質(zhì)之一,是植物體中核酸、蛋白質(zhì)、ATP的重要組分,參與植物體內(nèi)多數(shù)理化反應(yīng)過程的調(diào)節(jié)[1]。土壤中磷素的固定和轉(zhuǎn)化是通過磷素循環(huán)實現(xiàn)的,因此,磷素循環(huán)的速率決定了土壤中磷的積存[2]。若磷素循環(huán)較慢,土壤中有效磷含量下降,植物生長則會受到抑制。如今,絕大多數(shù)土壤中磷的含量只有2μmol/L,遠低于植物生長的需要(2000μmol/L)[3]。為解決土壤含磷量不足的問題,在實際生產(chǎn)過程中,將大量磷肥施加于土壤,導(dǎo)致大部分磷元素以難溶的無效態(tài)在土壤中積累,磷肥中含有較多的有害重金屬,過量施加會引起土壤重金屬污染,引起食物安全問題,對人類健康造成影響[4,5]。全國農(nóng)田中的有效磷含量利用率不足20%,導(dǎo)致大量的磷積累在土壤中引起諸多的環(huán)境問題,如水體富營養(yǎng)化、赤潮等[6]。

        解磷菌(Phosphate-solubilizing bacteria)是土壤中可將難溶性磷轉(zhuǎn)化為植物能夠吸收利用的可溶性磷的一類特殊的微生物功能類群,主要通過分泌各種酶類、有機酸來活化土壤中的難溶態(tài)磷,提高土壤有效磷含量,從而促進植物的生長發(fā)育[7-9]。此外,其代謝產(chǎn)物可以影響植物根系的分泌,改變植物根際酸化的現(xiàn)狀[10]。畢銀麗等[11]將植物根際分離得到的解磷菌制成菌肥,施加到荒漠植物的土壤中,土壤有效磷的含量提高,沙土也由酸性土壤變?yōu)橹行酝寥?,酸性磷酸酶的活性增強,最終加快植物生長發(fā)育。解磷菌分布在植物根系周圍的不同位置,表現(xiàn)出明顯的根際效應(yīng),即根際土中解磷菌的數(shù)目比根外土壤中多[12]。Hariprasad等[13]對16株解磷菌進行了番茄接種試驗,植株經(jīng)處理后,根長、株高、鮮重、干重和番茄的磷含量均有不同程度的提高;邢芳芳等[14]篩選了1株具有溶磷作用的枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis),盆栽試驗表明,經(jīng)解磷菌處理,白菜的葉綠素、生物產(chǎn)量和葉片數(shù)顯著地提高,對白菜有明顯的促生作用。

        霸王[Zygophyllum xanthoxylon(Bunge)Maxim]為蒺藜科,屬于強旱生灌木[15],在我國西北和內(nèi)蒙古的草原化荒漠地區(qū)分布較為廣泛。其適應(yīng)能力強,抗旱、抗寒、耐貧瘠,并且根系繁盛,生長快速,產(chǎn)量高,適合在干旱的砂地和多石地區(qū)生長的特性,對于保持土壤穩(wěn)定,改善環(huán)境有非常重要的作用[16]。本研究對霸王根際有解磷能力的細菌進行了初步探索,以期為改良和穩(wěn)定荒漠地區(qū)的生態(tài)系統(tǒng)提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 樣品采集 樣品為2018年7月采集自內(nèi)蒙古西鄂爾多斯荒漠灌木霸王根際土,用已滅菌的刷子輕輕將霸王根際土刷至聚乙烯塑料無菌采樣袋中,運回實驗室。

        1.1.2 培養(yǎng)基 1/2 R2A培養(yǎng)基,無機磷細菌培養(yǎng)基(NBRIP)[17](配制固體培養(yǎng)基加20g瓊脂,pH調(diào)至7.5左右)。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 解磷細菌的分離與純化 稱取植物根際土0.5g,加入49.5mL無菌水,震蕩30min,靜置10min。吸取1mL上清液,用無菌水稀釋成10-1~10-6等6個梯度,各自涂布在固體 NBRIP培養(yǎng)基,每個梯度設(shè)3個平行。26℃條件下培養(yǎng)7d,挑取形態(tài)各異的單菌落劃線純化,獲得單菌落。

        1.2.3 菌株的鑒定及其同源性分析 把純化的單菌落挑入1/2R2A液體培養(yǎng)基,搖床培養(yǎng)渾濁后,吸取菌液加入含30%甘油的1.5mL的無菌保存管中,-80℃保存,同時進行DNA的提取。將提取得到的細菌DNA模板,采用細菌16S rDNA通用引物27F和1492R[18]進行16S rRNA基因的擴增。擴增產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢驗后送至上海生工進行測序,利用RDP在線程序Classifier及EzTaxon進行同源性分析以確定菌株的種屬關(guān)系。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 分離篩選的解磷菌 利用傳統(tǒng)分離培養(yǎng)方法,使用無機磷細菌培養(yǎng)基,對內(nèi)蒙古西鄂爾多斯荒漠灌木霸王根際的解磷細菌進行分離培養(yǎng),共篩選得到解磷細菌36株。菌株的菌落多為白色或無色透明,邊緣光滑,圓形,表面濕潤且黏稠。

        2.2 菌株的16S rRNA同源性 分別以36株解磷菌的基因組DNA為模板進行16S rRNA基因擴增,部分電泳檢測結(jié)果見圖1。擴增片段測序后,在EzTaxon數(shù)據(jù)庫中進行同源性分析,結(jié)果顯示36株菌分屬4個綱、15個屬,相似度都在99%~100%(見表1、圖2)。16株屬于放線菌綱(Actinobacteria)類群,其中,GP6、GP7、P2-37-2屬于諾卡氏菌屬(Nocardioides),GP10、P1-10、P1-58-1、P1-58-2、P1-15、P2-4屬于節(jié)桿菌屬(Arthrobacter),GP12、HP2屬于鏈霉菌屬(Streptomyces),GP8、P2-45屬于原小單孢菌屬(Promicromonospora),P2-31屬于紅球菌屬(Rhodococcus),P2-35-1、P2-37-1屬于分支桿菌(Mycobacterium);8株屬于厚壁菌門的芽孢桿菌綱(Bacilli)類群,其中,GP20、P3-13、P1-2屬于類芽孢菌屬(Paenibacillus),HP4、HP4-1、P3-2、P1-12屬于芽孢桿菌屬(Bacillus),P2-38屬于威廉姆氏菌屬(Williamsia);10株屬于變形菌門的α-變形菌綱(α-Proteobacteria)類群,其中,GP16-1、GP16-2、P1-58、P2-6-1、P3-30屬于蒼白桿菌屬(Ochrobactrum),HP1、HP1-1、HP1-4屬于甲基桿菌(Methylobacterium),P2-41屬于根瘤菌屬(Rhizobium),GP9屬于葉桿菌屬(Phyllobacterium);2株屬于變形菌門的γ-變形菌綱(γ-Proteobacteria)類群,其中,GP22屬于泛菌屬(Pantoea),P1-13-1屬于腸桿菌屬(Enterobacter)。其中節(jié)桿菌屬(6株)占總數(shù)的16.7%,為第一優(yōu)勢菌屬,蒼白桿菌屬(5株)占總數(shù)的13.9%,為第二優(yōu)勢菌屬,芽孢桿菌屬(4株)占總數(shù)的11.1%,為第三優(yōu)勢菌屬。

        3 討論與結(jié)論

        解磷菌可產(chǎn)生抗真菌的化合物、鐵載體、抗生素、氫氰酸和溶菌酶抵抗病原菌,促進植物的生物固氮效率、植物激素的合成和提高Zn、Fe等微量元素的利用,從而促進植物的生長[19]。解磷菌因其具有較強的植物促生效應(yīng),對農(nóng)作物的生長和發(fā)育具有顯著的協(xié)同作用[20],可被作為生物肥料促進植物的生長[21]。

        對霸王根際解磷菌進行研究,篩選出高效解磷細菌,對于調(diào)節(jié)土壤磷素的供需矛盾,維護干旱荒漠地區(qū)生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定,改善內(nèi)蒙古地區(qū)的土地荒漠化狀態(tài)具有重要的意義和應(yīng)用價值。本研究從荒漠灌木霸王根際分離純化獲得36株解磷細菌,分屬15個屬,與已報道的文獻中解磷菌種屬類似[21-23]。其中,諾卡氏菌屬(Nocardioides)有3株、原小單孢菌屬(Promicromonospora)有2株、葉桿菌屬(Phyllobacterium)有1株、節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)有6株、鏈霉菌屬(Streptomyces)有2株、類芽孢菌屬(Paenibacillus)有3株、泛菌屬(Pantoea)有1株、芽孢桿菌屬(Bacillus)有4株、蒼白桿菌屬(Ochrobactrum)有5株、威廉姆氏菌屬(Williamsia)有1株、分支桿菌(Mycobacterium)有2株、甲基桿菌(Methylobacterium)有3株、腸桿菌屬(Enterobacter)有1株、紅球菌屬(Rhodococcus)有1株、根瘤菌屬(Rhizobium)有1株。在綱水平上,放線菌綱(Actinobacteria)為第一優(yōu)勢類群(44.45%),α-變形菌綱(α-Proteobacteria)為第二優(yōu)勢類群(27.78%),再次是芽孢桿菌綱(Bacilli)類群(22.22%),與鞏瑞紅等[23]研究結(jié)果一致,與賈麗娟等[21]研究結(jié)果有差異。在屬水平上,節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)(16.7%)為第一優(yōu)勢菌屬,蒼白桿菌屬(Ochrobactrum)(13.9%)為第二優(yōu)勢菌屬,再次為芽孢桿菌屬(Bacillus)(11.1%),與很多已報道文獻研究有差異[21-25]。解磷菌的分布與空間條件有關(guān)[26,27],其多樣性決定于土壤的理化性質(zhì),如有機質(zhì)及磷的含量[28]。在受植物影響、有機質(zhì)等營養(yǎng)更加豐富的植物如作物等根際微生物中,解磷菌的種類和數(shù)量更多樣,群落結(jié)構(gòu)更復(fù)雜[26]。

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        (責編:張宏民)

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