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        基于文獻(xiàn)計(jì)量的國內(nèi)外小麥遺傳育種研究進(jìn)展

        2020-04-10 06:57:04孟靜唐研徐淑良
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年3期
        關(guān)鍵詞:文獻(xiàn)計(jì)量研究進(jìn)展小麥

        孟靜 唐研 徐淑良

        摘要:小麥遺傳育種是將已有的遺傳和變異理論應(yīng)用于實(shí)踐,通過人工選擇、雜交和定向培育等手段來創(chuàng)造新的小麥品種的過程。采用文獻(xiàn)計(jì)量法和對比分析法,借助Citespace軟件,對Web of Science和中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI)中小麥遺傳育種的文獻(xiàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,繪制知識圖譜。從時(shí)間和空間兩大序列和發(fā)文量、國家、機(jī)構(gòu)、關(guān)鍵詞、主題詞等5個(gè)方面,進(jìn)行定量對比分析,以可視化的形式呈現(xiàn)研究進(jìn)展、熱點(diǎn)與前沿。結(jié)果顯示,近年來我國小麥遺傳育種研究發(fā)展迅速,發(fā)文量和研究水平正逐步趕超發(fā)達(dá)國家,主要研究內(nèi)容為小麥遺傳性狀、品質(zhì)改良、種質(zhì)資源、抗病性及抗逆性等。

        關(guān)鍵詞:小麥;遺傳育種;文獻(xiàn)計(jì)量;研究進(jìn)展

        中圖分類號: S512.103 ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A ?文章編號:1002-1302(2020)03-0064-09

        小麥?zhǔn)鞘澜绶秶鷥?nèi)種植面積最廣、產(chǎn)量最多、貿(mào)易額最高的糧食作物,小麥?zhǔn)俏覈诙蠹Z食作物,播種面積占全國耕地面積的20%~30%[1]。小麥遺傳育種始于19世紀(jì)中葉,早期的育種工作主要側(cè)重于對自然變異的選擇育種,經(jīng)過幾百年的發(fā)展,形成了以雜交育種為中心,以遠(yuǎn)緣雜交、誘變育種、倍性育種、優(yōu)勢利用等相結(jié)合的多種育種途徑,選育出了許多高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)的優(yōu)質(zhì)品種,對小麥產(chǎn)量的提高起到了重要的作用[2]。

        當(dāng)前,國內(nèi)外小麥遺傳育種已取得了一定的研究成果。從國外研究來看,Hu等通過近等基因系對特定位點(diǎn)擴(kuò)增片段測序鑒定發(fā)現(xiàn),位于7A染色體上的TATGW-7A對于提高小麥千粒質(zhì)量有重要的作用[3];Dakouri等分析小麥種苗期和成株期葉銹病抗性特征,發(fā)現(xiàn)Lr34是小麥成株期最重要的抗葉銹病基因[4];Allen等對5種六倍體面包小麥群體進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)篩選,發(fā)現(xiàn)了225 001個(gè)用于構(gòu)建遺傳圖譜的SNP標(biāo)記[5]。國內(nèi)研究方面,趙俊杰借助競爭性等位基因特異性PCR(KASP)分型檢測技術(shù),分析改良過程中基因組上留下的選擇印跡,發(fā)現(xiàn)我國地方品種和育成品種的11個(gè)農(nóng)藝性狀在3個(gè)環(huán)境下的表型差異顯著[6];鄒景偉等利用高通量的KASP標(biāo)記技術(shù)對株高、抗葉銹病、抗條銹病、抗赤霉病、抗穗發(fā)芽和加工品質(zhì)等性狀相關(guān)的基因進(jìn)行了檢測[7];宮文萍等利用寡聚核苷酸原位雜交(FISH)方法對2份雙二倍體進(jìn)行分析,建立了可用于鑒定山羊草細(xì)胞遺傳標(biāo)記輔助的回交群體[8]。

        本研究采用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法,對國內(nèi)外學(xué)術(shù)文獻(xiàn)進(jìn)行定量對比分析,并試圖解答以下4個(gè)問題:(1)發(fā)文的年代分布特點(diǎn);(2)發(fā)文國家、機(jī)構(gòu)分布情況;(3)發(fā)文的關(guān)鍵詞和主題詞統(tǒng)計(jì)情況;(4)研究熱點(diǎn)與前沿。

        1 數(shù)據(jù)來源與研究方法

        1.1 數(shù)據(jù)來源

        1.1.1 國外數(shù)據(jù) 國外文獻(xiàn)樣本以Web of Science數(shù)據(jù)庫作為數(shù)據(jù)源,設(shè)置檢索條件:主題=(“wheat breeding” OR “wheat genetic breeding”),時(shí)間跨度為2008—2018年,文檔類型(document type)為文章(article),檢索日期為2018年9月26日,對結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行清洗,得到3 012篇文獻(xiàn),以此作為國外文獻(xiàn)研究的數(shù)據(jù)樣本。

        1.1.2 國內(nèi)數(shù)據(jù) 國內(nèi)文獻(xiàn)樣本以中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫(CNKI)作為數(shù)據(jù)源,設(shè)置檢索條件:主題=(“小麥育種”或者“小麥遺傳育種”),時(shí)間跨度為2008—2018年,數(shù)據(jù)庫來源類別為“學(xué)術(shù)期刊”跨庫檢索,對結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行清洗,得到1 204篇文獻(xiàn),以此作為中文文獻(xiàn)的研究樣本。

        1.2 研究方法

        1.2.1 文獻(xiàn)計(jì)量法 文獻(xiàn)計(jì)量法是一種基于數(shù)理統(tǒng)計(jì)的定量分析方法,以科學(xué)文獻(xiàn)的外部特征為對象,研究文獻(xiàn)的分布結(jié)構(gòu)、數(shù)量關(guān)系、變化規(guī)律和定量管理,探討科學(xué)技術(shù)的某些結(jié)構(gòu)、特征和規(guī)律[9]。利用文獻(xiàn)計(jì)量法分析國內(nèi)外小麥遺傳研究現(xiàn)狀,揭示該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)和前沿問題,以期為未來育種工作的開展提供科學(xué)依據(jù)。

        1.2.2 對比分析法 對比分析法是把客觀事物加以比較,從數(shù)量上展示和說明研究對象規(guī)模的大小、水平的高低、速度的快慢以及各種關(guān)系是否協(xié)調(diào),以達(dá)到認(rèn)識事物本質(zhì)和規(guī)律并作出正確評價(jià)的方法[10]。利用該方法將國內(nèi)外小麥遺傳育種文獻(xiàn)進(jìn)行對比分析,發(fā)現(xiàn)國內(nèi)外研究差異,為國內(nèi)小麥遺傳育種的發(fā)展提供有利的參考和借鑒。

        2 國外文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)分析

        2.1 時(shí)間序列上的文獻(xiàn)特點(diǎn)

        在年代分布上,國外文獻(xiàn)總量呈平穩(wěn)增長態(tài)勢(圖1),2017年達(dá)發(fā)文量峰值,2013年和2016年發(fā)文量有所回落。小麥遺傳育種在國際上仍然是一個(gè)成長中的研究點(diǎn),發(fā)展中雖存在波動,但近年來的研究成果仍保持在較高的狀態(tài)。2018年數(shù)據(jù)尚不完善,這里所討論的文獻(xiàn)為從2008年開始的近10年數(shù)據(jù)。

        2.2 空間序列上的文獻(xiàn)特點(diǎn)

        2.2.1 各國研究實(shí)力 國外文獻(xiàn)共涉及87個(gè)國家(地區(qū)),發(fā)文量排名前10位的見表1。中國發(fā)文量居首位,其他依次是美國、澳大利亞、德國、印度、墨西哥、巴基斯坦、英國、法國、加拿大等,我國小麥遺傳育種的研究成果在世界范圍內(nèi)已名列前茅。用Citespace繪制國家分布知識圖譜(圖2),合作網(wǎng)絡(luò)中,各國之間的聯(lián)系普遍較為緊密,印度、美國、德國、墨西哥、英國等國家的中心性較高,占有更高的國際合作比例,在國際合作中優(yōu)勢顯著;中國發(fā)文量雖高,但中心性較低,僅為0.01,反映出我國當(dāng)前與其他國家的交流合作還有待進(jìn)一步的加強(qiáng)。

        2.2.2 主要研究機(jī)構(gòu) 文獻(xiàn)共涉及2 518個(gè)機(jī)構(gòu),發(fā)文量排名前10位的機(jī)構(gòu)如表2所示。根據(jù)普賴斯定律,N=0.749ηmax,ηmax=167(最高產(chǎn)研究機(jī)構(gòu)的發(fā)文量),核心研究機(jī)構(gòu)的發(fā)文量應(yīng)在10篇以上,由此,該研究領(lǐng)域的核心研究機(jī)構(gòu)共59個(gè)。發(fā)文量最高的機(jī)構(gòu)為中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院,其次為美國農(nóng)業(yè)部、堪薩斯州立大學(xué)、國際玉米小麥改良中心等。

        利用Citespace繪制機(jī)構(gòu)分布知識圖譜(圖3),從整體上看,核心發(fā)文機(jī)構(gòu)主要為農(nóng)業(yè)科研院所和高校;從節(jié)點(diǎn)中心性上看,國際玉米小麥改良中心、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院和華盛頓州立大學(xué)的中心性較高,研究合作較多。西北農(nóng)林科技大學(xué)(未入前10名)、四川農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)(未入前10名)等的發(fā)文量較高,但中心性低,說明國內(nèi)農(nóng)業(yè)高校在世界的影響力不足,應(yīng)加強(qiáng)科研走出去與團(tuán)隊(duì)合作,推進(jìn)協(xié)同創(chuàng)新。

        2.3 研究熱點(diǎn)分析

        關(guān)鍵詞是查找文獻(xiàn)的重要檢索點(diǎn),是文獻(xiàn)主旨的精煉,高頻關(guān)鍵詞常被視為一個(gè)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)[11]。通過篩選、合并、剔除同義詞等數(shù)據(jù)清洗方式,建立高頻關(guān)鍵詞表(表3),利用Citespace繪制關(guān)鍵詞共現(xiàn)知識圖譜(圖4)。除wheat、bread wheat和Triticum aestivum L.等與小麥定義直接相關(guān)的關(guān)鍵詞外,高頻關(guān)鍵詞還有cultivar、genetic diversity、winter wheat、identification、yield、durum wheat等。

        以出現(xiàn)頻次最高的小麥為中心點(diǎn),通過網(wǎng)絡(luò)連線尋找其他高頻關(guān)聯(lián)詞,有品種栽培、糧食產(chǎn)量、分子標(biāo)記、微衛(wèi)星標(biāo)記、抗逆等。聚類分析后歸納出5個(gè)研究熱點(diǎn):(1)小麥品種,包括大麥(barley)、硬質(zhì)小麥(durum wheat)、春小麥(spring wheat)、冬小麥(winter wheat)、六倍體小麥(hexaploid wheat)等;(2)小麥遺傳性狀,包括基因(gene)、基因組(genome)、數(shù)量性狀基因位點(diǎn)(quantitative trait loci)、分子標(biāo)記(molecular marker)等;(3)小麥種質(zhì)資源,包括種質(zhì)(germplasm)、產(chǎn)量(yield)、質(zhì)量(quality)、蛋白質(zhì)(protein)、多樣性(diversity)等;(4)小麥抗病性,包括條銹?。╯tripe rust)、葉銹?。╨eaf rust)、赤霉?。╯cab resistance)、白粉?。╬owdery mildew)、紋枯?。╯heath blight)、全蝕?。╢ull rot)等;(5)小麥抗逆性,包括抗性(resistance)、抗病性(disease resistance)、耐性(tolerance)、耐干旱性(drought tolerance)、耐熱性(heat tolerance)等。

        2.4 研究前沿分析

        對Web of Science中小麥遺傳育種文獻(xiàn)的主題詞按出現(xiàn)時(shí)間排序,利用時(shí)間序列尋找該領(lǐng)域的研究前沿,近5年出現(xiàn)的主題詞如表4所示。借助Citespace的突顯詞檢測(Brust Detection)功能,繪制主題詞共現(xiàn)圖譜(圖5)和時(shí)間序列(Time Zone)圖譜(圖6)。按由近及遠(yuǎn)的時(shí)間順序(含2018年),凸顯的主題詞依次為全變異(total variation)、重組自交系(recombinant inbred line)、候選基因(candidate genes)、連鎖基因圖譜(genetic linkage map)、全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association study)、環(huán)境互作(environment interaction)、全基因組關(guān)聯(lián)映射(genome-wide association mapping)、葉銹?。╨eaf rust)、性狀標(biāo)記關(guān)聯(lián)(marker-trait association)、未來育種項(xiàng)目(future breeding program)、花期(flowering time)、品質(zhì)性狀(quality traits)等。

        國外小麥遺傳育種的研究前沿主線十分鮮明,與研究熱點(diǎn)存在交叉,主要體現(xiàn)在3個(gè)方面:(1)基礎(chǔ)研究,包括基因、基因圖譜、基因組選擇、遺傳結(jié)構(gòu)、單核苷酸多肽性、數(shù)量性狀基因位點(diǎn)等;(2)試驗(yàn)技術(shù)與方法研究,包括全基因組關(guān)聯(lián)與映射、性狀標(biāo)記關(guān)聯(lián)、SNP標(biāo)記、原位雜交、 分子標(biāo)記連鎖圖譜等;(3)應(yīng)用研究,包括環(huán)境互作、品質(zhì)改良、生理性狀等。

        3 國內(nèi)文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)分析

        3.1 時(shí)間序列上的文獻(xiàn)特點(diǎn)

        國內(nèi)小麥遺傳育種發(fā)文量整體呈平穩(wěn)下降趨勢(圖7),2009年發(fā)文量達(dá)到最大值,為146篇,之后3年發(fā)文量持續(xù)下降,2012年后出現(xiàn)轉(zhuǎn)折,2014年達(dá)到第2個(gè)小高峰后發(fā)文量持續(xù)走低。國內(nèi)小麥遺傳育種的發(fā)文數(shù)量呈下降態(tài)勢,結(jié)合Web of Science國際發(fā)文量排名,我國發(fā)文量已位居世界第1位,說明國內(nèi)研究已日趨成熟,研究成果從高量向高質(zhì)轉(zhuǎn)變,并逐漸與國際接軌,得到國際認(rèn)可,朝著引領(lǐng)世界研究前沿的良好態(tài)勢發(fā)展。

        3.2 空間序列上的文獻(xiàn)特點(diǎn)

        文獻(xiàn)共涉及98個(gè)研究機(jī)構(gòu),發(fā)文量排名前10位的機(jī)構(gòu)如表5所示。發(fā)文量最高的為西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院,發(fā)文31篇,依據(jù)普賴斯定律,國內(nèi)小麥遺傳育種領(lǐng)域的核心研究機(jī)構(gòu)發(fā)文量應(yīng)在4篇以上,共有28個(gè)機(jī)構(gòu)。國內(nèi)小麥主產(chǎn)區(qū)河南、山東、山西、陜西等地區(qū)研究機(jī)構(gòu)的數(shù)量約占全部機(jī)構(gòu)的一半,說明該領(lǐng)域的研究是依托在田間試驗(yàn)基礎(chǔ)之上,作物的大面積種植對相關(guān)的研究有良性的促進(jìn)作用。

        利用Citespace繪制機(jī)構(gòu)分布知識圖譜(圖8),各機(jī)構(gòu)的中心性均為0,合作網(wǎng)絡(luò)松散,僅在文獻(xiàn)高產(chǎn)機(jī)構(gòu)和區(qū)域內(nèi)機(jī)構(gòu)之間存在合作,學(xué)術(shù)交流與合作有待進(jìn)一步加強(qiáng)。例如,以西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院、山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院小麥研究所、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所和山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所為核心的高產(chǎn)機(jī)構(gòu)之間的合作,以及山西大學(xué)生物工程學(xué)院、山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心和山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所之間的區(qū)域內(nèi)機(jī)構(gòu)合作。

        3.3 研究熱點(diǎn)分析

        提取文獻(xiàn)高頻關(guān)鍵詞作為研究熱點(diǎn)分析樣本,高頻關(guān)鍵詞(表6)有9個(gè)與Web of Science中的高頻關(guān)鍵詞重合,說明國內(nèi)研究已逐步接軌國際。利用Citespace繪制關(guān)鍵詞共現(xiàn)知識圖譜(圖9),中心性較高的關(guān)鍵詞有小麥育種、小麥品種、小麥新品種、麥類作物、冬小麥、分子標(biāo)記等。以高頻關(guān)鍵詞為結(jié)點(diǎn),向四周發(fā)散的連線呈復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)狀,說明該領(lǐng)域的研究方向和熱點(diǎn)眾多,各個(gè)研究方向與熱點(diǎn)之間存在交叉關(guān)系,證實(shí)了小麥遺傳育種的多學(xué)科交叉屬性。

        對高頻關(guān)鍵詞進(jìn)行聚類分析,得到4個(gè)研究熱點(diǎn):(1)高品質(zhì)新品種的培育,包括小麥育種、小麥新品種及農(nóng)藝性狀等;(2)區(qū)域小麥,包括冬小麥、春小麥、河南省及黃淮麥區(qū)等;(3)小麥育種技術(shù),包括分子標(biāo)記、分子育種及遠(yuǎn)緣雜交等;(4)小麥抗病性,包括白粉病、矮敗小麥及條銹病等。

        3.4 研究前沿分析

        將文獻(xiàn)主題詞進(jìn)行清洗、按時(shí)間排序,近5年出現(xiàn)的主題詞如表7所示,用Citespace繪制主題詞共現(xiàn)圖譜(圖10)和時(shí)間序列(Time Zone)圖譜(圖11)。在研究前沿分析中(包含2018年數(shù)據(jù)),按由近及遠(yuǎn)的時(shí)間順序,凸顯的主題詞為超氧化物歧化酶(superoxide dismutase)、特異性聚合酶鏈反應(yīng)(specific polymerase chain reaction)、人工合成六倍體小麥(synthetic hexaploid wheat)、自然通訊(nature communications)、成株期抗性(adult-plant resistance)、小麥葉銹?。╬uccinia triticina)、山羊草(aegilops longissima)、多酚氧化酶(polyphenol oxidase)等。

        國內(nèi)小麥遺傳育種的研究前沿與國際基本相似,特殊之處在于凸顯主題詞包含長穗偃麥草、粘果山羊草、二穗短柄草、黑麥等大量小麥的野生近種,在一定程度上說明國內(nèi)育種更重視遠(yuǎn)緣雜交,通過探索外源種屬的種質(zhì)資源,擴(kuò)大遺傳基礎(chǔ)、尋求基因改良途徑,跟我國地大物博,植物種類繁多、變異多樣、遺傳基礎(chǔ)豐富,能夠?yàn)樾←湹幕蚋牧继峁氋F的遺傳資源是息息相關(guān)的。

        4 結(jié)論

        培育高產(chǎn)、穩(wěn)定、優(yōu)質(zhì)的小麥新品種是改善民生、保障國家糧食安全的重大舉措,提高小麥遺傳育種工作的創(chuàng)新能力和育種水平,使小麥遺傳育種朝著高水平、多元化的方向發(fā)展,是國內(nèi)外農(nóng)業(yè)科研工作者的重要研究課題。本研究采用文獻(xiàn)計(jì)量和對比分析的方法,利用Citespace軟件繪制國內(nèi)外小麥遺傳育種文獻(xiàn)的可視化知識圖譜,對研究現(xiàn)狀、研究熱點(diǎn)和研究前沿進(jìn)行對比分析發(fā)現(xiàn),國內(nèi)該領(lǐng)域的研究不僅文獻(xiàn)產(chǎn)出量世界領(lǐng)先,研究前沿也逐步接軌國際先進(jìn)水平。

        展望未來,小麥遺傳育種的研究還面臨許多挑戰(zhàn),主要包括基因組學(xué)、健康、赤霉病、芯片技術(shù)、國際協(xié)作網(wǎng)等[12]。就國內(nèi)而言,發(fā)掘并利用小麥耐脅迫基因、建立精準(zhǔn)且高通量表型系統(tǒng)、充分利用生

        物學(xué)技術(shù)、實(shí)現(xiàn)多優(yōu)良基因聚合、提高育種效率、改進(jìn)小麥品質(zhì)、提高抗病性、應(yīng)對氣候變化以及兼抗型持久抗性等將是未來發(fā)展的主流趨勢。

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