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        渤海蝦醬中益消細(xì)菌的分離和鑒定

        2020-04-03 04:48:52陳笑語張力元紀(jì)海玉劉安軍
        中國食品學(xué)報 2020年3期
        關(guān)鍵詞:蝦醬吲哚芽孢

        陳笑語 張力元 紀(jì)海玉 劉安軍

        (天津科技大學(xué)食品工程與生物技術(shù)學(xué)院 天津300457)

        渤海蝦醬醬色鮮艷,醬質(zhì)細(xì)膩,組織均勻,氣味鮮香、口感好,醬香味和蝦鮮味濃郁,含有優(yōu)質(zhì)的蛋白質(zhì)、鈣、鐵、硒、維生素A 和脂肪酸等營養(yǎng)元素。蝦醬中還有蝦青素和甲殼素兩個重要的因子,其中被稱為超等維生素的蝦青素,具有維生素A、維生素E 和β 胡蘿卜素,可以改善免疫力,阻擋紫外線的傷害,提高視力能力,還可避免不飽和脂肪酸被氧化。甲殼素具有降血壓、降低膽固醇以及抗菌等功能。

        近年來研究發(fā)現(xiàn),蝦醬的風(fēng)味和保健活性與其中的微生物菌群密切相關(guān)。孫業(yè)盈等[1]通過研究蜢子蝦醬,分離鑒定出一株嗜鹽菌,經(jīng)鑒定確定為鹽脫氮枝芽孢桿菌,其屬于枝芽孢桿菌屬。連鑫等[2]對蝦醬中呈味優(yōu)勢菌種進(jìn)行挑選、分離鑒定,發(fā)現(xiàn)一株產(chǎn)香酵母,為季氏畢赤氏酵母,分析結(jié)果表明:菌株耐受高鹽環(huán)境,對菌株進(jìn)一步純化,提高耐鹽性,用于低鹽蝦醬的發(fā)酵,提高蝦醬發(fā)酵香氣,控制產(chǎn)品質(zhì)量。連鑫等[3]從蝦醬中分離出一株產(chǎn)蛋白酶霉菌,確定為黑曲霉,通過研究其在蝦醬生產(chǎn)中各種因素對于風(fēng)味變化的影響,對其產(chǎn)蛋白霉菌進(jìn)行改造,為傳統(tǒng)發(fā)酵產(chǎn)品的工業(yè)化生產(chǎn)提供優(yōu)質(zhì)的菌株。

        傳統(tǒng)蝦醬中由于含有多種多樣的微生物菌群,因此形成了比較穩(wěn)定的微生物系統(tǒng)[4],風(fēng)味良好,營養(yǎng)豐富,具有多種保健功能。鑒于目前對蝦醬的研究主要集中在風(fēng)味物質(zhì)的相關(guān)菌群方面,而對其益消細(xì)菌鮮有研究報道。本研究用營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基對渤海蝦醬中的細(xì)菌進(jìn)行分離,采用PCR 測序技術(shù)對其進(jìn)行鑒定,并研究該菌株的耐熱性,為蝦醬在食品加工過程中的合理利用提供一定的理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料與試劑

        渤海蝦醬:黃驊市王曼老李水產(chǎn)品有限公司。

        培養(yǎng)基:PDA 培養(yǎng)基、營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基、高氏一號培養(yǎng)基、馬鈴薯蔗糖MRS 培養(yǎng)基、營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基,購買于北京路橋技術(shù)有限責(zé)任公司。

        試劑:無水乙醇,天津市科密歐化學(xué)試劑有限公司;27F 引物和1492R 引物,北京鼎國盛世有限公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        電泳儀,美國Thermo 公司;冷凍離心機(jī),美國Thermo 公司;電熱恒溫培養(yǎng)箱,北京中興偉業(yè)儀器有限公司;真空冷凍干燥機(jī),北京博醫(yī)康實驗儀器有限公司。

        1.3 試驗方法

        1.3.1 傳統(tǒng)蝦醬生產(chǎn)工藝 工藝流程:原料去雜洗滌→裝入瓷缸→加入鹽度為25%~30%的鹽水→拌勻→控制溫度25~30 ℃發(fā)酵→30 d 后油、醬分離→包裝巴氏滅菌。蝦醬中鹽度一般控制到27%左右為佳,鹽分過高過低都會直接影響微生物的生存以及蝦醬的口感。

        1.3.2 細(xì)菌的分離和純化 在無菌條件下,取蝦醬樣品1 g 于錐形瓶中,注入9 mL 蒸餾水振蕩搖勻(8 000 r/min,5 min),按10-1,10-2,10-3 梯度稀釋并涂布于營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基中,37 ℃恒溫培養(yǎng)48 h。然后用接種環(huán)挑取分離得到的細(xì)菌菌株,接種到營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上培養(yǎng)進(jìn)行純化,37 ℃恒溫培養(yǎng)48 h。

        1.3.3 細(xì)菌的形態(tài)學(xué)鑒定 用接種環(huán)挑取分離純化后的細(xì)菌菌株,接種到營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基上,37℃恒溫培養(yǎng)48 h,觀察并記錄培養(yǎng)皿中菌落的形態(tài)特點(diǎn),觀察菌落形態(tài)并計數(shù),然后通過革蘭氏染色,光學(xué)顯微鏡觀察其形態(tài)。

        1.3.4 細(xì)菌的生理生化試驗 根據(jù)《The Yeasts:A Taxonomic Study》對分離菌株進(jìn)行糖、醇發(fā)酵試驗、V-P 試驗、甲基紅(Methyl Red)試驗、靛基質(zhì)吲哚試驗。

        1)糖、醇發(fā)酵試驗:將分離純化后的菌株做糖發(fā)酵試驗,檢驗菌株對各種糖醇類碳源的利用情況,將菌株制備成菌懸液,將裝有培養(yǎng)液的杜氏小管倒置放入試管中,置于37 ℃恒溫箱中培養(yǎng)5 d,如果顏色為紫色無氣泡,不產(chǎn)酸不產(chǎn)氣為陰性;如果顏色為黃色無氣泡,產(chǎn)酸不產(chǎn)氣為陽性;如果顏色為黃色有氣泡,產(chǎn)酸產(chǎn)氣為0。測定的糖類(醇、糖苷)包括:葡萄糖、蔗糖、甘露糖、乳糖(1.5%)、半乳糖(1.5%)、D-山梨醇、果糖、阿拉伯糖、麥芽糖、纖維二糖、木糖、水楊苷等[5-7]。

        2)乙酰甲基甲醇V-P 試驗:將分離純化后的菌株做V-P 試驗,將試驗菌接種于上述培養(yǎng)基,于36 ℃±1 ℃培養(yǎng)4 d、培養(yǎng)液2.5 mL,先加入a 萘酚 (2-na-phthol)純酒精溶液0.6 mL,再加40%氫氧化鉀水溶液0.2 mL,搖動2~5 min,若出現(xiàn)紅色,可判定為陽性細(xì)菌,若無紅色出現(xiàn),靜置于36 ℃±1 ℃恒溫箱,如2 h 內(nèi)仍不顯現(xiàn)紅色,可判定為陰性細(xì)菌。

        3)甲基紅(Methyl Red)試驗:將分離純化后的菌株做甲基紅試驗,挑取新的待試純培養(yǎng)物少許,接種于通用培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)3~5 d,從第2 天起,每日取培養(yǎng)液1 mL,加甲基紅指示劑1~2 滴,陽性呈鮮紅色,弱陽性呈淡紅色,陰性為黃色。至發(fā)現(xiàn)陽性或至第5 天仍為陽性,即可判定結(jié)果。

        4)靛基質(zhì)吲哚試驗 :將分離純化后的菌株做靛基質(zhì)吲哚試驗,取裝有蛋白胨水培養(yǎng)液的試管5 支,分別標(biāo)記大腸桿菌、產(chǎn)氣腸桿菌、普通變形菌、枯草芽孢桿菌和空白對照。以無菌操作分別接種少量菌苔到以上相應(yīng)試管中,第5 管作空白對照不接種,置37 ℃恒溫箱中培養(yǎng)24~48 h。在培養(yǎng)液中加入乙醚1~2 mL,經(jīng)充分振蕩使吲哚萃取至乙醚中,靜置片刻后乙醚層浮于培養(yǎng)液的上面,此時沿管壁緩慢加入5~10 滴吲哚試劑,如有吲哚存在,乙醚層呈現(xiàn)玫瑰紅色,此為吲哚試驗陽性反應(yīng),否則為陰性反應(yīng),陽性用“+”、陰性用“-”表示。

        1.3.5 16 SrDNA 序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建方法采用煮沸法提取目的基因,參照細(xì)菌的16sDNA序列分析,選取細(xì)菌1492R 與27F 通用引物(見表1),進(jìn)行PCR 反應(yīng)。選擇單菌落作為目的模板,反應(yīng)條件:變性94 ℃,1 min,退火58 ℃,45 s,延伸72 ℃,45 s,一共需要29 個循環(huán)。用移液器吸取5 μL PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,開始瓊脂糖凝膠電泳反應(yīng),根據(jù)圖判斷擴(kuò)增產(chǎn)物的分子質(zhì)量大小,并保存觀察,將擴(kuò)增成功的PCR 產(chǎn)物送檢(PCR 產(chǎn)物的測序工作由北京鼎國盛世有限公司完成)。將測序結(jié)果登錄NCBI 網(wǎng)站用BLAST 程序進(jìn)行序列比對,用ClustalX 2 軟件進(jìn)行多序列比對(Multiplealignments),用軟件MEGA5.2 進(jìn)行分析獲得系統(tǒng)進(jìn)化樹[8-9]。

        分子鑒定試驗步驟:

        目的基因的提?。喝「粢沟木? mL 于離心管中,振蕩搖勻(11 000 r/min,1 min),棄上清液,再取1 mL 菌液,離心,然后取150 μL 滅菌水吹洗菌體沉淀物,離心,棄上清液,反復(fù)洗滌2 次。用一次性手套包上離心管,開水煮10 min(煮沸過程中實時拿出爆蓋離心管,排氣后,再放回,振蕩搖勻)。取上清液,即所需要的目的基因。

        表1 引物堿基序列Table 1 Primer base sequence

        PCR 擴(kuò)增目的基因:取一個干凈的小離心管,依次加入17 μL H2O,0.5 μL Mg2+,1 μL 基因模板,2 μL dNTP,2 μL Buffer,0.5 μL Taq 酶,1 μL 27F,1 μL 1492R,放入PCR 儀中反應(yīng),設(shè)置程序(見表2)。制作膠體,取0.4 g 瓊脂糖,加25 mL EDTA 緩沖液,再加入0.9 mL EB 溴乙錠液體,放置15 min 膠體便制好,加樣跑膠,上機(jī)marker 跑膠出圖[10-15]。

        表2 PCR 程序Table 2 PCR program

        MEGA 5 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹:

        1)準(zhǔn)備序列文件 準(zhǔn)備txt.格式序列文件。

        2)多序列比對 開啟MEGA 5 系統(tǒng),單擊Align→Edit/Build Alignment→Create a new alignment,點(diǎn)擊OK,選擇序列為核酸DNA。選好之后,單擊Edit→Insert Sequence From File,選擇需要的序列文件,點(diǎn)擊按鈕→Align DNA,在彈出的窗口中,選擇默許的比對參數(shù),點(diǎn)OK,進(jìn)行序列比對,刪除兩端沒有比對上的序列,并保存文件。

        3)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹 在多序列比對窗口中,點(diǎn)擊Data→Phylogenetic Analysis,所用序列是否編碼蛋白質(zhì),選Yes。返回MEGA 5 主界面,點(diǎn)擊Phylogeny →Construct/Test Neighbor-Joining Tree…彈出的對話框:使用當(dāng)前的數(shù)據(jù),選Yes,Bootstrap 為1 000,點(diǎn)擊Compute。建樹完成后,注意點(diǎn)擊Bootstrap consensus tree 查看樹形。保存文件為filename.mts(可以用MEGA 5 打開)[16-24]。

        1.3.6 細(xì)菌耐熱性分析 將細(xì)菌懸液 (2.2×1010CFU/mL,6×109個)平均分成6 份,分別置于20,40,60,80,100,120 ℃的溫度下處理5 min 和10 min,然后分別接種至營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng)(37 ℃恒溫培養(yǎng)48 h)并計數(shù),每組3 個平行,統(tǒng)計菌落數(shù)。

        1.3.7 數(shù)據(jù)分析 采用ClustalX 2 對菌株Y8 及模式菌株序列進(jìn)行比對,MEGA5.2 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。采用Excel 軟件作圖,結(jié)果由3 個平行樣的平均值±標(biāo)準(zhǔn)偏差表示。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 細(xì)菌菌株的形態(tài)學(xué)初步鑒定

        從營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基中挑取分離純化的菌株,利用光學(xué)顯微鏡觀察其顏色、形態(tài)特征(見圖1),并對比《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》,然后進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定分析。

        根據(jù)對兩種細(xì)菌菌落形態(tài)及革蘭氏染色觀察,發(fā)現(xiàn)兩種菌株均呈短細(xì)桿狀,表面較粗糙扁平濕潤,半透明乳白色,且革蘭氏染色為藍(lán)紫色陽性。

        2.2 細(xì)菌菌株的生理生化鑒定

        對菌株進(jìn)行糖發(fā)酵試驗,結(jié)果如下。

        菌株A1 和A2 的糖發(fā)酵試驗結(jié)果見表3。乙酰甲基甲醇V-P 試驗呈現(xiàn)紅色,判定其為陽性菌。甲基紅(Methyl Red)試驗呈鮮紅色,判定其為陽性菌。靛基質(zhì)吲哚試驗有吲哚存在,乙醚層呈現(xiàn)玫瑰紅色,確定為吲哚試驗陽性反應(yīng)。

        2.3 對細(xì)菌的16SrDNA 序列基因片段的擴(kuò)增

        本試驗以1492R 和27F 作為引物,來進(jìn)行PCR 擴(kuò)增目的基因,得到的DNA 片段,經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳試驗,可以看到一條長度為1 100 bp左右的擴(kuò)增條帶,PCR 基因擴(kuò)增圖(見圖2)。

        圖1 菌株的菌落形態(tài)及菌體形態(tài)(×40)Fig.1 Colony and thallus morphology of the strain(×40)

        表3 菌株的糖發(fā)酵試驗Table 3 Strain sugar fermentation experiment

        結(jié)果表明:菌株A2 沒有擴(kuò)增成功,舍去。菌株A1 的16SrDNA 基因片段擴(kuò)增成功,可以將其送到北京鼎國盛世有限公司直接測序。

        2.4 測序結(jié)果的BLAST 比對

        雙向測序結(jié)果如表4所示,將公司測序所得到的DNA 序列,輸入NCBI 的數(shù)據(jù)庫中,進(jìn)行BLAST 比對,發(fā)現(xiàn)其與地衣芽孢桿菌中的Bacillus licheniformis ZF23 序列的相似度為98%,確定菌株A1 為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)。

        序列比對分值為1 871 bits,因為分?jǐn)?shù)值越高說明相似度越高;Expect 的期望值為0.0,說明比對效果很好;query cover 同源百分比為98%,Max ident 百分比為97%。確定菌株A1 為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)。

        圖2 菌株A1 的16SrDNA 擴(kuò)增片段凝膠電泳圖Fig.2 The 16SrDNA amplifying fragment gel electrophoresis diagram of the strain A1

        表4 菌株A1 的16SrDNA 序列的測序片段Table 4 Sequence of 16SrDNA sequences of strain A1

        (續(xù)表4)

        2.5 基于16SrDNA 序列分析的菌株系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建及分子鑒定

        根據(jù)序列BLAST 比對結(jié)果,選擇同源性較高的菌株,建立系統(tǒng)進(jìn)化樹,分析菌株的種屬地位。構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹如圖3所示。由圖3可以看出菌株A1 與地衣芽孢桿菌的親緣關(guān)系,菌株A1 與菌株Bacillus licheniformis strain ZF23 發(fā)育距離相近,其中bootstrap 值為99,可見菌株A1 與其同源性較高,確定其為地衣芽孢桿菌菌種。

        2.6 菌株A1 的耐熱性分析

        由圖4、圖5可以看到菌株A1 對于高溫具有一定的耐受性,在加熱溫度低于40 ℃時活菌體數(shù)量基本沒有影響,但隨著加熱溫度的繼續(xù)升高其耐受力下降,當(dāng)加熱溫度高于100 ℃時,加熱5 min 和加熱10 min 菌體個數(shù)基本都趨于0,菌體失活。結(jié)果表明本研究從渤海蝦醬中分離的菌株A1耐熱性不強(qiáng),80 ℃以上加熱熟制后,菌體基本失活,其助消化能力急劇降低。

        圖3 菌株A1 的16SrDNA 序列系統(tǒng)發(fā)育樹分析Fig.3 16SrDNA sequence analysis of strain A1 analysis of the neighbor-joining tree

        圖4 菌株A1 加熱5 min 的菌體個數(shù)變化Fig.4 The changes of bacteria strains A1 after heating 5 min

        圖5 菌株A1 加熱10 min 的菌體個數(shù)變化Fig.5 The changes of bacteria strains A1 after heating 10 min

        3 結(jié)論

        以渤海蝦醬為研究對象,通過營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基對蝦醬中細(xì)菌進(jìn)行分離純化鏡檢,采用PCR 技術(shù)提取目的基因,并測序進(jìn)行BLAST 比對,建立系統(tǒng)發(fā)育樹,得到1 株細(xì)菌A1,與地衣芽孢桿菌中的Bacillus licheniformis strain ZF23 的同源相似度為98%,其中bootstrap 值為99。對該菌株進(jìn)行耐熱性分析,發(fā)現(xiàn)地衣芽孢桿菌對于高溫耐受性較差,隨著加熱時間和溫度的增加其存活率逐漸下降,結(jié)果表明蝦醬在實際應(yīng)用過程中80 ℃及以上的加熱處理將致使其助消化能力顯著降低。本研究為蝦醬在食品加工過程中的合理利用提供一定的理論依據(jù)。

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