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        高光譜亞像元分解預(yù)測花生中的黃曲霉毒素B1

        2020-04-03 04:48:46韓仲志
        中國食品學報 2020年3期

        韓仲志 劉 杰

        (青島農(nóng)業(yè)大學理學與信息科學學院 山東青島266109)

        黃曲霉毒素(Aflatoxin)是一種劇毒、強致癌物,其毒性為砒霜的68 倍,是目前發(fā)現(xiàn)的最強的I類化學致癌物質(zhì)。其廣泛存在于花生、玉米籽粒表面及其制品中。中美兩國都對其進行了強制限量:食品級和飼料級的限量標準分別為20 μg/kg 和100 μg/kg[1-2]。目前對黃曲霉毒素的檢測主要是生化方法,包括薄層層析法、高效液相色譜法、微柱法、酶聯(lián)免疫吸附法等[3]。雖然檢測精度高,但檢測手段和檢測儀器復(fù)雜,檢測速度慢,價格昂貴,不能在線檢測。

        近年來,光譜成像技術(shù)作為一項新的化學計量學手段,廣泛應(yīng)用于農(nóng)產(chǎn)品及食品檢測中[4-5]。黃曲霉毒素具有紫外熒光特性和表面淺表面分布特性。高光譜技術(shù)為一種圖譜合一的新興手段,在黃曲霉毒素檢測中受到普遍關(guān)注。M.Atas 等[6]研究了市場上購買的辣椒粉黃曲霉毒素污染的高光譜成像分析技術(shù),提出基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)權(quán)值優(yōu)化的特征選擇方法,并找到對檢測起關(guān)鍵作用的特征波長,在420 nm 處留一法識別率達到85%;H.Yao[7]團隊主要集中在玉米的黃曲霉毒素污染的高光譜研究,他們通過人工種植的方法發(fā)現(xiàn)熒光強度隨著黃曲霉素含量的增加而減少,并且存在峰移現(xiàn)象,還基于此兩點發(fā)現(xiàn)申請了專利[8],然而這種設(shè)備的檢測還是手工進行,并不能做到自動檢測。王偉[9]研究組使用美國農(nóng)業(yè)部(USDA)的高光譜數(shù)據(jù)研究黃曲霉毒素的檢測問題,指出根據(jù)普通CCD 成像,黃曲霉毒素自然污染籽粒的檢出率為87.5%,他們采用Fisher 優(yōu)選了700~1 100 nm的5 個高光譜波長,對人工污染黃曲霉毒素濃度的預(yù)測正確率達到88.3%[10]。

        上述研究忽略了一個關(guān)鍵因素,黃曲霉毒素在籽粒表面分布并不均勻,這是由于黃曲霉毒素是黃曲霉菌的代謝物,呈顆粒狀不均勻分布。通過光學探測器得到的像元往往是特定分辨率下各種物質(zhì)平均像元,得到的光譜是各種物質(zhì)(包括黃曲霉毒素)的混合光譜。單個像素內(nèi)黃曲霉毒素豐度是定量計算整個籽粒含量的重要基礎(chǔ),有必要對單像素內(nèi)的黃曲霉毒素豐度進行解析。本研究擬借用遙感領(lǐng)域像元分解的方法,探討花生籽粒表面黃曲霉毒素的豐度,進而對黃曲霉毒素進行定量反演。

        1 試驗材料

        1.1 樣品制備

        試驗所用花生樣品為市場上購買4 粒紅小花生,經(jīng)青島市海潤農(nóng)大檢測中心檢測未檢出黃曲霉毒素,挑選1 g 左右表面光滑250 籽粒備用。在青島農(nóng)業(yè)大學食品學院實驗室對購買的黃曲霉毒素B1標準樣品,通過乙氰配比20,50,100,500 和1 000 μg/kg 共5 種黃曲霉毒素溶液,然后使用移液器將1 μL 的黃曲霉毒素溶液滴到花生表面,自然風干。如表1,共制備4 粒紅花生5 個濃度,每個濃度50 粒,共250 ?;ㄉ瑢@250 個籽粒以此編號為1~250,正面朝上,放置在無熒光紙板上,冷藏備用。

        表1 試驗材料濃度與編號Table 1 Concentration and number of experimental materials

        1.2 圖像采集

        圖像采集在中國科學院青島光電所光譜實驗室的暗室環(huán)境下進行。圖1(a)列出了試驗中使用的采集設(shè)備,試驗儀器為便攜式成像儀,該成像儀主要由液晶可調(diào)式濾波器(Liquid Crystal Tunable Filter,LCTF)和一臺普通CCD 相機組成,譜段范圍為400~720 nm,光譜帶寬為10 nm,使用一臺UV 365 nm 大功率LED 紫外燈 (美國陸陽LUYOR-3404 臺式紫外燈,樣品處照度7 000 流明)作為光源。高光譜圖像的分析采用ENVI4.7(ITT Visual Information Solutions,Boulder,Colo.),Matlab2012b(Math Works,USA)完成。計算機配置為:CPU 為Intel-E4600,主頻2.39 GHz,內(nèi)存為DDR3-3.25 GB。高光譜成像儀配套采集軟件可根據(jù)圖像整體亮度情況自動調(diào)整每個波長下的曝光時間從而避免過飽和和欠飽和現(xiàn)象。

        紫外燈下,將花生籽粒污染面朝上每9 個一組,每次采集9 顆花生籽粒,依此采完250 個籽粒的圖像,每次獲得的高光譜圖像數(shù)據(jù)塊大小為1 392×1 040×33。圖1(a)是基于RGB 圖像合成原理,通過33,5,16 三個波段(720,440,550 nm)合成的假彩色圖像。

        圖1 圖像采集設(shè)備圖Fig.1 Image acquisition equipment

        圖2 假彩色合成圖像Fig.2 Composited color image

        2 研究方法

        2.1 算法

        高光譜圖像像素的混合過程通常通過線性混合模型 (linear spectral random mixture model,LSRMM)[11]來描述,高光譜某個混合像元的輻射值:

        其中,ei,j為第j個純像元的光譜曲線,j=1,2,…m,m 為純像元個數(shù);其中i=1,2,…L,L 為波段數(shù);aj為第j 個像元的豐度,aj滿足非負約束和為一約束。

        根據(jù)線性混合模型,需要確定混合像元的端元波譜,N-FINDR 端元提取算法[12]是一種從已獲得的高光譜圖像自動化的獲取端元的方法。高光譜的所有像素在高維空間形成一個凸體,每個端元對應(yīng)于凸體的頂點,非端元則分布在凸體的內(nèi)部、棱或面上,該算法的迭代思想是,對經(jīng)PCA 或MNF 降維后的數(shù)據(jù),隨機選擇一組像素作為初始端元,然后將圖像中每個像素替換現(xiàn)有的端元向量中的端元計算替換后的體積,若體積增大則用新的端元向量替換原端元向量。重復(fù)遍歷所有像元,最終的端元向量即是該圖像的端元。

        著名的科學雜志《Nature》刊登了兩位科學家D.D.Lee 和H.S.Seung[13]對數(shù)學中非負矩陣研究的突出成果。該文提出了一種新的矩陣分解思想——非負矩陣分解(Non-negative Matrix Factorization,NMF)算法,即NMF 是在矩陣中所有元素均為非負數(shù)約束條件之下的矩陣分解方法。

        豐度圖像的灰度分布直方圖可能提供一些有價值的信息。可用于黃曲霉素含量的預(yù)測中,對一副灰度圖像的灰度量化特征表示為:

        式中:n=1,2,…,N 表示灰度值量化為灰度階的數(shù)量。I(x,y)——坐標(x,y)處灰度值。將這些直方圖量化特征作為支持向量機回歸的輸入特征。

        支持向量機(Support Vector Machine,SVM)是Corinna Cortes 和Vapnik 等[14]首先提出的,它在解決小樣本、非線性及高維模式識別中表現(xiàn)出許多特有的優(yōu)勢,并能夠推廣應(yīng)用到函數(shù)擬合等其它機器學習問題中。支持向量機算法可描述為:

        式中:αk——拉格朗日乘子;K(x,xk)——核函數(shù),本研究選自RBF 核函數(shù);b--偏置系數(shù)。

        2.2 研究框架

        黃曲霉毒素在花生表面分布呈微小顆粒狀不均勻分布,通過光學探測器得到的像元是一定區(qū)域(一個像素)內(nèi)各種物質(zhì)平均像元。將單個像元進行亞像元分解,分解為花生種皮光譜、黃曲霉素光譜和背景光譜各個組分的豐度,通過黃曲霉素組分豐度圖像可更為精確地反演黃曲霉含量。圖3是本文提出的方法流程圖。

        圖3 方法流程圖Fig.3 Method flow chart

        對通過高光譜儀獲得的高光譜圖像,首先進行圖像預(yù)處理和ROI 提取,將單個花生籽粒高光譜圖像塊提取出來,然后通過N-FINDR 算法,提取花生種皮、黃曲霉毒素及背景的端元光譜,反復(fù)比較提取較為純凈的3 個端元光譜,并觀察3 個端元光譜波形,確定黃曲霉素的光譜,然后使用非負矩陣分解(NMF)方法對籽粒高光譜圖像進行非負矩陣分解,得到黃曲霉毒素豐度圖像,對豐度圖像求取直方圖量化特征,使用該特征進行回歸預(yù)測輸入?yún)?shù),將該豐度與實際數(shù)據(jù)進行支持向量機回歸,為比較預(yù)測效果,與偏最小二乘回歸預(yù)測效果進行比較,進行精度評價和檢測方法的有效性。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 圖像預(yù)處理

        背景區(qū)域?qū)D像分析造成干擾,需要去除,采用RGB 圖像分量運算(R-1.2G)去除背景,并將背景置零;根據(jù)籽粒區(qū)域平均亮度一致原則將籽粒區(qū)域進行光照補償,然后標記籽粒區(qū)域,將籽粒區(qū)域定義為感興趣區(qū)域(ROI),根據(jù)籽粒左上角坐標與籽粒區(qū)域長寬,在33 個波段上將籽粒提取出來,順序存儲,將單籽粒高光譜數(shù)據(jù)存為.mat 文件,對應(yīng)的偽彩色圖像存為.jpg 文件,共得到250個單個籽粒(ROI)高光譜圖像塊,預(yù)處理過程通過Matlab 編程自動實現(xiàn)。圖4(a)是分割得到其中一個單籽粒高光譜圖像塊ROI 對應(yīng)的假彩色圖像,可見圖像上黃曲霉素區(qū)域的熒光現(xiàn)象比較明顯。

        3.2 N-FINDR 純端元提取

        端元提取就是在高光譜圖像上找到純像元(端元),圖4(b,c)是基于N-FINDR 對圖4(a)提取的端元所在位置圖和端元曲線。圖4(b)綠色圈點表示尋找到的端元的位置。圖4(c)從端元曲線來看端元1 在400~420 波段內(nèi)有一明顯的波峰,這于黃曲霉素的熒光曲線相符合,可見端元1 即為黃曲霉素端元,端元3 為純黑色很顯然是背景的端元,因為預(yù)處理是已將背景置為0,那么端元2 則為花生種皮光譜端元。可以看出,基本將3 種端元尋找出來。根據(jù)經(jīng)驗,多個籽粒反復(fù)比較得到黃曲霉毒素、花生種皮和背景的純像元光譜。

        圖4 端元及其光譜曲線Fig.4 Endmember and spectrum

        由于高光譜數(shù)據(jù)量巨大,在端元提取之前首先要進行最大噪聲分離(MNF)[15]以減少數(shù)據(jù)量,這樣可以用前幾個波段來代替整個高光譜影像,可以有效加快算法的執(zhí)行效率。圖5是最大噪聲分離后的信噪比分布,可以看出,前面MNF 波段信噪比高,5 個以后信噪比已經(jīng)低于1,前2 個MNF 分量的分布相當集中(圖5b)。

        圖5 MNF 前兩個端元分布與等高線圖Fig.5 First two end-members distribution and contour map

        3.3 NMF 豐度提取

        使用非負矩陣分解(NMF)進行亞像元分解,就是得到各個端元的豐度,圖6是各個端元的豐度,可以明顯看出,圖6(a)是黃曲霉毒素的豐度,圖6(b)是花生種皮的豐度,圖6(c)是背景的豐度,通過黃曲霉素豐度圖(圖6a)像素值求和即可計算出每個籽粒黃曲霉素的豐度和。

        圖6 各端元的豐度圖Fig.6 Endmember abundance image

        對黃曲霉毒素豐度圖像進行求和。圖7(a)是基于MNF 進行豐度分解后得到的250 個籽粒黃曲霉毒素的豐度和分布,單從圖像上看并無規(guī)律??梢妰H通過豐度求和較難準確預(yù)測黃曲霉毒素含量。豐度概率分布可能蘊含著大量的信息,對豐度圖像進行直方圖量化是體現(xiàn)豐度概率分布的有效手段。

        3.4 直方圖量化

        直方圖量化就是將豐度圖像(0~1)轉(zhuǎn)化為灰度圖像(0~255),然后將灰度值直方圖分成不同的區(qū)間(如0~50,50~100,100~150 等),統(tǒng)計灰度值落入每個區(qū)間的像素個數(shù)。圖7(b)是對圖6(a)黃曲霉毒素豐度圖的直方圖量化為12 個區(qū)間得到的直方圖量化結(jié)果,通過量化可以發(fā)現(xiàn),灰度主要集中在低灰度區(qū)域,這與整副圖像偏黑有關(guān)。各個區(qū)域直方圖分布代表了不同豐度黃曲霉毒素的分布,這些分布信息與黃曲霉毒素含量直接相關(guān),可將該量化特征(12 個)作為回歸模型的輸入特征。

        圖7 黃曲霉毒素豐度統(tǒng)計及直方圖量化Fig.7 Aflatoxin abundance and quantification histograms

        3.5 支持向量機回歸

        將直方圖量化特征作為黃曲霉毒素回歸模型的輸入?yún)?shù),進行含量預(yù)測,與黃曲霉毒素的實際含量比較得到預(yù)測誤差。圖8是比較了支持向量機回歸(SVR)與傳統(tǒng)的偏最小二乘回歸(PLS)得到的誤差圖,前200 個樣本用來訓(xùn)練,后5 個樣本用來測試,可以看出SVR 效果較PLS 效果好,且訓(xùn)練集誤差小于測試集誤差。

        表2是采用五折交叉驗證法得到的兩種模型的預(yù)測結(jié)果,可以看出SVR 訓(xùn)練集誤差只有0.89%。平均相對誤差為12.16%,由于黃曲霉素限量很低,只有20~100 μg/kg,1 μg/kg 相當于1 t 里的1 g[15],能夠達到這樣一個精度,可以在很大程度上將高黃曲霉毒素含量的籽粒鑒別出來,這是實際生產(chǎn)應(yīng)用可以接受的。

        圖8 SVR 和PLS 兩種方法預(yù)測誤差Fig.8 Predicted error of SVR and PLS methods

        表2 兩種模型的預(yù)測結(jié)果Table 2 Predicted result of the two models

        4 結(jié)論

        環(huán)境中的灰塵、背景板在一定程度上都具有熒光現(xiàn)象,在高光譜偽彩色合成圖像上表現(xiàn)為高亮黃綠熒光區(qū)域,這些因素的存在對黃曲霉素的準確預(yù)測造成了干擾,實用的技術(shù)中需要對這些因素進行預(yù)先的去除,比如加裝必要的除塵設(shè)備和配置沒有熒光現(xiàn)象的背景板,特氟龍材質(zhì)的背景板是一種很好的選擇。

        基于亞像元分解的方法被廣泛應(yīng)用遙感影像的定量解析中,本研究基于MNF 的亞像元分解,提出了一種能在食品安全檢測領(lǐng)域應(yīng)用的黃曲霉豐度檢測方法,并構(gòu)建了基于豐度圖像的直方圖量化特征進行非線性回歸,進而預(yù)測黃曲霉素精度,該方法最優(yōu)總體預(yù)測誤差以降低到12.16%。由于黃曲霉毒素含量在mg/kg 數(shù)量級,也就是百萬分之一數(shù)量級,這一精度,已能夠較為準確地識別花生是否被黃曲霉毒素污染,進而將污染籽粒剔除。相比較生化的檢測方法,雖然預(yù)測精度較低,但該方法預(yù)測速度快,可以在瞬間完成,對黃曲霉的在線快速檢測及其相關(guān)便攜式裝備的研發(fā)具有積極意義。

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