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        侵染廣東連州葫蘆的黃瓜綠斑駁花葉病毒的分子特征及致病性分析

        2020-03-30 02:02:36李正剛農(nóng)媛湯亞飛佘小漫于琳藍(lán)國(guó)兵鄧銘光何自福
        關(guān)鍵詞:葫蘆侵染抗性

        李正剛,農(nóng)媛,湯亞飛,佘小漫,于琳,藍(lán)國(guó)兵,鄧銘光,何自福

        (廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所/廣東省植物保護(hù)新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州510640)

        0 引言

        【研究意義】黃瓜綠斑駁花葉病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)隸屬于帚狀病毒科(Virgaviridae)煙草花葉病毒屬(Tobamovirus)[1],該屬病毒的特點(diǎn)是極易通過機(jī)械摩擦進(jìn)行傳播。CGMMV可以侵染黃瓜、葫蘆、甜瓜、西瓜等葫蘆科作物,造成植株生長(zhǎng)遲緩、葉片褪綠斑駁、果實(shí)變色和纖維化,導(dǎo)致嚴(yán)重?fù)p失[2-5]。CGMMV是典型的種傳病毒[6-7],是我國(guó)植物檢疫性有害生物[4]。因此,對(duì)CGMMV進(jìn)行監(jiān)測(cè)及鑒定,有利于對(duì)該病毒進(jìn)行預(yù)防,減輕該病毒造成的危害,對(duì)葫蘆科作物的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】CGMMV是正義單鏈RNA病毒,全長(zhǎng)約6 400 nt,編碼4個(gè)蛋白,分別為129 kD的復(fù)制酶、186 kD的復(fù)制相關(guān)蛋白、29 kD運(yùn)動(dòng)蛋白和17.4 kD的外殼蛋白[8]。CGMMV最早是在英格蘭發(fā)現(xiàn)的[9],隨后在全世界范圍內(nèi)陸續(xù)被報(bào)道[10-16]。CGMMV在世界范圍的傳播可以分為3個(gè)時(shí)期[17]:1935—1985年,該時(shí)期CGMMV在全球的傳播速度較慢,僅局限在歐洲、中東、南亞和東亞少數(shù)幾個(gè)國(guó)家以及中國(guó)臺(tái)灣等地區(qū)[17-20];1986—2006年,該時(shí)期CGMMV在全球傳播的速度有所加快,已傳播至歐洲大部分國(guó)家[17],在亞洲包括南亞的巴基斯坦,東亞的中國(guó)和韓國(guó),東南亞的印度尼西亞和泰國(guó),中東地區(qū)的以色列、沙特阿拉伯和敘利亞[11,17,21-27];2007—2016年,該時(shí)期CGMMV傳播速度更加迅速,傳播至更多的國(guó)家和地區(qū)[17],加拿大、美國(guó)、尼日利亞、澳大利亞這些國(guó)家也陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了CGMMV[17,28-30]。中國(guó)大陸于2005年在廣西南瓜上最早報(bào)道CGMMV,目前已經(jīng)在山東、河北、湖北、云南、廣東、遼寧等多地普遍發(fā)生[3,22,31-33],并對(duì)多地的瓜類作物造成了毀滅性的損失[2,4]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】CGMMV廣東分離物雖然已經(jīng)報(bào)道[32],但是只包含了運(yùn)動(dòng)蛋白和外殼蛋白的部分序列,不是全長(zhǎng)序列,而且沒有對(duì)其侵染性進(jìn)行分析?!緮M解決的關(guān)鍵問題】克隆侵染葫蘆的CGMMV廣東分離物基因組全長(zhǎng),構(gòu)建其全長(zhǎng)侵染性克隆,并測(cè)定其對(duì)3種重要葫蘆科植物(黃瓜、葫蘆和西瓜)的致病性,為該病毒的預(yù)防提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        試驗(yàn)于2018年9月至2019年7月在廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所完成。

        1.1 樣本來(lái)源

        2018年9月在廣東省連州市葫蘆產(chǎn)區(qū)發(fā)現(xiàn)有植株疑似感染CGMMV,采集2個(gè)有癥狀病樣以及1個(gè)無(wú)癥狀樣品后帶回實(shí)驗(yàn)室,并置于-80℃超低溫冰箱凍存。

        1.2 RNA提取

        采用TRIzol方法提取樣品總RNA,TRIzol購(gòu)自TaKaRa公司,提取好的RNA樣品凍存于-80℃超低溫冰箱備用。

        1.3 RT-PCR反應(yīng)

        反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自TaKaRa公司。CGMMV檢測(cè)引物參考CGMMV序列(GenBank登錄號(hào):KX883801)設(shè)計(jì),引物序列為F:CCACGAGTTGTTTCCTAAT GCTG/R:TTTGCTAGGCGTGATCGGATTGT,擴(kuò)增長(zhǎng)度為890 bp,退火溫度為53℃。

        1.4 CGMMV-GDLZ分離物全長(zhǎng)序列擴(kuò)增

        將CGMMV全長(zhǎng)序列分為兩段,前半段1—3 511 nt,后半段3 301—6 423 nt,分別設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增。前半段擴(kuò)增引物為F:AAGTTCATTTCATTTGGAGAG GGTTTTAATTTTTATAATTAAACAAA (下劃線序列為同源重組序列)/R:AGTTCTGCATTAATTGCTA TTTGGTAGGCACAGTGGTAG;后半段擴(kuò)增引物為F:GTGCGTGCTACCCCGACTCCAATAGGTTTGAT TGCCCGTG/R:GGTGGAGATGCCATGCCGACCC T GGGCCCCTACCCGGGGAAAGG(下劃線序列為同源重組序列)。將擴(kuò)增好的前半段和后半段序列通過同源重組的方法構(gòu)建到pCB301載體上[34]。將構(gòu)建好的pCB301-CGMMV質(zhì)粒送往上海生工生物工程股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。

        1.5 系統(tǒng)進(jìn)化分析

        將測(cè)序所得CGMMV全長(zhǎng)序列在NCBI中進(jìn)行Blast分析。利用MEGA7軟件[35]構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

        1.6 CGMMV-GDLZ侵染性克隆構(gòu)建及農(nóng)桿菌注射接種

        將約為0.5 μg的pCB301-CGMMV質(zhì)粒轉(zhuǎn)入100 μL GV3101(pSoup)農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞(上海唯地生物技術(shù)有限公司),菌落PCR驗(yàn)證。將含有pCB301-CGMMV質(zhì)粒的農(nóng)桿菌接種于含有卡那霉素(100 μg·mL-1)和利福平(25 μg·mL-1)的LB培養(yǎng)基內(nèi),28℃搖床過夜培養(yǎng),4 000 r/min離心10 min收集沉淀,棄上清,沉淀用農(nóng)桿菌懸浮緩沖液(10 mmol·L-1MES,10 mmol·L-1MgCl2,150 μmol·L-1As)重懸,利用紫外分光光度計(jì)將菌液OD600調(diào)至1.0。28℃培養(yǎng)箱靜置4 h,用注射器注射植物。

        1.7 Western blot檢測(cè)

        采集0.5 g發(fā)病及健康對(duì)照樣品于2 mL離心管中,液氮速凍,通過組織研磨機(jī)充分破碎,趁冷加入0.3 mL蛋白提取緩沖液(50 mmol·L-1Tris-HCl pH 6.8,10%甘油,2% SDS,2.5%巰基乙醇),充分振蕩混勻,沸水浴10 min,12 000 r/min離心10 min,取20 μL上清進(jìn)行Western blot檢測(cè)。Western blot一抗為CGMMV CP多克隆抗體,羊抗兔二抗購(gòu)自于Sigma Aldrich。

        2 結(jié)果

        2.1 樣品采集及檢測(cè)

        2018年9月在廣東省連州市一個(gè)葫蘆種植區(qū)調(diào)查時(shí)發(fā)現(xiàn),部分葫蘆植株葉片呈現(xiàn)明顯的褪綠、花葉、斑駁等癥狀(圖1-A),疑似感染CGMMV。采集了2株發(fā)病植株及1株無(wú)癥狀植株,RT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,2個(gè)發(fā)病樣品均可檢測(cè)到大小為900 bp左右的特異條帶(圖1-B),無(wú)癥狀CK樣品則沒有條帶,說(shuō)明2個(gè)發(fā)病樣品確實(shí)感染了CGMMV。

        圖1 疑似感染CGMMV的葫蘆植株田間發(fā)病癥狀以及RT-PCR檢測(cè)Fig.1 Symptoms of bottle gourd infected by CGMMV and RT-PCR detection of CGMMV

        2.2 CGMMV-GDLZ基因組全長(zhǎng)序列及其系統(tǒng)進(jìn)化

        為了得到CGMMV廣東連州分離物(CGMMVGDLZ)基因組的全長(zhǎng)序列,將CGMMV全長(zhǎng)分為兩段擴(kuò)增,PCR結(jié)果顯示,從毒源病樣中成功擴(kuò)增到預(yù)期大小的目的條帶(未展示數(shù)據(jù)),將膠回收的片段與pCB301載體[34]進(jìn)行重組反應(yīng),得到CGMMVGDLZ分離物基因組全長(zhǎng)序列,同時(shí)也構(gòu)建了其侵染性克隆pCB301-CGMMV。CGMMV-GDLZ分離物全長(zhǎng)為6 423 nt(GenBank登錄號(hào):MK933286),編碼4個(gè)蛋白,分別為129K復(fù)制酶(61—3 495 nt)、186K復(fù)制相關(guān)蛋白(61—5 007 nt)、運(yùn)動(dòng)蛋白MP(4 994—5 788 nt)和外殼蛋白CP(5 763—6 248 nt)。CGMMV-GDLZ分離物與CGMMV-eWT分離物(GenBank登錄號(hào):KY753928)核苷酸同源性最高,為99.97%,僅有第31位和4 143位核苷酸不同,而其編碼的所有蛋白的同源性則為100%。

        為了分析比較CGMMV-GDLZ分離物與其他分離物之間的關(guān)系,利用MEGA7軟件[35]構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹。選取不同地點(diǎn)(中國(guó)大陸、中國(guó)臺(tái)灣、日本、韓國(guó)、加拿大、以色列、西班牙、俄羅斯)、不同作物(黃瓜、葫蘆、西瓜)上的CGMMV分離物進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建。結(jié)果顯示CGMMV分離物根據(jù)地點(diǎn)分成了3個(gè)組:中國(guó)大陸、中國(guó)臺(tái)灣、韓國(guó)和日本等亞洲國(guó)家和地區(qū)的CGMMV分離物為第1組;以色列和加拿大CGMMV分離物為第2組;西班牙和俄羅斯CGMMV分離物為第3組。CGMMV-GDLZ分離物與山東黃瓜CGMMV-SD分離物(KJ754195)、河南西瓜CGMMV-hn分離物(KC851866)、浙江香瓜CGMMV-JD8分離物(KM873784)、浙江西瓜CGMMV-DY9分離物(KM873786)距離最近(圖2)。

        2.3 CGMMV-GDLZ分離物侵染性克隆接種驗(yàn)證

        為了驗(yàn)證侵染性克隆pCB301-CGMMV的侵染性,首先利用農(nóng)桿菌注射的方法接種了本生煙,結(jié)果顯示第7天時(shí),與Mock植株相比,接種的本生煙上部葉片開始出現(xiàn)明顯的泡狀凸起,隨著時(shí)間的發(fā)展,癥狀愈加明顯(圖3-A)。采集發(fā)病葉片進(jìn)行RT-PCR驗(yàn)證,結(jié)果顯示發(fā)病樣品可以檢測(cè)到CGMMV特異條帶,Mock樣品沒有檢測(cè)到(圖3-B)。進(jìn)一步利用Western blot進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果顯示發(fā)病樣品可以檢測(cè)到CGMMV CP條帶,而Mock沒有檢測(cè)到(圖3-C)。說(shuō)明侵染性克隆pCB301-CGMMV具有侵染性。

        圖2 基于CGMMV全長(zhǎng)序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree based on full-length sequence of CGMMV

        圖3 利用pCB301-CGMMV侵染性克隆接種本生煙Fig.3 Ago-infiltration into N.benthamiana with pCB301-CGMMV infectious cDNA clones

        2.4 CGMMV-GDLZ分離物的致病性

        利用含有CGMMV-GDLZ侵染性克?。╬CB301-CGMMV)的農(nóng)桿菌注射接種黃瓜、葫蘆和西瓜的子葉,15 dpi時(shí),葫蘆和西瓜上部葉片出現(xiàn)明顯的斑駁、花葉、突起,植株生長(zhǎng)遲緩,24 dpi時(shí)癥狀更明顯;而15 dpi時(shí),CGMMV-GDLZ分離物在黃瓜上的癥狀不明顯,與未接種對(duì)照植株幾乎沒有區(qū)別;將植株從控溫接種室移入網(wǎng)室中,30 dpi,黃瓜植株上部葉片開始出現(xiàn)斑駁和花葉,40 dpi時(shí),癥狀已經(jīng)非常明顯(圖4-A)。RT-PCR和Western blot結(jié)果驗(yàn)證了CGMMV的成功侵染(圖4-B、4-C)。這些結(jié)果說(shuō)明,CGMMVGDLZ分離物可以侵染黃瓜、葫蘆、西瓜等瓜類作物,顯癥時(shí)間有所差異。

        3 討論

        中國(guó)是世界上瓜類種植面積最大的國(guó)家,而CGMMV則是危害瓜類作物生產(chǎn)的主要病原菌之一,給我國(guó)的瓜類產(chǎn)業(yè)造成了巨大的損失。CGMMV屬于煙草花葉病毒屬[1],該屬病毒可以通過汁液、花粉、農(nóng)事操作以及嫁接的方式傳播,因此CGMMV在田間非常容易擴(kuò)散。CGMMV還是典型的種傳病毒[6-7],種子帶毒也是CGMMV長(zhǎng)距離傳播的主要方式。

        早在2002年和2004年,中國(guó)口岸檢疫部門就已在從日本進(jìn)口的瓜類種苗或種子中檢測(cè)到了CGMMV[36];2005年,秦碧霞等報(bào)道在廣西觀賞南瓜上檢測(cè)到了CGMMV,該南瓜品種是從歐洲、印度、日本等國(guó)引種后選育出的[22];2007年,研究人員在從日本引進(jìn)的西瓜中檢測(cè)到了CGMMV[37]。對(duì)不同國(guó)家和地區(qū)的CGMMV分離物進(jìn)行進(jìn)化樹分析,結(jié)果顯示亞洲的中國(guó)、日本、韓國(guó)被分到了一組,加拿大和以色列分到了一組,西班牙和俄羅斯等歐洲國(guó)家被分到了一組,其中中國(guó)與日本的CGMMV分離物在遺傳距離上更為接近。這些結(jié)果均表明中國(guó)大陸的CGMMV很有可能是從日本傳播擴(kuò)散而來(lái)。CGMMV-GDLZ分離物在遺傳距離上與山東、河南、浙江等地的分離物最接近,說(shuō)明廣東、山東、河南和浙江的CGMMV分離物可能來(lái)自相同的傳染源。

        圖4 CGMMV-GDLZ分離物在黃瓜、葫蘆和西瓜上的致病性Fig.4 Pathogenicity of CGMMV-GDLZ isolate on cucumber, bottle gourd, and watermelon

        接種后15 d,CGMMV-GDLZ在葫蘆以及西瓜上的癥狀已經(jīng)非常明顯,而在黃瓜上的癥狀卻不明顯;將黃瓜植株由溫度恒定的控溫室移入變溫的開放網(wǎng)室,30 dpi時(shí)黃瓜植株開始出現(xiàn)典型的斑駁和花葉,說(shuō)明CGMMV-GDLZ在不同作物上的發(fā)病時(shí)間及發(fā)病溫度有所差異,這些差異可能與不同的作物和品種有關(guān)。不同的作物和品種對(duì)同種病毒的抗性有很大的區(qū)別,包含抗性基因的作物和品種表現(xiàn)出抗病,反之則表現(xiàn)出感病;另外溫度對(duì)植物的抗性水平也起著重要的調(diào)控作用,在不同的溫度下植物表現(xiàn)出不同的抗性水平,比如包含Rychc抗性基因的馬鈴薯在不同的溫度下對(duì)馬鈴薯Y病毒(Potaoto Y virus,PVY)表現(xiàn)出不同的抗性水平,在22℃下馬鈴薯表現(xiàn)出極端抗性(extreme resistance,ER)水平,只在接種葉上有少量小的壞死斑,上部葉片沒有任何癥狀,而當(dāng)溫度升至28℃時(shí),接種葉上出現(xiàn)了明顯的壞死斑,上部葉片也開始有少量發(fā)病,另外研究人員還發(fā)現(xiàn)包含有Rychc抗性基因的馬鈴薯栽培品種在夏天比春天更容易出現(xiàn)壞死斑[38]。再如小麥品種Adl-cross在25℃以下對(duì)小麥條紋花葉病毒(Wheat streak mosaic virus,WSMV)表現(xiàn)為抗病,而在32℃時(shí)則不抗病[39]。這些結(jié)果都表明高溫可能會(huì)降低抗性基因賦予的抗性,使植物在高溫下更容易感病。黃瓜以及其他瓜類對(duì)CGMMV有沒有抗性基因、抗性基因是否受到溫度調(diào)控還需進(jìn)一步研究。

        4 結(jié)論

        侵染廣東省連州市葫蘆的CGMMV-GDLZ分離物全長(zhǎng)6 423 nt,與CGMMV-eWT分離物同源性最高,在遺傳距離上與山東、浙江和河南的CGMMV分離物最接近,很可能具有相同的傳染源。CGMMV-GDLZ分離物可以侵染黃瓜、葫蘆和西瓜等作物,但在不同作物上顯癥時(shí)間存在差異。

        致謝:感謝中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院王穎副教授惠贈(zèng)CGMMV CP多克隆抗體;感謝南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院陶小榮教授惠贈(zèng)pCB301載體。

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