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        基于16S rRNA基因分析蟲草寄主蝠蛾的系統(tǒng)進化關系

        2020-03-21 13:31:08彭樹英萬勝豪汪承巧韓蒙蒙汪雨晨耿雪俠張海軍
        關鍵詞:進化樹冬蟲夏草蟲草

        彭樹英,李 俊,萬勝豪,汪 敏,汪 玲,汪承巧,韓蒙蒙,汪雨晨,耿雪俠,張海軍①

        (淮北師范大學 生命科學學院,資源植物生物學安徽省重點實驗室,安徽 淮北235000)

        0 引言

        冬蟲夏草(Ophiocordyceps sinensis)為麥角菌科(Clavicipitaceae)冬蟲夏草菌(Ophiocordyceps sinensis(Berk.)G.H.Sung et al.(Cordyceps sinensis Berk.))寄生在蝠蛾屬(Hepialus)昆蟲幼蟲上長出的子座及幼蟲尸體所形成的蟲菌復合體[1~3]. 感染此種真菌的昆蟲幼蟲在冬天形成致密的菌核即“冬蟲”,至次年春末夏初之際蟲體頭部長出子座破土而出,即“夏草”[1-3]. 冬蟲夏草是一種極為珍貴的中藥材,具有補肺益腎[4]、止咳化痰、調節(jié)免疫力[5]、降血糖降血脂[6-7]、抗腫瘤[8]、抗氧化[9]和抗衰老[10]等多種功效. 冬蟲夏草寄主昆蟲的地理分布雖較獨特,但有其特定規(guī)律,主要分布于青海、西藏、四川、云南和甘肅五省境內海拔3 000 m以上的青藏高原高寒草甸區(qū)[11]. 冬蟲夏草菌主要寄主昆蟲為蝠蛾屬昆蟲,根據(jù)傳統(tǒng)形態(tài)學分析,中國境內記錄的蝠蛾屬昆蟲累計達到六十多種,據(jù)推測,未發(fā)現(xiàn)的種類可能會更多[12-13]. 1968年,Viette[14]以雄性生殖器抱器瓣底部明顯的突起為依據(jù),在蝙蝠蛾科下建立鉤蝠蛾屬(Thitarodes). 隨后,國外學者[15~17]將大部分蝠蛾種類歸于此屬. 由于昆蟲形態(tài)變化的可塑性及趨同進化導致傳統(tǒng)分類法不夠準確[18],而且對冬蟲夏草寄主的研究也多側重于形態(tài)特征、生物學特性分析,或蝠蛾屬昆蟲的種類和地理分布的研究[19~25],對我國不同產(chǎn)地冬蟲夏草寄主昆蟲之間的分子遺傳進化關系的研究報道也較少,這將直接影響冬蟲夏草種質資源的保護和有效利用[12].

        線粒體DNA(mtDNA)為雙鏈共價閉合環(huán)狀DNA,具有結構簡單、無組織特異性、嚴格遵守母系遺傳、不易發(fā)生重組、進化速率快等特點[11]. mtDNA是研究動物遺傳多樣性和分子進化的有效標記,已廣泛用于昆蟲分類和分子系統(tǒng)學的研究. 一些學者嘗試將形態(tài)分類方法和分子生物學方法結合,以彌補傳統(tǒng)方法的不足. 陳永久等[26]曾利用線粒體細胞色素b 基因(Cytochrome b,Cyt b)序列首次分析5 種冬蟲夏草寄主蝠蛾的分子進化關系. 程舟等[12]通過對冬蟲夏草寄主蝠蛾的線粒體Cyt b基因片段的序列分析,構建分子系統(tǒng)樹,分析我國冬蟲夏草寄主蝠蛾種屬的系統(tǒng)進化關系和地域分布格局. 鄒志文等[13,18]以蝠蛾雄性生殖器抱器瓣結構特征為依據(jù),修訂現(xiàn)行中國蝠蛾屬昆蟲分類系統(tǒng),將中國蝠蛾屬的62個種分別歸入擬蝠蛾屬(Parahepialus)、蝠蛾屬(Hepialus)、鉤蝠蛾屬(Thitarodes)及無鉤蝠蛾屬(Ahamus)等4個屬中,同時利用26 種原蝠蛾屬種類Cyt b基因片段構建系統(tǒng)進化樹,證明將蝠蛾雄性抱器瓣特征作為分屬依據(jù)是合理可信的. 陳抒云等[27]對冬蟲夏草和其它蟲草等物種的寄主昆蟲分別通過COⅠ基因和Cyt b 基因進行條形碼分析,表明COⅠ序列更適用于蟲草寄主昆蟲的DNA 條形碼研究. 近幾年,一些學者為深入研究蟲草寄主蝠蛾的分子進化及其分類,已相繼測定多條蟲草寄主蝠蛾mtDNA全基因組序列[11,18,28~31].

        作為分子標記,研究動物進化的mtDNA應用最多的是Cyt b,細胞色素氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ),NADH脫氫酶亞基(ND4),12S rRNA基因,A+T富集區(qū),腺苷三磷酸酶(ATP6或ATP8)等[32]. 16S rRNA基因亦是線粒體基因組中研究較多的基因,既含有保守序列,又含有與進化距離相適應的可變序列,被稱為進化分子鐘[32]. 16S rRNA基因用于評價生物的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)生關系的報道很多[33~38],但在冬蟲夏草寄主蝠蛾方面的研究尚未見報道. 本研究運用線粒體16S rRNA基因序列對不同蟲草寄主蝠蛾的進化關系進行分析,以期為進一步的遺傳系統(tǒng)進化分析、種質鑒定和資源保護奠定理論依據(jù).

        1 材料和方法

        1.1 基因序列來源

        目前已登錄至GenBank的蝠蛾科線粒體基因組全序列共有11條記錄,其中7條為蟲草寄主蝠蛾(其中6種蝠蛾基因序列有兩個序列號),亞香棒蟲草寄主蝠蛾1條,其他蝠蛾3條(其中2種蝠蛾基因序列有兩個序列號),從GenBank中獲取并下載蝠蛾科、其他科蛾類及果蠅(外群)線粒體16S rRNA和COⅠ基因序列(表1).

        表1 本研究序列來源及信息

        表1(續(xù))

        1.2 數(shù)據(jù)處理和系統(tǒng)進化分析

        將從NCBI 中獲取的序列保存為Fasta 格式,用ClustalX 2.1 軟件進行序列對比. 然后將比對序列用MEGA 7.0軟件統(tǒng)計不同蝠蛾科16S rRNA基因序列間的簡約位點、可變位點、保守位點以及種間遺傳間距,并構建系統(tǒng)進化樹. 用DAMBE軟件分析基因序列的堿基組成,并分析AT或GC偏斜性,計算公式為AT-skew=[A-T]/[A+T]和GC-skew=[G-C]/[G+C][39]. 本研究基于冬蟲夏草、亞香棒蟲草的寄主昆蟲(蝠蛾類)及其他蛾類的16S rRNA基因用NJ法構建系統(tǒng)進化樹. 為評估16S rRNA基因作為分類依據(jù)分子標記的可靠性,同時用相同物種線粒體基因組序列的16S rRNA 聯(lián)合COⅠ基因構建ML 系統(tǒng)進化樹. 將系統(tǒng)進化樹中bootstrap自檢值設置為1 000.

        2 結果

        2.1 序列堿基組成分析

        將16S rRNA 基因序列進行對比排列后,長度為1 411 bp,其中保守位點1 054個,簡約位點143個,可變位點310個. 通過計算可知,A、C、G、T堿基的平均含量分別為44.1%、5.3%、9.6%、40.0%. A+T的平均含量為85.0%,明顯高于G+C 含量(15%). 由表2 可知,AT 和GC 的偏斜度均為正值且小于1,最小ATSkew值為0.005(T.sylvina),最大AT-Skew值為0.045(A.yunnanensis),最小GC-Skew值為0.26(T.sp.),最大GC-Skew值為0.326(H.xiaojinensis),說明11種蝠蛾堿基組成對AT顯著偏移.

        表2 11種蝠蛾的16S rRNA基因堿基組成

        2.2 蝠蛾科11種蝠蛾的種間遺傳距離

        由表3可知,在11種蝠蛾中,種間遺傳距離范圍在0.005~0.117之間,人支蝠蛾(T.renzhiensis)與阿爾泰蝠蛾(T.sp.)和貢嘎蝠蛾(T.gonggaensis)的種間遺傳距離為最小(0.005),T.sylvina與蒲氏鉤蝠蛾(T.pui)間的遺傳距離是最大(0.117). 蟲草寄主蝠蛾間的遺傳距離為0.005~0.51.T.sylvina與其他蝠蛾的遺傳距離范圍在0.099~0.117,相比其他蝠蛾間的遺傳距離明顯偏大.

        表3 11種蝠蛾16S rRNA基因的遺傳距離

        2.3 系統(tǒng)進化分析

        基于16S rRNA基因和COⅠ基因聯(lián)合16S rRNA基因構建的系統(tǒng)進化樹均明顯分為兩個大分支. 在NJ樹(如圖1)中第Ⅰ支由蝠蛾科昆蟲包括蟲草寄主蝠蛾及其他蝠蛾構成. 在蟲草寄主蝠蛾中,人支蝠蛾(T.renzhiensis)與阿爾泰蝠蛾(T.sp.)聚為一支,與貢嘎蝠蛾(T.gonggaensis)及小金蝠蛾(H.xiaojinensis)聚成一簇,與色季拉山蝠蛾(T.sejilaensis)與蒲氏鉤蝠蛾(T.pui)聚成的一支構成姊妹群. 云南蝠蛾(A.yunnanensis)位于此支系的基部(自展值100%). 7種蟲草寄主蝠蛾構成一個獨立的大支系(自展值為100%),表明屬間親緣關系較近. 如蝠蛾屬的兩種蝠蛾(Endoclita signifer和Endoclita minanus)單獨聚類在一起,與湖南棒蝠蛾(N.hunanensis)和Triodia sylvina位于蟲草寄主蝠蛾類群的基部. 而在ML樹中(如圖2),蟲草寄主蝠蛾聚類與NJ樹中一致,但非蟲草寄主蝠蛾中N.hunanensis與T.sylvina單獨形成一個支系,E.signifer和E.minanus聚類形成另一個單獨支系. 兩種樹中第Ⅱ大支均由蠶蛾科、織蛾科、菜蛾科、卷蛾科、舉肢蛾科和麥蛾科蛾類構成,NJ 樹中蠶蛾科的家蠶Bombyx mori與Bombyx huttoni聚類形成一支,然后與菜蛾(Plutella xylostella)和卷蛾(Spilonota lechriaspis)形成一支. 舉肢蛾科、織蛾科和麥蛾科聚類形成另一支.ML樹中的第Ⅱ大支稍有不同,蠶蛾科單獨聚類成一支,菜蛾(Plutella xylostella)和卷蛾(Spilonota lechriaspis)也聚類成一支,其余科的蛾類均單獨形成一支(如圖1和圖2).

        圖1 基于線粒體16S rRNA基因構建的NJ樹

        圖2 基于16S+COⅠ基因構建的ML樹

        3 討論

        16S rRNA基因之所以成為常用的線粒體分子標記,主要原因有如下幾點:一是該基因存在于所有昆蟲的體內;二是16S rRNA 基因的保守性和特異性比較高[37];三是該基因序列較長,約含有50 個功能域[37]. COⅠ基因在線粒體DNA中分布普遍,具有多態(tài)性較高、基因進化速率適中、適于通用引物擴增等特點,是昆蟲分子系統(tǒng)學研究中較為理想的分子標記,該基因近年來在昆蟲的群體遺傳結構和系統(tǒng)進化方面有較多的研究[40]. 因此,在本研究中同時用蟲草寄主蝠蛾16S rRNA基因聯(lián)合COⅠ全基因構建系統(tǒng)進化樹,以驗證16S rRNA構建系統(tǒng)進化樹的可靠性和有效性.

        通過對蝠蛾科蝠蛾線粒體16S rRNA 基因序列進行分析,結果表明:序列中A+T 的平均含量為85.0%,G+C的平均含量為15.0%,堿基組成對A+T表現(xiàn)為顯著的偏移. 種間的最小遺傳距離為0.005(T.renzhiensis與T.sp.,T.renzhiensis與T.gonggaensis),說明三者的親緣關系較其他蛾類更近. 將蟲草寄主蝠蛾、其他蝠蛾及其他科蛾類的16S rRNA 基因全序列約1 400 bp個堿基作為系統(tǒng)進化樹的分析位點. NJ系統(tǒng)樹明顯分為2大支(圖1所示):第Ⅰ支由蝠蛾科昆蟲包括蟲草寄主蝠蛾及其他蝠蛾,7種蟲草寄主蝠蛾最先聚為一支,其中人支蝠蛾(T.renzhiensis)、阿爾泰蝠蛾(T.sp.)與貢嘎蝠蛾(T.gonggaensis)同屬鉤蝠蛾屬聚為一簇(種間遺傳距離最?。?,小金蝠蛾(H.xiaojinensis)與3種鉤蝠蛾屬蝠蛾形成一個支系,說明小金蝠蛾(H.xiaojinensis)應為鉤蝠蛾屬,這一結果印證并支持Kang[11]等的研究結論. 這一支系與色季拉山蝠蛾(T.sejilaensis)和蒲氏鉤蝠蛾(T.pui)形成的聚類簇互為姊妹群,而云南蝠蛾(A.yunnanensis)屬無鉤蝠蛾屬,獨立成一支. 以上結果與相關研究報道[11,18,29]所得結論一致. 同時發(fā)現(xiàn),蟲草寄主蝠蛾分布地域較近的也更趨于歸為一類,如蒲氏鉤蝠蛾(T.pui)和貢嘎蝠蛾(T.gonggaensis)均分布于西藏林芝地區(qū). 湖南棒蝠蛾(N.hunanensis)是亞香棒蟲草的寄主昆蟲,并不是冬蟲夏草的寄主昆蟲,但兩種蟲草形態(tài)卻極為相似,說明兩種蟲草寄主蝠蛾可能具有較近的親緣關系. 進化樹分析結果亦表明,在非蟲草寄主蝠蛾中湖南棒蝠蛾(N.hunanensis)的確是與所有冬蟲夏草寄主蝠蛾關系較近的一支,而其他蝠蛾與蟲草寄主蝠蛾關系明顯稍遠一些. 本研究分析蟲草寄主蝠蛾間的進化關系而得出的結論與Zou等[18]和Kang等[11]的觀點基本一致. 本研究同時也用來源于相同物種線粒體基因組的COⅠ基因聯(lián)合16S rRNA構建ML進化樹(圖2所示),與單獨用16S rRNA基因構建的進化樹結果相符,在一定程度上支持鄒志文等[13]提出形態(tài)學分類的觀點,即將蝠蛾屬以雄性生殖器抱器瓣結構特征為依據(jù)分為4個屬的合理性. 這也說明16S rRNA基因可以進行科屬級分類,作為系統(tǒng)進化分析和分類的標記基因是有效且可信的.

        本研究中樣本數(shù)有所欠缺,分布區(qū)域不均,因此今后研究過程中為更全面具體地進行系統(tǒng)分類,還需要增加種群數(shù)量并結合其他分析技術手段,從而為蟲草寄主昆蟲的系統(tǒng)進化研究提供更全面的科學依據(jù),同時為藥用蟲草資源的保護和利用奠定理論依據(jù).

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