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        干血斑耳聾基因檢測(cè)在茂名地區(qū)新生兒遺傳性耳聾診斷中的應(yīng)用

        2020-02-20 18:29:40李富寧學(xué)玲陳海玲
        海南醫(yī)學(xué) 2020年3期
        關(guān)鍵詞:血斑遺傳性耳聾

        李富,寧學(xué)玲,陳海玲

        1.茂名市婦幼保健院新篩中心,廣東 茂名 525000;

        2.湛江市中心人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東 湛江 524037

        遺傳性耳聾是臨床常見的先天性耳聾,與遺傳性耳聾相關(guān)的基因突變位點(diǎn)較多,臨床常用酶切法和直接測(cè)序法較難同時(shí)檢測(cè)多個(gè)基因突變位點(diǎn)?;蛐酒夹g(shù)高效、快速、方便,是高通量基因檢測(cè)方法,適合大規(guī)模人群進(jìn)行遺傳性耳聾基因篩查[1]。我國(guó)漢族人群耳聾患者最常見的基因突變是縫隙連接蛋白β2基因(GJB2)、離子轉(zhuǎn)運(yùn)體26A4蛋白基因(SLC26A4)、GJB3、線粒體mtDNA 12s rRNA等[2],但是不同地區(qū)耳聾基因突變具有顯著差異性。為了解茂名地區(qū)耳聾相關(guān)基因突變特點(diǎn),本研究采用干血斑基因檢測(cè)技術(shù)對(duì)170例遺傳性耳聾患者進(jìn)行檢測(cè),現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下:

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選取2018年5月至2019年3月茂名地區(qū)醫(yī)院優(yōu)生優(yōu)育遺傳醫(yī)學(xué)中心門診篩查的5 542例漢族兒童為研究對(duì)象,其中210例復(fù)查,共170例遺傳性耳聾患兒納入研究,排除伴智力障礙、顱腦占位性病變、綜合征聾、外耳與中耳畸形患兒。所有患兒家長(zhǎng)均簽署知情同意書。170例遺傳性耳聾患兒中男性104例,女性66例;年齡2~8歲,平均(4.56±2.05)歲;聽力損失程度:輕度聽力損失(26~40 dBHL)40例,中度聽力損失(41~60 dBHL)45例,重度聽力損失(61~80 dBHL)47例、極重度聽力損失(>80 dBHL)38例。另選擇篩查健康的漢族兒童60為對(duì)照組,男性37例,女性23例;年齡2~7歲,平均(4.49±2.16)歲,聽力均正常。兩組受試者年齡、性別分布比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。

        1.2 方法

        1.2.1 干血斑DNA提取 采集受試者末梢靜脈血,移液器取自然下落血滴(約50μL)于Whatman903濾紙,血斑直徑8 mm,保證濾紙兩面充分滲透,室溫下自然干燥,每單張?jiān)嚰埛湃胱苑獯鼉?nèi),室溫干燥保存待檢。采用離心柱型血液DNA提取試劑盒(潮州凱普)提取干血斑DNA,打孔器打取直徑3 mm干血斑3片,每份加200μL(緩沖液)和20μL蛋白酶K,震蕩混勻,56℃溫浴20 min,加入200μL無水乙醇混勻轉(zhuǎn)入帶硅膠離心柱,10 000 r/min離心1 min然后,利用洗液W1洗脫1次,洗液W2洗脫2次,利用TE洗脫液獲取DNA液60μL,將Taq酶分別加入到A組和B組PCR mix中配置總反應(yīng)體系,混勻,點(diǎn)動(dòng)離心,按照A組(28μL)和B組(28μL)的體系分別分裝到0.2 mL PCR管中,將臨床DNA按順序加入到A組和B組體系中。A組:2μL,B組:2μL,標(biāo)記各管,混勻,離心,各管對(duì)應(yīng)放入PCR儀中,注意各管蓋蓋緊,注意檢查擴(kuò)增程序是否正確,啟動(dòng)程序。DNA樣品-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 PCR擴(kuò)增 PCR反應(yīng)體系為25μL,含有60 ng DNA,2.5μL dNTPs(2 mmol/L),PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件:37℃預(yù)變性10 min,95℃變性9 min,96℃1 min,94℃30 s,RAMP 0.4℃/s,55℃30 s,共35個(gè)循環(huán),RAMP0.2℃/s,70℃45 s,60℃延伸6 min。PCR擴(kuò)增試劑等均購(gòu)自成都博奧生物有限公司。PCRmix放置4℃解凍;臨床樣本DNA解凍,將Taq酶分別加入到A組和B組PCRmix中配置總反應(yīng),按照A組(28μL)和B組(28μL)的體系分別分裝到0.2 mL PCR管中,將臨床DNA按順序加入到A組和B組體系中,標(biāo)記各管,混勻,離心,各管對(duì)應(yīng)放入PCR儀中,注意各管蓋蓋緊,注意檢查擴(kuò)增程序是否正確,啟動(dòng)程序。

        1.2.3 雜交、洗片、讀片 PCR產(chǎn)物(A組和B組)放PCR儀中進(jìn)行95℃變性7 min,按要求放置配件,鋪好雜交膜,加入雜交液0.8 mL,預(yù)雜交45℃2 min以上,開泵,排雜交液,關(guān)泵,加入雜交液0.8 mL,將A組和B組PCR產(chǎn)物按一定順序加入到相應(yīng)反應(yīng)槽,注意每加一個(gè)立即混勻,雜交45℃,20 min,WB1液0.8 mL清洗4次,每次沖洗間隔5~10 s。洗完WB1液后再把雜交儀溫度調(diào)節(jié)為25℃,加入0.5 mL封阻液,預(yù)封阻,當(dāng)溫度降至30℃時(shí),開泵排液,關(guān)泵,加封阻液0.5 mL,封阻5 min,開泵排液,加酶標(biāo)液0.5 mL,放置5 min,開泵排液,溶液A 0.8 mL清洗四次,清洗第二次時(shí)將溫度設(shè)定36℃,當(dāng)雜交儀溫度達(dá)到36℃時(shí)加顯色液0.5 mL,蓋好雜交儀蓋,顯色6 min,加雜交液0.8 mL,清洗三次,最后加蒸餾水清洗。最后按照凱普公司提供的標(biāo)準(zhǔn)判讀卡判讀結(jié)果。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS25.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,一般人口統(tǒng)計(jì)學(xué)資料采用統(tǒng)計(jì)學(xué)描述,年齡、性別分布分別采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)和χ2檢驗(yàn)。耳聾相關(guān)基因采用(%)表示,遺傳性耳聾患者與健康對(duì)照組耳聾基因突變率比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 耳聾基因檢測(cè)結(jié)果 經(jīng)復(fù)查210例受檢者中有188例遺傳性耳聾患兒,其中170例攜帶相關(guān)基因突變,突變率為90.43%,而健康對(duì)照組未檢測(cè)到相關(guān)基因突變,兩組基因突變率比較差異有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=170.504,P<0.01)。

        2.2 170例遺傳性耳聾患兒耳聾基因檢測(cè)結(jié)果 170例攜帶相關(guān)基因突變患兒中GJB2基因突變檢出率最高,達(dá)47.65%(81/170),以235delC突變?yōu)橹鳎蓟蛲蛔兓純旱?0.00%,其次為299delAT、176del16。SLC26A4基因突變率為37.06%(63/170),以IVS7-2A>G突變?yōu)橹鳎蓟蛲蛔兓純?2.94%,其次為2168A>G突變,占基因突變患兒的4.12%。mtDNA 12s rRNA突變率最低,為11.18%(19/170),以1555A>G突變?yōu)橹?,占基因突變患兒?.71%。本組共檢出特殊類型突變攜帶者7例,包括155.7445.1229.12201突變,見表1。

        表1 170例遺傳性耳聾患兒耳聾基因檢測(cè)結(jié)果

        3 討論

        我國(guó)1/3殘疾人口為聽力缺失,病例數(shù)達(dá)2 780萬人,每年約3萬名聽障兒童出生,其中遺傳性耳聾占50.00%,據(jù)統(tǒng)計(jì)新生兒中耳聾發(fā)病率為1‰,約50.00%與遺傳因素相關(guān)[3]。小兒遺傳性耳聾多在2歲以后發(fā)現(xiàn)語言能力障礙后確診,使患者喪失最佳醫(yī)學(xué)干預(yù)時(shí)機(jī),造成無法補(bǔ)救的聽力和語言功能損傷。因此早期發(fā)現(xiàn),早期通過耳聾基因篩查確診,可最大程度避免因聾致啞,保證患兒參與基本社會(huì)生活的能力。基因檢測(cè)要求較高的實(shí)驗(yàn)室設(shè)備和專業(yè)技術(shù)人才,在基層醫(yī)院尚未普及,大量基層單位多采取將標(biāo)本轉(zhuǎn)診至省級(jí)醫(yī)療單位或獨(dú)立的檢驗(yàn)機(jī)構(gòu)進(jìn)行檢測(cè),采血管轉(zhuǎn)運(yùn)存在低溫轉(zhuǎn)運(yùn)不便、容易破損等問題,影響檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性。干血斑將采集適量血標(biāo)本滴在濾紙片上干燥而成,僅需采集少量標(biāo)本,常溫下可穩(wěn)妥保存且便于運(yùn)輸?shù)?,適合基層醫(yī)院基因檢測(cè)血液標(biāo)本的采集和轉(zhuǎn)運(yùn),廣泛應(yīng)用于遺傳性耳聾的篩查。

        GJB2、GJB3和SLC26A4、DNA 12SrRN等是目前與遺傳性耳聾基因研究的熱點(diǎn),被多數(shù)國(guó)內(nèi)外研究證實(shí)與耳聾的發(fā)生有關(guān)。GJB2是最常見的耳聾遺傳基因,我國(guó)語前耳聾患者中GJB2突變率為26.00%~33.00%。GJB2基因突變可引起縫隙連接蛋白Cx26功能改變,導(dǎo)致鉀離子進(jìn)入內(nèi)耳淋巴液,造成Croti螺旋器鉀中毒,淋巴液循環(huán)障礙,發(fā)生聽力障礙。我國(guó)不同地區(qū)耳聾患者GJB2突變率為4.00%~30.40%[4]。本研究顯示170例攜帶相關(guān)基因突變患兒中GJB2基因突變檢出率最高,達(dá)47.65%(81/170),提示遺傳性耳聾患兒GJB2基因突變率最高,與多數(shù)研究報(bào)道一致。235delC是亞洲人群GJB2基因突變最常見的位點(diǎn),該位點(diǎn)突變導(dǎo)致隙連連接蛋Cx26截?cái)?,影響縫隙連接,導(dǎo)致感音神經(jīng)性耳聾[5]。本研究檢測(cè)235delC基因突變率最高,達(dá)40.00%,高于176del16、299delT,提示235delC突變可能導(dǎo)致茂名地區(qū)遺傳性耳聾的主要耳聾基因。徐彬等[6]檢測(cè)了安徽地區(qū)漢族遺傳性耳聾兒童GJB2基因突變特點(diǎn),發(fā)現(xiàn)235delC基因突變率最高。本研究未檢測(cè)到35delC基因突變,35delC突變?cè)谖覈?guó)西北回族和維吾爾族耳聾患兒中發(fā)生率較高[7],本研究以漢族人群為主,因此較為少見,提示GJB2基因突變位點(diǎn)存在較大地區(qū)和民族差異。

        SLC26A4是語前耳聾患者基因突變率僅次于GJB2突變基因,SLC26A4基因突變具有明顯種族差 異 性,T416P、L236P、2168A>G、IVS7-2A>G是SLC26A4基因常見突變類型,其中歐洲人SLC26A4基因突變類型以T416P和L236P為主,日本和韓國(guó)人以2168A>G為主,中國(guó)臺(tái)灣以IVS7-2A>G突變常見。IVS7-2A>G基因突變可使第8號(hào)外顯子功能障礙,影響氯離子轉(zhuǎn)運(yùn),引起大前庭導(dǎo)水管綜合征,導(dǎo)致感音神經(jīng)性聾,但是具體機(jī)制尚不清楚。中國(guó)漢人SLC26A4基因突變類型IVS7-2A>G和2168A>G檢出率最高分別達(dá)44.11%和11.60%[8]。本研究觀察茂名地區(qū)遺傳性耳聾患兒SLC26A4基因突變率37.06%(63/170),僅次于GJB2,IVS7-2A>G純合突變率最高,本組攜帶SLC26A4基因突變患兒中例出現(xiàn)大前庭導(dǎo)水管綜合征,與臨床診斷符合,提示檢測(cè)SLC26A4基因有助于遺傳性耳聾的診斷。

        線粒體DNA 12srRNA基因是與氨基糖苷類藥物性耳聾及非綜合征耳聾有關(guān)的母系遺傳基因,1555A>G、1494C>T是mtDNA 12s rRNA較為常見的突變位點(diǎn)。國(guó)內(nèi)報(bào)道1555A>G突變陽性率為1.00%~3.00%[9],本研究中1555A>G是mtDNA 12s rRNA檢出率最高的突變基因位點(diǎn),但其突變檢出率較低,僅4.71%,低于我國(guó)西北地區(qū)經(jīng)濟(jì)條件相對(duì)落后地區(qū)[10]。分析原因可能是近年來臨床對(duì)兒童用藥安全性意識(shí)提高,規(guī)范氨基糖苷類藥物的應(yīng)用,嚴(yán)格限制兒童使用氨基糖苷類藥物,避免其接觸此類耳毒性藥物大大減少了耳聾發(fā)生率。1494C>T突變檢出率0.59%,提示1494C>T不是茂名地區(qū)遺傳性耳聾的熱點(diǎn)突變。GJB3也是遺傳性耳聾相關(guān)基因,其突變可導(dǎo)致縫隙連接蛋白Cx31功能喪失,導(dǎo)致內(nèi)淋巴液鉀離子循環(huán)障礙,影響內(nèi)耳毛細(xì)胞功能而致聾。本研究未檢測(cè)到GJB3基因突變,詹悅等[11]檢測(cè)了湖北地區(qū)306例極重度耳聾患兒耳聾相關(guān)基因變異情況,也未發(fā)現(xiàn)GJB3基因突變,提示GJB3也不是茂名地區(qū)遺傳性耳聾的熱點(diǎn)突變。

        綜上所述,本研究通過茂名地區(qū)170例遺傳性耳聾患兒采用干血斑基因檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)耳聾相關(guān)基因發(fā)現(xiàn)GJB2、SLC26A4、mtDNA 12s rRNA基因突變可能是茂名地區(qū)遺傳性耳聾患兒主要致聾基因,235delC、IVS7-2A>G、1555A>G是本組遺傳性耳聾最常見的基因突變類型。由于本研究納入樣本例數(shù)較少,因此茂名地區(qū)遺傳性耳聾兒童耳聾基因突變特點(diǎn)仍需繼續(xù)擴(kuò)大樣本加以證實(shí)。

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