賀大芳,邱文英,陳奕帆,鄒 瑤,王 德
(華派生物工程集團有限公司,四川 簡陽 641402)
豬塞內(nèi)卡病毒A(Senecavirus A,SVA)易感染動物。豬是該病毒的重要傳染源,能通過多種途徑排出病毒,如唾液、糞便、水皰皮等,在康復(fù)的動物組織中也能檢測到該病毒核糖核酸[1]。SVA可引起豬出現(xiàn)水皰性變化和新生仔豬死亡,成年豬通常呈亞臨床感染,引起繁殖母豬和公豬鼻吻和冠狀帶、蹄部出現(xiàn)水皰樣病變,偶見腹瀉癥狀[2]。SVA易感動物較廣泛,不僅不同年齡豬均易感[3],研究者還在其他動物如人、蒼蠅[4]、牛和鼠等的血清中發(fā)現(xiàn)了SVA中和抗體,表明SVA能感染的動物種類可能較多。SVA能適應(yīng)不同的細胞系,可利用豬睪丸細胞(SK-RST)、豬腎細胞(PK-15)和幼倉鼠腎細胞(BHK-21)[5]、人肺癌細胞(NCI-H1299)[6]等對SVA進行分離。
SVA是小RNA病毒,是塞內(nèi)卡病毒屬(Senecavirus)的唯一成員[7]。它的基因組全長為7.2 kb,包括5'非編碼區(qū)、一個開放閱讀框及3'非編碼區(qū),其功能如同mRNA,編碼病毒聚蛋白。SVA顆粒呈典型的二十面體對稱,直徑27 nm左右,外表面點綴著VP1、VP2和VP3伸出的肽環(huán),且VP1和VP3是主要的抗原表位[8]。其中,VP1是能夠顯著誘導(dǎo)細胞發(fā)生早期和晚期凋亡,并且能夠促進凋亡蛋白Caspase3、Caspase8及Bax蛋白和mRNA水平的上調(diào)[9],且VP1核苷酸易發(fā)生變異[10],是抗原變異的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)蛋白,因此VP1是重要的抗原位點。
因此,本研究以SVAVP1基因為目的片段構(gòu)建的原核表達載體在大腸桿菌中進行了誘導(dǎo)表達,并經(jīng)過純化獲得較高純度的蛋白,為后續(xù)SVAVP1蛋白免疫原性的研究及塞內(nèi)卡病毒病抗體ELISA方法的建立奠定基礎(chǔ)。
SVAVP1基因序列[參考GenBank中收錄的SVA-001(DQ641257)的基因組序列VP1基因],大小為788 bp,由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成;pET-28a(+)載體由本實驗室(華派生物工程集團質(zhì)檢研發(fā)中心)保存;SVA高免血清由本實驗室自制。
E.coli DH5α和BL21(DE3)感受態(tài)細胞購自天根生化科技(北京)有限公司;T4連接酶、限制性內(nèi)切酶Bam HI和Xho I購自寶生物工程(大連)有限公司;2×Taq Mix、質(zhì)粒小提取試劑盒、DNA膠回收試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;HRP標記的山羊抗豬IgG抗體購自KPL公司。
1.3.1 VP1基因的擴增 參考GenBank中收錄的SVA-001(DQ641257)的基因組序列的VP1基因合成的序列為目的片段,并以此序列片段為模板設(shè)計1對引物,正向引物加入Bam HI酶切位點,F(xiàn):5'-CGCGGATCC TACCGTGAAACTCGGGCTATTACCA-3';反向引物加入Xho I酶切位點R:5'-CCGCTCGAGAAGCTTGGAA GCGCCCCCCCA-3',加下劃線部分即為引入的酶切序列,引物的合成由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成。以合成的VP1基因序列為模板進行PCR擴增,反應(yīng)體系為:2×Taq Mix 12.5μL,dNTPMix 1.0μL,上下游引物各1.0μL,模板2.0μL,ddH2O補足至25μL。PCR反應(yīng)程序為:94℃5min,(94℃30 s,53℃45 s,72℃1min)35個循環(huán),72℃10min。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進行電泳檢測。
1.3.2 重組質(zhì)粒的構(gòu)建 利用膠回收試劑盒將VP1基因擴增片段純化回收,利用Bam HI和Xho I進行雙酶切,同時用Bam HI和Xho I雙酶切pET-28a(+)載體,酶切結(jié)束電泳后切膠回收。兩種酶切產(chǎn)物按照適宜比例,利用T4連接酶在16℃過夜連接,連接產(chǎn)物經(jīng)熱擊法轉(zhuǎn)化至E.coli DH5α感受態(tài)細胞,涂布含卡那霉素的平板,37℃過夜培養(yǎng),挑取單個菌落進行菌落PCR鑒定。鑒定呈陽性的菌落經(jīng)擴大培養(yǎng)后,質(zhì)粒小提試劑盒提取質(zhì)粒,再進行Bam HI和Xho I雙酶切鑒定,酶切鑒定正確的克隆送成都擎科梓熙生物技術(shù)有限公司進行測序驗證,測序驗證正確的重組質(zhì)粒命名pET-28a(+)-VP1。
1.3.3 重組質(zhì)粒pET-28a(+)-VP1的誘導(dǎo)表達 取成功構(gòu)建的pET-28a(+)-VP1重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coli BL21(DE3)感受態(tài)細胞,涂布于含卡那霉素抗性的LB平板,37℃過夜培養(yǎng)。分別挑取3~5個單菌落于含卡那霉素抗性的液體LB培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min培養(yǎng)12~16 h,以此為種子液。種子液按照體積比1∶100轉(zhuǎn)接到含卡那霉素抗性的液體LB培養(yǎng)基中,當菌液的D600值在0.8~1.0時,加入終濃度為1 mmoL/L的IPTG,在37℃、180 r/min進行誘導(dǎo)表達,誘導(dǎo)6 h。誘導(dǎo)后菌液經(jīng)4℃、5 000 r/min離心收集菌體。菌體用PBS緩沖液重懸后冰浴超聲破碎,裂解液進行離心后分別收集上清和沉淀,對其進行SDS-PAGE凝膠電泳檢測,上樣量為15μL,考馬斯亮藍染色后分析重組VP1蛋白表達情況。
1.3.4 重組VP1蛋白的純化及復(fù)性 經(jīng)小量表達驗證成功的克隆,擴大培養(yǎng)后進行大量誘導(dǎo),收集大量誘導(dǎo)表達菌體后,用PBS緩沖液重懸,冰浴超聲破碎,離心收集包涵體沉淀。包涵體沉淀經(jīng)包涵體洗滌液洗滌后用8M尿素溶解,再4℃、12 000 r/min離心25 min。上清液移至處理后的透析袋中,依次經(jīng)6M、4M、2M、1M、0.5M、0.2M尿素透析復(fù)性。純化的每個步驟后都進行SDS-PAGE電泳,分析純化后重組蛋白的純度和表達量。
1.3.5 純化后VP1蛋白Western blot鑒定 取純化復(fù)性后的VP1蛋白,經(jīng)SDS-PAGE分離后,轉(zhuǎn)移至PVDF膜,用含50 g/L脫脂奶粉溶液的PBST常溫封閉2 h;加入SVA高免血清(1∶2 000稀釋),4℃孵育過夜;TBST洗滌3次后加入HRP標記的山羊抗小鼠IgG(1∶50 000稀釋),室溫孵育2 h;TBST洗滌3次后ECL顯影。
經(jīng)PCR法擴增出788 bp的VP1基因序列,擴增產(chǎn)物大小與預(yù)期相符(圖1),表明本研究成功克隆到SVAVP1基因。
將VP1的PCR產(chǎn)物和載體pET-28a(+)分別用限制性內(nèi)切酶Bam HI和Xho I進行雙酶切,酶切產(chǎn)物經(jīng)T4連接酶連接,熱擊轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細胞中。挑取菌落PCR驗證為陽性的單菌落(圖2),提取的重組質(zhì)粒經(jīng)雙酶切驗證(圖3)后送生物公司經(jīng)載體pET-28a(+)的T7-Terminal引物測序。測序結(jié)果表明該序列與GenBank中收錄的SVA-001(DQ641257)的基因組序列的VP1基因序列的相似性為100%,且編碼框插入正確。
利用鑒定為陽性的BL21(DE3)/pET-28a(+)-VP1原核表達菌株進行原核誘導(dǎo)表達,加入終濃度為1 mmol/L IPTG,37℃下誘導(dǎo)表達6 h。菌體經(jīng)過離心重懸,超聲破碎后進行SDS-PAGE電泳。結(jié)果(圖4):BL21(DE3)/pET-28a(+)-VP1菌成功表達出預(yù)期36 kDa大小的特異性蛋白條帶,且超聲裂解后菌液及離心后的上清液和沉淀的電泳結(jié)果表明,表達的VP1蛋白主要以包涵體形式存在。
將超聲波裂解后的菌液沉淀用包涵體洗滌液洗滌3次后,用8M尿素溶解可得到純度較高的VP1蛋白(圖5)。再依次經(jīng)6M、4M、2M、1M、0.5M、0.2M尿素進行透析復(fù)性,得到純度為80%以上、濃度為400μg/mL的VP1蛋白。
Western blot檢測結(jié)果表明,純化后的VP1蛋白可與SVA高免血清發(fā)生特異性結(jié)合,出現(xiàn)一條大小與SDS-PAGE中VP1蛋白一致的條帶(圖6),表明該條帶為VP1蛋白。
近幾十年來關(guān)于SVA大量研究發(fā)現(xiàn),SVA已發(fā)生變異,致病性逐漸增強[11]。并且VP1基因也表現(xiàn)出明顯差異,但這些變異是不是導(dǎo)致毒株致病性增強的原因還有待研究。有研究表明,誘導(dǎo)機體產(chǎn)生中和抗體的抗原具有構(gòu)象依賴性[12],因此VP1蛋白空間構(gòu)象與其功能有著重要聯(lián)系。作為SVA最重要的結(jié)構(gòu)蛋白,VP1蛋白在病毒感染和自然免疫中都發(fā)揮著重要作用[13],故而獲得有活性的高質(zhì)量的VP1蛋白對于進一步研究SVA診斷及其防治顯得尤為重要。
大腸桿菌表達系統(tǒng)能表達外源蛋白,具有方法簡單、蛋白表達量高、蛋白易純化、成本低等優(yōu)點,胰島素等生物制品都能在大腸桿菌中表達,其中以BL21(DE3)為應(yīng)用最廣泛的表達宿主。pET系列的載體采用噬菌體T7啟動子,目的基因克隆到載體上,可以實現(xiàn)目的基因的高效表達,但目標蛋白主要以包涵體形式表達[14]。包涵體是沒有生物活性的蛋白,是蛋白表達過程中肽鏈部分折疊的中間體聚合形成的,其復(fù)性效率較低,除了與復(fù)性過程性質(zhì)相關(guān)外,還與蛋白質(zhì)本身特性有關(guān)。
目前關(guān)于SVA的研究主要是流行病學、臨床癥狀和病原學等方面,其診斷技術(shù)主要集中在病原學診斷和血清學診斷,其防治技術(shù)仍處于探索階段。因此,本試驗起以pET-28a(+)為表達載體,構(gòu)建了重組質(zhì)粒pET-28a(+)-VP1并于原核表達系統(tǒng)BL21(DE3)表達了重組蛋白,以為后續(xù)VP1蛋白的功能研究、SVA診斷方法研究以及疫苗的開發(fā)奠定基礎(chǔ)。本研究結(jié)果顯示,VP1蛋白主要以包涵體的形式進行表達,與各文獻報道一致。本試驗經(jīng)洗滌,尿素溶解及復(fù)性過程得到了高純度的VP1蛋白,為后續(xù)研究奠定了基礎(chǔ)。