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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)蒼耳子的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)制的分析

        2020-02-10 13:12:04于盼盼楊忠杰郭麗娜王單單田會(huì)東程鐵峰王瑞
        安徽醫(yī)藥 2020年2期
        關(guān)鍵詞:研究

        于盼盼,楊忠杰,郭麗娜,王單單,田會(huì)東,程鐵峰,王瑞

        作者單位:1漯河市中心醫(yī)院藥學(xué)部,河南 漯河 462300;2河南大學(xué)藥學(xué)院,河南 開封 475000

        蒼耳子為菊科植物蒼耳的干燥成熟帶總苞的果實(shí),具有散風(fēng)寒、通鼻竅、祛風(fēng)濕的功效,用于風(fēng)寒頭痛、鼻鼽、鼻淵、風(fēng)疹瘙癢、濕痹拘攣[1]。蒼耳子已報(bào)道的主要化學(xué)成分有揮發(fā)油類、甾醇類、倍半萜內(nèi)酯類、水溶性苷類、酚酸及其衍生物、黃酮類、蒽醌類及其他化合物[2-6]。現(xiàn)代藥理研究表明蒼耳子有抗微生物、抗炎、鎮(zhèn)痛、抗過(guò)敏作用,另外還有研究表明其具有抗腫瘤作用、對(duì)免疫系統(tǒng)的、心血管系統(tǒng)、血液系統(tǒng)也有一定的影響[7-11]。中藥是多成分、多途徑和多靶點(diǎn)協(xié)同作用的復(fù)雜體系,因其化學(xué)成分復(fù)雜,使得中藥的深入研究困難重重,而網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)則為重要復(fù)雜成分研究提供了新的思路和方法。網(wǎng)絡(luò)藥理

        學(xué)基于“藥物-靶點(diǎn)-通路”相互作用網(wǎng)絡(luò),從整體角度、系統(tǒng)性預(yù)測(cè)藥物多成分和多靶點(diǎn)的關(guān)系,強(qiáng)調(diào)從“單靶標(biāo)”向“網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)”模式發(fā)展[12]。本文自2018年10月至2019年3月采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,對(duì)蒼耳子主要活性組分與作用機(jī)制進(jìn)行研究,以期為蒼耳子進(jìn)一步深入研究提供參考。

        1 資料與方法

        1.1 成分篩選本研究通過(guò)中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫(kù)(TCMSP)(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmspsearch.php)檢索蒼耳子的所有化學(xué)成分。含有相關(guān)的化學(xué)成分為111個(gè)。對(duì)所檢索化學(xué)成分進(jìn)行篩選,化合物口服生物利用度(OB)篩選閾值為OB≥30%,化合物類藥性(DL)篩選閾值為DL≥0.15。通過(guò)條件篩選,111個(gè)化合物分子中有14個(gè)符合條件,將其作為候選化合物。

        1.2 候選化合物“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建采用TCMSP(http://lsp.nwu.edu.cn/target.php)在線靶標(biāo)預(yù)測(cè)平臺(tái),對(duì)其候選化合物名稱進(jìn)行檢索,整理其對(duì)應(yīng)靶點(diǎn),并在Uniprot(https://www.uniprot.org)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化基因名,所有靶點(diǎn)均為人源,最終整合化學(xué)成分靶點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)。將虛擬篩選出的候選化合物和靶點(diǎn)預(yù)測(cè)得到的靶點(diǎn)基因輸入Cytoscape 3.7.0 軟件構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)。Cytoscape 3.7.0是一款可以圖形化顯示網(wǎng)絡(luò)并可進(jìn)行分析和編輯的軟件。

        1.3 對(duì)成分靶點(diǎn)進(jìn)行通路富集與成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建利用生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(kù)DAVID Bioinformatics Resources 6.8(https://david.ncifcrf.gov)對(duì)所預(yù)測(cè)的化學(xué)成分靶點(diǎn)進(jìn)行通路富集,以P<0.01 對(duì)所富集的通路進(jìn)行篩選,并通過(guò)Omicshare 3.0(http://www.omicshare.com)進(jìn)行可視化處理。利用Cytoscape 3.7.0對(duì)所富集的通路進(jìn)行成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建。分析成分、靶點(diǎn)和通路的相互作用,采用Cytoscape 中插件Network Analyzer 對(duì)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)度值進(jìn)行分析。

        2 結(jié)果

        2.1 OB和DL預(yù)測(cè)以O(shè)B≥30%和DL≥0.15作為蒼耳子活性成分的篩選條件,共篩選出14個(gè)候選化合物,其中4個(gè)化合物MOL007326[Cynarin(e)]、MOL008647(Moupinamide)、MOL011169(Peroxyergosterol)、MOL011676(carboxyatractyloside)在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中未找到相關(guān)靶點(diǎn),故共獲得蒼耳子的主要候選化合物10個(gè),候選化合物基本信息如表1所示。

        2.2 “成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖分析根據(jù)篩選所得到的10 個(gè)候選化合物與其對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape 3.7.0進(jìn)行成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建,如圖1所示。該圖包括86 個(gè)節(jié)點(diǎn)(10 個(gè)活性成分和76 個(gè)相關(guān)靶點(diǎn))和108條線,其中藍(lán)色圓形代表候選化合物,綠色方形代表相關(guān)靶點(diǎn),線表示活性成分和相關(guān)靶點(diǎn)的關(guān)系。度值(Degree)和介數(shù)值(betweenness)可反映節(jié)點(diǎn)的重要性,本圖中節(jié)點(diǎn)的大小表示度值的大小。

        表1 蒼耳子預(yù)測(cè)的10個(gè)候選化合物信息

        圖1 蒼耳子主要化合物-靶點(diǎn)(C-T)網(wǎng)絡(luò)圖

        從圖1 中可知,化合物MOL000358(β-谷甾醇)有最多的潛在靶標(biāo)(36 個(gè)),其次是MOL000471(蘆薈大黃素)和MOL000011(黃花菜木脂素A)分別有23和18個(gè)潛在靶標(biāo),靶點(diǎn)較多的活性成分可能在蒼耳子的藥理功能中發(fā)揮重要作用。相關(guān)研究表明,β-谷甾醇具有抗氧化、降低膽固醇、抗炎、免疫調(diào)節(jié)、抗腫瘤和中樞神經(jīng)系統(tǒng)作用[13];蘆薈大黃素具有心血管保護(hù)、保肝、抗腫瘤、抗菌、抗病毒、抗炎、皮膚調(diào)理、免疫調(diào)節(jié)及瀉下等藥理作用[14],黃花菜木脂素A具有抗氧化、抗炎、抗病毒、抑制平滑肌收縮、降血脂等作用[15]。在相關(guān)靶點(diǎn)中,細(xì)胞核受體共激活劑2(NCOA2),前列腺素G/H 合成酶2(PTGS2),孕酮受體(PGR)的度值分別為6、5、4,表明活性成分在靶點(diǎn)上具有協(xié)同作用。其中PTGS2 是經(jīng)典炎癥靶點(diǎn),與5個(gè)化合物相互作用,可能是蒼耳子發(fā)揮藥效的關(guān)鍵靶標(biāo)。其中19 個(gè)靶點(diǎn)至少與兩個(gè)活性成分相連,說(shuō)明了蒼耳子發(fā)揮藥效是多靶點(diǎn)協(xié)同作用的結(jié)果。

        2.3 潛在靶點(diǎn)富集分析為闡明蒼耳子中主要成分的作用機(jī)制,采用DAVID 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)所預(yù)測(cè)的76個(gè)靶點(diǎn)進(jìn)行通路富集分析共得到85 條通路,根據(jù)P<0.001 進(jìn)行篩選,篩選所得通路共37 條,涉及癌癥信號(hào)通路(Pathways in cancer)、神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路(Neuroactive ligand-receptor interaction)、磷脂酰肌醇3 激酶(PI3K)/AKT(蛋白激酶B)信號(hào)通路(PI3K-Akt signaling pathway)、乙肝(Hepatitis B)、鈣離子信號(hào)通道(Calcium signaling pathway)、甲狀腺激素信號(hào)通路(Thyroid hormone signaling pathway)、癌癥中的蛋白聚糖(Proteoglycans in cancer)、小細(xì)胞肺癌(Small cell lung cancer)等,見表2。

        表2 富集分析中通路信息(前10條通路)

        利用Omicshare 平臺(tái)對(duì)靶標(biāo)命中數(shù)量排名前20的通路進(jìn)行可視化處理,結(jié)果見圖2。通路富集中度值較大的神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路(Neuroactive ligand-receptor interaction)、乙肝(Hepatitis B)和癌癥信號(hào)通路(Pathways in cancer),可能是蒼耳子發(fā)揮其神經(jīng)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)及抗腫瘤作用的主要作用通路。另外通路富集中P值排名前二十的通路中有10個(gè)與腫瘤相關(guān),5個(gè)與神經(jīng)系統(tǒng)有關(guān),預(yù)測(cè)蒼耳子作用靶點(diǎn)的通路可能在治療腫瘤和神經(jīng)系統(tǒng)上也有優(yōu)勢(shì)。

        圖2 蒼耳子主要成分富集通路氣泡圖(前20)

        2.4 成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及拓?fù)浞治霾捎肅ytoscape 3.7.0 對(duì)所篩選得到的10 個(gè)成分、37 條通路以及其相關(guān)靶點(diǎn)進(jìn)行成分-靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。共得到節(jié)點(diǎn)99個(gè)(包括9個(gè)化合物,53個(gè)靶點(diǎn),37個(gè)通路),邊413條,見圖3。其中一個(gè)化合物、23個(gè)靶點(diǎn)未富集到通路。對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行拓?fù)鋮?shù)分析,結(jié)果顯示排名前十的靶點(diǎn)分別為PIK3CG,RELA,TP53,PRKCA,CASP3,CASP9,TNF,BCL2,JUN,BAX等靶點(diǎn)在網(wǎng)絡(luò)具有較高的度值,說(shuō)明這些靶點(diǎn)在蒼耳子發(fā)揮抗腫瘤、抗炎、免疫系統(tǒng)作用等藥效的過(guò)程中具有重要作用。

        圖3 蒼耳子“成分-靶點(diǎn)-通路”網(wǎng)絡(luò)

        度值最大的通路PIK3CG 是磷脂酰肌醇3-OH激酶(PI3K)的一個(gè)催化亞基,參與細(xì)胞增殖、凋亡、遷移、炎癥反應(yīng)[16],另外該基因的沉默可導(dǎo)致結(jié)直腸癌發(fā)生和發(fā)展[17]。RELA是NF-κB轉(zhuǎn)錄因子蛋白的一個(gè)亞型,NF-κB 通過(guò)調(diào)節(jié)Th1/Th2 細(xì)胞因子的比例,可降低IgE的表達(dá),進(jìn)而影響變應(yīng)性鼻炎的發(fā)生發(fā)展[18]。體現(xiàn)了蒼耳子治療疾病的多成分、多靶點(diǎn)、多通路的協(xié)同作用。

        3 討論

        蒼耳子現(xiàn)有研究主要為抗腫瘤、抑菌、抗炎鎮(zhèn)痛、降血糖等[19],本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)蒼耳子的活性成分、作用靶點(diǎn)、主要信號(hào)通路等方面的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行了分析。共篩選出10個(gè)候選化合物,相關(guān)靶點(diǎn)76 個(gè),相關(guān)通路共37 條。度值前三的候選化合物為β-谷甾醇、蘆薈大黃素、黃花菜木脂素A,β-谷甾醇具有抗腫瘤、抗炎、降膽固醇等活性[20];蘆薈大黃素可以明顯改善NASH 肝細(xì)胞的脂肪變性、炎癥浸潤(rùn)等病理?yè)p害[21]。度值前三的靶點(diǎn)為PIK3CG,RELA,TP53,其中PIK3CG 在心肌梗死、血栓形成及動(dòng)脈粥樣硬化等心血管疾病中起著重要作用[22],預(yù)示蒼耳子可能具有治療心血管疾病的作用。作用靶點(diǎn)參與的作用通路涉及神經(jīng)系統(tǒng)、抗炎、乙肝、免疫系統(tǒng)及抗腫瘤等通路,其中有10條與腫瘤相關(guān),5 條與神經(jīng)系統(tǒng)有關(guān)。由此可推斷蒼耳子可通過(guò)炎癥、免疫等通路起到散風(fēng)寒、通鼻竅、祛風(fēng)濕的功效。同時(shí)本研究顯示,蒼耳子還可能通過(guò)神經(jīng)系統(tǒng)、腫瘤等通路發(fā)揮神經(jīng)系統(tǒng)及抗腫瘤等作用,為蒼耳子進(jìn)一步深入探討作用機(jī)制及研究方向奠定了良好基礎(chǔ)。

        綜上所述,本研究應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對(duì)蒼耳子的化學(xué)成分、作用靶點(diǎn)和相關(guān)通路進(jìn)行了探索性研究。研究結(jié)果初步驗(yàn)證了蒼耳子的基本藥理學(xué)作用和相關(guān)機(jī)制,并為進(jìn)一步深入探討作用機(jī)制奠定了良好基礎(chǔ)。然而,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)作為一種新興的藥物研究手段,還存在一定的局限性,依托數(shù)據(jù)庫(kù)以數(shù)據(jù)研究為基礎(chǔ)對(duì)其藥效進(jìn)行研究,還需要更多藥理實(shí)驗(yàn)研究才能將得出的結(jié)論應(yīng)用于臨床。同時(shí),本研究在篩選化合物中存在局限性,可能導(dǎo)致主要成分篩選不充分,藥理作用研究不全面;中藥在炮制前后成分可能發(fā)生改變,并且藥效、毒性也會(huì)不同,藥效及機(jī)制研究不明確,尚需進(jìn)一步深入研究探討。

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