2014―2015年美國密歇根州弗林特市用水安全發(fā)生危機(jī)期間,在杰納西郡暴發(fā)了2起嗜肺軍團(tuán)菌病。在第二次暴發(fā)期間,收集了10份來自臨床的嗜肺軍團(tuán)菌分離株,及第二年收集的103份源于自來水的嗜肺軍團(tuán)菌分離株,提交給杰納西郡實驗室進(jìn)行全基因組的序列比對。記錄了來自臨床和自來水分離出的嗜肺軍團(tuán)菌株的遺傳多樣性。分離株來自1個分支(3個臨床分離株,3個來自弗林特醫(yī)院自來水的分離株,1個來自弗林特住宅的自來水分離株,及參考的巴黎菌株)具有高度的相似性(2-1062個單核苷酸多態(tài)性),所有嗜肺軍團(tuán)菌均為序列1型,血清組1型。血清組6型分離株屬于2518型序列,在弗林特醫(yī)院的水樣中廣泛分布,但與臨床分離株無相似之處。弗林特自來水中的嗜肺軍團(tuán)菌株在暴發(fā)后具有多樣性,與某些致病菌株相似。
侵襲性B族鏈球菌(GBS)仍然是全球引發(fā)嬰兒疾病和致死的主要原因。2015年1月1日至2017年12月31日,我們在中國18家醫(yī)院對3月齡內(nèi)的嬰兒進(jìn)行GBS陽性培養(yǎng)的前瞻性和回顧性實驗室監(jiān)測。GBS總發(fā)病率為0.31 (95%CI0.27-0.36)例/1000例活產(chǎn);參與研究醫(yī)院的發(fā)病率在0-0.76例/1000例活產(chǎn)。GBS導(dǎo)致的病死率為2.3%。我們估計中國每年由GBS導(dǎo)致13 604例病例和1 142例3月齡內(nèi)的嬰兒死亡。GBS分離株中最常見的是III型(占61.5%)和克隆復(fù)合體-17(占40.6%)。加強(qiáng)主動監(jiān)測和實施預(yù)防策略,如:給孕產(chǎn)婦接種GBS疫苗,需要在中國開展進(jìn)一步調(diào)查來預(yù)防GBS感染等。
印度尼西亞東雅加達(dá)區(qū)屬于家禽感染H5N1病毒的高發(fā)地區(qū)。在2011年10月至2014年9月期間,我們收集有流感樣病例的門診患者和有嚴(yán)重急性呼吸道感染(SARI)住院患者的呼吸道標(biāo)本,用來篩查季節(jié)性流感病毒和甲型禽流感(H5N1)病毒的感染。結(jié)果顯示有31% (1 875/6 008)的流感樣病例患者和15% (571/3 811)的嚴(yán)重急性呼吸道感染患者檢測出流感病毒陽性。歷時3年的監(jiān)測中均檢測到甲型流感病毒(H1N1)pdm09、甲型流感病毒(H3N2)和乙型流感病毒,流行季節(jié)從11月至次年5月。盡管28% (2 850/10 135)的病例患者報告與家禽有直接接觸,但僅發(fā)現(xiàn)1例嚴(yán)重急性呼吸道感染患者感染了甲型禽流感H5N1病毒。因此,在高危家禽接觸患者中開展有針對性的篩查(例如:最近到過活禽市場或與病禽、死禽密切接觸史者)將是對這類環(huán)境中H5N1病毒更有效的常規(guī)監(jiān)測策略。
鼻咽部肺炎球菌(肺炎鏈球菌)定植密度的增加與侵襲性肺炎球菌病有關(guān),但影響肺炎球菌密度增加的因素尚不清楚。通過調(diào)查秘魯無癥狀幼兒鼻咽部樣本的肺炎球菌密度及后續(xù)發(fā)生急性呼吸道疾病(ARI)之間的關(guān)系。在無呼吸道癥狀期,當(dāng)檢測到呼吸道病毒時,肺炎球菌的總密度(包括所有的血清型)顯著高于未檢測到病毒時(P<0.001)。通過校正分析,肺炎球菌密度的增加與隨后發(fā)生急性呼吸道疾病的風(fēng)險呈顯著相關(guān)(P<0.001),而無癥狀病毒檢測與后續(xù)發(fā)生急性呼吸道感染的風(fēng)險較低相關(guān)。研究表明,在無癥狀期鼻咽部病毒和肺炎球菌之間的相互作用可能與隨后導(dǎo)致的急性呼吸道感染疾病有關(guān)。呼吸道病毒和肺炎球菌之間的交互作用,宿主和環(huán)境間受潛在因素的影響,以及它們在急性呼吸道感染發(fā)病和肺炎球菌傳播中的作用需開展進(jìn)一步研究。
百日咳的復(fù)燃被認(rèn)為是由于疫苗免疫能力的減弱和百日咳博德特氏桿菌逃避疫苗誘導(dǎo)的免疫適應(yīng)機(jī)制有關(guān)。人體循環(huán)中的百日咳桿菌與百日咳疫苗生產(chǎn)中使用的菌株具有典型的基因差異。缺乏黏附素的百日咳菌株在使用無細(xì)胞疫苗(aP)的國家中普遍流行,這表明了對循環(huán)細(xì)菌實施強(qiáng)化aP的選擇。為證實這一假設(shè),需要對使用全細(xì)胞疫苗國家中的含黏附素的百日咳桿菌的感染率進(jìn)行系統(tǒng)研究。我們使用2000―2017年間阿根廷布宜諾斯艾利斯市的百日咳桿菌流行病學(xué)數(shù)據(jù)和分子特征。該地區(qū)免疫規(guī)劃使用無細(xì)胞疫苗接種。自2002年以來,百日咳病例的發(fā)病率約4年暴發(fā)一次;大多數(shù)病例發(fā)生在1歲以下的嬰兒。在分析的百日咳菌株中,90.6% (317/350)含有ptxP3-ptxA1-prn2-fim3-2等位基因。免疫印跡和測序技術(shù)僅檢測到2個缺乏黏附素的百日咳桿菌分離株。阿根廷百日咳桿菌黏附素缺乏株的低流行率表明,aP疫苗可能導(dǎo)致百日咳桿菌黏附素基因的表達(dá)缺失。
腸病毒D68 (EV-D68)可引起呼吸道感染和神經(jīng)癥狀。在美國俄亥俄州中部,通過比較2014年和2018年兩次EV-D68暴發(fā)和2016年散發(fā)的住院兒童臨床表現(xiàn),并使用PCR和測序技術(shù)進(jìn)行種系發(fā)生學(xué)的比較。在兩次暴發(fā)期間,受感染的兒童出現(xiàn)呼吸道癥狀并導(dǎo)致因哮喘住院人數(shù)增加。從兒科重癥監(jiān)護(hù)病房較低入院率可以看出,2018年EV-D68的呼吸道疾病的暴發(fā)似乎沒有往年的嚴(yán)重。然而,2018年受EV-D68感染的患兒出現(xiàn)嚴(yán)重神經(jīng)系統(tǒng)癥狀的發(fā)病率高于2014年。在2016年的同一時期,我們沒有發(fā)現(xiàn)EV-D68的患者增加,也沒有發(fā)現(xiàn)與哮喘相關(guān)的入院顯著增加。種系發(fā)生學(xué)分析表明,2018年分離出的EV-D68與2014年分離出的EV-D68在B分支內(nèi)的聚類不同,可能與感染不同的EV-D68亞分支有關(guān)。
在臨床上,西尼羅河病毒(WNV)可導(dǎo)致嚴(yán)重的神經(jīng)系統(tǒng)疾病。目前尚無治療西尼羅河病毒感染的方法,但抗西尼羅河病毒多克隆人抗體已經(jīng)在動物模型中初見療效。將免疫球蛋白高滴度抗WNV抗體的免疫球蛋白產(chǎn)品Omr-IgG-am與靜脈注射免疫球蛋白(IVIG)和生理鹽水進(jìn)行比較,用來評估其在北美洲開展的I/II期、隨機(jī)、雙盲、多中心研究中的安全性和有效性。在2003-2006年間,共有62名住院患者隨機(jī)接受Omr-IgG-am、標(biāo)準(zhǔn)IVIG或生理鹽水治療(3∶1∶1)。主要結(jié)局是要求藥物使用中的安全性。次要結(jié)局為該病的發(fā)病率和死亡率,采用4種標(biāo)準(zhǔn)化的認(rèn)知和功能狀態(tài)評估進(jìn)行測量。研究人群的死亡率為12.9%。在接受Omr-IgGam治療的組與接受IVIG或生理鹽水治療的組在安全性或有效性方面均無顯著差異。
2018年,西班牙通過尿抗原檢測發(fā)現(xiàn)了一例可能由血清3組菌株引起的嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的院內(nèi)感染病例。雖然不能從呼吸樣本中分離出軍團(tuán)菌,但分子學(xué)方法提示病房內(nèi)的水槽及水龍頭可能是感染來源。
我們通過分析臺灣暴發(fā)的微孢子蟲角膜結(jié)膜炎后的兩批環(huán)境樣本,結(jié)果顯示傳播路線為從停車場到洗腳池再到游泳池,并表明雨季洗腳池中堆積的泥漿可能是一個傳播微孢子蟲的危險因素。