據(jù)《細胞》雜志近日發(fā)表的一篇觀點文章，美國博德研究所與多個實驗室以及“人類腫瘤網(wǎng)絡(luò)圖譜”聯(lián)盟（HTAN）合作，從時間—空間維度全面地對單細胞分辨率上腫瘤發(fā)展過程進行闡述和總結(jié)，建立“人類腫瘤網(wǎng)絡(luò)圖譜”，從而為各類型腫瘤生成信息豐富的三維圖譜數(shù)據(jù)集。

單細胞基因組技術(shù)的快速發(fā)展，為這一人類從未能充分了解的復(fù)雜相互作用，提供了前所未有的研究機會。在此原理上，“人類腫瘤網(wǎng)絡(luò)圖譜”計劃出現(xiàn)。這是美國國家癌癥研究所（NCI）癌癥“登月計劃”的一部分，該項目力圖建立一個臨床、實驗、計算和組織框架，集成一份巨大的三維圖譜數(shù)據(jù)集，不但可以使人類對癌癥的理解更為深遠，還有可能精確有效地提高癌癥的篩查發(fā)現(xiàn)、預(yù)防和治療能力。

此次，包括美國博德研究所“人類細胞圖譜研究先鋒”阿維芙·蕾格夫，以及多家實驗機構(gòu)、聯(lián)盟的科學家們，闡述了動態(tài)的、多參數(shù)的三維腫瘤圖譜，公開了其概念、應(yīng)用、理論研究以及實驗策略，同時還將對“人類腫瘤圖譜網(wǎng)絡(luò)”的組織結(jié)構(gòu)、相關(guān)補充計劃和合作單位以及合作機會進行介紹，面向公眾全面展開“人類腫瘤圖譜網(wǎng)絡(luò)”的構(gòu)建。

這一圖譜的建立工作，涵蓋了腫瘤樣本收集、細胞空間分析工具開發(fā)、數(shù)據(jù)分析、圖譜可視化和查詢等各個方面。為確保廣泛性，需要從不同種族的人群中獲得高質(zhì)量的樣本；而多數(shù)據(jù)集成、深度學習等技術(shù)，將會持續(xù)應(yīng)用到對于圖譜網(wǎng)絡(luò)的建立之中。

研究人員表示，第一代“人類腫瘤圖譜網(wǎng)絡(luò)”可能包括交互式2D和可視化3D，并將關(guān)鍵的分子和細胞特征與臨床數(shù)據(jù)元素和患者預(yù)后聯(lián)系起來；而二代腫瘤圖譜會從多參數(shù)數(shù)據(jù)集中獲得更多信息，以更全面描述特定腫瘤的遺傳、分子、超微結(jié)構(gòu)、細胞和組織學特征等多維度信息。