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        對(duì)蝦急性肝胰腺壞死綜合征不同檢測(cè)方法結(jié)果分析

        2020-01-08 01:45:40郭書林尤穎哲陳何東王藝紅陳信忠丁亦男龔艷清楊俊萍陳長(zhǎng)樂陳炳穎
        中國(guó)動(dòng)物檢疫 2020年1期
        關(guān)鍵詞:血清型菌落抗原

        郭書林,尤穎哲,陳何東,王藝紅,陳信忠,丁亦男,龔艷清,楊俊萍,陳長(zhǎng)樂,陳炳穎

        (1.廈門海關(guān),福建廈門 361016;2.漳州市水產(chǎn)技術(shù)推廣站,福建漳州 363000)

        我國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖已有很長(zhǎng)的歷史,但人工規(guī)?;B(yǎng)殖只有幾十年時(shí)間,其間因暴發(fā)性傳染病等原因,經(jīng)歷了從起始、興旺,到衰退和恢復(fù)的發(fā)展過程。其中,副溶血性弧菌(Vibrio parahemolyticus,VP)被認(rèn)為是首要致病菌。2009 年,我國(guó)暴發(fā)一種對(duì)蝦疫病,隨后傳播到越南(2010 年)、馬來西亞(2011 年)、泰國(guó)(2012 年)。這些對(duì)蝦疫病的主要特征是急性肝胰腺壞死,發(fā)病階段為養(yǎng)殖早期的35 d 左右。2013 年,確定該病病原是某種細(xì)菌,初步確認(rèn)為一種VP,同時(shí)確定該病為急性肝胰腺壞死?。╝cute hepatopancreas necrosis disease,AHPND)[1]。研究[2-3]報(bào)道,該種菌株因攜帶了一種130 kb 大小的毒力質(zhì)粒pVA1 而具有特殊的毒性,可以引起對(duì)蝦肝胰腺上皮細(xì)胞大量脫落等病理癥狀的急性肝胰腺壞死綜合征(acute hepatopancreas necrosis syndrome,AHPNS)。這種致病性VP 給對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)造成嚴(yán)重危害,但不會(huì)引起腹瀉。

        生化鑒定和血清學(xué)分型是檢測(cè)鑒定細(xì)菌的經(jīng)典方法。PCR 技術(shù)通過對(duì)生物體的特異性RNA 或DNA 進(jìn)行識(shí)別,已被廣泛應(yīng)用于水生動(dòng)物的病原檢測(cè)、鑒定。目前,一種AHPND PCR 檢測(cè)方法所用引物為AP3,其以一種毒力基因(序列分析顯示該基因編碼的蛋白質(zhì)與細(xì)菌抗昆蟲毒素具有顯著的同源性)片段為擴(kuò)增靶標(biāo),具有較好的準(zhǔn)確性和靈敏性[4]。基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)是近年來發(fā)展起來的一種通過識(shí)別細(xì)菌表面蛋白的特異性而對(duì)細(xì)菌進(jìn)行快速檢測(cè)鑒定的方法[5]。本試驗(yàn)通過生化鑒定、血清學(xué)分型、MALDI-TOF-MS 鑒定,以及以AP3 為引物的PCR 方法,分別對(duì)從福建省南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖場(chǎng)中分離到的9 株VP 進(jìn)行檢測(cè),比較各種方法檢測(cè)結(jié)果的一致性、相關(guān)性,從而確定一種準(zhǔn)確快速檢測(cè)AHPNS 的方法。

        1 材料與方法

        1.1 樣本處理

        從福建省9 家規(guī)模化南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖場(chǎng),各采集10 只患病幼蝦活體,共90 份樣本,取肝胰腺。

        1.2 主要儀器

        MALDI Biotyper 高通量微生物鑒定系統(tǒng):德國(guó)Bruker Dahonics 公司生產(chǎn),參數(shù)設(shè)置為線性操作模式、正離子、基質(zhì)抑制偏轉(zhuǎn)模式,脈沖離子提取時(shí)間為100 ns,相對(duì)分子質(zhì)量為2~20 kD;VITEK-2 全自動(dòng)細(xì)菌鑒定系統(tǒng):法國(guó)生物梅里埃公司生產(chǎn)。

        1.3 主要試劑

        VP 診斷血清:寧波天潤(rùn)生物藥業(yè)有限公司產(chǎn)品;VP 分離純化用培養(yǎng)基:青島海博公司產(chǎn)品;PCR mix 反應(yīng)液:天根生物科技有限公司產(chǎn)品;PCR 引物:上海生工科技有限公司合成。

        1.4 方法

        1.4.1 弧菌分離 將1.1 中所述的90 份肝胰腺樣本,分別在TCBS 和弧菌顯色培養(yǎng)基平板中劃板,37 ℃培養(yǎng)24 h,挑取可疑單菌落在營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)平板上劃線培養(yǎng),編號(hào)備用。

        1.4.2 生化鑒定 取營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)平板上純化培養(yǎng)的菌落,用比濁儀將所檢測(cè)細(xì)菌濃度調(diào)整到0.5~0.63 麥?zhǔn)蠞岫?;利用VITEK-2 中的GN 卡,對(duì)VP 可疑菌株進(jìn)行檢測(cè)。

        1.4.3 MALDI-TOF-MS 鑒定 挑取營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上的單個(gè)菌落于1.5 mL 離心管中,加入1 mL生理鹽水,混勻、離心,洗滌2 次;將清洗干凈的細(xì)菌加入300 μL 無菌水,混勻后加入900 μL 無水乙醇,混勻,室溫固定3~4 min,10 000 r/min離心2 min,棄上清;向沉淀中加入50 μL 70%甲酸,混勻后再加入50 μL 乙腈,混勻;室溫放置3~4 min,10 000 r/min 高速離心2 min,吸取上清點(diǎn)靶;點(diǎn)1 μL 上清于樣品靶盤上,同時(shí)點(diǎn)1 μL標(biāo)準(zhǔn)溶液(校準(zhǔn)),待液體干后立即點(diǎn)1 μL 基質(zhì)溶劑。通過flexControl 軟件,采集數(shù)據(jù)圖譜;通過Biotyper 軟件對(duì)質(zhì)譜圖進(jìn)行分析和鑒定。得分2.300~3.000,表示可完全達(dá)到鑒定到種的水平;得分2.000~2.299,表示可靠鑒定到屬的水平,有可能鑒定到種的水平;得分1.700~1.999,表示有可能鑒定到屬的水平;得分0.000~1.699,表示沒有可信的鑒定結(jié)果。本研究均選取分值≥2.300 的結(jié)果作為待測(cè)樣本鑒定結(jié)果。

        1.4.4 血清學(xué)鑒定 按照國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)GB 4789.7—2013 的操作方法,使用抗O 和抗K 抗體,測(cè)定弧菌體(O)抗原和莢膜多糖(K)抗原血清型。

        1.4.5 PCR 檢測(cè) 取營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上的菌落,按照商品化核酸抽提試劑盒的操作方法提取 DNA,并以此作為PCR 檢測(cè)用模板。反應(yīng)體系為:10×PCR buffer(Mg2+Plus)2.5 μL,AP3 上下游引物各(10 μmol/L)1 μL,dNTP(10 mmol/L)2 μL、TaqDNA 聚合酶0.5 μL、提抽物5 μL,加水補(bǔ)至25 μL。按照以下程序進(jìn)行擴(kuò)增:94 ℃ 5 min,然后進(jìn)行32 次循環(huán)(94 ℃ 30 s,53 ℃ 30 s,72 ℃ 40 s),72 ℃5 min,4 ℃ 保溫。PCR 檢測(cè)通過引物AP3F:5'-ATGAGTAACAATATAAAACATGAAAC-3'(SEQ ID NO:1 )和 AP3R:5'-GTGGTAATAGATTGTACAGAA-3'(SEQ ID NO:2)擴(kuò)增質(zhì)粒pVA1 的基因片段,目的片段大小為336 bp。PCR 產(chǎn)物經(jīng)測(cè)序、Blast 比對(duì)后,確定分離所得的菌株是否為引起AHPND 的VP 分離株。

        2 結(jié)果

        2.1 菌株分離

        將從福建省9 家規(guī)?;瘜?duì)蝦養(yǎng)殖場(chǎng)采集的90份樣本,經(jīng)劃線分離培養(yǎng)后,從各樣本長(zhǎng)有可疑VP 菌落的TCBS 和弧菌顯色平板上,挑取≤5 個(gè)菌落進(jìn)行VITEK-2 生化鑒定。其中從6 家養(yǎng)殖場(chǎng)樣品中分離到VP 菌株數(shù)量分別是21、21、13、12、10 和4 株,總計(jì)81 株。從檢出VP 菌株數(shù)量≥13 的3 家養(yǎng)殖場(chǎng)中,分別隨機(jī)選取2 個(gè)樣本中的VP 分離株各1 株(共6 株);從其余3 家養(yǎng)殖場(chǎng),分別隨機(jī)挑取VP 分離株各1 株(共3 株)。以這9 株VP 分離株作為MALDI-TOF-MS 鑒定、血清學(xué)分型、PCR 檢測(cè)用樣本。

        2.2 MALDI-TOF-MS 鑒定

        對(duì)2.1 中所述的9 株VP 分離株進(jìn)行MALDITOF-MS 鑒 定。FT-18-1、FT-18-3、FT-18-4、XA-18-1 號(hào)分離株檢測(cè)得到的結(jié)果與VP 4a ISB 的匹配值分別為2.438、2.421、2.372、2.443;FT-18-2、XA-18-2、XA-18-3、XA-18-4、XA-18-5 號(hào)分離株檢測(cè)得到的結(jié)果與VP CCM5937 的匹配值分別為2.375、2.453、2.439、2.387、2.406;9 株分離株與MALDI-TOF-MS 中VP 數(shù)據(jù)庫(kù)匹配值均大于2.300,表明鑒定結(jié)果可信度很高。

        2.3 血清型測(cè)定

        對(duì)9 株VP 分離株血清型進(jìn)行測(cè)定,發(fā)現(xiàn)4 株為O1:KUT 血清型,3 株為O1:K68 血清型,2 株為O3:K6 血清型。其中:O1,菌體抗原為13 種血清群中編號(hào)為O1 的血清群;KUT,莢膜抗原的血清型不能分型;K68,莢膜抗原的血清型為65 種血清型中編號(hào)為K68 的血清型;O3,菌體抗原為13 種血清群中編號(hào)為O3 的血清群;K6,莢膜抗原的血清型為65 種血清型中編號(hào)為K6 的血清型。

        2.4 PCR 檢測(cè)

        對(duì)9 株分離株進(jìn)行PCR 檢測(cè),發(fā)現(xiàn)4 株為引起AHPND 的VP 分離株,其余5 株未擴(kuò)增出目的片段,判為陰性。9 株菌株的血清學(xué)、MALDITOF-MS、VITEK-2 和PCR 鑒定結(jié)果見表1。

        表1 9 株菌株的血清學(xué)、MALDI-TOF-MS、VITEK-2 和PCR 鑒定結(jié)果比較

        3 分析與討論

        本試驗(yàn)結(jié)果顯示,MALDI-TOF-MS 鑒定方法對(duì)AHPND 的PCR 檢測(cè)呈陽(yáng)性和陰性的VP 均可以進(jìn)行菌種的準(zhǔn)確鑒定,且與經(jīng)典的VITEK-2 鑒定結(jié)果吻合,說明這種新發(fā)現(xiàn)的AHPND VP 變異株不影響MALDI-TOF-MS 菌種鑒定的準(zhǔn)確性。同時(shí),MALDI-TOF-MS 技術(shù)較之于細(xì)菌生化鑒定方法更加簡(jiǎn)便快捷,在AHPND VP 菌株的分離鑒定中,可以提高檢測(cè)效率;將MALDI-TOF-MS 與PCR 檢測(cè)方法相結(jié)合,在AHPND 的病原學(xué)分析、流行病學(xué)調(diào)查以及診斷、監(jiān)測(cè)中可以取得準(zhǔn)確的測(cè)定結(jié)果。

        本研究發(fā)現(xiàn),引起AHPND 的VP 分離株血清型為O1:KUT 和O1:K68,結(jié)合Kongrueng 等[6]在其研究中測(cè)定到的AHPND VP 血清型包括O1:KUT、O1:K33 和O1:K68,可以看到所測(cè)定的AHPND VP 分離株均為O1 血清型,而K 抗原血清型至少有3 種。根據(jù)上述情況可以假設(shè),由兩種情況導(dǎo)致AHPND VP 血清型不同[6]:一種假設(shè)是,最初1 個(gè)VP 克隆變異為AHPND VP,隨后變異為多種血清型的AHPND VP;另一種假設(shè)是,致病質(zhì)粒轉(zhuǎn)化進(jìn)入了具有不同血清型的VP。因此目前分離到的AHPND VP 具有多種血清型。然而后一種假設(shè)很難解釋為什么沒有測(cè)定到除O1 血清型之外的AHPND VP。AHPND VP 是否在MALDI-TOF-MS測(cè)定中具有某些特征,還需要通過建立MALDITOF-MS 中大量AHPND VP 分離株分析結(jié)果的數(shù)據(jù)庫(kù)才能獲得。

        4 結(jié)論

        MALDI-TOF-MS 鑒定方法對(duì)這種新發(fā)現(xiàn)的AHPND VP 變異株可以進(jìn)行菌種鑒定,而且較之于細(xì)菌生化鑒定方法更加簡(jiǎn)便快捷;而將MALDITOF-MS 與PCR 方法相結(jié)合,可使AHPND 檢測(cè)結(jié)果更加準(zhǔn)確。

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