劉渝嬌,李耀輝,張冠英,范鵬飛,遲象陽,房婷,劉樹玲,陳旖,宋小紅,于長明
軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所,北京100071
尼帕病毒(Nipah virus,NiV)屬于副黏病毒科 (Paramyxoviridae)亨尼帕病毒屬(Henipavirus),為單股負(fù)鏈RNA病毒,其自然宿主為果蝠,可感染豬、馬等哺乳動(dòng)物以及人類,能夠引起嚴(yán)重的神經(jīng)系統(tǒng)性疾病和呼吸系統(tǒng)性疾病等[1]。尼帕病毒最早出現(xiàn)于1998 年9 月,該次疫情持續(xù)至1999 年4 月,最終造成馬來西亞霹靂州256 人感染,105人死亡,另有116 萬頭豬死亡,并蔓延至新加坡一屠宰場,造成11 名工人感染、1 人死亡[2-3]。1999年10 月,研究人員從一名患者腦脊髓液中分離出病毒[2]。不久之后,又從馬來西亞果蝠尿液中分離出尼帕病毒,確定了尼帕病毒的自然宿主[3]。隨后,在印度、柬埔寨、泰國等國家都曾報(bào)道過尼帕疫情,近年來,尼帕病毒感染疫情多次在孟加拉國和印度發(fā)生,已造成數(shù)百人死亡,死亡率為50%~100%[4]。
NiV 基因組共編碼6 個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白(N,P,M,F(xiàn),G,L),有黏附蛋白(G)和融合蛋白(F)2 個(gè)包膜糖蛋白。其中G 蛋白是以四聚體形式存在的Ⅱ型跨膜蛋白,胞外域包括一個(gè)莖狀區(qū)以及含受體結(jié)合區(qū)域的頭部區(qū);而F 蛋白為Ⅰ型跨膜蛋白,包含546 個(gè)氨基酸殘基,相對(duì)分子質(zhì)量約67×103,包括2 段七肽重復(fù)序列(heptad repeat,HR)和疏水性融合多肽(fusion peptide,F(xiàn)p)[5],其基因位于病毒基因組6370~8706 nt[6]。在F 蛋白合成過程中,首先合成為不具備活性的前體蛋白F0,F(xiàn)0運(yùn)輸至細(xì)胞膜表面后,通過內(nèi)吞作用回到細(xì)胞內(nèi)部[7-8],然后在酸性核內(nèi)體中被組織蛋白酶L 或B 分解[9-10],形成F1(C 端)和F2(N 端)2 個(gè)有活性的蛋白,F(xiàn)1和F2通過二硫鍵連接形成有融合功能的融合蛋白,最終在膜表面以三聚體形式存在[11]。尼帕病毒入侵宿主細(xì)胞時(shí),通過G 蛋白識(shí)別并結(jié)合宿主細(xì)胞膜表面受體Ephrin B2 和Ephrin B3[12-13],這一過程會(huì)激發(fā)F 蛋白發(fā)生顯著的構(gòu)象重排[14],從一個(gè)亞穩(wěn)定狀態(tài)重新折疊成為較低的能量狀態(tài),從而促進(jìn)Fp 暴露并插入宿主細(xì)胞膜[15]。因此,含有受體結(jié)合區(qū)的G 蛋白與含有融合肽的F 蛋白經(jīng)常被作為尼帕病毒結(jié)構(gòu)、入侵機(jī)制等研究的主要對(duì)象,以及疫苗研制和抗體篩選的重要靶標(biāo)。
鑒于F 蛋白在病毒入侵過程中扮演著極為重要的角色,表達(dá)純化獲得接近天然構(gòu)象及生物化學(xué)性質(zhì)的F 蛋白以及制備其特異性血清,對(duì)于尼帕病毒的疫苗研究、中和抗體的篩選及相關(guān)機(jī)制探討至關(guān)重要。因此,我們構(gòu)建了F 蛋白的真核表達(dá)質(zhì)粒,在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中表達(dá)獲得了可溶性F 蛋白(sF),并且驗(yàn)證了純化得到的蛋白以三聚體的形式存在,且能在體外被胰蛋白酶消化分解為F1和F2蛋白。以該蛋白免疫小鼠,獲得了針對(duì)尼帕病毒F 蛋白的特異性血清。本研究為后續(xù)開展尼帕病毒的蛋白結(jié)構(gòu)、入侵機(jī)制、疫苗及中和抗體等相關(guān)研究奠定了基礎(chǔ)。
4~6 周雌性BALB/c 小鼠購自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司;Expi293F 細(xì)胞、尼帕病毒G蛋白、抗埃博拉病毒GP 蛋白單克隆抗體由本實(shí)驗(yàn)室保存;限制性內(nèi)切酶XbaⅠ、AgeⅠ,胰蛋白酶購自NEB 公司;去內(nèi)毒素大提試劑盒購自天根生化有限公司;Expi293 細(xì)胞培養(yǎng)基及轉(zhuǎn)染試劑購自ThermoFisher 公司;Strep Trap HP 預(yù)裝柱購自GE Healthcare 公司;Western 化學(xué)發(fā)光顯色液、30k 15 mL 超濾管購自Millipore 公司;蛋白酶抑制劑購自Promega 公司;山羊抗鼠IgG 二抗(HRP)購自Abcam 公司;抗Strep(HRP)抗體購自Merck Millipore 公司;TMB 單組分顯色液、ELISA 終止液購自索萊寶有限公司。
尼帕病毒融合蛋白F 基因(GenBank:NC_002728.1)刪除跨膜區(qū)和細(xì)胞質(zhì)尾區(qū),僅保留胞外域基因,C 端加上Strep 標(biāo)簽,序列設(shè)計(jì)完成后由金斯瑞有限公司進(jìn)行密碼子優(yōu)化并合成,酶切位點(diǎn)為XbaⅠ和AgeⅠ,連接至表達(dá)載體pcDNA3.4,得到表達(dá)質(zhì)粒pcDNA-sF。將菌液送至生工生物工程有限公司測序,序列比對(duì)確認(rèn)無誤后,振蕩培養(yǎng)提質(zhì)粒pcDNA-sF,在37℃經(jīng)XbaⅠ/AgeⅠ雙酶切1 h 后核酸電泳鑒定。
轉(zhuǎn)染前1 d,接種2×106細(xì)胞到30 mL Expi293 表達(dá)培養(yǎng)基中,在5% CO2、37℃、120 r/min條件下懸浮培養(yǎng);轉(zhuǎn)染當(dāng)天,檢測細(xì)胞密度達(dá)3×106/mL 時(shí),取 80 μL ExpiFectamine293 轉(zhuǎn)染試劑加入1.5 mL MEM 培養(yǎng)基中,取30 μg 表達(dá)載體pcDNA-sF 加入1.5 mL MEM 培養(yǎng)基中,分別混勻,室溫孵育5 min 后將二者混合,室溫孵育25 min 后加入細(xì)胞培養(yǎng)瓶中。轉(zhuǎn)染12 h 后,加入150 μL 轉(zhuǎn)染增強(qiáng)劑1 和1.5 mL 轉(zhuǎn)染增強(qiáng)劑2;繼續(xù)培養(yǎng)84 h,將細(xì)胞培養(yǎng)物800 r/min 離心15 min 后再以3000 r/min 離心15 min,收集上清。
用0.45 μm 濾膜過濾收集的細(xì)胞表達(dá)上清,Strep Trap 親和柱用0.5 mol/L NaOH 再生后,用平衡緩沖液(100 mmol/L Tris-HCl,150 mmol/L NaCl,1 mmol/L EDTA·2Na)平衡后上樣,上樣結(jié)束后再平衡,然后用洗脫液(1 L 平衡液,2.5 mmol/L 脫硫生物素)洗脫,收集洗脫峰。用30k 超濾管對(duì)洗脫峰進(jìn)行超濾濃縮,同時(shí)用PBS 溶液進(jìn)行換液。
取純化后的樣品,加入含DTT 的4×SDS 上樣緩沖液,煮沸10 min,電泳結(jié)束后用金斯瑞轉(zhuǎn)膜儀電轉(zhuǎn)移蛋白到PVDF 膜上;轉(zhuǎn)膜后用5%的脫脂奶粉室溫封閉1 h,加入抗Strep(HRP)抗體(1∶5000)或免疫小鼠血清(1∶2500)室溫孵育1 h;用TBST 洗膜后加入羊抗鼠IgG 二抗(HRP)室溫孵育1 h;洗膜后滴加化學(xué)發(fā)光試劑,在化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)中曝光。
在反應(yīng)體系中加入1 μg 純化的sF 蛋白、100 ng 胰蛋白酶,用1×緩沖液補(bǔ)至總體積為10 μL,4℃孵育過夜;次日加入1 μL 10×蛋白酶抑制劑終止反應(yīng),取10 μL 消化產(chǎn)物加入4×SDS 上樣緩沖液,煮沸10 min,通過Western 印跡分析消化產(chǎn)物成分,一抗為抗Strep(HRP)抗體(1∶5000稀釋)。
HPLC 分析儀為Waters 2695-2487,凝膠色譜柱為TSKgel G3000SWXL;標(biāo)準(zhǔn)液、樣品液上樣量均為30 μL,流速1 μL/min,上樣時(shí)間30 min,柱溫25℃,流動(dòng)相為PBS 緩沖液。
將純化得到的F 蛋白與弗氏佐劑均勻混合,在每只小鼠腹股溝皮下多點(diǎn)注射20 μg(共6只),在第0、14 和28 d 分別免疫,共免疫3 次;第42 d 時(shí)取小鼠尾靜脈血,常溫靜置4 h 后8000 r/min 離心10 min,收集上清。
以1 μg/mL 的濃度包被純化的sF 蛋白,4℃孵育過夜;用PBST 洗板4 次后用ELISA 封閉液于37℃封閉1 h;再次洗板后首孔加入150 μL 稀釋比為1∶100 的小鼠血清,其余孔加入100 μL 稀釋液,1∶3 稀釋,37℃孵育1 h;洗滌后加入1∶10 000的山羊抗鼠IgG 二抗(HRP),37℃孵育1 h;洗滌后每孔加入100 μL TMB 單組分顯色液顯色6 min,每孔加入50 μL 終止液終止顯色,讀取D450nm/D630nm值。
pcDNA-sF 質(zhì)粒設(shè)計(jì)及鑒定結(jié)果見圖1。表達(dá)質(zhì)粒pcDNA-sF 經(jīng)XbaⅠ/AgeⅠ雙酶切后得到約6000 bp 的pcDNA3.4 載體條帶和約1600 bp 的目的基因條帶,說明質(zhì)粒pcDNA-sF 表達(dá)質(zhì)粒含有目的基因?;驕y序結(jié)果與原序列一致,沒有堿基缺失與突變,表明得到了序列正確并成功克隆的表達(dá)質(zhì)粒。
圖1 重組質(zhì)粒pcDNA-sF 的質(zhì)粒圖譜(A)及酶切鑒定(B)
2.2.1 純化產(chǎn)物的SDS-PAGE 鑒定 將濃縮換液后的蛋白進(jìn)行SDS-PAGE 和Western 印跡分析(圖2)。SDS-PAGE 結(jié)果顯示所純化蛋白相對(duì)分子質(zhì)量約為70×103,稍大于F 蛋白胞外區(qū)相對(duì)分子質(zhì)量的理論值61×103,推測是由于F 蛋白上含有5個(gè)N 糖基化位點(diǎn)(Asn64、Asn67、Asn99、Asn414、Asn464),使得蛋白質(zhì)遷移速率減慢;并且結(jié)果顯示所純化的蛋白純度在95%以上。用抗Strep 抗體進(jìn)行Western 印跡,結(jié)果與SDS-PAGE 結(jié)果一致,表明表達(dá)蛋白含有Strep 標(biāo)簽,說明純化的蛋白為本研究所設(shè)計(jì)的蛋白。
2.2.2 胰蛋白酶切鑒定 在sF 蛋白的體外酶解實(shí)驗(yàn)中,經(jīng)胰蛋白酶消化后的sF 蛋白經(jīng)SDSPAGE 分析分離出2 條大小不一的條帶(圖3A),與文獻(xiàn)報(bào)道的F0蛋白經(jīng)胰蛋白酶消化形成F1和F2蛋白的理論相對(duì)分子質(zhì)量(分別為51×103和19×103)基本一致。進(jìn)一步用抗Strep 抗體進(jìn)行Western 印跡,在70×103、51×103左右有明顯條帶,應(yīng)為含有Strep 標(biāo)簽的F 蛋白和位于F 蛋白C 端的F1(圖3B)。
圖2 純化產(chǎn)物的SDS-PAGE 分析(A)與Western 印跡鑒定(B)
圖3 sF 蛋白酶解產(chǎn)物的SDS-PAGE(A)與Western 印跡(B)
2.2.3 HPLC 分析 以已知相對(duì)分子質(zhì)量的尼帕病毒G 蛋白(四聚體,約240×103)、抗埃博拉病毒GP 蛋白單克隆抗體(150×103)為對(duì)照,HPLC 分析結(jié)果顯示本實(shí)驗(yàn)表達(dá)純化的F 蛋白保留時(shí)間(9.722 min)在G 蛋白(8.610 min)和單克隆抗體(11.094 min)之間,說明重組表達(dá)的F 蛋白相對(duì)分子質(zhì)量介于150×103和240×103之間。而單體F蛋白胞外區(qū)的理論相對(duì)分子質(zhì)量約61×103,提示本實(shí)驗(yàn)表達(dá)純化的F 蛋白以三聚體(190×103)形式存在,其結(jié)合方式有待于進(jìn)一步研究。
取小鼠血清,通過Western 印跡驗(yàn)證血清對(duì)F蛋白的特異性識(shí)別能力(圖5A),對(duì)照抗原為尼帕病毒G 蛋白。結(jié)果顯示在F 蛋白泳道上有一條相對(duì)分子質(zhì)量約70×103的條帶,而對(duì)照抗原處沒有條帶,表明所制備的鼠抗血清能特異性識(shí)別尼帕病毒sF 蛋白。通過ELISA 測定小鼠血清中抗F 蛋白的抗體滴度(圖5B),結(jié)果顯示小鼠血清中抗F抗體的滴度在104以上,表明重組表達(dá)的sF 有效地激發(fā)了小鼠體液免疫反應(yīng),制備的血清結(jié)合活性良好,可用于后續(xù)研究。
圖4 HPLC 分析sF 蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量
圖5 鼠抗F 蛋白特異血清與F 蛋白的特異性結(jié)合(A)及其抗體滴度檢測(B)
NiV 是一種烈性病原體,對(duì)病原的操作必須在生物安全4 級(jí)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行,目前尚無獲批的疫苗或抗體治療藥物[4]。F 蛋白在病毒入侵過程中至關(guān)重要,并且通過其構(gòu)象重排促進(jìn)病毒與宿主細(xì)胞的膜融合[11],而在免疫系統(tǒng)中體液免疫所產(chǎn)生的主要中和性抗體也依賴于F 蛋白的構(gòu)象。有研究顯示,大多數(shù)人源呼吸道合胞病毒(RSV)中和抗體都識(shí)別融合前狀態(tài)也就是未發(fā)生構(gòu)象改變的F 蛋白[16];Stewart-Jones 等的研究證明穩(wěn)定地處于融合前狀態(tài)的F 蛋白在小鼠和恒河猴體內(nèi)能更好地激發(fā)體液免疫反應(yīng)[17]。因此在關(guān)于F 蛋白的大多數(shù)研究中,都是以前體蛋白F0為主要研究對(duì)象,例如Chan 等制備了尼帕病毒可溶性的以三聚體形式存在的F0蛋白,并鑒定了其生物化學(xué)性質(zhì)、構(gòu)象及免疫原性都接近于天然F 蛋白[18];Dang等則以F0為免疫原免疫小鼠后篩選得到具備廣譜中和活性的抗F 蛋白的單克隆抗體,該單抗通過抑制F 蛋白的構(gòu)象改變而發(fā)揮中和作用[4]。制備以三聚體形式存在的F 蛋白用于免疫動(dòng)物篩選尼帕病毒中和性單抗也是本研究的目的之一。
在蛋白表達(dá)系統(tǒng)中,對(duì)比原核表達(dá)系統(tǒng),哺乳動(dòng)物細(xì)胞能夠準(zhǔn)確地完成糖基化、磷酸化及蛋白水解等多種翻譯后加工功能,因而表達(dá)產(chǎn)物在分子結(jié)構(gòu)、理化特性和生物學(xué)功能等方面更接近天然蛋白[19]。而分泌表達(dá)相較于胞質(zhì)內(nèi)表達(dá),經(jīng)歷了蛋白翻譯后加工的整個(gè)過程,具有簡化蛋白產(chǎn)物的檢測與純化、降低生物處理工藝的復(fù)雜性、提高蛋白產(chǎn)物的產(chǎn)量與質(zhì)量等優(yōu)勢[20]。
本研究在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中對(duì)NiV 融合蛋白F進(jìn)行了重組表達(dá),獲得了可溶性F 蛋白。該蛋白在自然狀態(tài)下以三聚體形式存在,與天然狀態(tài)下F 蛋白的存在方式一致,且能在體外被胰蛋白酶消化分解為F1、F2蛋白,具有與天然F 蛋白相似的生物化學(xué)性質(zhì);將sF 蛋白免疫小鼠后獲得了高效價(jià)的特異性血清。這些結(jié)果為NiV 入侵機(jī)制、疫苗設(shè)計(jì)、中和抗體篩選及作用機(jī)制等后續(xù)研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。