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        四川省稻城縣3個藏香豬豬場腹瀉樣本4種病毒的檢測

        2019-12-04 08:30:32楊丹嬌劉怡雯吳建平葉忠明何宗偉
        養(yǎng)豬 2019年6期
        關(guān)鍵詞:檢測

        張 敏,楊丹嬌,劉怡雯,吳建平,藍(lán) 嵐,葉忠明,何宗偉

        (1.甘孜藏族自治州畜牧業(yè)科學(xué)研究所,四川 甘孜藏族自治州 626000;2.稻城縣農(nóng)牧科技和供銷合作局,四川 甘孜藏族自治州 627750)

        在養(yǎng)豬業(yè)中腹瀉是一種常見、多發(fā)對養(yǎng)豬業(yè)危害較為嚴(yán)重的影響?zhàn)B豬業(yè)發(fā)展的重要原因之一,能引起不同年齡、品種的豬發(fā)病,并能使患病豬死亡的病毒性疫病之一。近些年來腹瀉所造成的豬死亡的數(shù)量逐漸上升,根據(jù)資料顯示,從2010 年起由病毒造成的腹瀉在我國多個省份都有暴發(fā),僅在南方10省就導(dǎo)致100 萬頭以上仔豬死亡[1]。其中仔豬腹瀉最為嚴(yán)重,導(dǎo)致仔豬腹瀉的原因復(fù)雜,細(xì)菌感染、飼養(yǎng)管理、霉變飼料和環(huán)境因素等都能引起仔豬腹瀉,但最為嚴(yán)重的是由病毒感染所引起的腹瀉,所帶來的損失也是最大,是影響?zhàn)B豬業(yè)發(fā)展的重要因素之一。其中豬流行性腹瀉病毒(Porcine Epidemic Diarrhea virus, PEDV)、豬δ 冠狀病毒(Porcine Delta Corona virus, PDCoV)、傳染性胃腸炎病毒(Transmissible gastroenteritis virus of swine, TGEV)和豬A 群輪狀病毒(Porcine Group A Rotavirus, GARV)是造成豬腹瀉最主要的4 種病毒。PEDV、PDCoV、TGEV 屬于冠狀病毒科、冠狀病毒屬,GARV 是呼腸孤病毒科輪狀病毒屬,而且4 種病毒的臨床癥狀以及病理變化過程都十分相似,都以嘔吐、水樣腹瀉和脫水等癥狀為主。會使飼料報酬下降,無形中使豬場的飼養(yǎng)成本增加了許多,并且還能讓豬的抵抗力下降,使其他疾病更容易發(fā)生,而且在康復(fù)以后也可能會成為僵豬,是在世界各養(yǎng)豬場廣泛流行的疾病之一,該病有一定的季節(jié)性,多發(fā)生于冬末春初的寒冷季節(jié)。

        藏香豬作為稻城縣重要的養(yǎng)殖品種之一,是當(dāng)?shù)厝嗣裰匾慕?jīng)濟(jì)來源,但是由于飼養(yǎng)管理、基礎(chǔ)設(shè)施等多種因素導(dǎo)致各種疫病和傳染病發(fā)生率極高,其中仔豬腹瀉尤為嚴(yán)重,是造成豬場經(jīng)濟(jì)損失的重要因素之一,但并沒有對該地區(qū)仔豬腹瀉情況的報道和調(diào)查,流行病學(xué)資料和豬的感染情況基本屬于空白,但當(dāng)?shù)刎i場時有因為仔豬腹瀉導(dǎo)致的死亡,給豬場帶來了較大的經(jīng)濟(jì)損失,制約了當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)和養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,所以試驗采用RT-PCR 方法對稻城縣3 個發(fā)生腹瀉的豬場采集的共50 份腹瀉樣本,進(jìn)行4 種腹瀉病毒的檢測,旨在查清3 個豬場腹瀉的病因,為豬場的有效治療和防控腹瀉病毒提供參考,減少因腹瀉帶來的經(jīng)濟(jì)損失。

        1 材料與方法

        1.1 臨床樣本

        試驗從稻城縣3 個發(fā)生腹瀉的豬場共采集了50 份樣本,其中在2018 年1 月木拉鄉(xiāng)豬場采得25份仔豬腹瀉樣本,該豬場仔豬存欄750 頭,發(fā)病60頭,無死亡;2018 年2 月在傍河鄉(xiāng)豬場采得10 份樣本,該豬場仔豬存欄200 頭,發(fā)病18 頭,無死亡;2018 年2 月在金珠鎮(zhèn)豬場采得15 份腹瀉樣本,該豬場仔豬存欄70 頭,發(fā)病26 頭,無死亡。

        1.2 主要儀器和試劑

        高速離心機(5801,Eppendorf 公司),凝膠成像儀(Universal HoodⅡ, BIO- RAD 公司),電泳儀(北京君意東方電泳設(shè)備有限公司),PCR 儀(美國Bio-Rad 公司),異丙醇溶液、75%冰乙醇、DPEC 水、RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒、DNA Marker TRIZOL 試劑、氯仿溶液。

        1.3 RNA 的提取和cDNA 的合成

        根據(jù)Trizol 說明書提取糞便樣品的總RNA。按照Super Script TM III Reverse Transcriptase(TAKARA,CHN)使用說明書將提取的病毒總RNA 反轉(zhuǎn)錄成cDNA;-20 ℃保存。

        1.4 RT-PCR 檢測4 種病毒

        PEDV、TGEV、GARV 的檢測方法參考曹恭貌等四川部分豬場PEDV、TGEV、GARV 和PKV 感染狀況調(diào)查中報道的方法[2],PDCoV 的檢測方法參考彭艷伶等在涼山地區(qū)豬腹瀉樣本中PEDV、PDCoV 和GARV 感染檢測中報道的方法[3],所有引物均由寶生物工程(大連)有限公司合成,引物具體信息見表1。

        表1 檢測4 種病毒的引物信息

        反應(yīng)體系和反應(yīng)條件:用4 種病毒的cDNA 模板與其對應(yīng)的引物進(jìn)行擴增。體系為10 體系,上下引物各0.5 μL、ddH2O 3 μL、cDNA 模板1 μL、酶5 μL。

        擴增條件:PCR 擴增條件為:95 ℃5 min,95 ℃30 s,55 ℃30 s,72 ℃55 s,35 個循環(huán),72 ℃8 min,4 °C 保存。

        反應(yīng)結(jié)束后,取產(chǎn)物5 μL 在含核酸染料的凝膠板上進(jìn)行點樣,并點等體積的DNA MarkerⅡ作對照,在電泳儀中電泳20~40 min,電泳完成后再凝膠成像儀中觀察是否有條帶以及條帶出現(xiàn)情況,進(jìn)行結(jié)果判定。將檢測結(jié)果為陽性的核酸樣本送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序比對分析。

        2 試驗結(jié)果

        試驗結(jié)果表明,從3 個豬場50 份腹瀉樣本中PEDV 檢出陽性樣本30 份,樣本總陽性率為60%,場陽性率為100%,各個豬場PEDV 陽性情況見表2。PDCoV、TGEV、GARV 3 種病毒未檢出。部分PEDV的電泳圖見圖1。

        表2 3 個豬場PEDV 的檢出率

        圖1 PEDV RT-PCR 擴增部分結(jié)果

        因此可知,3 個豬場都感染了PEDV 且感染率極高,是3 個豬場腹瀉的主要病原。

        3 討論

        稻城縣仔豬腹瀉嚴(yán)重,但發(fā)病原因不清楚。本試驗對3 個豬場的腹瀉樣本進(jìn)行了檢測,檢測結(jié)果表明,PEDV 的檢出率十分高,確定PEDV 是腹瀉的主要病因,因此加強對病毒性腹瀉的防控是提高豬場經(jīng)濟(jì)收入的有效措施。近年來藏香豬的養(yǎng)殖發(fā)展十分迅速,PEDV 帶來的損失也較為嚴(yán)重,該研究進(jìn)一步為仔豬腹瀉的防控提供參考。雖然其余3 種病毒未檢出,但豬腹瀉的新病原PDCoV 也逐漸受到關(guān)注。已有研究證實,從臨床樣本中分離的PDCoV 可引起5 日齡新生仔豬劇烈腹瀉,產(chǎn)生與PEDV、PoRV(輪狀病毒)等常見腹瀉病原極為相似的臨床癥狀及病理組織學(xué)變化,在防治PEDV 時也應(yīng)該重視其余3 種病毒[4],雖然沒有檢出但不排除健康豬帶毒的情況,以防止3 種病毒的突發(fā)帶來的經(jīng)濟(jì)損失[5]。

        關(guān)于藏香豬PEDV 的流行病學(xué)資料較少,但試驗結(jié)果與2013—2014 年四川省9 個地區(qū)的代表樣品,PEDV 的陽性率為86.67%相近[6],同時也符合四川省以PEDV 陽性率最高的調(diào)查結(jié)果[2]。2016 年1—6 月,對我國26 個省份收集到的896 份血清樣品進(jìn)行PEDV、PoRV 和TGEV 抗體檢測,結(jié)果顯示PEDV 和TGEV 抗體陽性率分別為62.3%、23.0%[7]。薛瑞雪等調(diào)查顯示,山東省部分地區(qū)豬場PEDV 和TGEV 感染率分別為34.96%、2.21%[6]。大量資料表明,PEDV 是造成我國豬場仔豬腹瀉的主要原因[8],因此對藏香豬腹瀉調(diào)查以及加強對仔豬腹瀉防控十分必要。

        稻城仔豬腹瀉情況嚴(yán)重,仔豬腹瀉病因復(fù)雜,病毒感染是最常見的因素[9],因此試驗同時對4 種病毒進(jìn)行了檢測,最終只檢測出PEDV,表明PEDV 是造成仔豬腹瀉的主要原因,這為提高豬場經(jīng)濟(jì)收入、仔豬腹瀉的防控提供參考[10]。

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