王蓮萍 王博 楊春雨 國會艷 任如意
摘要:根據(jù)白樺MYB基因編碼區(qū)設計引物,以白樺的cDNA為模板,擴增出8個MYB基因,純化回收后與T載體進行連接并利用熱激法轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)細胞中,后經(jīng)PCR檢測成功將8個MYB基因構建到T載體上。對8個MYB基因進行生物信息學分析,結果表明,8個MYB蛋白質(zhì)的分子量在27.2~38.8 ku之間,等電點在5.38~8.66之間;并且,8個MYB均為核蛋白質(zhì),但都沒有跨膜結構域,屬于非跨膜蛋白質(zhì);系統(tǒng)進化樹分析結果預測8個MYB基因在植物生長發(fā)育的各個方面發(fā)揮著重要的作用,為后續(xù)研究8個MYB基因在白樺中的功能以及通過優(yōu)良基因改良白樺的品質(zhì)性狀提供前期數(shù)據(jù)支持。
關鍵詞:白樺;MYB基因;序列分析
中圖分類號: S188文獻標志碼: A
文章編號:1002-1302(2019)18-0093-05
收稿日期:2018-05-15
基金項目:黑龍江省教育廳項目(編號:1352MSYYB002);研究生創(chuàng)新項目(編號:kjcx2018-80mdjnu)。
作者簡介:王蓮萍(1994—),女,黑龍江省鶴崗人,碩士研究生,主要從事植物分子生物學與基因工程研究。E-mail:928718821@qq.com。
通信作者:任如意,博士,教授,主要從事植物分子生物學與基因工程研究。E-mail:swxrry@126.com。
轉(zhuǎn)錄因子也稱反式作用因子,是指能夠與基因啟動子區(qū)域中順式作用元件發(fā)生特異性相互作用的DNA結合蛋白質(zhì),通過它們之間以及與其他相關蛋白質(zhì)之間的相互作用激活或抑制某些基因的轉(zhuǎn)錄[1]。根據(jù)轉(zhuǎn)錄因子保守域可分為很多家族,如bZIP、bHLH、MYB等。
MYB蛋白質(zhì)普遍存在與動植物中,是植物最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,它參與植物次生代謝調(diào)控、激素和環(huán)境的應答、并對細胞分化、細胞周期、器官的形成以及植物葉片的形態(tài)建成具有重要的調(diào)節(jié)作用[2-3]。自Paz-ares等首次報道玉米轉(zhuǎn)錄因子C1基因的克隆[4]以來,從番茄[5]、月季[6]、水稻[7]等多種植物中都分離克隆了MYB基因,并體現(xiàn)出MYB蛋白質(zhì)功能的多樣性。植物體中大多數(shù)MYB蛋白質(zhì)有2個重復MYB結構域(R2、R3),根據(jù)C端保守氨基酸序列的不同R2R3-MYB可分為22個亞類,同一亞類的基因往往具有相對保守的功能[8],有學者推測在擬南芥中有130多個R2R3-MYB基因[9],玉米中至少有80個MYB基因[10]。MYB家族轉(zhuǎn)錄因子有很多的成員被鑒定為是次生壁合成重要的調(diào)控因子[11],MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物應答生物脅迫中具有重要的作用,在植物的生長過程中,幾乎參與了植物的發(fā)育和代謝的各個方面。楊樹的PtrMYB092和PtrMYBJ52基因參與了植物中木質(zhì)素合成的調(diào)控,并能通過激活下游轉(zhuǎn)錄因子和關鍵酶基因的表達提高木質(zhì)素的合成速率,促進植物細胞次生壁發(fā)生木質(zhì)化[12]。有學者從桉樹克隆到了參與調(diào)控樹木木質(zhì)部形成的關鍵基因,桉樹中的Eg MYB2基因可以調(diào)控木質(zhì)素合成基因的轉(zhuǎn)錄,從而影響了桉樹木質(zhì)素和次生壁的形成[13]。Zhong等研究表明擬南芥的AtMYB58和AtMYB63過表達時,植物細胞壁的木質(zhì)素含量顯著增加,而其他細胞壁成分沒有變化[14]。擬南芥中HbMYB85a/b過表達都能使導管、木質(zhì)纖維和維管束間纖維的細胞壁厚度增加,木質(zhì)素含量升高,木質(zhì)素合成相關酶基因表達升高,葉片量加厚,抽薹開花延遲[15]。McCarthy等在楊樹中克隆了MYB46、MYB83的同源基因Ptr MYB3、Ptr MYB20,最后通過功能分析證實了Ptr MYB3、Ptr MYB20參與了次生木質(zhì)部的合成[16]。小麥中的TaMYB33受ABA介導的逆境響應信號調(diào)控,通過積累滲透壓調(diào)節(jié)物和提高細胞活性氧清除能力來提高植物對干旱和鹽的耐受性[17]。Yang等研究發(fā)現(xiàn)OsMYB2過表達植株中可溶性糖和脯氨酸含量上升,并發(fā)現(xiàn)其細胞內(nèi)脯氨酸合成酶和轉(zhuǎn)運蛋白基因等逆境相關基因表達量上升,同時抗氧化酶的活性升高,對低溫、鹽害和干旱逆境脅迫的耐受性都明顯增強[18]。擬南芥中的MYB68基因在根中柱鞘細胞中特異型表達,在高溫脅迫下,根中MYB68表達會明顯增強,并且MYB68突變體的生長活力比野生型低,說明MYB68參與了擬南芥高溫脅迫的應答反應[19]。水稻Osmyb4基因的過表達大大提高了轉(zhuǎn)基因水稻對干旱、高鹽、紫外輻射等的耐受能力[20]。從以往研究中不難發(fā)現(xiàn),MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物中起著關鍵性作用,但其作用的詳細分子機理還沒有被完全闡述清楚,因此,有必要對MYB轉(zhuǎn)錄因子的功能和作用機制繼續(xù)進行深入研究。
白樺(Betula platyphylla Suk.)為樺木屬的落葉喬木,其木材可供一般建筑及制作器具,樹皮可以提煉樺油,樹汁在保健藥用上有抗衰老止咳等功效,植株本身可用于園林景觀。隨著對白樺不斷深入的研究,它的經(jīng)濟市場價值也將不斷地被開發(fā)出來。本研究從白樺轉(zhuǎn)錄組中找到8個MYB基因,并以白樺cDNA為模板將其克隆出來,與T載體進行連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌中。并對8個MYB基因進行生物信息學分析,為后續(xù)利用試驗手段深入研究這8個MYB基因的功能提供前期依據(jù)。
1?材料與方法
1.1?材料
1.1.1?試驗材料
白樺組培苗,由牡丹江師范學院生命科學與技術學院提供。
1.1.2?試驗試劑
大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞、2×Power Taq PCR MasterMIX混合酶(百泰克生物技術公司)、DL2000 DNA marker。膠回收試劑盒、PMD18-T載體試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒(天根生物技術有限公司)。
1.1.3?培養(yǎng)基
培養(yǎng)基配方。1/2 MS固體培養(yǎng)基:1/2 MS粉(不含瓊脂粉和蔗糖)2.47 g,瓊脂粉8 g,蔗糖30 g,加蒸餾水定容至1 g,調(diào)節(jié)pH值為5.8。LB液體培養(yǎng)基:10 g蛋白胨、10 g NaCl、5 g酵母粉,加蒸餾水定容至1 L,調(diào)節(jié)pH值為7.0。
3?結論與討論
MYB作為最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,根據(jù)所含保守結構域的不同分為1R、2R、3R、4R多個亞家族,不同的亞家族也具有著不同的結構特征和功能。從白樺轉(zhuǎn)錄組中找到8個MYB基因,在從白樺的cDNA中克隆出這8個基因,與擬南芥MYB家族基因進行系統(tǒng)進化分析,暗示這8個白樺MYB基因在白樺生長發(fā)育的各個方面具有不同的功能,但這只是一種預測,后續(xù)還需要進行轉(zhuǎn)基因試驗來證實,本研究為進一步利用試驗手段分析MYB基因在白樺中的功能提供前期基礎數(shù)據(jù)。
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