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        濰坊地區(qū)非綜合征型耳聾患者遺傳性耳聾基因突變情況分析

        2019-11-27 07:15:54竇曉寧徐榮華高玲任雪蓮張敏敏鄭燕
        山東醫(yī)藥 2019年29期
        關(guān)鍵詞:基因突變

        竇曉寧,徐榮華,高玲,任雪蓮,張敏敏,鄭燕

        (濰坊市婦幼保健院,山東濰坊261011)

        先天性耳聾的致病因素可以分為遺傳性和非遺傳性。遺傳因素造成的耳聾中,約30%為綜合征型耳聾(SHI),70%為非綜合征型耳聾(NSHI)[1]。NSHI患者中,75%~80%為常染色體隱性遺傳,20%為常染色體顯性遺傳,2%~5%為X連鎖遺傳,1%的線粒體突變母系遺傳[2]。NSHI的致病基因和突變種類繁多,不同地區(qū)、不同種族遺傳背景存在差異。了解本地區(qū)常見耳聾基因突變特點(diǎn),能夠針對耳聾人群、高危人群進(jìn)行遺傳性耳聾基因檢測和篩查,有依據(jù)地制定本地區(qū)遺傳性耳聾防治工作規(guī)劃。濰坊地區(qū)尚缺乏遺傳性耳聾基因致病突變類型的研究。為此,我們對濰坊地區(qū)142例NSHI患者進(jìn)行耳聾基因檢測,分析該地區(qū)耳聾基因的流行情況和突變類型。

        1 資料與方法

        1.1 臨床資料 選擇我院2017年7月~2018年12月聽力中心確診的耳聾患者,以及本市聾校的部分耳聾學(xué)生?;颊咴诙呛砜漆t(yī)師指導(dǎo)下完成調(diào)查問卷,問卷內(nèi)容包括一般信息、分娩情況、聽障高危因素調(diào)查、家族史、疾病史等。納入標(biāo)準(zhǔn):籍貫為本市及所轄縣區(qū);經(jīng)聽力學(xué)檢測及影像學(xué)檢查(包括耳科常規(guī)檢查、純音測聽或聽性腦干反應(yīng)、耳聲發(fā)射、聲導(dǎo)抗、顳骨CT或MR)確診為永久性神經(jīng)性聽力損失;排除后天致病因素造成的耳聾和SHI。共納入142例患者,其中男78例、女64例,年齡0.2~40(14.4±6.8)歲。本研究經(jīng)我院醫(yī)學(xué)倫理委員會審核通過,由患者本人或法定監(jiān)護(hù)人簽署《遺傳性耳聾基因檢測知情同意書》。

        1.2 耳聾基因檢測方法 采集外周靜脈血3~5 mL,EDTA抗凝。采用一代測序Massarray法檢測耳聾基因。檢測基因及位點(diǎn):GJB2基因的109G>A,MET34THR,35delG,427C>T,176_191del16,235delC,299_300delAT,167delT,508_511dupAACG;GJB3基因的538C>T,547G>A,357C>T,423A>G,497A>G,R42P,CYS86SER,GLY12ASP;SLC26A4基因的281C>T,589G>A,IVS7-2A>G,1174A>T,1229C>T,IVS15+5G>A,1975G>C,2027T>A,2162C>T,2168A>G,1226G>A;12SrRNA基因的1555A>G,1494C>T,1291T>C,827A>G,961T>G;POU3F4基因的LYS202TER,LEU317TRP,LYS334GLU,ARG323GLY;GJB6基因的THR5MET,GLY11ARG,ALA88VAL,VAL37GLU。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS21.0統(tǒng)計軟件。計數(shù)資料以百分?jǐn)?shù)表示,組間比較采用χ2檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 NSHI患者耳聾基因突變類型及位點(diǎn) 142例NSHI患者中,共檢測出耳聾基因突變60例,突變率為42.25%。其中單基因純合突變15例,單基因雜合突變29例,單基因復(fù)合雜合突變10例,多基因復(fù)合突變6例。具體基因突變類型及位點(diǎn)見表1。

        表1 NSHI患者耳聾基因突變類型及位點(diǎn)

        注:*為純合突變。

        2.2 耳聾基因突變攜帶者的性別分布 60例耳聾基因突變攜帶者中,男性39例,檢出率為27.46%(39/142),男性攜帶率為50.00%(39/78),攜帶占比65.00%(39/60);女性21例,檢出率為14.79%(21/142),女性攜帶率為32.81%(21/64),攜帶占比35.00%(21/60)。男性檢出率、攜帶率、攜帶占比均高于女性(P<0.05或<0.01)。

        2.3 NSHI患者耳聾突變基因的突變位點(diǎn)、檢出頻次及構(gòu)成比 見表2。

        3 討論

        表2 NSHI患者耳聾突變基因的突變位點(diǎn)、檢出頻次及構(gòu)成比

        現(xiàn)實生活中,聾聾結(jié)合在聾人中比例較高,這是造成基因突變呈現(xiàn)多形態(tài)、多種基因復(fù)合攜帶的重要原因,也是先天性耳聾發(fā)生率居高不下的原因之一。耳聾中遺傳因素占比約60%,很大一部分耳聾患者由于自身基因缺陷或基因多態(tài)性造成對環(huán)境易感性增加而致聾。耳聾基因致病類型及頻率存在明顯地域特征,耳聾基因檢測可以明確病因,預(yù)測病情變化,協(xié)助治療,更重要的是可以指導(dǎo)并阻止耳聾傳遞,預(yù)防耳聾發(fā)生。因此,了解耳聾基因的流行情況和突變類型,掌握其發(fā)生發(fā)展規(guī)律及分布情況,對耳聾防治具有重要作用。

        GJB2基因與常染色體隱性遺傳NSHI相關(guān),其突變可導(dǎo)致內(nèi)耳K+循環(huán)紊亂,影響信使分子傳遞,從而導(dǎo)致聽覺異常。本研究中,GJB2基因在濰坊地區(qū)NSHI患者中的突變頻次為16次,檢出率為11.27%,其中235delC位點(diǎn)突變,占該基因突變位點(diǎn)的58.8%,預(yù)示該位點(diǎn)在本地區(qū)NSHI者中為GJB2基因主要致病位點(diǎn)。與林文津等[3]報道的檢出率11.06%接近,但與余紅等[4]報道的26.72%及劉雙雙等[5]報道的19.1%差異較大,表明存在明顯的地域性差異。

        GJB3基因編碼間隙連接蛋白31,其突變主要導(dǎo)致高頻聽力損失。以往研究發(fā)現(xiàn),GJB3基因538C>T、547G>A位點(diǎn)突變較多[4];但劉雙雙等[5]對山東省845例NSHI者GJB3基因538C>T、547G>A位點(diǎn)檢測結(jié)果僅發(fā)現(xiàn)1例538C>T雜合突變者(不包括濰坊地區(qū)),可見以上2個位點(diǎn)并不是山東地區(qū)主要的致病位點(diǎn)。而本研究的357C>T位點(diǎn)突變檢出率高達(dá)20.78%,表明357C>T位點(diǎn)是濰坊地區(qū)GJB3基因主要的突變位點(diǎn)。

        SLC26A4基因位于人類染色體7q31,具有較強(qiáng)的遺傳異質(zhì)性,其突變廣泛,目前國內(nèi)外已報道200余種突變類型。SLC26A4基因編碼Pendrin蛋白質(zhì),該蛋白是一種跨膜碘/氯轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,具有高度疏水性。Pendrin蛋白質(zhì)功能障礙可引起Cl-轉(zhuǎn)運(yùn)障礙或內(nèi)耳淋巴液流動異常,引起前庭水管擴(kuò)大(EVA)和內(nèi)淋巴管內(nèi)壓升高,內(nèi)耳毛細(xì)胞受損和聽神經(jīng)萎縮,從而導(dǎo)致聽力下降,為常染色體隱性遺傳,EVA為感音神經(jīng)性聾兒童最常見的內(nèi)耳畸形[6]。本研究SLC26A4基因突變檢出率為25.35%,突變占比46.75%,明顯高于其他基因,這與國內(nèi)孟培等[7]的研究結(jié)果有所不同,可以看出SLC26A4基因為本地區(qū)NSHI者主要致病基因。IVS7-2A>G位點(diǎn)為中國地區(qū)最常見突變,本研究中該位點(diǎn)的突變檢出率為14.08%,略高于全國其他地區(qū)[5,8]。該位點(diǎn)的突變占比為55.56%,在本地區(qū)NSHI者中占該基因突變的第1位,高于張艷芳等[9]報道的28.29%。2168A>G位點(diǎn)檢出率為4.93%,占SLC26A4基因突變第2位,與我國其他地區(qū)[10,11]相近,但高于全國平均水平[4]。

        12SrERNA基因為藥物性耳聾的易感基因,是以母系線粒體DNA為遺傳方式的基因遺傳,為“一針致聾”的主要原因。以往國內(nèi)研究其突變位點(diǎn)多集中在1555A>G與1494G>T[12~14]。本研究中12SrERNA基因突變?nèi)繛榧兒贤蛔?,?27A>G位點(diǎn)突變與1555A>G位點(diǎn)突變?yōu)橹鳎?27A>G位點(diǎn)突變攜帶率(2.82%)略高于1555A>G位點(diǎn)突變攜帶率(2.11%)。這與Lu等[13]報道的12SrERNA基因突變位點(diǎn)以1555A>G與1494G>T為主不同,與江帆等[14]報道的廣州地區(qū)耳聾基因分析主要以1555A>G位點(diǎn)突變也不同,存在明顯的地域差異。1494C>T位點(diǎn)未發(fā)現(xiàn)突變攜帶者,可見此位點(diǎn)并非本地區(qū)NSHI者12SrERNA基因主要致病位點(diǎn)。12SrERNA基因突變者對氨基糖苷類藥物極為敏感,小劑量短時應(yīng)用即可造成聽力嚴(yán)重受損。12SrERNA基因檢測可以指導(dǎo)用藥,避免因使用氨基糖苷類藥物發(fā)生耳聾。

        POU3F4基因位于X染色體上,以X連鎖隱性遺傳的方式向后代傳遞,家系中患者多為男性呈現(xiàn)明顯的隔代遺傳規(guī)律。大部分表現(xiàn)為混合性聾,聽力損失可成進(jìn)行性發(fā)展,少數(shù)表現(xiàn)為感音神經(jīng)性聾。GJB2/GJB6基因突變導(dǎo)致的聽力損失程度更重,一般為極重度。本研究上述2個基因檢出率均為0,提示在本地人群中少見。

        本研究中單基因雜合突變檢出率20.42%,占比48.33%,單基因雜合突變通常認(rèn)為不致病,而同一基因的不同位點(diǎn)雜合突變通常認(rèn)為可致病。耳聾患者出現(xiàn)單基因雜合突變,有必要對該基因全外顯子測序,以期找到其他協(xié)同致病的突變位點(diǎn)。本研究還發(fā)現(xiàn),在本地區(qū)NHSI者中,基因突變攜帶率表現(xiàn)為多種類型與形態(tài),多基因復(fù)合突變檢出率達(dá)4.23%,突變占比10.00%,在以往的報道中較少見。

        綜上所述,濰坊地區(qū)NSHI者遺傳性耳聾的主要致病基因和位點(diǎn)依次為:SLC26A4基因IVS7-2A>G、1174A>T、2168A>G、IVS15+5G>A、589G>A、1975G>C位點(diǎn),GJB2基因235delC、299_300delAT、MET34THR、109G>A、176_191del16位點(diǎn),GJB3基因357C>T、538C>T位點(diǎn),12SrERNA基因827A>G、1555A>G位點(diǎn)。本地區(qū)耳聾基因突變形態(tài)多樣,與其他地區(qū)有明顯地域差異。由于NSHI的臨床表型差異大而且遺傳異質(zhì)性非常強(qiáng),醫(yī)學(xué)工作者應(yīng)將遺傳性耳聾基因的基因型與表型之間的相關(guān)性作為研究重點(diǎn),為臨床提供更準(zhǔn)確的指導(dǎo)。

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