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        基于SDS-PAGE與熒光標記檢測技術(shù)的黃淮麥區(qū)小麥品種(系)HMW-GS組成分析

        2019-11-21 02:52:30賈琳琳王永霞靳曉杰
        河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年11期
        關(guān)鍵詞:亞基位點熒光

        賈琳琳,王永霞,靳曉杰

        (河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 作物設(shè)計中心,河南 鄭州 450002)

        隨著我國經(jīng)濟的發(fā)展和人民生活水平的不斷提高,人們對小麥品質(zhì)的要求越來越高,小麥品質(zhì)改良已成為小麥育種工作的重要研究方向。在影響小麥品質(zhì)的眾多因素中,高分子質(zhì)量麥谷蛋白亞基(HMW-GS)對小麥面粉加工品質(zhì)起關(guān)鍵作用[1-2],其組成已成為品質(zhì)育種中親本選配和雜交后代選擇的重要依據(jù)。HMW-GS由第一部分同源染色體長臂上的Glu-A1、Glu-B1、Glu-D1位點編碼[3]。每個位點都含有2個緊密連鎖基因,分別編碼分子質(zhì)量較大的x型和分子質(zhì)量較小的y型亞基。到目前為止,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并命名的亞基超過40種。公認的優(yōu)質(zhì)HMW-GS有1、2*、7+8、14+15、13+16、5+10等,優(yōu)質(zhì)亞基組合有1/14+15(13+16)/5+10、1/7+8/5+10、1/17+18/2+12等[4-8]。研究表明,我國小麥品種的HMW-GS組成較豐富,但優(yōu)質(zhì)亞基頻率較低,同時含有多個優(yōu)質(zhì)亞基組合的品種也較少,品質(zhì)仍較差[9-11]。因此,篩選含有優(yōu)質(zhì)HMW-GS和亞基組合的材料成為提高小麥面粉加工品質(zhì)的關(guān)鍵。

        檢測小麥HMW-GS的方法主要有SDS-PAGE[5]、分子標記[12]和高效毛細管電泳[13]等。其中,SDS-PAGE是最常用的方法,并得到了廣泛應(yīng)用,分子標記可輔助SDS-PAGE有效鑒定HMW-GS多樣性。分子標記可以直接對HMW-GS 基因進行檢測,不受植株發(fā)育時期、取材部位的限制,具有其獨特的優(yōu)越性。編碼HMW-GS的基因具有高度的同源性,每個基因位點都存在大量的等位變異,不同等位基因之間的差異由DNA序列的重復(fù)和缺失造成。國內(nèi)外諸多學(xué)者根據(jù)其特點設(shè)計出特異性、保守性引物,可快速、準確地檢測HMW-GS基因[14-17]。LEI等[14]針對Glu-B1位點編碼區(qū)域DNA序列變異設(shè)計出特異性引物,可有效鑒定By7、By8、By9基因。LIU等[15]在前人研究的基礎(chǔ)上,在Glu-A1、Glu-D1位點上設(shè)計出共顯性標記UMN19、UMN25、UMN26,可分別鑒定Ax2*、Ax1、null,Dx2、Dx5,Dy10、Dy12基因。此外,已開發(fā)分子標記的基因還有Bx7*、Bx7OE、By8*、By16等[16]。毛細管電泳熒光標記檢測法是一種快速、準確、高效的分子標記檢測方法,能極大提高工作效率,增強試驗結(jié)果的穩(wěn)定性和可重復(fù)性。鄭永勝等[17-18]利用該方法建立了小麥品種DNA指紋鑒定體系,并利用81個SSR標記對96份小麥品種進行了相似度分析。目前,將凝膠電泳與分子標記相結(jié)合進行小麥HMW-GS檢測的研究很少,且分子標記檢測的方法均為瓊脂糖凝膠電泳[19-21],而同時使用SDS-PAGE和毛細管電泳熒光標記檢測的研究尚未見報道。為此,利用SDS-PAGE和熒光標記法同時對91份黃淮麥區(qū)小麥品種(系)的HMW-GS組成進行分析,以期為黃淮麥區(qū)小麥品質(zhì)改良提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 試驗材料

        供試材料為91份黃淮麥區(qū)小麥品種(系),包括68份品種和23份品系(表1),分別來自河南省、河北省、山東省等地,以中國春(Null/7+8/2+12)、師欒02-1(1/7+9/5+10)、石4185(1/14+15/2+12)為對照材料。其中,師欒02-1和石4185由河北省農(nóng)林科學(xué)院張穎君惠贈,其余材料均由河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物設(shè)計中心提供。

        表1 小麥品種(系)名稱及來源Tab.1 Wheat varieties(lines) name and source

        續(xù)表1 小麥品種(系)名稱及來源Tab.1(Continued) Wheat varieties(lines)name and source

        1.2 試驗方法

        1.2.1 HMW-GS 提取 HMW-GS樣品提取參考PENG等[22]的方法。每份樣品取10粒種子磨粉后,稱取20 mg 置于2 mL 離心管中,加入1 mL樣品提取液[62.5 mmol/L Tris-HCl (pH值6.8)、0.002%溴酚藍、10%甘油、1.5%二硫蘇糖醇、2% SDS]65 ℃水浴浸提30 min,渦旋5 min,取出冷至室溫,9 000×g離心5 min,取上清保存于4 ℃冰箱。

        1.2.2 SDS-PAGE電泳 采用10%(pH值 8.8)的分離膠和4%(pH 值6.8)的堆積膠,用甘氨酸溶液為電極緩沖液,單板電流15 mA,電壓100 V,電泳8 h,用考馬斯亮藍R250染色液染色過夜,蒸餾水脫色至條帶清晰,拍照保存。參照 PAYNE等[23]的亞基命名及編號方法對亞基進行記錄。

        1.2.3 毛細管電泳熒光標記檢測 采用CTAB法從幼苗葉片中提取供試材料的基因組DNA。PCR反應(yīng)體系總體積為10 μL:dNTPs(25 mmol/L)0.15 μL、上游引物(10 μmol/L)0.15 μL、下游引物(10 μmol/L)0.3 μL、M13熒光標記引物(10 μmol/L)0.15 μL、Taq酶 0.15 μL、10×Buffer 1 μL、模板60 ng,用去離子水補足至10 μL。本研究涉及的引物為UMN19、UMN25、UMN26,其中上游引物前端加有M13的尾巴序列(5′-CACGACGTTGTAAAACGAC-3′),由生工(上海)生物工程有限公司合成,M13熒光標記引物由英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司合成(表2)。

        表2 熒光標記引物信息Tab.2 The information of fluorescent labeled primers

        PCR擴增反應(yīng)在Eppendorf Mastercycler?pro 384擴增儀上進行,PCR擴增程序參照LIU等[15]的方法。PCR結(jié)束后,每孔加7 μL甲酰胺于95 ℃變性5 min,在ABI 3500XL上進行熒光檢測,結(jié)果利用Genograper 2.1軟件進行分析。

        1.2.4 品質(zhì)評分和聚類分析 HMW-GS評分標準參照宋建民等[24]的方法,目的條帶存在時賦值為1,不存在時賦值為0,根據(jù)1、0數(shù)據(jù)構(gòu)建矩陣,計算遺傳相似系數(shù),利用軟件NTSYS 2.1中UPGMA進行聚類分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 基于SDS-PAGE檢測的小麥品種(系)HMW-GS組成分析

        SDS-PAGE檢測結(jié)果顯示,供試小麥材料共含有14種HMW-GS類型,表現(xiàn)出豐富的變異(表3—4)。Glu-A1位點上共有1、Null、2*三種亞基類型,出現(xiàn)頻率分別為59.34%、37.36、3.30%。Glu-B1位點上共有5種亞基類型,分別為7、7+8、7+9、13+16、14+15。其中,7+8的頻率最高(52.75%),其次為7+9(25.27%),攜帶稀有亞基7、13+16、14+15的材料有19份。Glu-D1位點亞基變異較豐富,共出現(xiàn)6種亞基類型,除所占比例較高的2+12和5+10亞基外,還有10、12、3+12、4+12稀有亞基,特別是3+12和4+12亞基,累計出現(xiàn)比例高達21.98%,說明近年來更多的亞基類型被用于小麥品質(zhì)改良育種。

        2.2 基于熒光標記檢測的小麥品種(系)HMW-GS組成分析

        熒光標記檢測結(jié)果(部分結(jié)果見圖1)顯示,91份供試小麥材料中含Ax1、Null基因的材料較多,含Ax2*基因的材料有3份;含Dx2、Dx5基因的材料各有42、27份,比例分別為46.15%、29.67%;周麥18等63份材料含有Dy12基因,28份材料含有Dy10基因。綜上,熒光標記檢測結(jié)果與SDS-PAGE檢測結(jié)果相吻合,說明亞基特異性分子標記可準確、快速地檢測小麥中HMW-GS基因。

        表3 基于SDS-PAGE檢測的91份小麥品種(系)的HMW-GS組成分析

        續(xù)表3 基于SDS-PAGE檢測的91份小麥品種(系)的HMW-GS組成分析

        表4 基于SDS-PAGE檢測的小麥品種(系)HMW-GS等位變異及頻率分析Tab.4 Allelic variation and frequency analysis of HMW-GS in 91 wheat varieties (lines) based on SDS-PAGE

        1—18為品種(系)編號(同表1)1—18 are varieties(lines)number(the same as Tab.1)

        2.3 小麥品種(系)HMW-GS組合及其頻率、品質(zhì)分析

        由表5可知,在91份供試小麥材料中,共檢測出28種HMW-GS組合,表現(xiàn)出豐富的HMW-GS組成多樣性。其中,適合制作面包的優(yōu)質(zhì)亞基組合類型1/7+8/5+10出現(xiàn)頻率最高,為14.29%;其次是適合制作優(yōu)質(zhì)手工饅頭的亞基組合1/7+8/2+12和Null/7+8/2+12,均為12.09%;15個亞基組合出現(xiàn)頻率較低,均為1.10%。

        由表5可知,供試材料得分介于5.5~11.0,平均得分為7.78,由于10、12亞基的品質(zhì)評分未見報道,暫不對含有這些亞基的組合進行評分,且含有這2個亞基的材料均只有1份,對總體評分影響不大。Null/13+16/5+10組合得分最高(11.0分),分別來自泉麥28、小偃6號、龍科1109。品質(zhì)評分在9分及以上的亞基組合有1/13+16/2+12、1/7+8(7+9)/5+10、Null/13+16/2+12、Null/14+15/5+10。

        表5 供試小麥品種(系)HMW-GS組合類型及其頻率、品質(zhì)得分

        2.4 基于HMW-GS的小麥品種(系)聚類分析

        由圖2可知,在遺傳相似系數(shù)為0.42時,可以將供試材料分為4大類:第Ⅰ類包括03中42、衡562、滄麥6001、泉麥28,小偃6號和龍科1109等6份材料,其Glu-B1位點上的亞基類型為13+16,亞基組合所得品質(zhì)評分相對較高;第Ⅱ類包括2份材料,分別為良星66和平安11,其Glu-B1位點上的亞基類型為稀有亞基14+15;第Ⅲ類包括22個材料,其Glu-D1位點上的亞基類型為優(yōu)質(zhì)亞基 5+10,該類集中了大部分強筋小麥材料,如新麥26、鄭麥7698和鄭麥366等;第Ⅳ類可以分為3個亞類,第一亞類包括28份材料,第二亞類包括7份材料,第三亞類包括23份材料。

        圖2 基于HMW-GS的91個小麥品種(系)的聚類分析

        3 結(jié)論與討論

        黃淮麥區(qū)是我國小麥的主產(chǎn)區(qū),該區(qū)域小麥HMW-GS等位基因和亞基組合的多態(tài)性較豐富,但分布均嚴重不均。優(yōu)質(zhì)亞基5+10和14+15所占比例有所提高,但優(yōu)質(zhì)亞基組合所占比例仍然很低[25]。麻珊珊等[26]對參加黃淮麥區(qū)南片冬、春小麥預(yù)備試驗的143個小麥新品種(系)HMW-GS組成進行分析,發(fā)現(xiàn)了10種等位基因和15種亞基組合,對加工品質(zhì)具有正效應(yīng)的優(yōu)質(zhì)亞基1出現(xiàn)的頻率為59.44%,14+15出現(xiàn)頻率為13.99%,5+10出現(xiàn)頻率為37.06%,謝科軍等[27]、李立等[28]研究結(jié)果與之相似。本研究也得到相似的結(jié)果,在隨機選取來源不同的小麥品種(系)中,優(yōu)質(zhì)亞基1(59.34%)和5+10(29.67%)出現(xiàn)頻率依然較高,14+15出現(xiàn)頻率則沒有提高。本研究中除檢測到1、7+8、2+12、5+10等所占比例較高的亞基外,還發(fā)現(xiàn)一些稀有優(yōu)質(zhì)亞基,如2*、13+16、14+15等,極大地豐富了黃淮麥區(qū)小麥的HMW-GS類型,說明近年來人們開始注重不同優(yōu)質(zhì)亞基材料的引進、篩選和利用。供試材料的平均品質(zhì)得分較張瑞奇等[29]研究結(jié)果有所提高,品質(zhì)評分在9.0分及以上的亞基組合有1/13+16/2+12、1/7+8(7+9)/5+10、Null/13+16/2+12、Null/14+15/5+10。其中,Null/13+16/5+10亞基組合出現(xiàn)頻率較低(3.30%),但它們的品質(zhì)評分最高(11.0分);優(yōu)質(zhì)亞基組合1/7+8/5+10出現(xiàn)品頻率最高(14.29%),其品質(zhì)評分高達9.5分。小麥的品質(zhì)育種過程中應(yīng)加強對優(yōu)異種質(zhì)的利用,本研究所篩選出來的含有1、2*、5+10、13+16、14+15等優(yōu)質(zhì)亞基和亞基組合的品種(系)可作為雜交親本和轉(zhuǎn)育材料,用于黃淮麥區(qū)小麥定向品質(zhì)改良育種。

        SDS-PAGE是分離檢測HMW-GS最常用的方法,在國內(nèi)各育種單位得到了廣泛應(yīng)用,對加速小麥品質(zhì)育種做出很大的貢獻。SDS-PAGE法具有一定的局限性,如需要用收獲后的籽粒作為材料,且電泳圖譜上亞基的遷移率與分子質(zhì)量并不總是一致,從而混淆分子質(zhì)量不同而遷移率相似的亞基等。利用分子標記進行HMW-GS鑒定,克服了SDS-PAGE方法的局限性,可在不同的生育時期進行取樣,可以快速大量地檢測相關(guān)基因,因而受到了廣泛的重視。白升升等[21]利用分子標記有效鑒定了遷移率相近的7、7*與7OE,8與8*亞基,準確分析了小麥HMW-GS類型。本研究中分子標記檢測結(jié)果與SDS-PAGE檢測結(jié)果相吻合,說明利用分子標記技術(shù)可有效鑒定材料中HMW-GS。此外,本研究采用的毛細管電泳熒光標記檢測技術(shù),相比之前的瓊脂糖凝膠電泳和普通的SDS-PAGE,具有高通量、高靈敏度、分析過程自動化等優(yōu)點,適用于大規(guī)模材料的分析研究。試驗過程中合理搭配擴增片段差異較大的同種熒光標記,實現(xiàn)多熒光多目的片段PCR產(chǎn)物的同時檢測,提高基因型鑒定效率,有效降低了鑒定成本。

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