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        合成β-內(nèi)酰胺酶抑制劑阿維巴坦的關(guān)鍵中間體的研究進(jìn)展

        2019-11-01 01:37:26陸凡武紅麗沙鳳曹祁陳姣曹飛韋萍
        中國抗生素雜志 2019年10期

        陸凡 武紅麗 沙鳳 曹祁 陳姣 曹飛 韋萍

        (南京工業(yè)大學(xué)生物與制藥工程學(xué)院,南京 211816)

        自抗生素被發(fā)現(xiàn)并應(yīng)用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域后,許多感染性疾病得到了有效控制,新生兒死亡率及手術(shù)后感染率大大降低,因此延長了人類生存的平均壽命。然而,細(xì)菌的耐藥性也隨之產(chǎn)生,人類的健康和生命安全又面臨新的考驗[1]。當(dāng)前,面對日趨嚴(yán)峻的“抗菌”形勢,一些國家已經(jīng)開始采取激勵措施,鼓勵新抗生素的研發(fā)。美國于2012年7月通過了《鼓勵開發(fā)抗生素法案》(GAIN),根據(jù)規(guī)定,符合標(biāo)準(zhǔn)的抗生素藥物將獲得額外5年的市場獨占權(quán),以幫助開發(fā)者收回投資。然而新抗生素的開發(fā)難度越來越大,因此通過復(fù)方抗生素來提升治療效果也是解決細(xì)菌耐藥性的途徑之一[2]。

        β-內(nèi)酰胺酶抑制劑阿維巴坦(2)本身幾乎不具有抗菌活性[3],但其抑酶譜廣,與其他抗生素聯(lián)用可有效恢復(fù)或增強(qiáng)其活性。2015年2月,由阿特維斯與阿斯利康聯(lián)合研發(fā)的阿維巴坦與頭孢他啶組成的復(fù)方藥物avycaz獲得美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準(zhǔn)上市,用于治療成人復(fù)雜性腹腔內(nèi)感染及復(fù)雜性尿路感染等系列疾病[4-5]。阿維巴坦屬于DBOs類化合物,化學(xué)名為[(1R,2S,5R)-2-(氨基羰基)-7-氧代-1,6-二氮雜雙環(huán)[3.2.1]辛-6-基]硫酸單酯。其合成路線非常繁多,起始原料大致可分為L-焦谷氨酸衍生物、手性的哌啶環(huán)衍生物等,而以L-焦谷氨酸衍生物為起始原料的合成路線大都需要經(jīng)歷開環(huán)后增碳再閉環(huán)形成哌啶環(huán)衍生物的步驟[6]。因此,人們開始研究直接以手性的哌啶環(huán)衍生物為原料的合成路線。2014年,默克公司的一個研發(fā)小組報道了以手性哌啶環(huán)衍生物順式-5-羥基哌啶-2-甲酸(cis-5-hydroxy-L-pipecolic acids,cis-5-hypip,1)為原料,合成同樣具有二氮雜二環(huán)辛烷基本骨架的化合物,總收率高達(dá)39%,且該工藝路線具有公斤級放大規(guī)模的潛力[7]。而從化學(xué)結(jié)構(gòu)上來看,阿維巴坦具有兩個手性中心,這兩個手性中心都在哌啶環(huán)上,因此以cis-5-hypip作起始原料,則可較好地解決手性光學(xué)純度問題(圖1)。cis-5-hypip同樣也是TNF-α轉(zhuǎn)化酶抑制劑[8]合成的重要中間體。其本身也對導(dǎo)致存儲谷物腐敗的曲霉菌具有抑制作用[9]。目前,對cis-5-hypip合成的研究,主要分為化學(xué)合成和酶促合成兩個方面。

        圖1 cis-5-hypip(1)與阿維巴坦(2)Fig.1 cis-5-hypip(1)and avibactam(2)

        1 化學(xué)合成cis-5-hypip

        Bailey等[10-11]以谷氨酰胺(3)為原料,將其轉(zhuǎn)化為N-芐氧基羰基甲酯(4)后,用亞硝酸叔丁酯作為[NO]+的來源并在乙腈中進(jìn)行處理,使其側(cè)鏈酰胺基團(tuán)選擇性水解的同時沒有水解酯或氨基甲酸酯,從而得到光學(xué)純的N-芐氧基羰基-L-谷氨酸-α-甲基酯(5)(Z-Glu-OMe,Z=芐氧基羰基)(74%)。用氯甲酸乙酯處理(5)后與混合酸酐和重氮甲烷反應(yīng)生成重氮甲酮(6)(收率82%),接著通過碳烯引入N-H鍵將(6)轉(zhuǎn)化為受保護(hù)的5-氧代哌啶酸(7)(75%)。最后用硼氫化鈉立體特異性還原得到cis-5-hypip衍生物(8)(93%),脫保護(hù),得到最終產(chǎn)物(1)(圖2),總收率為42%。但是該方法有使用工業(yè)上難以使用的重氮甲烷的工序,因此難以工業(yè)化,還存在所得到的化合物為立體異構(gòu)體的混合物的問題。

        Krishnamurthy等[12]以具有叔丁氧基羰基(Boc)保護(hù)的丙二酸二乙酯(9)為原料,在乙醇鈉中用過量的4-溴-1-丁烯處理(9),得到烷基化二酯,接著用固體LiOH選擇性皂化,得到半酸半酯,在回流甲苯中脫羧,得到(RS)-10(相對于9的總收率為59%)。用α-胰凝乳蛋白酶處理后得到純的對映體2-氨基-5-己烯酸衍生物(R)-10(51%)、(S)-11(46%)。在Et3N中用乙基溴將(S)-11酯化,得到(S)-10,產(chǎn)率84%。接著用過量的m-CPBA進(jìn)行一系列處理得到環(huán)氧化物(12)(產(chǎn)率為90%)。再將非對映異構(gòu)環(huán)氧化物(12)分離得到手性二醇(2S,5S)-13和手性環(huán)氧化物(2S,5R)-12,收率分別為46%和47%。其中手性環(huán)氧化物(2S,5R)-12經(jīng)過6步反應(yīng)最終可以得到反式-5-羥基哌啶-2-甲酸。而手性二醇(2S,5S)-13在催化劑的作用下用TsCl處理二醇的選擇性甲苯磺酰化得到單甲苯磺?;a(chǎn)物(14)。使用NaI將(14)中的甲苯磺酰基基團(tuán)用碘基團(tuán)取代,得到(2S,5S)-15(95%)。接著除去Boc基團(tuán)使分子內(nèi)環(huán)化后用Boc基團(tuán)再次重新保護(hù)氨基酸的氮,得到(2S,5S)-16(76%),最后將其轉(zhuǎn)化為(1)(圖3)。該方法需要兩次分離非對映異構(gòu)體,每次分離都只能有一半的收率,導(dǎo)致最終總收率更低(7%),且分離步驟較復(fù)雜,很難實現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)。

        圖2 cis-5-hypip的化學(xué)合成路線一[11]Fig.2 Chemical synthetic route of cis-5-hypip[11]

        2016年,竹原潤等[13]以(3S)-4-氯-3-羥基丁酸乙酯(17)為原料,先將羥基進(jìn)行保護(hù)得到(18),接著將(18)中的酯基還原從而合成(3S)-4-氯-3-(四氫吡喃-2-基氧基)-丁烷-1-醇(P=四氫吡喃基)(19),對它的羥基進(jìn)行磺酸酯化從而得到(3S)-甲磺酸-4-氯-3-(四氫吡喃-2-基氧基)-丁酯(20),將其與乙酰基氨基丙二酸二乙酯(21)反應(yīng)后得到(22),環(huán)化,脫保護(hù),得到(5S)-1-乙?;?5-羥基-哌啶-2,2-二甲酸二乙酯(24)。接下來將(24)中的酯基水解,通過使一個羧基與羥基反應(yīng)而進(jìn)行內(nèi)酯化,然后使羧基脫羧得到(26);或者將酯基水解,通過將一個羧基脫羧而得到2位單羧酸的立體異構(gòu)體混合物(25),接著使該立體異構(gòu)體混合物進(jìn)行異構(gòu)化內(nèi)酯化得到(26)。最后將(26)中的內(nèi)酯水解,并使其中的酰胺鍵斷裂,從而得到順式-5-羥基哌啶-2-甲酸,總產(chǎn)率達(dá)到44.8%(圖4)。該方法避免了因立體異構(gòu)體拆分導(dǎo)致產(chǎn)物較大損失的問題,具備工業(yè)化生產(chǎn)的潛力。

        2 酶促合成cis-5-hypip

        由于化學(xué)合成需要分子內(nèi)環(huán)化生成哌啶環(huán)且需要復(fù)雜的手性拆分方法,因而導(dǎo)致較長的合成步驟,使得總產(chǎn)率較低。而酶具有高度選擇性和專一性的特征,因此,人們也開始研究通過生物法制備cis-5-hypip。不同于化學(xué)合成中需要進(jìn)行分子內(nèi)環(huán)化形成哌啶環(huán),生物法可以運用酶的立體和區(qū)域選擇性,直接在L-哌啶甲酸(L-pipecolic acid,L-Pip)的5位碳上進(jìn)行羥基化,這其中的關(guān)鍵酶為哌啶甲酸羥化酶(pipecolic acid hydroxylases,PiHs)。2016年,Hibi等[14]發(fā)現(xiàn)了來自于Fusarium oxysporumc8D和Aspergillus nidulansFGSC中的兩種順式-4-哌啶甲酸羥化酶基因(FoPip4H和AnPip4H),可以將L-Pip羥基化生成順式-4-羥基哌啶甲酸。2017年,Huttel等[15]從Streptomycessp.和Frankia alni中發(fā)現(xiàn)了兩種PiHs(GetF和PiFa),但是這兩種酶只能對L-Pip的3位碳進(jìn)行羥基化,5位羥基化的哌啶甲酸羥化酶至今還沒有被發(fā)現(xiàn)。而在之前的報道中,脯氨酸羥化酶(proline hydroxylases,PHs)具有較為寬廣的底物選擇性,可以催化L-Pip生成羥基哌啶甲酸[16-17],如順式-4-脯氨酸羥化酶(cis-proline-4-hydroxylases,cis-P4H)可以將L-Pip羥基化生成cis-5-hypip。為了降低成本,人們又以L-賴氨酸(L-lysine,L-Lys)為原料,通過賴氨酸環(huán)化脫氨酶(lysine cyclodeaminase,LCD)生產(chǎn)L-Pip,最終形成了從L-Lys到L-Pip再到cis-5-hypip的合成過程(圖5)。

        圖3 cis-5-hypip的化學(xué)合成路線二[12]Fig.3 Chemical synthetic route of cis-5-hypip[12]

        圖4 cis-5-hypip的化學(xué)合成路線三[13]Fig.4 Chemical synthetic route of cis-5-hypip[13]

        2.1 賴氨酸環(huán)化脫氨酶

        L-哌啶甲酸也是合成許多重要藥物的手性中間體,如卡因類局麻藥物S-利多卡因、S-羅哌卡因、S-布比卡因、S-左布比卡因等[18]。目前,以L-Lys脫去α位氨基來實現(xiàn)脫氨環(huán)化反應(yīng)過程有3條,分別是①L-賴氨酸-α-氧化酶與Δ1-哌啶-2-甲酸酯(Δ1-piperideine-2-carboxylate,P2C)還原酶途徑;②L-賴氨酸-2-氨基轉(zhuǎn)移酶與P2C還原酶途徑;③L-賴氨酸環(huán)化脫氨酶途徑[19]。由于前兩種途徑都是先生成一個P2C中間產(chǎn)物后再由P2C還原酶催化生成L-PA,反應(yīng)需要兩種酶參與且需要分兩步完成,因此人們更加傾向于更高效,更簡便的賴氨酸脫氨環(huán)化酶途徑,其在NAD+的幫助下,可以直接將線性底物L(fēng)-賴氨酸催化環(huán)化成為L-哌啶甲酸,相較其他途徑,更為簡便快捷[20]。

        圖5 cis-5-hypip的生物合成過程Fig.5 Biosynthesis route of cis-5-hypip

        賴氨酸環(huán)化脫氨酶(LCD)的發(fā)現(xiàn)要歸功于對著名的移植抗排異藥物雷帕霉素的研究[21]。Moluar等[22]在研究鏈霉菌中次級代謝產(chǎn)物雷帕霉素的合成過程時,通過同位素標(biāo)記意外地發(fā)現(xiàn)雷帕霉素中的效價基團(tuán)哌啶甲酰胺來源于初級代謝產(chǎn)物賴氨酸,他們通過基因挖掘技術(shù),初步獲得了LCD的基礎(chǔ)信息。然而早期對于LCD的研究因為技術(shù)手段的匱乏而十分局限,甚至出現(xiàn)了誤解(認(rèn)為LCD也可以催化D-賴氨酸產(chǎn)生D-哌啶甲酸)。2006年,Gatto等[23]對來源于Streptomyces hygroscopicus的賴氨酸環(huán)化脫氨酶的基因rapL的酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了全面的表征并成功的將rapL在大腸埃希菌中進(jìn)行了異源表達(dá),同時也對ShLCD的輔酶依賴性做了詳細(xì)的考察,在外源性NAD+存在下,初始速率提高8倍,他們將NAD+進(jìn)行催化利用的過程被稱之為“復(fù)雜NAD+依賴型轉(zhuǎn)化”(complex NAD+-dependent transformation),豐富了改造這類酶的經(jīng)驗和基礎(chǔ)。2018年,Ying等[24]對以來源于Streptomyces pristinaespiralis的賴氨酸環(huán)化脫氨酶SpLCD進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)晶條件的篩選與優(yōu)化,通過X射線衍射法解析SpLCD及其與小分子配體復(fù)合物的三維晶體結(jié)構(gòu)。進(jìn)而對SpLCD進(jìn)行分子動力學(xué)模擬,并結(jié)合定點突變闡述SpLCD與底物的識別與轉(zhuǎn)運機(jī)制、產(chǎn)物的釋放機(jī)制,篩選出了組合突變株Val61-Val94-SpLCD,相比野生型SpLCD,其催化效率提高了1.81倍,并且解除了底物與產(chǎn)物抑制。隨后利用該組合突變株進(jìn)行了全細(xì)胞催化合成L-Pip的研究,在單次底物上載量為50g/L,分批補料3次的條件下,使最終的L-Pip產(chǎn)物濃度達(dá)到了73.4g/L,展現(xiàn)了一定的實際應(yīng)用潛力。

        2.2 脯氨酸羥化酶

        由于目前尚未發(fā)現(xiàn)對L-Pip上5位碳進(jìn)行羥基化的PiHs,而PHs具有羥基化L-Pip的能力,因此人們轉(zhuǎn)向?qū)Hs的利用與改造[17]。PHs屬于非血紅霉素Fe(Ⅱ)/α-酮戊二酸(α-KG)雙加氧酶家族,這些酶通過與Fe2+、α-KG和O2產(chǎn)生的高反應(yīng)性鐵基(FeIV=O)復(fù)合物將羥基引入底物上沒有反應(yīng)活性的碳,是具有高度的區(qū)域和立體選擇性的C-H催化反應(yīng)[25],與NAD(P)H依賴性P450單加氧酶相反,它們的共底物α-KG價格便宜,因此不需要再生循環(huán)系統(tǒng)。根據(jù)不同的區(qū)域和立體選擇性,PHs可以分為4種類型:順式-3-、反式-3-、順式-4-和反式-4-脯氨酸羥化酶(cis-P3H、trans-P3H、cis-P4H和trans-P4H),分別將L-Pip羥基化形成對應(yīng)的羥基哌啶甲酸(圖6)。

        1996年,Lawrence等[26]成功從綠灰菌素生產(chǎn)者Streptomyces griseoviridusP8648中發(fā)現(xiàn)了第一個PHs:trans-P4H。Sankyo公司的科學(xué)家使用Heliocerus oryzae和Acrocylindrium oryzae生產(chǎn)順式-4-羥基脯氨酸,最大產(chǎn)量為30mg/L[27]。Mori等[28-29]使用高靈敏度的HPLC分析篩選了超過3000種放線菌菌株的脯氨酸羥化酶活性,找到了8株具有trans-P4H活性的菌株,還鑒定了4種具有cis-P3H活性的菌株,之后,Mori等[29-34]還對這些基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增和克隆并構(gòu)建重組表達(dá)載體,以大腸埃希菌為宿主進(jìn)行異源表達(dá),為之后進(jìn)一步對這類酶的研究打下了基礎(chǔ)。2009年,Hara等[35]報道了從Sinorhizobium meliloti和Mesorhizobium loti的基因組中鑒定出的cis-P4H,并將這些cis-P4H分別命名為SmP4H和M1P4H,但是這些酶在催化L-Pip生成羥基哌啶甲酸的過程中會產(chǎn)生出兩個區(qū)域異構(gòu)體cis-5-hypip和cis-3-hypip,為了選擇性地生產(chǎn)cis-5-hypip,他們對SmP4H進(jìn)行了3輪定向進(jìn)化并成功地創(chuàng)建了cis-P4H三重突變體V97F/V95W/E114G,大大增加了對cis-5-hypip的區(qū)域選擇性(圖7),同時還提高了酶的催化活性,使cis-5-hypip的產(chǎn)量達(dá)到778mg/L[36]。Haibin等[37]同樣使用蛋白質(zhì)工程對SmP4H進(jìn)行改造,但即使改變了SmP4H的基因,也會生產(chǎn)出約9%的cis-3-hypip。Keisuke等[38]報道了來自于Swgniliparus rugosus的cis-P4H(SrP4H),其在將L-Pip羥基化生成cis-5-hypip的過程中,只生成2%的cis-3-hypip,但是這種酶的催化活性較低,產(chǎn)量只有50mg/L。Ryoma等[39]從Xwnorhabdus doucetiaeFRM16和Xwnorhabdus romaniistr.PR06-A中鑒定出兩種具有很高5位羥基化選擇性的PHs(XdP4H和XrP4H),其中XdP4H只生產(chǎn)出0.17%的cis-3-hypip,同樣XrP4H也只生產(chǎn)1.75%的cis-3-hypip,但是這兩種酶同樣存在催化活性低的問題。洪浩等[40]篩選了現(xiàn)有的PHs序列的同源序列,篩選出一個來自于Kordia jejudonensis的序列,具有較強(qiáng)的催化活性,他們對該羥化酶的氨基酸序列進(jìn)行了突變試驗,得到了多株具有更高5位選擇性的突變株,在催化過程中3位的異構(gòu)體只占到2%左右。

        3 小結(jié)

        圖6 PHs的類型[17]Fig.6 The different kind of PHs[17]

        圖7 PHs的定向進(jìn)化[36]Fig.7 Directed evolution of PHs[36]

        隨著細(xì)菌耐藥性的問題越來越嚴(yán)重,阿維巴坦作為一個能與其他抗生素聯(lián)用并提升療效的廣譜抑酶制劑,必將會受到廣泛應(yīng)用。而對于其合成路線中的關(guān)鍵中間體cis-5-hypip的研究也將越受關(guān)注。相對于化學(xué)合成復(fù)雜的手性拆分,導(dǎo)致產(chǎn)率較低,生物方法更加直接與高效,但是目前生物催化也存在一些問題,如SpLCD在催化底物轉(zhuǎn)化過程中酶活力不斷下降,并逐漸開始產(chǎn)生副產(chǎn)物P2C,而PHs在催化過程中的催化活性和選擇性也不是很好,這些都是在工業(yè)化生產(chǎn)之前需要解決的問題。無論是酶促合成或化學(xué)合成的方法,都期待更多、更高效、更利于工業(yè)化生產(chǎn)的cis-5-hypip合成路線的問世。

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