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        FAM64A在腎癌發(fā)生發(fā)展中的分子機制

        2019-10-16 06:41:42李維清毛龍毅周穎琛員海超桂耀庭李賢新歐龍華史本濤
        關(guān)鍵詞:水平研究

        張 洋,李維清,王 燕,3,4,毛龍毅,周穎琛,員海超,桂耀庭,3,李賢新,5,歐龍華,史本濤

        腎癌(renal cell carcinoma,RCC)是全球范圍內(nèi)十分常見的腫瘤之一,發(fā)病率占所有惡性腫瘤的3%~4%[1],約占腎臟惡性腫瘤的90%[2],每年超過20萬例新發(fā)病例及10萬例死亡病例,嚴重影響人類健康[3-4]。有研究[5]認為RCC的發(fā)生與遺傳因素及環(huán)境因素相關(guān),但是RCC發(fā)生發(fā)展的分子機制尚不清楚。人類FAM64A基因(磷脂酰肌醇結(jié)合網(wǎng)格蛋白相互作用有絲分裂調(diào)節(jié)因子,phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein interacting mitotic regulator,又名RCS1或CATS),最初研究[6]顯示FAM64A基因在小鼠胚胎時期的心肌細胞中高表達,并證明FAM64A作為有絲分裂的調(diào)節(jié)因子調(diào)節(jié)細胞周期;研究[7]表明FAM64A與細胞增殖密切相關(guān),可能作為一個新的細胞增殖標志物。僅有一篇文獻[8]報道FAM64A在多種腫瘤組織中高表達,但其作用機制尚不明確。對FAM64A在RCC發(fā)生發(fā)展的機制研究可為今后尋找RCC分子標志物和基因治療靶點提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 病例資料本研究選取的15 例RCC及其配對癌旁正常組織標本皆來源于選擇2013年1月~2015年12月收治于北京大學(xué)深圳醫(yī)院泌尿外科的RCC患者。收集的新鮮組織標本離體后立即加入RNA 穩(wěn)定劑以防止RNA降解,隨后用液氮冷凍運輸,并置于-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆?。所收集的標本均獲得患者知情同意,并經(jīng)過所在醫(yī)院和北京大學(xué)深圳醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會的批準。每例RCC組織及其配對癌旁正常組織標本均被術(shù)后病理證實,正常組織距離癌組織至少5 cm,患者臨床病理資料不完整。

        1.2 前期轉(zhuǎn)錄組測序和篩選本研究前期測序由深圳華大基因公司通過Illumina Hiseq 2000測序儀完成,采用第二代高通量測序的方法篩選在RCC組織及其癌旁正常組織中差異表達的 mRNA,因 FAM64A 在RCC組織中的表達量較低,且目前在泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤中未有相關(guān)研究報道,故選其作為研究對象。

        1.3 組織總RNA的提取從-80 ℃冰箱中隨機選取15例RCC及其配對癌旁正常組織,加入液氮進行碾磨,并根據(jù)產(chǎn)品說明書操作步驟加入TRIzol(購自美國Invitrogen公司)試劑提取研磨后組織中的總RNA,然后通過NanoDrop 2000c紫外分光光度計測定提取組織的總RNA濃度。

        1.4 RNA提取和RT-qPCR檢測采用TRIzol裂解細胞,通過氯仿抽提異丙醇沉淀總RNA后,使用Nanodrop-2000紫外分光光度計(美國Thermo Scientific公司)測定RNA濃度。按照 PrimeScriptTMRTreagent Kit with gDNA Eraser試劑盒說明書要求(日本TaKaRa公司),取1 μg RNA,去除基因組DNA后配制反轉(zhuǎn)錄體系,使用普通PCR儀完成反轉(zhuǎn)錄。以反轉(zhuǎn)錄后得到的cDNA為模板,按照SYBR ? Premix Ex TaqTM試劑盒(日本Takara公司)要求配制反應(yīng)體系,使用熒光定量PCR儀LC480(美國Roche公司)進行實時熒光定量PCR反應(yīng),檢測FAM64A在RCC組織和RCC細胞中的表達情況。FAM64A上游引物:5′-CCTGAGAGTGTCTTGGGAG-3′,下游引物:5′-ACAGTGGGTGAGTGACTCTG-3′;以 GAPDH 作為內(nèi)參進行標準化處理(上游引物:5′-CCACTCCTCCACCTTTGACG-3′,下游引物:5′-CTGGTGGTCCAGGGGTCTTA-3′)。

        1.5 細胞培養(yǎng)人RCC細胞系A(chǔ)CHN、人胚腎細胞HEK-293和人腎近曲小管上皮細胞系HK-2采用MEM培養(yǎng)基培養(yǎng),786-0、769-P采用1640培養(yǎng)基,Caki-1和Caki-2細胞采用McCoy′s 5A培養(yǎng)基,均加入10%的胎牛血清、100 U/ml的青鏈霉素、1×GlutaMAX,置于含有5%CO2的37 ℃恒溫飽和濕度培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)。待細胞密度達到70%~90%時,用含有EDTA的胰蛋白酶消化細胞進行傳代,每隔1~2 d換一次細胞培養(yǎng)基。

        1.6Westernblot使用10%SDS-聚丙烯酰胺凝膠置于TRIs-Glycine SDS 電泳緩沖液電泳分離(SDS-PAGE)。將分離后蛋白置于TRIs-Glycine轉(zhuǎn)膜緩沖液,使用0.2 mm PVDF(美國密理博公司)以330 mA電流轉(zhuǎn)膜60 min。轉(zhuǎn)膜后將PVDF膜置于5%脫脂牛奶中室溫下孵育1 h,然后用FAM64A一抗(美國賽默飛公司,貨號#PA5-62098,稀釋濃度0.4 μg/ml),細胞周期素B1(Cyclin B1)一抗(美國CST公司,貨號#12231,稀釋比例1 ∶1 000),β-tubulin一抗(英國Abcam公司,貨號ab52623,稀釋比例1 ∶5 000)于4 ℃孵育過夜。二抗(Anti-rabbit IgG,美國CST公司,貨號#7074,稀釋比例1 ∶1 000)室溫孵育1 h,發(fā)光液 (美國密理博公司)1 ∶1混勻。

        1.7 CCK-8檢測細胞增殖能力在96孔板中接種細胞至 70%~90%密度,轉(zhuǎn)染FAM64A-siRNA組和正常對照組、過表達FAM64A組和正常對照組,每孔加入細胞計數(shù)試劑(cell counting kit-8,CCK-8,日本東仁化學(xué)公司)反應(yīng)液10 μl,于細胞培養(yǎng)箱內(nèi)繼續(xù)孵育1 h,使用酶標儀測量450 nm處吸光度,設(shè)置 0、24、48、72 h 時間梯度分析不同時間點細胞數(shù)量,各實驗組設(shè)置5個復(fù)孔。

        1.8 細胞周期同步化(胸腺嘧啶核苷雙阻斷法)取相同生長基數(shù)的細胞培養(yǎng),將正常生長細胞的培養(yǎng)基換為含2 mmol/L胸腺嘧啶核苷的新鮮培養(yǎng)基,阻斷26 h后所有的細胞均停止在G1/S期,加入含1 mmol/L胞苷的新鮮培養(yǎng)基開始釋放,后每2 h收取一次細胞提取蛋白,得到的蛋白樣為細胞周期同步化后由G1/S期開始不同時間點的細胞。

        1.9 統(tǒng)計學(xué)處理RT-qPCR實驗中,采用GAPDH作為內(nèi)參,根據(jù) RT-qPCR反應(yīng)后得到的各樣本Ct 值,采用2-ΔΔCt法(ΔCt=Ct FAM64A-Ct GAPDH,ΔΔCt=ΔCt tumor-ΔCt normal )進行計算。采用Graphpad prism統(tǒng)計軟件進行分析,用t檢驗比較FAM64A在腎癌及癌旁組織中的表達量,四格法χ2檢驗比較FAM64A的表達量與臨床病理特征之間有無統(tǒng)計學(xué)意義,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 FAM64A在腎癌組織和腎癌細胞系中的高表達為驗證FAM64A在RCC組織中的表達是否與前期轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果相一致,通過RT-qPCR方法檢測FAM64A在15例RCC組織及其配對癌旁正常組織中FAM64A的表達水平。結(jié)果顯示:15例RCC組織中有12例FAM64A表達水平高于其配對癌旁組織,見圖1A;并且RCC組織中FAM64A的mRNA水平明顯高于其對應(yīng)的癌旁組織(P<0.05),見圖1B,這與前期測序結(jié)果一致。另外通過比較人腎近曲小管永生化細胞(HK-2)和人腎細胞腺癌細胞(ACHN)、人腎透明細胞癌皮膚轉(zhuǎn)移細胞(Caki-1)、人腎透明細胞癌細胞(Caki-2)、人腎透明細胞腺癌細胞(786-O)、人腎癌細胞(769-P)的FAM64A mRNA水平后發(fā)現(xiàn),腎癌細胞系中FAM64A mRNA表達水平均明顯高于HK-2,見圖1C,其中在RCC細胞系786-O和Caki-2中FAM64A的表達水平相對較高,其次是ACHN、769-P和Caki-1。上述結(jié)果提示FAM64A在RCC組織和細胞系中高表達可能與RCC的發(fā)生發(fā)展相關(guān)。

        2.2 不同分期RCC患者FAM64A的表達水平通過腫瘤基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫篩選510例RCC患者,將所有樣本按照RCC組織中FAM64A表達量的平均值為界分為低表達組和高表達組。按照50歲將所有樣本分為2組,同時與性別、TNM分期和愈后5年存活率列出四格表,進行χ2檢驗分析各組間FAM64A表達水平差異。結(jié)果顯示不同性別、TNM分期、愈后5年存活率之間的FAM64A表達水平差異均有統(tǒng)計學(xué)意義,但不同年齡段之間FAM64A的表達水平差異無統(tǒng)計學(xué)意義,見表1。510例RCC患者根據(jù)FAM64A表達量及愈后時間繪制生存分析,結(jié)果顯示差異有統(tǒng)計學(xué)意義,F(xiàn)AM64A高表達組RCC患者的預(yù)后生存率明顯降低。見圖2。

        圖1 FAM64A在腎癌組織和細胞系中的表達

        A、B :15例RCC及其配對的癌旁組織的FAM64A的相對表達量;C:FAM64A在RCC細胞系里的表達量;與對照組比較:*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001

        表1 FAM64A的表達水平與患者臨床病理特征之間相關(guān)性分析(n)

        圖2 FAM64A的表達量與愈后相關(guān)

        2.3 FAM64A可以促進RCC細胞的增殖在FAM64A相對高表達的786-O細胞中轉(zhuǎn)染FAM64A特異性小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)后,分別通過RT-qPCR及Western blot檢測786-O細胞中FAM64A mRNA和蛋白的表達變化(P<0.05),見圖3A;正常對照組(normal control,NC),siR1為FAM64A特異性干擾RNA1,siR2為FAM64A特異性干擾RNA2;與正常對照比較,轉(zhuǎn)染FAM64A-siRNA后786-O細胞中FAM64A表達水平明顯降低,說明FAM64A-siRNA可下調(diào)其表達,同時Cyclin B1的表達量下調(diào),見圖3B;CCK-8結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染FAM64A-siRNA后,786-O細胞的增殖能力受到明顯抑制(P<0.05),見圖3C。提示FAM64A可以促進RCC細胞的增殖。在FAM64A相對低表達的ACHN細胞中通過慢病毒感染穩(wěn)定過表達FAM64A后,通過RT-qPCR及Western blot檢測ACHN細胞中FAM64A和Cyclin B1的表達變化(P<0.05),見圖4A; 過表達組(over expression,OE),慢病毒轉(zhuǎn)染后FAM64A和Cyclin B1的表達水平明顯上調(diào),見圖4B。CCK-8結(jié)果顯示,過表達FAM64A后,ACHN細胞的增殖能力明顯增強(P<0.05)。見圖4C。

        2.4 FAM64A能加快細胞G2/M期進程在786-O細胞中通過FAM64A-siRNA敲低FAM64A后,利用細胞周期同步化技術(shù)使用過量的胸苷將細胞同步阻滯在G1期后,開始釋放,收集不同時間點的細胞提取蛋白,通過Werstern blot方法檢測細胞周期G2/M期檢測點標志性分子Cyclin B1水平變化,觀察FAM64A對細胞周期的影響。結(jié)果顯示,正常786-O細胞系中Cyclin B1開始升高的時間點為釋放后4 h,敲低FAM64A后,Cyclin B1升高時間推遲到6 h。該結(jié)果表明過表達FAM64A后得到Cyclin B1水平升高時間提前,可加快細胞通過G2/M期。見圖5。

        圖3 下調(diào)FAM64A后786-O細胞的增殖能力

        A:FAM64A敲低后mRNA表達水平;B:FAM64A敲低后的蛋白表達水平及Cyclin B1的蛋白表達水平;C:FAM64A敲低后細胞增殖能力;與NC組比較:*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001

        3 討論

        前期轉(zhuǎn)錄組測序首次發(fā)現(xiàn)FAM64A在RCC組織中高表達[9],隨后又在15例RCC與癌旁組織以及RCC細胞系中驗證了這一結(jié)果,發(fā)現(xiàn)FAM64A的確在RCC組織和細胞中高表達;同時通過TCGA數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)分析得出FAM64A的表達與RCC患者的性別、腫瘤分級以及預(yù)后相關(guān)。這提示FAM64A的異常表達可能與RCC的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。Hashimoto et al[6]報道FAM64A在小鼠胚胎時期的心肌細胞中高表達,并且FAM64A的高表達與心肌細胞的增殖密切相關(guān);但當心肌細胞接觸氧后FAM64A的表達量明顯下降。Hu et al研究[8]報道FAM64A在多種腫瘤如廣泛高表達,敲低FAM64A后可以抑制腫瘤細胞的生長,但其具體分子調(diào)控機制尚不明確。

        圖4 過表達FAM64A后ACHN細胞的增殖能力

        A: FAM64A過表達后mRNA表達水平;B:FAM64A過表達后蛋白表達水平及Cyclin B1的蛋白表達水平;C:FAM64A過表達后細胞增殖能力;與NC組比較:*P<0.05,**P<0.01,***P<0.001

        圖5 FAM64A能加快細胞進入M期

        Zhao et al[10]研究報道FAM64A作為原癌基因可通過加快細胞通過G2/M期以促進細胞周期,以及細胞增殖;FAM64A有可能作為一個新的細胞增殖標志物[7]。目前為止尚沒有FAM64A對RCC細胞發(fā)生發(fā)展的研究,為了進一步驗證FAM64A與RCC細胞增殖的相關(guān)性,選擇FAM64A相對高表達和低表達的RCC細胞系786-O和ACHN作為研究模型,同干擾RNA敲低FAM64A后786-O細胞增殖減慢,而過表達FAM64A后ACHN細胞增殖加快。Cyclin B1是細胞G2/M期的關(guān)鍵性標志物,Cyclin B1的高表達可加快細胞周期促進細胞增殖。在ACHN細胞中過表達FAM64A后發(fā)現(xiàn)Cyclin B1隨FAM64A表達量的增加而升高;在786-O細胞系中敲低FAM64A后Cyclin B1隨FAM64A表達量的減少而降低。為了進一步驗證FAM64A和Cyclin B1的關(guān)系,通過細胞周期同步化實驗發(fā)現(xiàn)FAM64A低表達可以推遲Cyclin B1升高的時間點,進而影響RCC細胞G2期向M期的轉(zhuǎn)換。FAM64A可以通過調(diào)控Cyclin B1的表達而影響RCC的細胞周期和增殖。通過對FAM64A腎癌細胞系中的功能研究,確定FAM64A作為原癌基因通過加速RCC細胞通過G2/M期以加速細胞增殖,這提示FAM64A與RCC細胞的增殖密切相關(guān),這為今后靶向治療提供一定的支持。但FAM64A作用的具體分子機制尚不清楚。Archangelo et al[11]研究表明FAM64A可作為一種激酶的底物被磷酸化,并可與該激酶共同定位在細胞核中進而促進細胞增殖?,F(xiàn)階段研究[6-8,10-11]表明FAM64A在細胞內(nèi)擔當多種功能,但是具體的分子機制和信號通路尚不清楚。這需要后期進一步工作來確定FAM64A的具體分子機制。

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