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        癌癥易感性基因發(fā)現(xiàn)和多元性理論的研究進(jìn)展

        2019-09-06 00:32:32高靚權(quán)磊
        智慧健康 2019年22期
        關(guān)鍵詞:多態(tài)易感性大腸癌

        高靚,權(quán)磊

        (1.天津體育學(xué)院,運(yùn)動(dòng)與健康研究院,天津 300381;2.天津市和睦家醫(yī)院 全科門診,天津 300221)

        0 引言

        癌癥是嚴(yán)重危害人類健康的世界性問(wèn)題。預(yù)測(cè)表明全球癌癥發(fā)病將呈現(xiàn)迅猛態(tài)勢(shì)增長(zhǎng),2025 年遞增至1900 萬(wàn)人,而2035 年將達(dá)到2400 萬(wàn)人。加快實(shí)現(xiàn)癌癥病人的危險(xiǎn)性預(yù)測(cè)以及個(gè)體化預(yù)防和治療,具有重大的科學(xué)意義和臨床價(jià)值[1]。

        1 癌癥易感性基因

        近年來(lái),越來(lái)越多的研究表明非家族性癌癥在受遺傳因素的調(diào)控。與家族性癌癥不同,非家族性癌癥是一種多基因現(xiàn)象,因而并不遵循孟德爾遺傳定律。雖然單個(gè)易感性基因的作用較弱,但由于數(shù)量眾多并且基因多態(tài)在人群中分布廣泛,多個(gè)易感性基因可協(xié)同對(duì)癌癥危險(xiǎn)性產(chǎn)生巨大的影響[2]。在英國(guó)的一項(xiàng)研究中所報(bào)道的,人群中易感性最強(qiáng)的20%女性與易感性最弱的20%女性相比,患乳腺癌的危險(xiǎn)性高出了近40 倍[3]。顯然,對(duì)高危人群進(jìn)行有針對(duì)性地監(jiān)測(cè)和預(yù)防,對(duì)于有效的控制癌癥發(fā)病具有重要意義。

        2 全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS)

        通過(guò)全基因組拷問(wèn)的方式,GWAS 對(duì)常見的DNA變異在癌癥患者和相匹配的健康人群中的分布頻數(shù)進(jìn)行比較,以發(fā)現(xiàn)與癌癥危險(xiǎn)性相關(guān)的遺傳位點(diǎn)。許多相鄰的DNA片段彼此連鎖,基于這種連鎖不平衡原理,選取約30 萬(wàn)個(gè)標(biāo)簽單核苷酸基因多態(tài)(SNP)即可有效地覆蓋整個(gè)基因組[4]。目前,全基因組關(guān)聯(lián)研究已經(jīng)對(duì)所有常見癌癥進(jìn)行了分析,并發(fā)現(xiàn)幾百個(gè)不同類型癌癥的易感性位點(diǎn)。在大腸癌、乳腺癌和前列腺癌中所發(fā)現(xiàn)的多個(gè)易感性位點(diǎn)的聯(lián)合作用,已經(jīng)展示了一定可用于病人風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)判別的潛力[5]。

        然而,目前已知的易感性位點(diǎn)尚不能精確的預(yù)測(cè)個(gè)體的癌癥危險(xiǎn)性,而新的易感性基因的發(fā)現(xiàn)也遇到了瓶頸,這與全基因組關(guān)聯(lián)研究本身的一些局限有關(guān)[6]。首先,GWAS 通常采用雙階段研究的方法,這種研究方式在降低基因型鑒定成本的同時(shí),必然會(huì)忽略一部分潛在重要的SNP 的信號(hào)。其次,隨著國(guó)際GWAS 聯(lián)盟組織的成立,許多研究開始使用純粹的薈萃分析來(lái)提升樣本數(shù)量和統(tǒng)計(jì)學(xué)威力,整合不同平臺(tái)產(chǎn)生的基因型數(shù)據(jù)可能導(dǎo)致錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)。第三,目前所發(fā)現(xiàn)的大部分影響癌癥危險(xiǎn)性的SNP 并非真正改變蛋白質(zhì)序列的功能性遺傳變異,而是與之相連鎖的標(biāo)簽多態(tài)。最后,雖然GWAS 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)會(huì)盡量對(duì)癌癥患者和健康人群進(jìn)行年齡、性別和生活習(xí)慣等方面的匹配,并不能精確地控制環(huán)境因素的影響,并且GWAS 的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)很難探測(cè)到罕見基因多態(tài)、結(jié)構(gòu)性基因多態(tài)、或是對(duì)基因與基因間的相互作用。

        3 動(dòng)物模型與癌癥易感性研究

        小鼠與人類基因組高度同源,被廣泛應(yīng)用于解讀人類基因功能、疾病機(jī)理和藥物開發(fā)等方面的研究[7]。其優(yōu)勢(shì)主要在于小鼠的遺傳結(jié)構(gòu)相對(duì)簡(jiǎn)單,實(shí)驗(yàn)過(guò)程中環(huán)境因素可控,可以根據(jù)需要增加樣本數(shù)量而提供較強(qiáng)的統(tǒng)計(jì)學(xué)威力。在小鼠中進(jìn)行遺傳定位一般包括四個(gè)步驟(圖1),即選取抵抗性和易感性的鼠種進(jìn)行雜交;將F1 代相互雜交,產(chǎn)生基因分離;在上百只F2 代小鼠中誘發(fā)腫瘤并行表型鑒定(腫瘤數(shù)量、腫瘤體積等),使用遺傳標(biāo)記對(duì)每只F2 小鼠進(jìn)行基因型鑒定;通過(guò)對(duì)表型和基因型的連鎖研究定位癌癥易感性位點(diǎn),并進(jìn)行后期的候選基因發(fā)現(xiàn)。

        圖1 小鼠F2 遺傳定位的基本原理

        利用小鼠模型發(fā)現(xiàn)各個(gè)器官中的癌癥易感性基因,進(jìn)而驗(yàn)證其人類同源基因?qū)Π┌Y危險(xiǎn)性的影響,已有被驗(yàn)證可行。例如,Ptprj 基因是小鼠大腸癌易感性位點(diǎn)Scc1 的候選基因,后被確認(rèn)同樣影響人類大腸癌易感性。有趣的是,后續(xù)研究發(fā)現(xiàn)Ptprj 的人類同源基因?qū)θ祟惾橄侔┑囊赘行砸灿酗@著影響[8]。這些現(xiàn)象支持了癌癥易感性基因多元性(Pleiotropy)理論。

        4 癌癥易感性基因的多元性

        迄今為止,癌癥易感性研究多在單一器官中進(jìn)行。目前國(guó)內(nèi)外關(guān)于多器官癌癥易感性的研究?jī)H限于個(gè)例性的報(bào)道。例如,位于8q24.21 位點(diǎn)的幾個(gè)相互連鎖的SNP 可能通過(guò)調(diào)節(jié)MYC 基因的表達(dá)來(lái)影響前列腺癌和大腸癌等多種癌癥的易感性。以5p13.3(TERT)為代表的一些與端粒功能相關(guān)的位點(diǎn)同時(shí)影響超過(guò)10 種不同癌癥的危險(xiǎn)性[9]。以肺癌和大腸癌為例,我們的前期研究證明這兩種癌癥的易感性具有顯著的相關(guān)性。我們將目前在人類、小鼠和大鼠中全基因組關(guān)聯(lián)研究或連鎖研究中所發(fā)現(xiàn)的全部159 個(gè)肺癌和大腸癌易感性基因映射到小鼠染色體上。只有16 個(gè)基因單獨(dú)分布,而其他90%的基因組成了41個(gè)短基因簇,其中36 個(gè)基因簇同時(shí)包含了肺癌和大腸癌易感性基因。這些數(shù)據(jù)一方面說(shuō)明癌癥易感性基因在人類、小鼠和大鼠中高度保守,證明了這些基因的穩(wěn)定性和強(qiáng)效性;另一方面揭示了肺癌和大腸癌易感性基因之間高度顯著的連鎖關(guān)系,可能代表相同或功能及物理位置高度相近的基因[10]。

        綜上所述,癌癥的全基因組聯(lián)鎖研究革新性地?cái)U(kuò)展了我們所知的癌癥易感性基因和相關(guān)的分子作用機(jī)理與通路。利用動(dòng)物模型作為補(bǔ)充,可以發(fā)現(xiàn)更多的易感性基因。我們和其他實(shí)驗(yàn)室的證據(jù)均支持癌癥基因多元性的存在,未來(lái)可能產(chǎn)生單一器官和多器官相結(jié)合的全新的癌癥研究模式。

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