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        RAD23B基因rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與含鉑類方案治療非小細(xì)胞肺癌療效和血液學(xué)毒性的關(guān)系

        2019-06-18 11:27:40謝曉楠文貽勇凌瓊穎黃文鋒覃芳卉王洪學(xué)周文獻(xiàn)陸永奎謝裕安謝偉敏
        中國癌癥防治雜志 2019年2期
        關(guān)鍵詞:血液學(xué)多態(tài)性基因型

        謝曉楠 文貽勇 凌瓊穎 黃文鋒 覃芳卉 王洪學(xué) 周文獻(xiàn) 陸永奎 謝裕安 謝偉敏

        對于無法接受酪氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitors,TKIs)治療或TKIs治療失敗后的進(jìn)展期非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者,含鉑類聯(lián)合方案是有效的治療措施,能顯著改善患者的生存質(zhì)量和預(yù)后[1-3],而DNA修復(fù)通路相關(guān)基因的表達(dá)狀況或遺傳變異被認(rèn)為是影響含鉑類方案療效的重要因素[4-6]。本課題組在臨床實(shí)踐中發(fā)現(xiàn),NSCLC患者接受含鉑類方案化療后其外周血中RAD23B mRNA的表達(dá)水平可能與其對鉑類藥物的敏感性有關(guān)。RAD23B基因是DNA修復(fù)通路的關(guān)鍵點(diǎn),可影響腫瘤細(xì)胞對順鉑等藥物的敏感性[7-8]。研究顯示,RAD23B基因的單核苷酸多態(tài)性(singlenucleotide polymorphism,SNP)與肝癌等多種腫瘤的遺傳易感性有關(guān)[9-11],但其與含鉑類方案治療NSCLC的療效及不良反應(yīng)的關(guān)系尚不明確。為此,本研究探討RAD23B基因rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與含鉑類方案一線治療晚期NSCLC患者的療效及血液學(xué)毒性的關(guān)系,為闡明兩者關(guān)系提供依據(jù)。

        1 資料和方法

        1.1 一般資料

        從本課題組前期建立的肺癌患者臨床資料庫及外周血樣本庫中選擇2005年9月—2009年8月在廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院治療的NSCLC患者。納入標(biāo)準(zhǔn):⑴經(jīng)病理組織學(xué)或細(xì)胞學(xué)確診為NSCLC;⑵年齡18~70歲,美國東部腫瘤協(xié)作組(eastern cooperative oncology group,ECOG)評分 0~2分,預(yù)計生存期≥3個月;⑶TNM分期Ⅲ~Ⅳ期;⑷有化療適應(yīng)證且接受含順鉑(Cisplatin,DDP)或卡鉑(Carboplatin,CBP)方案一線化療,包括無表皮生長因子受體(epithelial growth factor receptor,EGFR)突變的初治患者,或有突變但接受TKIs治療后進(jìn)展且未接受過化療者,或既往手術(shù)和輔助治療后出現(xiàn)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移者(無進(jìn)展生存期≥1年);⑸入組時血常規(guī)、肝腎功能和心電圖檢查等指標(biāo)均基本正常,無化療禁忌證;⑹至少有1個經(jīng)CT等影像學(xué)檢查確定的可測量病灶;⑺自愿接受治療并簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):⑴有癥狀的中樞神經(jīng)系統(tǒng)轉(zhuǎn)移;⑵心、肝、肺、腎等重要器官功能不全,無化療適應(yīng)證;⑶無法評價療效和血液學(xué)毒性者。本研究已獲得廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)。

        1.2 治療方案

        入組患者接受的含鉑類方案包括多西他賽聯(lián)合鉑類(DC方案)、培美曲塞聯(lián)合鉑類(PC方案)、吉西他濱聯(lián)合鉑類(GP方案)或長春瑞濱聯(lián)合鉑類(NP方案)等。鉑類藥物使用方法:DDP 25 mg/m2,d1~d3;或CBP曲線下面積(AUC)=5,d1。多西他賽、培美曲塞、吉西他濱等其他化療藥物的劑量和使用方法按常規(guī)。各化療方案均以21 d為1個周期。除非出現(xiàn)疾病進(jìn)展或患者不能耐受,否則至少化療2個周期(最多6個周期)?;熎陂g按常規(guī)給予5-羥色胺3受體(5-HT3R)拮抗劑聯(lián)合地塞米松止吐,注意保護(hù)心、肝、腎功能,必要時使用粒細(xì)胞集落刺激因子防治粒細(xì)胞減少癥等。

        1.3 總DNA提取

        所有入組患者均在接受含鉑類方案化療前抽取外周血2~5 mL,用乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝。采用基因組DNA提取試劑盒按說明抽提總DNA,紫外分光光度儀檢測DNA濃度及純度,將符合要求的基因組DNA在-80℃冰箱凍存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 PCR及基因型檢測

        通過My Sequenom網(wǎng)頁設(shè)計rs10759225位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增引物,序列:上游引物為5'-GAGGGGTTTTGCGCACACG-3';下游引物為 5'-TTTCTCACATTCC-ACTCATTCCTCA-3',引物由上海生工生物有限公司合成。PCR反應(yīng)體系為20μL,其中含樣本DNA和多重PCR引物各1μL,其余同常規(guī)PCR反應(yīng)。PCR擴(kuò)增條件:95 ℃ 預(yù)變性2 min,94 ℃變性20 s,65 ℃退火40 s,72℃ 延伸90 s,共36個循環(huán);72℃延伸2 min。擴(kuò)增片段長度為400 bp。PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后,進(jìn)行連接反應(yīng)(94℃ 1 min,56℃ 4 min,38個循環(huán))。采用改良多重高溫連接酶檢測反應(yīng)技術(shù)(上海天昊生物科技有限公司遺傳分析中心)進(jìn)行基因分型:取連接產(chǎn)物0.5μL,與Liz500 SIZE STANDARD 0.5 μL和Hi-Di 9 μL混勻,95℃變性5 min,然后使用 ABI3730XL測序儀檢測,采用 GeneMapper 4.1(Applied Biosystems,USA)對收集的原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。

        1.5 療效和不良反應(yīng)評價

        每2個周期采用實(shí)體瘤療效評價標(biāo)準(zhǔn)(response evaluation criteria in solid tumors,RECIST)1.1 版進(jìn)行療效評價[12],分為完全緩解(complete response,CR)、部分緩解(partial response,PR)、疾病穩(wěn)定(stable disease,SD)和疾病進(jìn)展(progressive disease,PD)。有效率(overall response rate,ORR)=(CR+PR)/總例數(shù)×100%,疾病控制率(disease control rate,DCR)=(CR+PR+SD)/總例數(shù)×100%。將CR和PR定義為化療有效,將SD和PD定義為化療無效。無進(jìn)展生存期(progress-free survival,PFS)定義為從含鉑類方案化療開始到腫瘤出現(xiàn)進(jìn)展的時間。每個周期采用通用不良事件術(shù)語標(biāo)準(zhǔn)4.0版(CTCAE 4.0)[13]評價不良反應(yīng)。

        1.6 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行分析。采用χ2檢驗(yàn)比較不同基因型病例組之間ORR和血液學(xué)毒性發(fā)生率的差異;采用比值比(OR)及其95%可信區(qū)間(CI)描述基因型與ORR及血液學(xué)毒性的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度,以非條件Logistic回歸模型計算OR和95%CI,并校正潛在混淆因素:性別、年齡、吸煙狀況、ECOG評分(0~1分與2分)、TNM分期(Ⅲ期與Ⅳ期)、腫瘤組織學(xué)類型(鱗癌與非鱗癌)、放療史、輔助化療史、化療方案以及TKIs治療史。通過Kaplan-Meier繪制曲線,采用Log-rank檢驗(yàn)比較不同基因型患者PFS的差異。采用雙側(cè)概率檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 入組患者的臨床資料

        共150例NSCLC患者符合入組條件。中位年齡55歲(22~70歲);男性 106例,女性 44例;既往使用TKIs治療后進(jìn)展12例。其余詳細(xì)資料見表1。

        表1 150例非小細(xì)胞肺癌患者的臨床資料Tab.1 Clinical data of 150 patients with non-small cell lung cancer

        2.2 基因分型結(jié)果

        所有樣本均分型成功,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P=0.276)。各基因型的頻率:G/G基因型 52.0%(78/150),G/A 基因型 40.0%(60/150),A/A基因型8.0%(12/150);A等位基因型(G/A和A/A基因型)48.0%(72/150)。

        2.3 療效

        全部患者均完成至少2個周期化療,中位化療周期數(shù)為3個(2~6個周期),均可評估客觀療效,其中獲CR 3例(2.0%)、PR 40例(26.7%)、SD 66例(44.0%)、PD41例(27.3%),ORR為43例(28.7%)。Ⅲ期患者ORR為 35.7%(20/56),高于Ⅳ期患者的 24.5%(23/94),但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=2.171,P=0.141)。使用GP方案化療的患者占54.7%,但其ORR與其他方案組比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。組織學(xué)類型為非鱗癌、ECOG評分0~1分、有TKIs治療史患者的ORR均高于對應(yīng)亞組,但差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。

        2.4 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療療效的關(guān)系

        以GG基因型為參照,A等位基因型在治療有效組中的頻率顯著高于無效組,攜帶A等位基因型患者對含鉑類方案的敏感性是攜帶G/G基因型患者的1.78 倍(OR校正=1.780,95%CI:1.110~2.884,P=0.042),見表2。

        表2 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療療效的關(guān)系[n(%)] Tab.2 Relationship between rs10759225 polymorphism and efficacy of chemotherapy[n(%)]

        2.5 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與預(yù)后的關(guān)系

        隨訪至2016年12月31日,全組患者均可評價PFS,完成PFS隨訪后有35例失訪,由于失訪率過高,無法評價全組總生存期(overall survival,OS)。全組中位無進(jìn)展生存期(mPFS)為 5.6個月(95%CI:5.0~6.2個月)。G/G基因型患者mPFS為5.0個月(95%CI:3.3~6.7個月),G/A 基因型為 5.6個月(95%CI:3.6~7.6個月),A/A 基因型為 7.5個月(95%CI:4.7~10.3個月),A等位基因型為6.0個月(95%CI:5.2~6.8個月),各組PFS差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.537)。其中,A/A基因型患者的mPFS較G/G基因型患者延長2.5個月,但差異亦無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.314),見圖1。

        2.6 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療相關(guān)血液學(xué)毒性的關(guān)系

        2.6.1 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與白細(xì)胞減少的關(guān)系 所有入組患者均可評價血液學(xué)毒性。白細(xì)胞減少組和未發(fā)生白細(xì)胞減少組中,各基因型頻率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表3。但以G/G基因型為參照,A/A基因型在0~Ⅱ度白細(xì)胞減少組中的頻率顯著低于Ⅲ/Ⅳ度白細(xì)胞減少組(OR校正=0.468,95%CI:0.204~0.711,P=0.008),提示攜帶A/A基因型患者在化療后發(fā)生中重度白細(xì)胞減少的風(fēng)險顯著高于攜帶G/G基因型患者,見表4。

        圖1 各基因型患者的無進(jìn)展生存曲線Fig.1 Progression-free survival curve of patients in each genotype group

        表3 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后白細(xì)胞減少的關(guān)系[n(%)] Tab.3 Relationship between rs10759225 polymorphism and leukopenia[n(%)]

        表4 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后白細(xì)胞減少程度的關(guān)系[n(%)] Tab.4 Relationshipbetween rs10759225polymorphism and degree of leukopenia[n(%)]

        2.6.2 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與中性粒細(xì)胞減少的關(guān)系 在發(fā)生中性粒細(xì)胞減少組和未發(fā)生中性粒細(xì)胞減少組中,各基因型的頻率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表5。但以G/G基因型為參照,A等位基因型的頻率在0~Ⅱ度中性粒細(xì)胞減少組中顯著低于Ⅲ/Ⅳ度中性粒細(xì)胞減少組(OR校正=0.502,95%CI:0.155~0.887,P=0.022),提示攜帶A等位基因型患者在化療后發(fā)生中重度中性粒細(xì)胞減少的風(fēng)險較攜帶G/G基因型患者顯著增高,見表6。

        表5 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后出現(xiàn)中性粒細(xì)胞減少的關(guān)系[n(%)] Tab.5 Relationship between rs10759225 polymorphism and neutropenia[n(%)]

        表6 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后中性粒細(xì)胞減少程度的關(guān)系[n(%)] Tab.6 Relationship between rs10759225polymorphism and degree of neutropenia[n(%)]

        2.6.3 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與血小板減少的關(guān)系全組無患者出現(xiàn)Ⅳ度血小板減少。分析顯示,與攜帶G/G基因型患者比較,攜帶A等位基因型患者化療后發(fā)生血小板減少的風(fēng)險顯著增高(OR校正=0.494,95%CI:0.101~0.833,P=0.047),見表 7。

        表 7 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后中性粒細(xì)胞減少的關(guān)系[n(%)] Tab.7 Relationship between rs10759225 polymorphism and neutropenia[n(%)]

        2.6.4 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與貧血的關(guān)系 全組無患者出現(xiàn)Ⅳ度貧血。各基因型的頻率在發(fā)生貧血組中與未發(fā)生貧血組的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表8。但與攜帶G/G基因型患者比較,攜帶G/A基因型患者在化療后發(fā)生Ⅱ/Ⅲ度貧血的風(fēng)險顯著增高(OR校正=0.504,95%CI:0.213~0.890,P=0.047),見表9。

        表8 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后貧血的關(guān)系[n(%)] Tab.8 Relationship between rs10759225 polymorphism and anemia[n(%)]

        表9 rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與化療后貧血程度的關(guān)系[n(%)] Tab.9 Relationship between rs10759225 polymorphism and degree of anemia[n(%)]

        3 討論

        探索將DNA修復(fù)基因或其遺傳變異位點(diǎn)作為預(yù)測化療等治療手段療效和不良反應(yīng)的分子生物標(biāo)志物,以指導(dǎo)臨床實(shí)施精準(zhǔn)治療是NSCLC研究領(lǐng)域的重要內(nèi)容[5,14-15]。RAD23B 基因定位于人類染色體9q31.2,是核苷酸切除修復(fù)通路修復(fù)順鉑等大分子引起DNA雙鏈損傷的關(guān)鍵因子[8]。當(dāng)DNA損傷發(fā)生后,RAD23B蛋白與著色性干皮病基因組C(XPC)蛋白結(jié)合形成的XPC-RAD23B復(fù)合體可最先結(jié)合到損傷部位,識別損傷片段和啟動修復(fù)過程[7,16-17]。RAD23B基因遺傳變異與腫瘤的相關(guān)研究已有報道,涉及的多態(tài)性位點(diǎn)包括rs1805329(又稱Ala249Val)和rs10739234等,其中有關(guān)rs1805329位點(diǎn)的研究最多,其他位點(diǎn)的研究少見。研究表明,rs1805329位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌[9]、原發(fā)性肝癌[10]及非霍奇金淋巴瘤[11]的遺傳易感性有關(guān),與攜帶TT基因型個體比較,攜帶CC基因型的個體罹患癌癥的風(fēng)險顯著增高。一項(xiàng)研究[18]在接受含DDP方案一線治療的NSCLC患者中,分析了rs1805329等位點(diǎn)多態(tài)性與預(yù)后的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)攜帶rs1805329位點(diǎn)TT基因型患者的死亡風(fēng)險是攜帶CC基因型患者的2.08倍。但另一項(xiàng)在NSCLC患者中開展的相似研究(接受含鉑方案治療)卻未發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)多態(tài)性與NSCLC患者的生存期有關(guān)[19]。一些研究還探討了rs1805329位點(diǎn)多態(tài)性與食管癌[20]、直腸癌[21]同期放化療引起的急性毒性反應(yīng)的關(guān)系,但均未發(fā)現(xiàn)存在相關(guān)性。關(guān)于RAD23B基因的其他位點(diǎn),僅檢索到一項(xiàng)研究報道了rs10739234位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險相關(guān)[9]。

        本研究分析的rs10759225位點(diǎn)位于RAD23B基因的內(nèi)含子區(qū),其多態(tài)性表現(xiàn)為腺嘌呤(A)被鳥嘌呤(G)替代。此位點(diǎn)發(fā)生突變對RAD23B功能的影響目前尚不明確,其與腫瘤的遺傳易感性、抗腫瘤治療的療效、不良反應(yīng)及患者預(yù)后等關(guān)系亦未見報道。本研究結(jié)果顯示,rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與含鉑類方案治療NSCLC的療效顯著相關(guān),攜帶A等位基因型的患者治療有效(CR或PR)的概率顯著高于攜帶G/G基因型的患者。但未發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)多態(tài)性與患者的PFS有關(guān),可能原因?yàn)槠渌麧撛诘幕祀s因素影響了此位點(diǎn)的遺傳變異與患者預(yù)后的關(guān)系。而在RAD23B基因多態(tài)性與含鉑類方案治療NSCLC患者的預(yù)后關(guān)系方面,現(xiàn)有研究的報道結(jié)果也不一致[18-19]。因此,RAD23B基因的rs10759225等位點(diǎn)的遺傳變異對NSCLC患者生存期的影響尚待進(jìn)一步研究。

        本研究還發(fā)現(xiàn),以G/G基因型為參照,含A等位(A/A和/或G/A)的基因型與含鉑類方案化療引起的血液學(xué)毒性密切相關(guān)。其中,A/A基因型與患者化療后發(fā)生Ⅲ/Ⅳ度白細(xì)胞減少的風(fēng)險相關(guān),A等位基因型則與患者發(fā)生Ⅲ/Ⅳ度中性粒細(xì)胞減少和≥Ⅰ度血小板減少的風(fēng)險相關(guān),而G/A基因型與發(fā)生Ⅱ/Ⅲ度貧血的風(fēng)險有關(guān)。為了消除潛在混淆因素對探討rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與相關(guān)指標(biāo)關(guān)系的影響,本研究在關(guān)聯(lián)分析中對性別、年齡、TNM分期和化療方案等多個因素進(jìn)行了校正。結(jié)果表明,此位點(diǎn)可作為預(yù)測NSCLC患者對含鉑類方案的敏感性及發(fā)生骨髓抑制風(fēng)險的遺傳標(biāo)志物。由于rs10759225位點(diǎn)位于RAD23B基因的內(nèi)含子區(qū),其發(fā)生的堿基突變并不影響基因編碼的mRNA和蛋白質(zhì),因此該位點(diǎn)影響化療療效及相關(guān)血液學(xué)毒性的作用機(jī)制尚待進(jìn)一步研究。

        綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)RAD23B基因rs10759225位點(diǎn)多態(tài)性與含鉑類方案一線治療NSCLC的客觀緩解率及血液學(xué)毒性的發(fā)生風(fēng)險有關(guān),此位點(diǎn)可能成為有效的療效預(yù)測指標(biāo),為NSCLC患者的個體化治療提供依據(jù)。本研究入組的患者均在我院接受規(guī)范化診治,療效和不良反應(yīng)評估的一致性良好,但部分患者化療無效或出現(xiàn)疾病進(jìn)展后,由于經(jīng)濟(jì)等原因終止后續(xù)治療,造成失訪率偏高,無法分析此位點(diǎn)的遺傳變異與患者總生存期的關(guān)系,有關(guān)方面有待進(jìn)一步研究。

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