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        雙價RNA 干擾載體的構(gòu)建及dsRNA 體外飼喂褐飛虱的研究

        2019-06-16 09:23:12王愛娜
        陜西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年12期
        關(guān)鍵詞:飛虱亞基載體

        楊 穎,王愛娜

        (渭南職業(yè)技術(shù)學(xué)院,陜西 渭南 714026)

        褐飛虱(Nilaparvata lugens Stal),半翅目飛虱科屬,是農(nóng)作物水稻最具破壞性的農(nóng)業(yè)害蟲,主要通過直接吸食水稻韌皮部汁液傳播水稻草狀矮化病毒[1],目前防控飛虱的主要措施仍以化學(xué)防治為主[2],盡管利用殺蟲劑較為便捷,但也存在廣泛使用造成環(huán)境污染,飛虱抗藥性的產(chǎn)生,由于其非選擇性的滅殺對一些有益生物也是有害的,例如傳粉昆蟲和自然天敵[3],而不加選擇性的使用殺蟲劑尤其是在作物早期,也會引起刺吸式害蟲的大爆發(fā)[4]。因此,選擇抗性靶基因,采取新的防治手段,對褐飛虱治理具有重要意義。

        RNA 干擾(RNA interferenee,RNAi)作為一種重要基因沉默機(jī)制,可通過dsRNA 的介導(dǎo),高效特異性降解目的基因的mRNA,抑制(Knockdown)目的基因的表達(dá)。目前利用RNAi 技術(shù)對于昆蟲的研究,主要利用注射或飼喂的方法,將dsRNA 或siRNA 導(dǎo)入昆蟲細(xì)胞或活體昆蟲體內(nèi)從而實(shí)施干擾[5],通過檢測靶基因的沉默效率或相應(yīng)生物表型分析從而研究相應(yīng)基因功能,為進(jìn)一步篩選出可有效防控害蟲的基因資源提供了保障。孟山都公司Baum 等研究發(fā)現(xiàn),利用表達(dá)玉米根葉甲VATPase 基因dsRNA 的轉(zhuǎn)基因玉米,飼喂玉米根葉甲幼蟲,幼蟲出現(xiàn)發(fā)育受阻或死亡現(xiàn)象[6]。

        V-ATPases 是一類ATP 驅(qū)動的質(zhì)子泵,存在于真核生物細(xì)胞質(zhì)膜和細(xì)胞器內(nèi)膜上,通過ATP水解產(chǎn)生的能量,將H +泵出包膜形成跨膜質(zhì)子梯度,維持細(xì)胞正常生理活動,在胞內(nèi)外pH 環(huán)境,離子和代謝物的轉(zhuǎn)運(yùn)中發(fā)揮著重要作用[7,8]。此外V-ATPases 是由多個亞基構(gòu)成的功能性復(fù)合物,該復(fù)合體包括V1 和V0 兩大結(jié)構(gòu)域,位于外周的V1 由8 個亞基組成,負(fù)責(zé)催化ATP 水解,跨膜的V0 結(jié)構(gòu)域由6 個亞基組成,負(fù)責(zé)質(zhì)子轉(zhuǎn)移[9,10]。為利用RNAi 技術(shù)進(jìn)行褐飛虱防治,本研究將褐飛虱V-ATPase D 亞基基因片段和VATPase H 亞基基因片段進(jìn)行融合,獲得約800 bp的V-ATPase D-H (VAD-H)融合基因,其以反向重復(fù)方式連入經(jīng)改造含有Pdk 內(nèi)含子的中間載體pUCm-T。通過重組PCR 將上述兩種基因融合后構(gòu)建具有反向重復(fù)發(fā)夾結(jié)構(gòu)的RNAi 表達(dá)載體,旨在為利用RNAi 技術(shù)培育雙價轉(zhuǎn)基因抗蟲水稻新種質(zhì)提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 材料 本試驗(yàn)飼養(yǎng)飛虱所用水稻材料為日本晴水稻,褐飛虱由本校植物抗逆研究中心提供,在光照培養(yǎng)箱內(nèi)(溫度25 ±2 ℃,相對濕度70%~80%,15 h 光照/9 h 黑暗)利用水稻幼苗進(jìn)行飼養(yǎng)繁育。后續(xù)生測實(shí)驗(yàn)中,選取同齡期幼蟲并分成3 組每組20 只左右。

        1.1.2 主要試劑 試驗(yàn)所用大腸桿菌(Escherichia.coli)菌株DH5α,載體pUCm-T 均由本實(shí)驗(yàn)室保存和提供。引物由擎科生物合成,RNA 抽提試劑Trizol 購自Invitrogen 公司,MEGAscriptTM T7 Transcription Kit (ambion,AM1334)轉(zhuǎn)錄試劑盒購自ThermoFisher scientific 公司,Ex Taq、內(nèi)切酶和T4 ligase 購自Takara 公司,cDNA 合成和qPCR 試劑盒均購自全式金公司。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 V-ATPase D-V-ATPase H(VAD-H)融合基因的獲取 利用半翅目點(diǎn)蜂緣蝽(Riptortus pedestris)的vacuolar H+ATPase subunit 氨基酸序列(Genebank:BAN20615),作為探針在褐飛虱數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行tBlastn 檢索,發(fā)現(xiàn)褐飛虱的V-ATPase H 亞基基因序列(GenBank:XM _022328393.1),根據(jù)該基因不同轉(zhuǎn)錄本選其共有序列,以及褐飛虱V-ATPase D (GenBank:XM_022330230)基因的保守序列分別設(shè)計特異性擴(kuò)增引物(表1),采用重組PCR 擴(kuò)增獲取V-ATPase D-V-ATPase H(簡稱VAD-H)的融合基因。以3 齡飛虱若蟲cDNA 為模板,VAD-H-α-F1 和VAD-H-α-R1 為引物,擴(kuò)增獲取V-ATPase D 亞基的基因片段;以VAD-H-F2 和VAD-H-R2 為引物,擴(kuò)增獲取V-ATPase H 亞基基因片段,再以PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物V-ATPase D 和V-ATPase H 亞基基因?yàn)槟0澹琕AD-H-F1 和VAD-H-R2 為引物進(jìn)行重組PCR,擴(kuò)增VADH 融合基因。

        圖1 hp(VAD-H)結(jié)構(gòu)示意

        PCR 反應(yīng)體系:2 ×Prime STAR Buffer (Mg2+Plus)12.5 μl,10 mmol/L dNTP 1 μl,Prime STAR HS DNA Polymerase(2.5 U/μl)0.5 μl,10 μmol·L-1上游引物0.5 μl,10 μmol·L-1下游引物0.5 μl,模板0.5 μl,加ddH2O 至25 μl。PCR 反應(yīng):98℃變性10 s,56℃退火15 s,72℃延伸50 s,30 個循環(huán)。PCR 產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳回收并純化后,將融合基因片段連入pMD19-T 載體,得T-VAD-H 并測序驗(yàn)證。

        表1 引物序列

        1.2.2 dsRNA 的體外合成 上述獲得的VAD-H 融合基因,在擴(kuò)增該序列所設(shè)計的特異性引物VAD-H-F1、R2 的5'端分別加上T7 啟動子序列(TAATACGACTCACTATAGGG),以及添加T7 啟動子序列的dsGFP F 和dsGFP R(表1),利用試劑盒MEGAscript T7 Kit (ambion,AM1334)在體外分別進(jìn)行干擾片段VAD-H 的dsRNA 和dsGFP 合成。

        1.2.3 體外飼喂dsRNA 通過體外飼喂法進(jìn)行飛虱RNAi 研究,選TN1 水稻幼苗上的3 齡褐飛虱生測,體外實(shí)驗(yàn)所用飛虱先經(jīng)過2 d 人工飼料(未加dsRNA)喂食適應(yīng)再進(jìn)行dsRNA 飼喂。喂食含400 ng·μL-1ds-VAD-H 的人工飼料為試驗(yàn)組,添加400 ng·μL-1dsGFP 的作為對照組,每天按時更換人工飼料。褐飛虱飼喂采用雙通玻璃管,其一端用parafilm 膜密封,另一端采用雙層parafilm 膜中間添加人工飼料而成,管內(nèi)接入生長發(fā)育一致的3 齡待測褐飛虱,每管接入30 頭,重復(fù)3 次,每天記錄飛虱存活率和生長發(fā)育情況。實(shí)驗(yàn)在人工氣候室中進(jìn)行,實(shí)驗(yàn)條件:溫度27 ±1℃,濕度75 ±5%,光照周期為16 h 光照,8 h 黑暗。

        1.2.4 實(shí)時定量RT-PCR 分析檢測 用Trizol提取總RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄試劑盒(TransScript One-step cDNA Synthesis SuperMix)合成cDNA。將合成的第一鏈cDNA 稀釋10 倍后作為模板,進(jìn)行定量檢測,所用引物為如表2 所示。qPCR 反應(yīng)體系為20 μL:2 ×TransStart Tip Green qPCR Super-Mix 10 μL,F(xiàn)orward Primer(10 μmol·L-1)0.4 μL,Reverse Primer(10 μmol·L-1)0.4 μL,cDNA模板(20 ng·μL-1)1 μL,ddH2O 8.2 μL。qPCR反應(yīng)程序?yàn)?94℃30 s;94℃5 s,60℃30 s,40 個循環(huán)。Real-Time qPCR 所用的儀器為ABI Prism 7300,選用揭飛虱β-actin 基因(GenBank:EUl79846)作為內(nèi)參,基因相對表迖量計算采用Livak 和Schmittgen[11]的方法。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 重組PCR 擴(kuò)增獲取VAD-H 融合基因

        以3 齡飛虱若蟲cDNA 為模板,VAD-H-F1 和VAD-H-R1 為引物,擴(kuò)增獲取了約400 bp 的V-ATPase D 亞基基因片段。以VAD-H-F2 和VAD-H-R2 為引物,擴(kuò)增獲取400 bp的V-ATPase H 亞基基因片段。再以PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物V-ATPase D 和V-ATPase H 亞基基因?yàn)槟0澹琕AD-H-F1 和VAD-H-R2 為引物進(jìn)行重組PCR,擴(kuò)增獲得約800 bp 的VAD-H 融合基因片段(圖2)。將融合基因片段連入pMD19-T載體,經(jīng)測序驗(yàn)證,所得序列為基因重組序列(圖2)。

        圖2 VAD-H 融合基因片段的PCR 擴(kuò)增

        2.2 pUCm-hp(VAD-H)重組載體構(gòu)建

        為獲取發(fā)夾結(jié)構(gòu)的RNAi 載體,利用經(jīng)改造含有Pdk 內(nèi)含子的中間載體pUCm-T 構(gòu)建干擾片段的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。采用限制性內(nèi)切酶Sac I 和Kpn I 對T-VAD-H 質(zhì)粒進(jìn)行酶切,獲得大小為800 bp 的融合基因片段VAD-H,酶切片段回收后連入經(jīng)Sac I/Kpn I 酶切的pUCm-T 載體,獲得pUCm-T-VAD-H-Intron 重組載體。再用Sal I 和Xho I 對重組載體T-VAD-H 進(jìn)行酶切,酶切片段回收后連入經(jīng)Sal I/Xho I 酶切的重組載體pUCm-T-VAD-H-Intron,獲取含有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的pUCm-hp(VAD-H)重組載體(圖3)。

        圖3 pUCm-hp(VAD-H)載體結(jié)構(gòu)示意圖

        2.3 體外喂食dsRNA 后褐飛虱的存活率

        選取生長發(fā)育一致的3 齡飛虱若蟲,用人工飼料飼喂2 d 后再用于dsRNA 飼喂試驗(yàn),持續(xù)8 d后各處理存活的若蟲均羽化變?yōu)槌上x。測試用融合基因VAD-H 的dsRNA 通過體外合成,添加到人工飼料中濃度為0.4 μg·μl-1,與對照組進(jìn)行比較,從第2 天開始處理組飛虱存活率便出現(xiàn)降低,當(dāng)飼喂至第8 天時VAD-H 干擾組存活率僅為48.3%,并且VAD-H 干擾組與對照組差異顯著(圖4)

        圖4 飼喂dsRNA 后褐飛虱的存活率

        2.4 體外喂食dsRNA 后對飛虱靶基因影響

        為檢測飛虱取食dsRNA 后對其體內(nèi)靶標(biāo)基因mRNA 的影響,利用熒光定量PCR 對靶基因的轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行測定,實(shí)驗(yàn)所用飛虱為上述喂食添加dsGFP 的對照組和添加dsRNA 試驗(yàn)組,4 到8天后選取生長發(fā)育一致的褐飛虱,分別抽提RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA 后,用qRT-PCR 檢測褐飛虱體內(nèi)靶基因的相對表達(dá)量。

        持續(xù)飼喂dsRNA 4 d、6 d 至8 d 后,褐飛風(fēng)體內(nèi)靶標(biāo)mRNA 水平均發(fā)生不同程度的降低,降低水平隨著飼喂時間的延長而升高。如圖5 靶基因的轉(zhuǎn)錄水平從第4 天開始降低,飼喂至第八天飛虱靶基因V-ATPase D 轉(zhuǎn)錄水平降低了47.6%,靶基因V-ATPase H 的轉(zhuǎn)錄水平降低了29.7%(圖5)。

        圖5 飼喂dsRNA 后褐飛虱靶基因表達(dá)量(*,P <0.05;**,P <0.01.)

        3 討論

        目前利用RNAi 進(jìn)行昆蟲功能基因的研究主要通過注射法和飼喂法。Liu 等利用顯微注射向褐飛虱體內(nèi)注射組成型表達(dá)的鈣網(wǎng)蛋白(Calr)和腸道特異蛋白(Ctsb)基因的dsRNA[12],注射后第4 天兩種基因表達(dá)水平均降低了40%左右。Chen等利用添加靶基因海藻糖磷酸合酶(NlTPS)dsRNA 的人工飼料飼喂褐飛虱[13],使該基因在mRNA 水平和酶活性顯著降低,此外隨著飼喂時間延長褐飛虱發(fā)育水平也受到影響,甚至出現(xiàn)死亡。上述研究表明dsRNA 進(jìn)入褐飛虱體內(nèi)后能夠特異性地沉默相關(guān)靶基因,由于注射法對飛虱、蚜蟲等體型較小的昆蟲易造成機(jī)械損傷,死亡率較高,因此本實(shí)驗(yàn)采用人工飼料喂食法。

        筆者研究將褐飛虱V-ATPase D 亞基基因片段和V-ATPase H 亞基基因片段進(jìn)行融合,獲得約800 bp 的融合基因,構(gòu)建針對該融合基因的RNAi 干擾載體。相比于之前有關(guān)RNAi 抗蟲研究,只針對單個目的基因,本實(shí)驗(yàn)通過基因融合形成新的干擾基因片段,同時構(gòu)建了雙價干擾載體。褐飛虱取食添加有融合基因VAD-H dsRNA 的人工飼料,飼喂8 天后褐飛虱死亡率為51.7%,與對照相比差異顯著(圖3),此外我們對取食dsRNA的褐飛虱靶標(biāo)基因轉(zhuǎn)錄水平,進(jìn)行熒光定量PCR,結(jié)果表明實(shí)驗(yàn)組體內(nèi)相關(guān)基因表達(dá)量與對照相比顯著下降(圖5),表明攝入體外表達(dá)的融合基因dsRNA,能夠引發(fā)褐飛虱體內(nèi)RNAi 效應(yīng)。

        由于人工飼料飼喂時添加dsRNA 的濃度與蟲體RNAi 呈劑量效應(yīng),因此當(dāng)外界不能持續(xù)提供dsRNA 時,干擾效果會受到限制。因此本研究后面將通過構(gòu)建RNAi 植物表達(dá)載體,獲取體外穩(wěn)定表達(dá)dsRNA 的植株,進(jìn)一步驗(yàn)證轉(zhuǎn)基因植物抗飛虱方面作用。

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