張慶芳,王澤坤,姜 南,于 爽,遲乃玉*
(1.大連大學(xué) 生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,遼寧 大連 116622;遼寧省海洋微生物工程技術(shù)研究中心,遼寧 大連 116622)
纖維素(cellulose)約占整個植物干質(zhì)量的50%,是植物細胞壁的主要成分[1-3]。纖維素作為一種可再生資源,在實際生產(chǎn)中利用率并不高。目前,纖維素的降解方法主要有物理法、化學(xué)法和生物酶法。其中傳統(tǒng)的物理方法利用效率低,工藝條件難以控制;化學(xué)方法容易產(chǎn)生大量副產(chǎn)物,污染環(huán)境且成本高;近年來,隨著生物酶解技術(shù)的發(fā)展和成熟,生物酶解已成為研究者的研究熱點[4-5],而生物酶法綠色環(huán)保,反應(yīng)條件溫和,不產(chǎn)生大量有毒物質(zhì),且效率高[6-8]。因此,選擇高產(chǎn)纖維素酶菌株以增加纖維素的利用率具有十分重要的意義[5]。
反芻動物瘤胃液中的微生物能夠分泌纖維素酶并降解纖維素[9-10],國外關(guān)于瘤胃細菌的研究較多,而我國對這方面的研究相對較少。LEE S M等[11]研究發(fā)現(xiàn),稻秸青貯時添加純培養(yǎng)瘤胃真菌能夠降低青貯飼料中性洗滌纖維和酸性洗滌纖維含量,提高青貯飼料粗纖維的降解率;朱雅新等[12]成功構(gòu)建了荷斯坦奶牛瘤胃微生物元基因組BAC文庫,并從BAC文庫中篩選出16個具有淀粉酶活性和26個具有纖維素酶活性的陽性克??;李昊[13]從奶牛瘤胃液中分離到21株兼性纖維素分解細菌。
西藏黃牛耐寒、耐低氧能力突出,且瘤胃中的微生物產(chǎn)纖維素酶的能力高[14-15]。因此,本研究從西藏黃牛瘤胃中篩選高產(chǎn)纖維素酶菌株,采用形態(tài)觀察、生理生化試驗及分子生物學(xué)技術(shù)對其進行鑒定,并對其所產(chǎn)的纖維素酶酶學(xué)特性進行研究,以期為纖維素酶制劑研制及益生菌制劑提供基礎(chǔ),從而促進西藏地區(qū)農(nóng)牧業(yè)的發(fā)展。
1.1.1 樣品
雌性黃牛:西藏娟姍純種繁育示范基地,年齡為4.5歲。
1.1.2 試劑
羧甲基纖維素鈉(sodium carboxymethyl cellulose,CMC-Na)、酵母粉、胰蛋白胨、牛肉膏、MgSO4·7H2O、瓊脂粉、氯化鈉、KH2PO4、(NH4)2SO4、3,5-二硝基水楊酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)、剛果紅(均為分析純):生物工程(上海)股份有限公司。
1.1.3 培養(yǎng)基
富集培養(yǎng)基:蛋白胨5 g/L,CMC-Na 10 g/L,KH2PO42 g/L,(NH4)2SO41 g/L,MgSO4·7H2O 1 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 10 mg/L,MnSO4·H2O 5 mg/L,NaCl 3 g/L,pH 7.0。
篩選培養(yǎng)基:CMC-Na 20g/L,(NH4)2SO42g/L,KH2PO42 g/L,MgSO4·7H2O 1 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 10 mg/L,MnSO4·H2O 5 mg/L,NaCl 3 g/L,瓊脂 15 g/L,pH7.0。
發(fā)酵培養(yǎng)基:蛋白胨2g/L,酵母膏1g/L,CMC-Na20g/L,KH2PO42 g/L,MgSO4·7H2O 1 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 10 mg/L,(NH4)2SO42 g/L,MnSO4·H2O 5 mg/L,NaCl 3 g/L,pH自然。
以上培養(yǎng)基均在0.1 MPa、121℃條件下滅菌20 min。
CRY-2112立式恒溫搖床:上海茸研儀器有限公司;LTI-700低溫恒溫培養(yǎng)箱:上海愛朗儀器有限公司;YXQ-75SII立式壓力蒸汽滅菌器:上海博訊實業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;CR21N高速冷凍離心機:株式會社日立制作所;Multiskan GO全波長酶標儀;美國賽默飛世爾科技公司;BioLogMicro Station III全自動微生物鑒定儀:美國Bio Log有限公司;DHG-9070電熱恒溫鼓干燥箱:上海一恒科技有限公司。
1.3.1 黃牛瘤胃液樣品的采集
使用聚氯乙烯(polyvinyl chloride,PVC)管在牛瘤胃的瘤胃囊中的不同位置提取牛瘤胃液樣品。收集后立即將樣品置于含有CO2的培養(yǎng)箱中,快速關(guān)閉。
1.3.2 富集培養(yǎng)
取1 mL西藏黃牛瘤胃液樣品于9 mL液體富集培養(yǎng)基中,150 r/min、37℃條件下培養(yǎng)4 d。
1.3.3 纖維素酶產(chǎn)生菌的篩選
初篩:富集培養(yǎng)液經(jīng)梯度(10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7)稀釋后,取150 μL梯度稀釋液涂布于篩選培養(yǎng)基平板上,每個梯度設(shè)置三組平行,37℃條件下倒置培養(yǎng)4 d。每個梯度選擇一個平板用剛果紅溶液染色20 min,染色后,棄掉剛果紅染液并用1 mol/L NaCl脫色。如果在菌落周圍產(chǎn)生透明圈,則可以初步證明該菌株是產(chǎn)纖維素酶的菌株。挑取產(chǎn)生透明圈的單菌落進行分離、純化。
復(fù)篩:基于初級篩選菌株的透明圈大小,選取透明圈直徑(D)與菌落直徑(d)比值(D/d值)最大的菌株進行纖維素酶活力的測定。
1.3.4 纖維素酶活的測定方法[16]
葡萄糖標準曲線的繪制:取7支試管,分別加入質(zhì)量濃度為2.0 mg/mL葡萄糖標準溶液0、0.2 mL、0.4 mL、0.6 mL、0.8mL、1.0mL、1.2mL,加蒸餾水至2.0mL,分別加入2.0 mL DNS后在沸水浴中加熱2 min,迅速冷卻,并加入蒸餾水至15 mL?;旌虾?,使用分光光度計在波長540 nm處測定吸光度值(OD540nm值),以葡萄糖質(zhì)量濃度(x)為橫坐標,吸光度值(y)為縱坐標,繪制葡萄糖標準曲線。葡萄糖標準曲線為y=3.291 8x+0.032 5,R2為0.995 3,線性關(guān)系良好,可用于纖維素酶活力的測定。。
粗酶液的制備:將篩選菌株接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,裝液量為125 mL/250 mL,在37℃、150 r/min條件下培養(yǎng)2 d,作為種子培養(yǎng)液。按1%(V/V)的接種量將種子培養(yǎng)液接種于液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,裝液量為125 mL/250 mL,在37℃、150 r/min條件下培養(yǎng)3 d,每24 h取出一定量的發(fā)酵液,室溫條件下4 000 r/min離心10 min,收集上清作為粗酶液。
纖維素酶活力的測定:取A和B兩只試管,分別加入1.8 mL 1%CMC-Na,A管中添加0.2 mL粗酶液,將A和B管于50℃恒溫水浴60 min,取出,分別加入2 mL DNS,B管中加入0.2 mL粗酶液,沸水浴10 min,快速冷卻,加入蒸餾水補充至15 mL。采用分光光度計測定OD540nm值。
1.3.5 菌株的鑒定
形態(tài)觀察:采用平板點樣法獲得單菌落,通過革蘭氏染色的方法對菌體染色,鏡檢,觀察菌體形態(tài)。
生理生化試驗:通過Biolog微生物鑒定系統(tǒng)進行生理生化試驗。
分子生物學(xué)鑒定:將復(fù)篩得到的高產(chǎn)纖維素酶菌株送交寶生物工程(大連)有限公司,對其16S rDNA進行測序,測序結(jié)果提交至美國國立生物技術(shù)信息中心(nationalcenter forbiotechnologyinformation,NCBI)的Genbank數(shù)據(jù)庫中進行BLAST比對,利用MEGA5軟件中的鄰接(neighborjoining,NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.3.6 纖維素酶酶學(xué)性質(zhì)初步研究
溫度對纖維素酶酶促反應(yīng)的影響:粗酶液分別于10~100℃(梯度為5℃)、pH 7.0條件下進行酶促反應(yīng),測定不同反應(yīng)溫度下的纖維素酶活性,并以最大酶活力為100%,計算相對酶活。每個樣品重復(fù)測定3次。
熱穩(wěn)定性:將反應(yīng)體系分別在10~100℃(梯度為5℃)條件下保溫2 h,快速冷卻后,在37℃、pH 7.0條件下測定酶活力,并計算相對酶活。每個樣品重復(fù)測定3次。
pH對纖維素酶酶促反應(yīng)的影響:粗酶液分別在pH為3.0~10.0(梯度為0.5)、37℃條件下進行酶促反應(yīng),測定不同反應(yīng)pH條件下的纖維素酶活性,并以最大酶活力為100%,計算相對酶活。每個樣品重復(fù)測定3次。
pH穩(wěn)定性:粗酶液在pH為3~10(梯度為0.5)、37℃條件下放置2 h,在37℃、pH 7.0條件下測定酶活力,并計算相對酶活。每個樣品重復(fù)測定3次。
金屬離子對纖維素酶活力的影響:反應(yīng)體系中添加0.5 mmol/L不同種類的金屬離子(K+、Mg2+、Fe2+、Zn2+、Cu2+、Ag2+、Co2+)后,在37 ℃、pH 7.0條件下測定酶活力,并計算相對酶活。每個樣品重復(fù)測定3次。
表1 篩選菌株透明圈直徑與菌落直徑比值Table 1 Ratio of transparent circle diameter and colony diameter of screened strains
圖1 菌株N30的產(chǎn)酶曲線Fig.1 Enzyme production curve of strain N30
通過初篩共篩選到7株產(chǎn)生透明圈的菌株,編號為N5、N7、N14、N18、N30、N36、N37,7株菌株的透明圈直徑與菌落直徑比值(D/d值)見表1。由表1可知,菌株N30的透明圈直徑與菌落直徑比值最大,為7。因此,選取菌株N30為目的菌株,對其纖維素酶活力進行測定,菌株N30的發(fā)酵產(chǎn)酶曲線如圖1所示。由圖1可知,菌株N30在發(fā)酵72 h時,纖維素酶活力最大,為15.6 U/mL,其他從西藏地區(qū)動物胃腸道中篩選得到的產(chǎn)纖維素酶菌株的酶活力大多在10 U/mL以內(nèi),該纖維素酶酶活與其他纖維素酶相比,酶活較高[17-18]。
2.2.1 形態(tài)觀察
菌株N30的菌落和細胞形態(tài)見圖2。由圖2a可知,菌落形態(tài)為淡黃色,半透明,光滑濕潤,邊緣整齊;由圖2b可知,菌株N30呈棒狀桿菌,染色后為紫色,屬于革蘭氏陽性菌。
圖2 菌株N30的菌落形態(tài)(a)和細胞形態(tài)(b)Fig.2 Colony morphology(a)and cell morphology(b)of strain N30
2.2.2 生理生化試驗
通過Biolog微生物鑒定系統(tǒng)共測定了菌株N30的103項生理生化特征,結(jié)果見表2。由表2可知,菌株N30的淀粉水解、檸檬酸鹽和硝酸鹽還原試驗均為為陽性;可以利用48種碳源,如D-麥芽糖、D-海藻糖、D-纖維二糖等;易被氨曲南、溴酸鈉、醋竹桃霉素、林肯霉素、萬古霉素、萘啶酮酸等15種物質(zhì)抑制生長。結(jié)果表明,菌株N13的生理生化特征與模式株類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)基本一致,因此,初步鑒定菌株N30為類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)。
表2 菌株N30的生理生化特征Table 2 Physiological and biochemical characteristics of strain N30
續(xù)表
2.2.3 分子生物學(xué)鑒定
利用軟件MEGA5中的NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果如圖3所示。由圖3可知,菌株N30與燦爛類芽孢桿菌(Paenibacillus lautus)N3-6聚于一支,同源性為99%。因此,結(jié)合菌株N30形態(tài)特征和生理生化特征,將其鑒定為燦爛類芽孢桿菌(Paenibacillus lautus)。
圖3 基于16S rDNA序列菌株N30的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Phylogenetic tree of strain N30 based on 16S rDNA sequences
2.3.1 反應(yīng)溫度對纖維素酶酶促反應(yīng)的影響
由圖4可知,該纖維素酶的最適反應(yīng)溫度為55℃,且在40~65℃保持較高的酶活,相對酶活>80%;當(dāng)溫度超過65℃時,纖維素酶活力急劇下降;當(dāng)溫度為100℃時,相對酶活僅為9%。其他纖維素酶在25~45℃時保持50%以上酶活力,本研究中的纖維素酶相較于其他纖維素酶。最適溫度較高,應(yīng)用潛力更大[19]。
圖4 反應(yīng)溫度對纖維素酶活力的影響Fig.4 Effect of reaction temperature on cellulase activity
2.3.2 纖維素酶的熱穩(wěn)定性
粗酶液的熱穩(wěn)定性試驗結(jié)果見圖5。
圖5 纖維素酶的熱穩(wěn)定性Fig.5 Thermal stability of cellulase
由圖5可知,該酶在10~35℃之間保持較高的酶活力,相對酶活>80%。當(dāng)處理溫度高于70℃后,相對酶活明顯下降;在70~90℃時,相對酶活仍在10%以上;在95℃保溫2 h后,纖維素酶失去活力。相較于其他纖維素酶(在45~55℃之間,相對酶活>80%),該酶溫度穩(wěn)定性相對較高[20]。
2.3.3 反應(yīng)pH對纖維素酶酶促反應(yīng)的影響
反應(yīng)pH對纖維素酶酶促反應(yīng)的影響結(jié)果見圖6。
圖6 反應(yīng)pH值對纖維素酶活力的影響Fig.6 Effect of reaction pH value on cellulase activity
由圖6可知,該酶最適反應(yīng)pH值為4.5,同時該酶在pH 4.0~6.5時酶活較高;該酶在pH 7.0~9.0時仍保持60%的相對酶活,相較于其他纖維素酶最適pH無明顯差別[21]。
2.3.4 纖維素酶的pH穩(wěn)定性
菌株N30所產(chǎn)的纖維素酶的pH穩(wěn)定性結(jié)果見圖7。
圖7 纖維素酶的pH穩(wěn)定性Fig.7 pH stability of cellulase
由圖7可知,該酶在pH 3.5~9.0時仍保持60%以上的相對酶活,其他纖維素酶在pH 4.0~5.5時保持60%以上相對酶活,本研究中的纖維素酶相較于其他纖維素酶,該酶具有較廣的pH穩(wěn)定性[22-23]。
2.3.5 金屬離子對纖維素酶活力的影響
金屬離子對纖維素酶活力的影響結(jié)果見圖8。
由圖8可知,Ag2+、K+、Mg2+、Fe2+、Zn2+、Co+對纖維素酶活力有顯著的促進作用,而Cu2+對纖維素酶活力有抑制作用。
圖8 金屬離子對纖維素酶活力的影響Fig.8 Effect of metal ions on cellulase activity
本研究從西藏黃牛瘤胃中篩選出一株高產(chǎn)纖維素酶的菌株N30,并通過形態(tài)觀察、生理生化鑒定和分子生物學(xué)技術(shù)鑒定其為燦爛類芽孢桿菌(Paenibacillus lautus)。菌株N30在發(fā)酵72 h時,纖維素酶活力最高,為15.6 U/mL。該纖維素酶的最適反應(yīng)溫度為55℃,在10~35℃時保持較高的酶活力;最適pH為4.5,在pH 4.5時有最高的穩(wěn)定性,在pH 3.5~9.0時仍保持60%以上的相對酶活力;Ag2+、K+、Mg2+、Fe2+、Zn2+、Co+對纖維素酶活力具有促進作用,而Cu2+對纖維素酶活力有抑制作用。
菌株N30來自于西藏黃牛瘤胃,與其他從西藏地區(qū)動物胃腸道中篩選得到的產(chǎn)纖維素酶菌株的酶活相比,酶活較高。并且較于其他纖維素酶,該酶在更寬的溫度范圍內(nèi)保持較高酶活,溫度穩(wěn)定性和pH穩(wěn)定性更高,因此,如將該菌株用作益生菌制劑的生產(chǎn),應(yīng)用至當(dāng)?shù)啬翗I(yè),會有較強的當(dāng)?shù)剡m應(yīng)性,效果更好,應(yīng)用潛力更大,可為西藏地區(qū)的農(nóng)牧業(yè)發(fā)展提供基礎(chǔ)。