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        HHIP基因rs13118928單核苷酸多態(tài)性與慢性阻塞性肺疾病易感性的薈萃分析

        2019-04-27 01:16:14吳天勇陳宏斌
        中華肺部疾病雜志(電子版) 2019年4期
        關(guān)鍵詞:分析模型研究

        吳天勇 陳宏斌 程 丹

        慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease, COPD)是最常見的呼吸系統(tǒng)疾病之一,以不完全可逆、進(jìn)展性的氣流受限為主要特征[1]。COPD不僅使患者遭受極大的痛苦,而且給家庭和社會帶來沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[2]。COPD的病因較為復(fù)雜,遺傳和環(huán)境因素都發(fā)揮著重要作用。盡管已有研究表明吸煙是COPD確切的危險因素,但是大部分COPD患者的病因并不能用吸煙來解釋[3]。研究人員很早就發(fā)現(xiàn)COPD有明顯的家族聚集現(xiàn)象[4]。隨著基因測序技術(shù)的發(fā)展,很多基因及大量的單核苷酸多態(tài)性都被報道與COPD的發(fā)生相關(guān)[5]。

        Hedgehog相互作用蛋白(Hedgehog interacting protein, HHIP)基因位于染色體4q31,編碼同名蛋白HHIP[6]。HHIP信號通路在包括肺在內(nèi)的多種器官的形成過程中發(fā)揮著重要作用[7- 8]。自從Pillai等[9]報道了HHIP 基因rs13118928單核苷酸多態(tài)性與COPD的相關(guān)性以來,研究人員相繼在不同人群中開展了類似研究,但是得到的結(jié)果并不一致。本文將對現(xiàn)有的研究成果進(jìn)行薈萃分析,以期得到更加真實(shí)可靠的結(jié)果。

        資料與方法

        一、檢索策略

        系統(tǒng)檢索PubMed、Web of Science、EMBASE、中國知網(wǎng)和萬方五個電子數(shù)據(jù)庫。檢索關(guān)鍵詞為“Polymorphism”、“HHIP”和“COPD”。語種不限,檢索時間設(shè)定為建庫到2018年1月5日。此步驟由兩位作者獨(dú)立完成。

        二、納入和排除標(biāo)準(zhǔn)

        納入標(biāo)準(zhǔn):病例-對照研究;病例組符合COPD的診斷標(biāo)準(zhǔn);文獻(xiàn)能獲得全文,并且提供病例組和對照組的樣本量和基因型頻率;原始文獻(xiàn)研究內(nèi)容必須涉及rs13118928;納入文章必須是同行評審的論文;重復(fù)發(fā)表的文獻(xiàn),納入最新發(fā)表的研究。動物研究、會議摘要、綜述及病例系列報道等需要被排除。

        三、文獻(xiàn)篩選和信息提取

        按照預(yù)先制定的納入和排除標(biāo)準(zhǔn),兩位作者分別獨(dú)立完成文獻(xiàn)的篩選。確定文獻(xiàn)符合要求后,提取以下信息:第一作者的姓名、發(fā)表年份、人種、研究類型、樣本量及病例組和對照組的基因頻率分布。此過程中如果遇到分歧,由兩位作者共同商討解決。

        四、方法學(xué)質(zhì)量評價

        兩位作者分別利用紐卡斯?fàn)?渥太華量表(Newcastle-Ottawa Scale, NOS)評價標(biāo)準(zhǔn)對納入文獻(xiàn)的質(zhì)量進(jìn)行評估。NOS采用星級評價標(biāo)準(zhǔn),由人群選擇、病例組和對照組的可比性、暴露因素的測量3個欄目構(gòu)成,包括8個條目,共9顆星[10]。當(dāng)納入文獻(xiàn)≥5顆星時,可視為質(zhì)量較高。計算納入文獻(xiàn)中的對照組人群基因型頻率是否符合哈代-溫伯格遺傳平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)[11]。若P<0.05,則表明對照組不符合HWE。在質(zhì)量評估過程中如有分歧,通過商討解決。

        五、統(tǒng)計學(xué)分析

        利用RevMan5.3軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。分別計算出rs13118928在等位基因模型(Avs. G)、共顯性純合子模型(AAvs. GG)、共顯性雜合子模型(AGvs. GG)、顯性模型(AA+AGvs. GG)及隱性模型(AAvs. AG+GG)的OR及相應(yīng)的95%CI。按照人種將納入人群分為亞洲人種和高加索人種進(jìn)行亞組分析。用I2檢驗(yàn)來評估納入研究之間的異質(zhì)性:當(dāng)P≥0.1,I2<50%時,表明異質(zhì)性較小,采用固定效應(yīng)模型(M-H, Fixed-effect model);反之,則采用隨機(jī)效應(yīng)模型(M-H, Random-effect model)[12]。

        六、敏感性分析和發(fā)表偏倚評估

        通過逐一去除各項(xiàng)研究的方式來檢測研究結(jié)果的敏感性。利用漏斗圖法來評估研究的發(fā)表偏倚。

        結(jié) 果

        一、文獻(xiàn)檢索結(jié)果

        通過對5個電子數(shù)據(jù)庫的系統(tǒng)檢索,共得到173篇相關(guān)文獻(xiàn),其中32篇來自PubMed,60篇來自EMBASE,42篇來自Web of Science,5篇來自中國知網(wǎng),54篇來自萬方數(shù)據(jù)庫。去除90篇重復(fù)文獻(xiàn)后剩下83篇。通過閱讀題目和摘要,剔除了72篇明顯不相關(guān)的文獻(xiàn),剩余11篇文獻(xiàn)。通過閱讀全文,發(fā)現(xiàn)有4篇文獻(xiàn)未提供基因型和基因頻率,將其排除。最終獲得了7篇[13-19]高質(zhì)量文獻(xiàn)。

        二、納入文獻(xiàn)的基本特征

        納入的7篇文獻(xiàn)包括6篇[14-19]英文和1篇[13]中文。其中的5項(xiàng)[13-15, 17, 18]研究在中國實(shí)施,1項(xiàng)[16]在俄羅斯實(shí)施,另外1項(xiàng)在荷蘭[19]實(shí)施。7項(xiàng)研究共包括5 157個COPD患者和9 768個健康對照者。其中Xie等[17]的研究包括3項(xiàng)獨(dú)立的研究,Xu等[15]的研究包括2項(xiàng)分別在中國漢族和蒙古族中實(shí)施的獨(dú)立研究。需要指出的是Xu等[15]的第一項(xiàng)研究和Korytina等[16]的研究不符合HWE。納入文獻(xiàn)的基本特征見表1。根據(jù)NOS評價標(biāo)準(zhǔn),納入的每項(xiàng)研究至少得到了5顆星,均為高質(zhì)量研究。質(zhì)量評估結(jié)果,見表2。

        三、薈萃分析和亞組分析結(jié)果

        由于在Avs. G,AAvs. GG和AAvs. AG+GG三種遺傳模型下,各項(xiàng)研究之間的異質(zhì)性較小(I2分別為0,21%,0),所以采用固定效應(yīng)模型。AGvs. GG和AA+AGvs. GG模型下,研究之間的異質(zhì)性較大(I2分別為63%,52%),采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行分析。合并后的數(shù)據(jù)顯示在五種遺傳模型下, rs13118928與COPD易感性均有顯著相關(guān)性,具體為:Avs. G,OR=1.14,95%CI,1.08~1.20,P<0.001,見圖1;AAvs. GG,OR=1.36,95%CI,1.20~1.55,P<0.001;AGvs. GG,OR=1.27,95%CI,1.03~1.58,P=0.030;AA+AGvs. GG,OR=1.31,95%CI,1.10~1.57,P=0.003;AAvs. AG+GG,OR=1.12,95%CI,1.04~1.21,P=0.002。

        亞組分析結(jié)果顯示在亞洲人種中,rs13118928多態(tài)性在Avs. G,AAvs. GG,AAvs. AG+GG三種遺傳模型下與COPD有顯著相關(guān)性。在高加索人群中,rs13118928多態(tài)性除了在AAvs. AG+GG遺傳模型下與COPD無顯著的相關(guān)性外,其余幾種遺傳模型下均存在顯著的相關(guān)性。具體的薈萃分析結(jié)果,見圖1,表3。

        四、敏感性分析及發(fā)表偏倚評估

        排除Korytina等[16]和Xie等[17]這兩項(xiàng)不符合HWE的研究后,結(jié)果無明顯變化,所以本研究未將這兩項(xiàng)研究剔除。此外,在逐一排除其余各項(xiàng)研究后,整體的效應(yīng)值和可信區(qū)間也無顯著改變,表明研究結(jié)果具有良好的穩(wěn)定性。漏斗圖近似對稱,見圖2,未檢測到明顯的發(fā)表偏倚。

        圖1 等位基因模型下亞洲人種和高加索人種亞組分析結(jié)果

        圖2 等位基因模型下的漏斗圖結(jié)果

        表1 納入研究的基本特征

        注:HWE,哈迪-溫伯格平衡定律

        表2 納入研究根據(jù)紐卡斯?fàn)?渥太華量表的評估結(jié)果

        注:★得分,☆不得分

        表3 HHIP基因rs13118928單核苷酸多態(tài)性與慢性阻塞性肺疾病易感性的薈萃分析結(jié)果

        注:OR,比值比;95%CI,95%可信區(qū)間;R,隨機(jī)效應(yīng)模型;F,固定效應(yīng)模型

        討 論

        本文通過整合現(xiàn)有的證據(jù),發(fā)現(xiàn)HHIP基因 rs13118928單核苷酸多態(tài)性與COPD易感性有顯著統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)。具體來說,rs13118928位點(diǎn)的A等位基因和AA基因型攜帶者表現(xiàn)出較高的COPD易感性。亞組分析結(jié)果顯示,除了個別遺傳模型,rs13118928多態(tài)性與COPD關(guān)聯(lián)性在亞洲人種和高加索人種中也存在。亞洲人種和高加索人種之間的差異可能是種族特異性所致。除了rs13118928位點(diǎn)外,與COPD相關(guān)的HHIP基因多態(tài)性位點(diǎn)還包括rs13141641和rs1828591[9, 20-22]。但由于多數(shù)涉及這兩個位點(diǎn)的研究未提供等位基因和基因型頻率,所以本文未對這兩個位點(diǎn)進(jìn)行薈萃分析。

        COPD的發(fā)病機(jī)制十分復(fù)雜,機(jī)體的內(nèi)在因素和外在環(huán)境因素共同促進(jìn)其發(fā)生[23]?;蜃鳛橐环N內(nèi)在因素,在COPD的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮著重要作用。HHIP基因編碼的同名跨膜糖蛋白是一種內(nèi)源性音猬因子拮抗劑[24]。音猬因子信號通路廣泛參與胚胎發(fā)育、慢性炎癥及腫瘤生成等過程。由HHIP調(diào)控的音猬因子信號通路還在肺的發(fā)育,特別是早期支氣管的生成過程中發(fā)揮著重要作用[7]。敲除HHIP基因的小鼠,生育的純合子后代會在出生后數(shù)小時內(nèi)因呼吸衰竭而死亡[7]。Zhou等[6]發(fā)現(xiàn)與正常人相比,COPD患者HHIP基因在蛋白水平和信使RNA水平的表達(dá)均明顯降低。Kim等[25]也得到了與Zhou等相似的研究結(jié)果。HHIP蛋白結(jié)構(gòu)的改變還能夠影響肺的發(fā)育及自我修復(fù)[26]。這些研究均表明HHIP對維持正常肺功能有重要作用。

        早在2009年,Pillai等[9]在多個人群中開展了全基因組關(guān)聯(lián)研究,發(fā)現(xiàn)HHIP基因多態(tài)性和COPD的關(guān)聯(lián)性。Van Durme等[19]隨后在荷蘭人群中證實(shí)了這種關(guān)聯(lián)。Zhou等[27],Cho等[21],Siedlinski等[28]也相繼在高加索人群中開展了相關(guān)研究。Wang等[18]在中國的漢族人群中開展HHIP基因多態(tài)性和COPD相關(guān)性的研究以來,類似的研究在中國的黎族[22]、蒙古族[15]和哈薩克族[13]人群中也相繼被開展??紤]到每項(xiàng)研究的樣本量大小各異、納入的種族不同、得到的結(jié)果也不一致,我們采用了薈萃分析的方法對現(xiàn)有的研究結(jié)果進(jìn)行合并,得到了循證級別更高的證據(jù)。需要指出的是,Xie等[17]在其研究中對先前的四項(xiàng)研究[18-19, 21, 29]也進(jìn)行了薈萃分析。但是Xie等[17]只是對既往研究的OR值進(jìn)行了合并,沒有根據(jù)不同的遺傳模型進(jìn)行薈萃分析,也沒有對納入文獻(xiàn)進(jìn)行方法學(xué)質(zhì)量評估,所以Xie等[17]的研究并不是嚴(yán)格意義上的薈萃分析。相比之下,本文除了對納入文獻(xiàn)進(jìn)行質(zhì)量評估和分析不同遺傳模型下的作用效應(yīng)外,還納入了幾項(xiàng)最新發(fā)表的研究成果。本文的這些優(yōu)勢都保證了結(jié)果的可信性。

        盡管本文對現(xiàn)有的研究結(jié)果進(jìn)行了合并,擴(kuò)大了總體的樣本量,但是仍存在一些局限性:第一,納入文獻(xiàn)的研究對象只包含亞洲人種和高加索人種,不能反映其他人種的情況;第二,本文只對三個英文數(shù)據(jù)庫和兩個中文數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了系統(tǒng)檢索,以其他語種發(fā)表及收錄在其他數(shù)據(jù)庫的文獻(xiàn),無法被納入,可能存在一定的發(fā)表偏倚[30];第三,納入的研究并沒有按照吸煙狀況、年齡及性別等因素進(jìn)行分層分析,因此不能消除這些因素對研究結(jié)果的影響。第四,本文只對HHIP基因的單一位點(diǎn)進(jìn)行了分析,而位點(diǎn)與位點(diǎn)之間、基因與基因之間、基因與環(huán)境之間的相關(guān)作用不能被控制,這也可能導(dǎo)致研究結(jié)果偏離真實(shí)情況。

        綜上所述,本文結(jié)果表明HHIP基因rs13118928單核苷酸多態(tài)性與COPD易感性有顯著的相關(guān)性??紤]到本文存在的缺陷,還需要在不同地區(qū)、不同人種中開展大樣本的研究進(jìn)一步驗(yàn)證本文的結(jié)果。

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