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        TRAF6調(diào)控NLRP3炎癥小體信號通路的機(jī)制研究

        2019-04-02 11:34:04于敏朱占芳劉飛楊瑾王英
        生物技術(shù)通訊 2019年1期
        關(guān)鍵詞:小體活化調(diào)控

        于敏,朱占芳,劉飛,楊瑾,王英

        西安交通大學(xué) 醫(yī)院,陜西 西安710049

        炎癥反應(yīng)是機(jī)體應(yīng)對刺激時的一種保護(hù)性免疫反應(yīng)。機(jī)體產(chǎn)生的炎癥反應(yīng)太弱就不能及時、有效地清除病原微生物,會導(dǎo)致持續(xù)性感染;而炎癥反應(yīng)過強(qiáng)則會誘發(fā)炎癥相關(guān)疾病[1],已經(jīng)證實炎癥參與多種炎癥相關(guān)疾病如2型糖尿病[2]、痛風(fēng)[3]、腫瘤[4]等的發(fā)生發(fā)展。因此,機(jī)體內(nèi)存在嚴(yán)密的機(jī)制調(diào)控炎癥反應(yīng)的整個過程。

        病原體的病原相關(guān)分子模式(pathogen-asso?ciated molecular patterns,PAMP)和機(jī)體釋放的損傷相關(guān)分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMP)均能通過機(jī)體內(nèi)的模式識別受體(pattern recognition receptors,PRR)或感應(yīng)系統(tǒng)啟動天然免疫系統(tǒng)、激活炎癥反應(yīng)。常見的PAMP包括脂多糖、肽聚糖、鞭毛蛋白以及一些微生物的核酸分子等,這些PAMP能夠被相應(yīng)的PRR識別進(jìn)而激活下游信號通路,引起炎癥反應(yīng)或抗菌應(yīng)答[5]。已知的PRR主要包括三類:Toll樣受體、RIG-Ⅰ樣受體和NOD樣受體(NOD like recep?tors,NLR)。其中NLR是定位于胞漿中廣泛表達(dá)的模式識別受體家族,在受到PAMP和DAMP的刺激時,一些NLR可以和凋亡相關(guān)顆粒樣蛋白(apoptosis associated speck-like protein,ASC)、天冬氨酸特異性的半胱氨酸蛋白水解酶(caspase-1)形成一種被稱作炎癥小體的多聚蛋白復(fù)合物,進(jìn)而激活下游信號通路,引起炎癥反應(yīng)。NLRP3(NLR pyrin domain-3)是NLR家族中研究最為深入的一個[6],其被證實參與多種炎癥相關(guān)疾病的發(fā)生發(fā)展。迄今,關(guān)于NLRP3炎癥小體信號通路的調(diào)控機(jī)制還有很多未知問題有待探索。因此,研究機(jī)體對NLRP3炎癥小體信號通路的調(diào)控具有重要意義。

        腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子6(tumor necrosis factor receptor-associated factor 6,TRAF6)是細(xì)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路上的關(guān)鍵接頭蛋白,能直接或間接地與腫瘤壞死因子受體(tumor necrosis factor receptor,TNFR)超家族和(或)白介素1(interleu?kin-1,IL-1)/Toll樣受體超家族成員結(jié)合,通過轉(zhuǎn)錄因子NF-κB、JNK/p38、(PI3K)/AKT、AP-1通路的激活,影響細(xì)胞的生成、增殖、分化和死亡,調(diào)控先天性和獲得性免疫、炎癥反應(yīng)、胚胎發(fā)育、氧化應(yīng)激、骨代謝等多個生物學(xué)過程[8-9]。目前關(guān)于TRAF6對NLRP3炎癥小體信號通路調(diào)控的報道還很少。本研究揭示了TRAF6通過增加NLRP3的穩(wěn)定性,正調(diào)控NLRP3炎癥小體信號通路的分子機(jī)制。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        人胚胎腎細(xì)胞HEK-293T和人單核巨噬細(xì)胞THP-1,真核表達(dá)質(zhì)粒Myc-Vector、Myc-TRAF6、Myc-NLRP3、Flag-Vector、Flag-TRAF6和Flag-NL?RP3為西安交大醫(yī)學(xué)部保存;Myc標(biāo)簽抗體、Flag標(biāo)簽抗體、α-tubulin抗體、TRAF6抗體購自Abcam公司;HRP標(biāo)記的羊抗鼠二抗購自北京中杉金橋生物有限公司;siTRAF6序列和作為對照的siS?cramble序 列(5'-GTGCAAGTGCAAACCAGACTT-3')購自蘇州吉瑪基因股份有限公司;Flag標(biāo)簽抗體偶聯(lián)的瓊脂糖珠、Myc標(biāo)簽抗體偶聯(lián)的磁珠、脂多糖(LPS)、腺苷三磷酸(ATP)購自Sigma公司;轉(zhuǎn)染試劑jetPRIME購自PolyPlus公司;培養(yǎng)基和血清購自Gibco公司;聚偏二氟乙烯膜(PVDF)、顯影液購自Millipore公司;乳酸脫氫酶(LDH)細(xì)胞毒性檢測試劑盒購自碧云天生物公司;細(xì)胞培養(yǎng)箱產(chǎn)自Thermo公司;蛋白質(zhì)電泳槽和電源產(chǎn)自Bio-Rad公司;旋轉(zhuǎn)孵育儀產(chǎn)自江蘇海門儀器廠;離心機(jī)產(chǎn)自Eppendorf公司;半干轉(zhuǎn)膜儀和化學(xué)發(fā)光拍照系統(tǒng)產(chǎn)自天能生物技術(shù)公司;酶標(biāo)儀產(chǎn)自Perkin Elmer公司。

        1.2 細(xì)胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染

        用含10%胎牛血清、100 mmol/L鏈霉素、100 mmol/L青霉素的DMEM培養(yǎng)基,于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)HEK-293T細(xì)胞;用含10%胎牛血清、100 mmol/L鏈霉素、100 mmol/L青霉素的1640培養(yǎng)基,于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)THP-1細(xì)胞。用轉(zhuǎn)染試劑jetPRIME進(jìn)行轉(zhuǎn)染,取細(xì)胞培養(yǎng)基1/10量的轉(zhuǎn)染試劑緩沖液,向緩沖液中加入待轉(zhuǎn)染質(zhì)粒后漩渦混勻15 s,靜置10 min后加入jetPRIME轉(zhuǎn)染試劑再漩渦混勻15 s,室溫靜置15 min后將配好的轉(zhuǎn)染液加入提前半量換液的細(xì)胞培養(yǎng)基中,4~6 h后補(bǔ)充新鮮的培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)染24 h后細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)處理。

        1.3 免疫共沉淀

        用細(xì)胞刮子刮取細(xì)胞,4℃、3000 r/min離心5 min收集細(xì)胞,再用預(yù)冷的PBS清洗細(xì)胞3次,加入600μL NP40裂解液重懸細(xì)胞,冰上靜置20 min,4℃、12 000 r/min離心10 min,收集上清。取上清的1/10用于檢測全細(xì)胞蛋白,剩余部分各加入20μL Flag瓊脂糖珠子,4℃旋轉(zhuǎn)搖床上孵育2 h,4℃、3000 r/min離心3 min,棄上清,沉淀用NP40洗脫液清洗3次,得到的沉淀和之前取出的1/10上清分別加入50μL含巰基乙醇的4×SDS緩沖液,沸水中煮10 min,4℃、12 000 r/min離心10 min,進(jìn)行免疫印跡分析。

        1.4 免疫印跡

        用細(xì)胞刮子刮取細(xì)胞,4℃、3000 r/min離心5 min收集細(xì)胞,再用預(yù)冷的PBS清洗細(xì)胞3次,用1×PBS重懸細(xì)胞,再加入含巰基乙醇的4×SDS緩沖液混勻,沸水煮10 min后12 000 r/min離心10 min,取上清進(jìn)行SDS-PAGE,半干轉(zhuǎn)膜儀18 V、100 min將凝膠中的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,將PVDF膜放入5%脫脂牛奶中室溫封閉1 h,封閉完畢后孵育一抗(室溫1 h),TBST洗滌3次,每次5 min,孵育二抗(室溫1 h),TBST洗滌3次,每次5 min,化學(xué)發(fā)光顯影。

        1.5 LDH檢測

        用碧云天生物公司的乳酸脫氫酶細(xì)胞毒性檢測試劑盒檢測細(xì)胞釋放的LDH。

        1.6 統(tǒng)計學(xué)分析

        數(shù)據(jù)以x±s表示,用SPSS17.0軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行重復(fù)測量資料的方差分析,組間數(shù)據(jù)比較采用Dunnettt檢驗,P<0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 TRAF6與NLRP3相互作用

        為了研究TRAF6與NLRP3是否存在相互作用,我們將Myc-TRAF6分別與Flag-Vector和Flag-NLRP3共轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞,用Flag珠子進(jìn)行免疫共沉淀,結(jié)果顯示Flag-NLRP3的免疫沉淀復(fù)合物中含有Myc-TRAF6,而Flag-Vector的免疫沉淀復(fù)合物中不含Myc-TRAF6(圖1A)。為了進(jìn)一步驗證TRAF6與NLRP3的相互作用,排除Myc-TRAF6與Flag珠子發(fā)生非特異結(jié)合的可能性,再次將Flag-NLRP3分別與Myc-Vector和Myc-TRAF6共 轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞,用Myc珠子 進(jìn)行免疫共沉淀,結(jié)果顯示Myc-TRAF6的免疫沉淀復(fù)合物中含有Flag-NLRP3,而Myc-Vector的免疫沉淀復(fù)合物中不含F(xiàn)lag-NLRP3(圖1B)。上述結(jié)果說明TRAF6能夠與NLRP3相互作用。

        2.2 TRAF6增加NLRP3的蛋白穩(wěn)定性

        TRAF6能夠與NLRP3相互作用,接下來我們研究TRAF6對NLRP3蛋白穩(wěn)定性的影響。將不同劑量的Myc-TRAF6分別與Flag-NLRP3共轉(zhuǎn)染HEK-293T細(xì)胞,進(jìn)行免疫印跡檢測,結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染不同量Myc-TRAF6的實驗組中Myc-TRAF6的表達(dá)量確實存在差異,而且表達(dá)量隨著轉(zhuǎn)染量的增加而增加,證明本實驗使用的轉(zhuǎn)染體系的高效性。同時,Myc-TRAF6能夠使Flag-NLRP3蛋白水平顯著增加(圖2),而且Flag-NLRP3的蛋白水平隨Myc-TRAF6蛋白水平的升高而逐步升高,這說明TRAF6對NLRP3具有正調(diào)控作用。

        2.3 TRAF6促進(jìn)NLRP3炎癥小體介導(dǎo)的LDH釋放

        如上,TRAF6能夠與NLRP3相互作用并上調(diào)NLRP3的蛋白穩(wěn)定性,因此進(jìn)一步研究TRAF6對NLRP3炎癥小體信號通路的影響。首先檢測TRAF6小干擾RNA(siRNA)序列在THP-1細(xì)胞中的干擾效率。將TRAF6 siRNA序列和作為對照的siScramble序列分別轉(zhuǎn)染THP-1細(xì)胞,收取細(xì)胞進(jìn)行免疫印跡實驗,檢測TRAF6的表達(dá),結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染TRAF6 siRNA序列的實驗組THP-1細(xì)胞中TRAF6蛋白表達(dá)水平明顯低于轉(zhuǎn)染siScram?ble序列的對照組(圖3A),說明該TRAF6 siRNA序列可有效敲低THP-1細(xì)胞中的TRAF6。隨后進(jìn)行NLRP3炎癥小體介導(dǎo)的LDH釋放的研究。先將TRAF6 siRNA序列和siScramble序列分別轉(zhuǎn)染THP-1細(xì)胞,然后同時加入刺激物L(fēng)PS,接著再同時加入刺激物ATP,刺激一段時間后檢測LDH的釋放。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染TRAF6 siRNA序列的實驗組THP-1細(xì)胞中LDH的釋放量明顯低于轉(zhuǎn)染siScramble序列的對照組(圖3B),說明TRAF6能夠促進(jìn)NLRP3炎癥小體介導(dǎo)的LDH釋放,能夠正調(diào)控NLRP3炎癥小體信號通路的活性。

        圖1 TRAF6與NLRP3相互作用

        3 討論

        炎癥小體主要由受體蛋白、含CARD結(jié)構(gòu)域的ASC和caspase-1前體(pro-caspase-1)構(gòu)成[10]。不同的受體蛋白響應(yīng)不同的刺激信號,從而介導(dǎo)炎癥小體的組裝,進(jìn)而激活下游信號通路。

        NLRP3炎癥小體可以被機(jī)體內(nèi)多種PAMP和DAMP所活化。研究表明,細(xì)胞內(nèi)鉀離子和鈣離子濃度的變化、線粒體損傷后釋放的線粒體DNA和活性氧(reactive oxy gen species,ROS)、顆粒物微晶尿酸鈉(monosodium urate,MSU)等都能夠激活NLRP3炎癥小體[11-15],翻譯后修飾(post-transla?tional modification,PTM)在NLRP3炎癥小體信號通路的調(diào)控中也起重要作用。

        圖2 TRAF6下調(diào)NLRP3的蛋白穩(wěn)定性

        圖3 TRAF6抑制NLRP3炎癥小體介導(dǎo)的LDH釋放

        研究表明,有絲分裂相關(guān)的絲蘇氨酸激酶Nek7能夠調(diào)節(jié)NLRP3炎癥小體的活化,抑制Nek7的表達(dá)可以阻斷NLRP3炎癥小體的組裝和活化[16-17]。盡管鑒定Nek7在炎癥小體活化中的作用是該領(lǐng)域近年來的重要進(jìn)展之一,但Nek7調(diào)控NLRP3炎癥小體活化的具體機(jī)制還須進(jìn)一步探究。激酶JNK1也能促進(jìn)NLRP3磷酸化,該磷酸化修飾介導(dǎo)了NLRP3去泛素化及寡聚化,進(jìn)而促進(jìn)NLRP3炎癥小體的激活[18-20]。NLRP3炎癥小體的活性除了受到激酶的調(diào)控,文獻(xiàn)報道磷酸酶2A(phosphatase 2A,PP2A)可通過使NLRP3 PYD(pyrin domain,PYD)結(jié)構(gòu)域去磷酸化而調(diào)節(jié)炎癥小體的組裝,可見激酶和磷酸酶之間的平衡對于NLRP3的活化是重要的調(diào)節(jié)元件。除了磷酸化修飾參與的調(diào)控,泛素化修飾也在其中起著重要的作用,有文獻(xiàn)報道,NLRP3炎癥小體活化時依賴其自身的去泛素化,抑制去泛素化酶BRCC3的表達(dá)能夠顯著抑制NLRP3炎癥小體的活化[21]。

        盡管近年來關(guān)于NLRP3炎癥小體活化機(jī)制的研究取得了一些重要的進(jìn)展,但仍然還有很多問題很不清楚。比如,目前已知的NLRP3炎癥小體激活劑是如何最終激活NLRP3的,還有哪些成分能夠激活NLRP3炎癥小體,調(diào)控NLRP3炎癥小體信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的成分有哪些、它們是如何起作用的等。本研究揭示了TRAF6通過增加NLRP3的穩(wěn)定性正調(diào)控NLRP3炎癥小體信號通路的分子機(jī)制,這不僅闡明了重要信號分子TRAF6的新功能,而且為理解NLRP3炎癥小體激活的分子機(jī)制提供了重要的啟示。但是TRAF6調(diào)控NLRP3炎癥小體信號通路的具體分子機(jī)制是什么,TRAF6是否依賴于其自身E3泛素蛋白連接酶活性泛素化修飾NLRP3促進(jìn)其穩(wěn)定性增加,TRAF6是否特異性地調(diào)控NLRP3炎癥小體信號通路,TRAF6是否特異性地調(diào)控某些成分激活的NLRP3炎癥小體信號通路,這些都還有待進(jìn)一步研究。

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