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        ARMS法檢測(cè)肺腺癌EGFR基因突變分析

        2019-04-01 11:45:22吳海喬
        醫(yī)藥前沿 2019年4期
        關(guān)鍵詞:基因突變差異檢測(cè)

        吳海喬

        (廈門大學(xué)附屬成功醫(yī)院病理科 福建 廈門 361001)

        一直以來,尋找早期篩查肺癌的方法是學(xué)者目前的熱門研究問題。表皮生長因子(EGFR)是一種受體型酪氨酸激酶,在細(xì)胞的生長、生殖以及分化過程中發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用。經(jīng)過諸多研究發(fā)現(xiàn)EGFR在多種腫瘤中會(huì)存在突變表達(dá),對(duì)腫瘤的生長、侵襲以及轉(zhuǎn)移發(fā)揮調(diào)節(jié)作用。尤其是在肺腺癌中具有較高的突變率[2]。臨床實(shí)踐研究中,分析肺腺癌患者的EGFR基因突變對(duì)于患者的靶向治療療效具有全面性評(píng)價(jià),評(píng)價(jià)EGFR基因突變檢測(cè),對(duì)于選擇合適的患者進(jìn)行靶向治療十分必要。本文則探討采用ARMS法檢測(cè)肺腺癌患者的EGFR基因突變并分析。

        1.臨床資料

        收集我院病理科的148例肺腺癌患者標(biāo)本作為研究對(duì)象,包括82例肺活檢標(biāo)本、24例手術(shù)切除標(biāo)本以及42例胸腔積液細(xì)胞塊標(biāo)本。所選患者中男性86例,女性62例,年齡在34-78歲之間,所選患者均未進(jìn)行放化療及其他抗癌治療。

        2.研究方法

        2.1 標(biāo)本采集與DNA提取

        根據(jù)經(jīng)驗(yàn)切取不同類型的腫瘤標(biāo)本,制作石蠟標(biāo)本,采用廈門艾德公司的石蠟包埋組織樣品 DNA 提取試劑盒,進(jìn)行DNA提取。調(diào)整DNA質(zhì)量濃度至2ng/μl。

        2.2 EGFR檢測(cè)

        檢測(cè)EGFR基因突變,具體為19del,L858R以及T790M突變。

        采用ARMS法檢測(cè)EGFR基因突變,儀器為ABI 7500熒光PCR儀,試劑盒購自廈門艾德生物公司的人類 EGFR 基因突變檢測(cè)試劑盒。具體實(shí)驗(yàn)操作按照試劑盒說明書進(jìn)行:取上述DNA標(biāo)本23.5μl,加入1.5μlTaq酶,進(jìn)行混勻后取出5μl加入8聯(lián)管。然后進(jìn)行程序擴(kuò)增,95℃ 5min,95℃ 25s,64℃ 20s,72℃ 20s,15個(gè)循環(huán);93℃ 25s,60℃ 35s,72℃ 20s,31 個(gè)循環(huán)。60℃時(shí)收集熒光信號(hào)。

        2.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        采用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)數(shù)資料進(jìn)行卡方檢驗(yàn),結(jié)果均以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        3.結(jié)果

        3.1 EGFR基因在肺腺癌標(biāo)本中的突變

        本文所選148例肺腺癌患者標(biāo)本,共檢測(cè)出EGFR基因突變60例(40.5%)。具體基因突變類型,包括19del突變23例(15.5%),L858R突變34例(23.0%),19del和L858R雙突變2例(1.35%)。本文未檢測(cè)到T790M突變。

        3.2 EGFR 基因突變與肺腺癌臨床病理特征的關(guān)系

        根據(jù)是否存在EGFR基因突變,進(jìn)行分組為EGFR基因突變陽性組和陰性組,比較不同臨床資料患者間的差異,結(jié)果提示在性別、吸煙史上,EGFR基因突變情況存在差異(P<0.05);在年齡及腫瘤家族史上,EGFR基因突變情況不存在差異(P>0.05)。提示EGFR基因突變與患者的性別及吸煙是存在顯著關(guān)系。

        表1 EGFR基因突變與肺腺癌患者相關(guān)因素分析 [n(%)]

        4.討論

        在NCCN指南推薦中,對(duì)于晚期肺腺癌患者的一線治療可根據(jù)是否存在EGFR等驅(qū)動(dòng)基因事件進(jìn)行指導(dǎo),其中EGFR基因突變的類型不同,其靶向治療效果亦存在一定的差異。因此,臨床上準(zhǔn)確檢測(cè)肺腺癌患者的EGFR基因突變,對(duì)于指導(dǎo)患者的個(gè)體化靶向治療具有重要意義。EGFR基因突變,與諸多因素有關(guān),如患者因素、檢測(cè)方法以及標(biāo)本因素等。

        本文在總結(jié)既往諸多文獻(xiàn)基礎(chǔ)上,采用以熒光定量PCR技術(shù)為基礎(chǔ)的ARMS法,根據(jù)不同位點(diǎn)設(shè)計(jì)的特異性探針,特異性識(shí)別并擴(kuò)增 EGFR 突變序列,盡量減少非腫瘤組織的干擾。通過ARMS檢測(cè)法,最大限度地縮短擴(kuò)增產(chǎn)物的目標(biāo)長度,避免DNA提取出現(xiàn)片段化。結(jié)合RT-PCR平臺(tái)在擴(kuò)增時(shí)采用了一個(gè)閉管操作,簡單,不需要產(chǎn)物的后處理,較大避免了擴(kuò)增產(chǎn)物的污染,使得結(jié)果更為準(zhǔn)確。

        本文研究結(jié)果提示所選148例肺腺癌患者標(biāo)本,共檢測(cè)出EGFR基因突變60例(40.5%),檢出率較高,與宿杰·阿克蘇相關(guān)報(bào)道一致[1]。進(jìn)一步研究EGFR基因突變的臨床資料,提示不同性別、吸煙史患者其EGFR基因突變發(fā)生率存在差異,女性、不吸煙患者EGFT突變率更高為53.2%、50.5%,提示吸煙會(huì)影響患者的EGFR基因突變。而腫瘤家族史以及患者年齡方面因素,不會(huì)影響患者的EGFR發(fā)生突變。因此,臨床上對(duì)于女性、不吸煙的肺腺癌患者建議進(jìn)行 EGFR基因突變檢測(cè),進(jìn)一步指導(dǎo)臨床治療。

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