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        人SIRT6蛋白的原核表達及純化

        2019-02-28 03:26:38羅沙柳任鑫鑫羅菲梁迎春馬超劉坤冉芳施亞嬌李玲葉棋濃
        生物技術(shù)通訊 2019年6期
        關(guān)鍵詞:糖酵解菌液質(zhì)粒

        羅沙柳,任鑫鑫,羅菲,梁迎春,馬超,劉坤,冉芳,施亞嬌,李玲,葉棋濃

        1.貴州大學 醫(yī)學院,貴州 貴陽550025;2.軍事科學院 軍事醫(yī)學研究院 生物工程研究所,北京100850;3.山西醫(yī)科大學 第二醫(yī)院,山西 太原030000;4.大連醫(yī)科大學 腫瘤干細胞研究院,遼寧 大連,116044;5.中部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院 衛(wèi)勤部科訓科,湖北 武漢430072

        Sirtuins(SIRT)家族中的沉默信息調(diào)節(jié)因子2(silent information regulator 2,Sir2)最早在酵母中被發(fā)現(xiàn)[1]。迄今,科學家們在哺乳動物中已經(jīng)確定 了7種與Sir2 同 源的基因,即SIRT1~SIRT7[2]。人類的SIRT6基因位于染色體19P13.3 區(qū)域,包括8個外顯子,編碼的蛋白全長355個氨基酸殘基,相對分子質(zhì)量39×103,等電點9.12[3]。SIRT6 最初被認為是單-ADP-核糖基轉(zhuǎn)移酶,可以通過分子內(nèi)機制完成放射性標記的轉(zhuǎn)移,這表明SIRT6 可能利用ADP-核糖基化來自動調(diào)節(jié)自身活性,但是其最主要作用還是作為組蛋白脫乙酰酶[4-9]。

        目前研究證明,SIRT6在基因組穩(wěn)定性、代謝、染色質(zhì)調(diào)控、端粒完整性、基因轉(zhuǎn)錄和糖脂代謝等方面都起關(guān)鍵調(diào)控作用,調(diào)節(jié)糖尿病、心臟病、肥胖、癌癥及壽命、衰老等相關(guān)病理生理的發(fā)生發(fā)展[10-12]。SIRT6在體內(nèi)控制許多代謝途徑,包括糖酵解、糖異生、甘油三酯合成和LDL-膽固醇穩(wěn)態(tài),SIRT6 缺乏導致主要代謝缺陷[13-16]。對于癌癥,SIRT6 可以通過多種機制發(fā)揮抑癌作用,敲除SIRT6的小鼠胚胎成纖維細胞(MEF)比野生型MEF細胞生長增殖快,且敲除SIRT6 有促進腫瘤發(fā)生的作用[13];敲除SIRT6基因的腫瘤細胞的乳酸生成、葡萄糖攝取等均增加[17]。對116例乳腺癌病人的組化分析顯示SIRT6 高表達的病人生存預后差,SIRT6 通過調(diào)控FOXO的表達降低腫瘤細胞對化療藥的敏感性;在前列腺腫瘤組織和前列腺癌細胞中SIRT6表達都高于正?;虬┡越M織,且敲低SIRT6 降低細胞活力,增加藥物的敏感性等;這又從另外一個層面說明SIRT6 發(fā)揮致癌作用[17-20]。有文獻報道SIRT6 能與缺氧誘導因子HIF1α相互作用[17],從而調(diào)控腫瘤的代謝重編程。

        在本研究中,我們構(gòu)建了帶GST 標簽的人SIRT6基因原核表達載體,表達純化獲得重組GST-SIRT6 蛋白,驗證了SIRT6與HIF1α之間的關(guān)系,有助于進一步探討SIRT6在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的調(diào)控機制。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        大腸桿菌DH5α、BL21(DE3)感受態(tài)細胞購自北京博邁德科技發(fā)展有限公司;人乳腺文庫、帶GST 標簽的pGEX-KG 原核表達載體為本室保存;PCR 試劑、限制性內(nèi)切酶及DNA 連接酶購自TaKaRa 公司;質(zhì)粒提取、膠回收試劑盒購自Pro?mega 公司;GST-Sepharose 4B 珠購自Pharmacia 公司;HRP 標記的抗GST 單克隆抗體購自GE Healthcare Life Sciences 公司;引物合成及測序由北京博邁德科技發(fā)展有限公司完成。

        1.2 人SIRT6基因編碼區(qū)的獲取

        根據(jù)GenBank 中的人源SIRT6基因編碼序列設計上游引物5'-CGGGATCCATGTCGGTGAATT ACGCGGCGGGG-3'和下游引物,5'-CCGCTCGAG TCAGCTGGGGACCGCCTTGGCCT-3'。以本室保存的乳腺文庫為模板,用Primer Star DNA 聚合酶擴增目的基因片段(PCR 程序:95℃預變性5 min,95℃變性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸75 s,共35個循環(huán),72℃再延伸5 min)。瓊脂糖膠檢測PCR 產(chǎn)物,切出目的基因片段,用膠回收試劑盒回收目的片段。

        1.3 GST-SIRT6 重組質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定

        將回收的目的基因片段及載體GST 分別用限制性內(nèi)切酶BamHⅠ/XhoⅠ于37℃雙酶切4~6 h 或過夜,瓊脂糖凝膠電泳回收雙酶切后的PCR 產(chǎn)物及載體。將雙酶切的PCR 產(chǎn)物及載體用T4DNA連接酶于16℃連接6 h 以上后轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),挑菌進行菌液PCR 鑒定,將鑒定得到的陽性克隆用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,雙酶切鑒定,并送北京博邁德生物公司測序。

        1.4 重組質(zhì)粒GST-SIRT6的誘導及表達鑒定

        將測序正確的GST-SIRT6 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21 感受態(tài)并涂于含氨芐青霉素的LB 板上,37℃恒溫箱中培養(yǎng)過夜,挑取單菌落于裝有5 mL 含氨芐青霉素的LB 培養(yǎng)基的10 mL 試管中,于37℃、200 r/min 搖床上振蕩培養(yǎng)過夜,按1∶50 將菌液稀釋,30℃培養(yǎng)至D600nm約為0.6,用終濃度1 mmol/L的IPTG 小量誘導,調(diào)定溫度至20℃繼續(xù)振蕩培養(yǎng)4~6 h。收集誘導前、后的菌液,裂解后行Western 印跡,鑒定有無SIRT6 蛋白表達。

        1.5 GST-SIRT6 融合蛋白的純化

        挑選出能誘導GST-SIRT6 蛋白的重組大腸桿菌BL21 接種于5 mL 含氨芐青霉素的LB 中,37℃培養(yǎng)過夜,將菌液轉(zhuǎn)移到300 mL 含氨芐青霉素的LB 中,30℃、200 r/min 振蕩培養(yǎng)4~6 h,直至菌液D600nm為1.0~1.5,再 按1∶10 000的比例 加 入IPTG,20℃、200 r/min 培養(yǎng)16~24 h。離心收集菌體沉淀,加入裂解液重懸,冰浴30 min 使菌體充分裂解,再用超聲波裂解細菌,收集上清液,加入GST-Sepharose 4B 純化珠,4℃旋轉(zhuǎn)結(jié)合4 h 或過夜,離心收集結(jié)合蛋白后的GST-Sepharose 4B 純化珠,緩沖液洗脫未結(jié)合的蛋白后得到純化的融合蛋白,行SDS-PAGE,考馬斯亮藍染色鑒定。

        1.6 GST-pulldown 實驗

        用5 μg MYC-HIF1α真核表達載體分別轉(zhuǎn)染2個6 cm 皿的293T細胞系,24~48 h后收細胞,超聲波裂解半小時,4℃、12 000 r/min 離心5 min,取25 μL 上清,加入等量2×SDS 上樣緩沖液作為結(jié)合前的蛋白樣,將剩余上清與已純化的GST、GST-SIRT6 蛋白珠于4℃結(jié)合4~6 h,再用IP緩沖液洗滌蛋白珠,棄上清,加入2×SDS 上樣緩沖液,Western 印跡檢測。

        2 結(jié)果

        2.1 GST-SIRT6 重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定

        以本實驗室保存的人乳腺文庫為模板,PCR擴增人SIRT6基因的編碼序列,獲得1059 bp的DNA片段,與預期大小一致(圖1)。將BamHⅠ/XhoⅠ酶切后的PCR 產(chǎn)物與GST 載體連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),挑菌后進行菌液PCR 鑒定,獲得與目的條帶1059 bp 大小接近(圖2)的克隆,初步認定是帶有人源SIRT6基因的陽性重組克隆。選取陽性克隆提質(zhì)粒,酶切鑒定,可切出長度分別約為5000和1059 bp的條帶,而相應的空載體酶切后只見大條帶,與預期結(jié)果相符(圖3)。重組質(zhì)粒測序結(jié)果表明,插入的DNA片段序列與人SIRT6基因的編碼序列一致(序列略)。

        2.2 GST-SIRT6 重組質(zhì)粒的表達鑒定

        分別用HRP 標記的抗GST 單克隆進行West?ern 印跡,結(jié)果見圖4。泳道4 相對分子質(zhì)量68×103左右有抗體特異結(jié)合條帶,即GST-SIRT6 融合蛋白(谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶GST 相對分子質(zhì)量26×103左右,SIRT6 為42×103左右)。泳道4 相對分子質(zhì)量26×103~42×103是蛋白降解帶。結(jié)果與預期一致,說明GST-SIRT6 融合蛋白表達正確。

        2.3 融合蛋白GST-SIRT6的純化

        圖1 PCR 擴增人SIRT6的編碼序列

        圖2 重組質(zhì)粒GST-SIRT6的菌液PCR 結(jié)果電泳圖譜

        圖3 重組質(zhì)粒GST-SIRT6的BamHⅠ/XhoⅠ雙酶切電泳圖譜

        利用GST-Sepharose 4B 親和珠對GST-SIRT6進行純化,行SDS-PAGE,考馬斯亮藍染色,泳道2可見相應蛋白條帶出現(xiàn)(圖5)。

        2.4 GST-pulldown 實驗

        將MYC-HIF1α轉(zhuǎn)染293T細胞,所提取的蛋白和純化的GST、GST-SIRT6 蛋白珠結(jié)合,進行SDS-PAGE,分別用MYC-HRP和GST-HRP 抗體檢測,結(jié)果如圖6。結(jié)合后孵育MYC-HRP 抗體,泳道2 出現(xiàn)特異蛋白條帶,證明MYC-HIF1α與GSTSIRT6 融合蛋白有相互作用。

        3 討論

        圖4 Western 印跡檢測融合蛋白的表達

        圖5 重組蛋白GST-SIRT6的純化

        目前研究發(fā)現(xiàn)SIRT6在腫瘤中的作用具有爭議。SIRT6 最近被證明是一種明顯的腫瘤抑制因子,在人類多種癌癥中SIRT6 蛋白水平偏低,如在肝癌、胰腺癌、卵巢癌和結(jié)直腸癌等中都下調(diào)或突變[18-20]。在卵巢癌中,SIRT6 通過降低Notch3 抑制腫瘤增殖[21]。SIRT6 還通過控制Lin28b 抑制胰腺癌的發(fā)生發(fā)展。然而,SIRT6在前列腺癌、皮膚癌和乳腺癌等其他一些癌癥類型中高表達,并作為癌基因發(fā)揮作用,在小細胞肺癌中也有類似的現(xiàn)象[22]。在癌癥發(fā)生發(fā)展中,增加蛋白質(zhì)合成對癌細胞的存活、增殖、發(fā)展和轉(zhuǎn)化至關(guān)重要[23-24]。Ravi 等發(fā)現(xiàn)SIRT6 可以通過與轉(zhuǎn)錄因子SP1 結(jié)合,一起轉(zhuǎn)錄調(diào)控mTOR 信號通路,從而調(diào)控蛋白質(zhì)合成來影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展[25]。另有報道,SIRT6通過ERK1/2/MMP9 通路調(diào)控骨肉瘤的遷移和侵襲[26]。SIRT6 通過抑制糖酵解相關(guān)基因的表達來調(diào)節(jié)葡萄糖代謝的穩(wěn)態(tài)。SIRT6 通過在HIF1α靶基因啟動子上使H3K9 脫乙酰化而起到HIF1α轉(zhuǎn)錄活性的共抑制劑的作用,當SIRT6 失活時,HIF1α被激活,糖酵解基因啟動子的乙?;c多個代謝基因的表達增加,并最終導致糖酵解的增加和線粒體呼吸的減少[17]。SIRT6與SIRT1 直接結(jié)合后可以去乙?;痟nRNPA1,從而抑制肝癌細胞糖酵解和增殖[27]。綜上所述,SIRT6在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中都起到了關(guān)鍵作用。

        SIRT6 通過一些酶反應尤其是去乙?;?,可以模擬染色質(zhì)在致密狀態(tài)(如SREBP1和PCSK9)來抑制基因表達[28]。有報道發(fā)現(xiàn)SIRT6 可以通過HIF1α來調(diào)控Pdk1、Ldha、Pfkl1 等糖酵解相關(guān)基因[13],從而調(diào)控腫瘤代謝重編程[17]。在此我們進一步驗證了SIRT6與HIF1α在體外有相互作用,為后續(xù)研究SIRT6與HIF1α在腫瘤中對腫瘤糖代謝的影響進而影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。

        圖6 GST-pulldown 驗證GST-SIRT6與MYC-HIF1α的體外相互作用

        本研究構(gòu)建了帶GST 標簽的SIRT6 原核表達載體,并在IPTG誘導下表達了GST-SIRT6 融合蛋白,Western 印跡鑒定證實了目的蛋白的表達。該重組質(zhì)粒的構(gòu)建,為后續(xù)研究SIRT6在腫瘤中的發(fā)生發(fā)展制備了材料。

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