亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        高通量測序方法研究傳統(tǒng)四川泡菜母水中微生物群落的動態(tài)變化

        2019-01-07 02:38:12伍亞龍鄧維琴張其圣
        食品科學(xué) 2018年24期
        關(guān)鍵詞:泡菜群落真菌

        李 恒,陳 功,伍亞龍,鄧維琴,張 偉,朱 翔,王 勇,張其圣,*

        (1.四川東坡中國泡菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究院,四川 眉山 620030;2.四川省食品發(fā)酵工業(yè)研究設(shè)計院,四川 成都 611130)

        泡菜是一種具有獨特風(fēng)味和口感的傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜制品,歷史悠久,源遠(yuǎn)流長,距今已有三千多年的歷史。我國泡菜工藝多樣,產(chǎn)品種類極為豐富,其中尤以四川泡菜最為出名。傳統(tǒng)四川泡菜是以新鮮蔬菜為原料,經(jīng)乳酸菌為主導(dǎo)的微生物發(fā)酵而成,因富含活性乳酸菌、發(fā)酵副產(chǎn)物等健康元素,越來越得到消費者的青睞[1-4]?!澳杆l(fā)酵”是傳統(tǒng)四川泡菜最具特色的制備工藝之一。泡菜母水即傳統(tǒng)四川泡菜泡漬發(fā)酵時的鹽水,經(jīng)過不斷取出和投加蔬菜及輔料進(jìn)行泡制。泡菜母水中存在大量的乳酸菌、酵母菌、醋酸菌等活性微生物,同時,蔬菜的發(fā)酵也賦予了泡菜母水豐富的有機酸、游離氨基酸、醛類、酮類、酯類等風(fēng)味物質(zhì)[5-9]。

        國內(nèi)外學(xué)者研究發(fā)現(xiàn)泡菜中乳酸菌和酵母菌是優(yōu)勢菌群,乳酸菌在發(fā)酵過程中起主導(dǎo)作用。泡菜發(fā)酵過程中優(yōu)勢乳酸菌有糞腸球菌(Enterococcus faecalis)、乳酸球菌(Lactococcus lactis subsp.)、明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides subsp.)、Mesenteroides、植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)、干酪乳桿菌(Lactobacillus casei)和玉米乳桿菌(Lactobacillus zeae)等[6-7,10]。家庭制作泡菜中酵母菌有熱帶假絲酵母(Candida tropicalis)、漢森德比利酵母、Kazachstania unispora等[11]。泡菜中的微生物種類和數(shù)量極多,但其種群與構(gòu)成并不是一成不變的,在不同的發(fā)酵時期微生物種群和構(gòu)成有一定的差異。傳統(tǒng)四川泡菜采用“母水發(fā)酵”工藝,母水的形成與泡菜體系中微生物及其代謝產(chǎn)物有密切的關(guān)系[12-13]。目前已有報道多是針對泡菜本身或者泡菜母水中微生物含量[2,14-16]的研究,而針對不同發(fā)酵代數(shù)泡菜母水中微生物種類及動態(tài)變化的研究還鮮見報道。研究傳統(tǒng)四川泡菜母水中微生物隨不同發(fā)酵代數(shù)泡菜的動態(tài)變化對研究四川泡菜的安全性、風(fēng)味物質(zhì)、營養(yǎng)物質(zhì)的形成具有重要意義,可作為促進(jìn)四川傳統(tǒng)泡菜工業(yè)化生產(chǎn)的重要依據(jù)。

        可培養(yǎng)方法是傳統(tǒng)發(fā)酵食品體系中微生物最常見的研究方法,但采用可培養(yǎng)方法得到的微生物信息非常有限,對微生物世界的認(rèn)識存在片面性,存在較大的局限性。近年來,高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展為解析復(fù)雜的微生物體系提供了一種有效、便捷的方法。其通量高、準(zhǔn)確率高、可同時獲得微生物群落中的全部微生物定性及相對定量的遺傳信息等特點,被廣泛用于傳統(tǒng)發(fā)酵食品微生物體系的研究[17-18]。目前高通量測序已被廣泛用于奶酪、白酒、泡菜等發(fā)酵食品中微生物多樣性的研究[19-22]。本研究采用高通量測序技術(shù)對傳統(tǒng)四川泡菜母水(20 代泡菜)中細(xì)菌和真菌群落的動態(tài)變化進(jìn)行研究,解析不同代數(shù)發(fā)酵泡菜母水中的主要微生物群落構(gòu)成,揭示泡菜母水在不同蔬菜發(fā)酵代數(shù)的微生物群落動態(tài)變化規(guī)律及其穩(wěn)態(tài)結(jié)構(gòu)的形成,為傳統(tǒng)四川泡菜的多次數(shù)發(fā)酵泡菜風(fēng)味及品質(zhì)評價提供數(shù)據(jù)參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        蓮花白、白蘿卜、胡蘿卜、生姜、辣椒、花椒眉山當(dāng)?shù)夭耸袌?;無碘食用鹽 四川省鹽業(yè)公司;陶制泡菜壇 眉山當(dāng)?shù)厥袌觥?/p>

        無水乙醇(96%~100%) 成都市科龍化工有限公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒、DNA回收試劑盒天根生化科技(北京)有限公司;OMEGA真菌DNA提取試劑盒 美國BioTek公司;MRS培養(yǎng)基、孟加拉紅培養(yǎng)基、PDA培養(yǎng)基 北京陸橋技術(shù)有限公司;瓊脂糖北京索萊寶科技有限公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        DW-86W100超低溫冰箱 青島海爾股份有限公司;L6S紫外分光光度計、雷磁pHS-3C pH計 上海儀電科學(xué)儀器股份有限公司;T2002型電子天平 常熟市天量儀器有限責(zé)任公司;SHZ-D(III)循環(huán)式真空泵 鞏義市予華儀器有限責(zé)任公司;DZKW-4電子恒溫水浴鍋 北京中興偉業(yè)儀器有限公司;YM75Z75L不銹鋼立式壓力蒸汽滅菌器 上海博訊實業(yè)有限公司;QL-901旋渦混合器 海門市其林貝爾儀器制造有限公司;SW-CJ-IFD超凈工作臺江蘇蘇凈集團(tuán)有限公司;純水機 四川優(yōu)普超純科技有限公司。

        圖1 泡菜母水制備示意圖Fig. 1 Schematic representation of pickle brine preparation

        1.3 方法

        1.3.1 泡菜母水制備

        表1 泡菜制備原輔料配比Table 1 Ingredients used for Paocai preparation

        泡菜母水的制備方法如圖1所示,原輔料配比如表1所示。泡菜母水的制備步驟為:1)將新鮮蓮花白、白蘿卜、胡蘿卜、生姜、小米辣用清水沖洗干凈,并按照要求進(jìn)行切分;2)先將處理后的原輔料投入到2.5 L的陶制泡菜壇中,再將食鹽加入到純凈水中溶解并加入到壇內(nèi);3)密封后的泡菜壇置于23 ℃條件下進(jìn)行密封發(fā)酵,并及時取樣檢測;4)新鮮疏菜密封發(fā)酵5 d后,揭開壇蓋用干凈的玻璃棒輕微攪拌壇內(nèi)泡菜,再靜置10 min后,于液面下10 cm處四周及中間共5 點取泡菜及母水樣品10 mL混合后待測,此為1代泡菜母水;再向壇內(nèi)加入新鮮的蓮花白、白蘿卜、胡蘿卜,同時向壇內(nèi)加入新鮮蔬菜總質(zhì)量2%的食鹽16 g,密封后置于23 ℃恒溫條件下發(fā)酵2 d,繼續(xù)取樣,此為2代泡菜;此后每隔2 d取出成熟泡菜與泡菜水,并加入新鮮蔬菜進(jìn)行下一代泡制,如此不斷重復(fù),連續(xù)泡菜20 代;5)泡菜壇內(nèi)生姜與辣椒在泡漬發(fā)酵5 代后更換相同質(zhì)量的新鮮生姜、辣椒和花椒,即在第5、10、15、20代時將壇內(nèi)的泡生姜、泡辣椒和花椒取出,加入相同質(zhì)量的新鮮生姜、辣椒和花椒,同時加入新鮮生姜和辣椒總質(zhì)量2%的食鹽。

        1.3.2 DNA提取和聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增

        分別取第1、2、3、5、7、10、12、15、18、20代的泡菜母水,采用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒和真菌DNA提取試劑盒分別提取細(xì)菌和真菌基因組DNA,采用核酸蛋白微量檢測儀檢測DNA的濃度和純度,置于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>

        采用338 F-806 R為引物擴(kuò)增細(xì)菌16S DNA V3-V4區(qū)序列,采用ITS1 F-2043 R為引物擴(kuò)增真菌ITS區(qū)序列。采用天根瓊脂糖DNA回收試劑盒對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行切膠回收,然后按照PCR產(chǎn)物的檢測方法檢測。

        1.3.3 高通量測序

        將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司進(jìn)行MiSeq測序,按照97%相似性對非重復(fù)序列(不含單序列)進(jìn)行操作分類單元(operational taxonomic units,OTU)聚類,得到OTU的代表序列,將所有優(yōu)化序列map至OTU代表序列,選出與OTU代表序列相似性在97%以上的序列,最后采用RDP classifier貝葉斯算法對97%相似水平的OTU代表序列進(jìn)行分類學(xué)分析,并在各個水平統(tǒng)計每個樣品的群落組成。16S細(xì)菌使用Silva數(shù)據(jù)庫,ITS真菌使用Unite的真菌數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 泡菜母水中的細(xì)菌多樣性結(jié)果分析

        利用MiSeq測序方法對第1、2、3、5、7、10、12、15、18、20代泡菜母水的10 個樣品進(jìn)行分析,共得到961 752 條序列,平均序列長度449.34 bp。其中421~440 bp的序列占2.84%;441~460 bp的序列占97.16%。本次測序的目標(biāo)序列是V3-V4,說明測序長度正確。

        圖2 泡菜母水細(xì)菌在門(A)和屬(B)水平上的相對含量Fig. 2 Relative abundance of bacteria in Paocai brine at the phylum (A) and genus (B) levels

        對優(yōu)化序列提取非重復(fù)序列,按照97%相似性對非重復(fù)序列(不含單序列)進(jìn)行OTU聚類,在聚類過程中去除嵌合體,得到OTU的代表序列。將所有優(yōu)化序列map至OTU代表序列,選出與OTU代表序列相似性在97%以上的序列,生成OTU表格。961 752 條序列經(jīng)過上述處理,共劃分得到81個OTU分類。

        泡菜母水中細(xì)菌在門和屬水平上的相對含量分布結(jié)果如圖2所示,其細(xì)菌分屬7個門,分別為Firmicutes、Proteobacteria、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(Actinobacteria)、梭菌門(Fusobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)和藍(lán)藻門(Cyanophyta)。Firmicutes是泡菜中最常見的細(xì)菌類群,含有19 個OTU,占OTU總數(shù)量的23.46%;包含有效序列896 313 條,占總有效序列的94.64%。Proteobacteria在泡菜菌群中占46個OTU,占OTU總數(shù)量的56.79%;包含有效序列25 787條,占總有效序列的2.73%。其他5個菌門的序列占細(xì)菌總有效序列的比例均很低,分別為Bacteroidetes 0.025%、Actinobacteria 0.001 4%、Fusobacteria 0.002 3%、Chloroflexi 0.001 2%、Cyanophyta 2.61%。與Liang Huipeng等[5]以聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCRDGGE)結(jié)合熒光定量核酸(real-time quantitative PCR,qPCR)擴(kuò)增檢測系統(tǒng)為手段分析的泡菜微生物菌群結(jié)構(gòu)(僅發(fā)現(xiàn)Firmicutes和Proteobacteria 2 個門的細(xì)菌)相比,本研究結(jié)果準(zhǔn)確、全面地揭示了四川泡菜中的細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu),進(jìn)一步表明高通量測序手段在微生物群落結(jié)構(gòu)分析方面的優(yōu)勢[23]。

        從屬水平來看,泡菜母水中含量在0.1%以上的細(xì)菌屬有7 個,包括乳桿菌屬(Lactobacillus)、拉烏爾菌屬(Raoultella)、檸檬酸桿菌屬(Citrobacter)、乳球菌屬(Lactococcus)、藍(lán)藻細(xì)菌屬(Cyanobacteria_norank)、腸桿菌屬(Enterobacter)和未鑒定到屬(Enterobacteriaceae_unclassifi)。其中Lactobacillus是泡菜母水中的主要細(xì)菌屬,包含3 個OTU,占OTU總數(shù)的3.70%,但包含有效序列904 029 條,占總有效序列的93.89%;Cyanobacteria_norank包含1 個OTU,占OTU總數(shù)的1.23%,包含有效序列255 210 條,占總有效序列的2.65%;Raoultella包含1 個OTU,占OTU總數(shù)的1.23%,包含有效序列8 022 條,占總有效序列的0.83%;Citrobacter包含1 個OTU,占OTU總數(shù)的1.23%,包含有效序列6 785 條,占總有效序列的0.70%;Lactococcus包含2 個OTU,占OTU總數(shù)的2.46%,包含有效序列5 399 條,占總有效序列的0.56%。除此之外,還包括Enterobacter、Enterobacteriaceae_unclassifi、Pseudomonas、Leuconostoc、Enterococcus、Acinetobacter等菌屬,但相對含量均不足0.1%。Lactobacillus在整個泡菜發(fā)酵過程中均為優(yōu)勢菌,這種細(xì)菌因其益生作用被廣泛用作各類食品的發(fā)酵劑[5,24-26];最近有報道顯示,Raoultella在廣元酸菜中也有檢出[27];Citrobacter和Lactococcus細(xì)菌在發(fā)酵蔬菜研究中常被檢出,Lactococcus對發(fā)酵乳的酸化及風(fēng)味的產(chǎn)生貢獻(xiàn)較大,其對于泡菜的風(fēng)味形成亦起重要作用[5,28]。

        2.2 泡菜母水中的真菌多樣性結(jié)果分析

        利用Illumina高通量測序平臺對第1、2、3、5、7、10、12、15、18、20代泡菜母水的20個樣品進(jìn)行分析,共得到514 126 條真菌序列,平均序列長度318.25 bp。其中221~240 bp的序列占2.79%,241~260 bp的序列占1.45%,241~260 bp的序列占95.03%,可以覆蓋目標(biāo)測序長度。

        對優(yōu)化序列提取非重復(fù)序列,按照97%相似性對非重復(fù)序列(不含單序列)進(jìn)行OTU聚類,在聚類過程中去除嵌合體,得到OTU的代表序列。將所有優(yōu)化序列map至OTU代表序列,選出與OTU代表序列相似性在97%以上的序列,生成OTU表格。514 126 條真菌序列經(jīng)過上述處理,共劃分得到90 個OTU分類。

        圖3 泡菜母水真菌在門(A)和屬(B)水平上的相對含量Fig. 3 Relative abundance of fungi in Paocai brine at the phylum (A) and genus (B) level

        圖3 是真菌屬水平和種水平相對含量分布圖,10 個泡菜母水樣本的真菌有效序列被劃分為90 個OTU,包含子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)、接合菌門(Zygomycota)3 個門和一個未分類的種群。從含量來看,Ascomycota是泡菜母水中的主要真菌類群,含有62 個OTU,占OTU總數(shù)的68.89%;包含有效序列512 784 條,占總有效序列的99.93%。Basidiomycota含有18 個OTU,占OTU總數(shù)的20%;包含有效序列226條,占總有效序列的比例不足1%。Zygomycota含有OTU 3條,占OTU總數(shù)的3.33%,有效序列12 條,占總有效序列的比例不足1%。一個未分類種群含有7 個OTU,占OTU總數(shù)的7.78%,含有效序列134 條,占總有效序列的比例不足1%。Liang Huipeng等[5]的研究所檢測出的真菌均屬于Ascomycota,在門水平多樣性其多樣性遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于本研究結(jié)果,這可能也是菌群分析方法不同所致,該研究采用的是PCR-DGGE和qPCR的方法,說明本研究采用的高通量測序分析方法更加全面。

        從屬水平來看,泡菜母水中的真菌屬主要是Kazachstania和假絲酵母屬(Candida)。其中Kazachstania包含1 個OTU,占OTU總數(shù)的1.11%,但包含了498 172 條有效序列,占總有效序列的97.08%;Candida包含7 個OTU,占OTU總數(shù)的7.78%,包含14 251 條有效序列,占總有效序列的2.78%。Liang Huipeng等[5]分析的泡菜中畢赤酵母屬(Pichia)和地絲酵母屬(Geotrichum)為主要真菌屬,與本研究結(jié)果不同,可能是由于地域、蔬菜原輔料及加工工藝等的差異所致。

        2.3 泡菜母水中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化

        圖4 泡菜母水發(fā)酵過程中門水平(A)和屬水平(B)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)動態(tài)變化Fig. 4 Dynamic changes of bacteria community in Paocai brine during fermentation

        泡菜母水中的細(xì)菌群落包括7 個門,其中Firmicutes和Proteobacteria為優(yōu)勢菌門。在泡菜母水進(jìn)化過程中,細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在門水平上的動態(tài)變化規(guī)律如圖4A所示,F(xiàn)irmicutes自始至終都占絕對優(yōu)勢,而且所占比例呈現(xiàn)緩慢上升趨勢:在1代泡菜母水中Firmicutes所占比例為91.86%,20代時上升至97.05%;Proteobacteria在泡菜母水發(fā)酵前期所占比例較高,為7.62%,但隨著泡菜母水的進(jìn)化其所占比例逐漸減少,直至20代時其含量為1.24%。

        在屬水平上,傳統(tǒng)四川泡菜發(fā)酵過程中的細(xì)菌多樣性呈下降趨勢,各細(xì)菌數(shù)表現(xiàn)出不同的變化規(guī)律(圖4B)。發(fā)酵前期泡菜母水中Lactobacillus、Raoultella、Citrobacter、Lactococcus、Cyanobacteria_norank是泡菜母水中的主要細(xì)菌屬,Lactobacillus是其中的優(yōu)勢菌屬,隨著泡菜母水的持續(xù)發(fā)酵,其含量總體呈現(xiàn)增長趨勢,始終是泡菜母水中的優(yōu)勢菌屬,在1代泡菜母水中Lactobacillus的比例為90.30%,10代和12代泡菜母水中,其占比上升至96.36%和97.34%,此后略有波動。到20代時其相對含量達(dá)到95%以上。此外,Cyanobacteria_norank屬細(xì)菌所占比例也逐漸上升,所占比例由0.4%上升到3%。而Raoultella、Citrobacter、Lactococcus、Enterobacteriaceae_unclassifi和Enterobacter等菌屬的占比逐漸下降,最終其總含量不足2%。Raoultella所占比例隨泡菜母水的進(jìn)化呈逐漸減少趨勢,1代時為2.55%,20代時僅為0.17%。Lactococcus在1~7代時相對含量達(dá)到0.5%~1.7%,此后迅速下降至0.1%以下;Enterobacter在1~7代時的相對含量達(dá)到0.35%~1%,此后迅速降低至0.06%~0.1%;Enterobacteriaceae_unclassifi在1~7代時的相對含量達(dá)到0.1%~1.6%,此后迅速降低至0.1%以下。

        2.4 泡菜母水中真菌群落結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化

        圖5 泡菜母水發(fā)酵過程中門水平(A)和屬水平(B)真菌群落結(jié)構(gòu)動態(tài)變化Fig. 5 Dynamic changes of fungal community in Paocai brine during fermentation at the phylum (A) and genus (B) level

        泡菜母水發(fā)酵生態(tài)系統(tǒng)中的真菌群落結(jié)構(gòu)隨著泡菜母水代數(shù)的增加,其多樣性逐漸降低,群落結(jié)構(gòu)也發(fā)生改變。泡菜不斷發(fā)酵過程中泡菜母水中真菌群落結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化如圖5所示。從門水平(圖5A)看,Ascomycota從始至終都占據(jù)絕對優(yōu)勢,所占比例達(dá)到99%以上,是泡菜母水中的主要真菌群類;此外,還有威克漢姆酵母(Wickerhamomyces)、季也蒙酵母(Meyerozyma)、鐮刀菌屬(Fusarium)、赤霉菌屬(Gibberella)、紅酵母屬(Rhodotorula)、耐冷酵母(Guehomyces)、被孢霉屬(Mortierella)、Basidiomycota、Zygomycota和其他一些未鑒定到門的真菌界微生物,它們所占比例不足1%,不是泡菜發(fā)酵過程中的主要真菌群落,相對含量在泡菜母水進(jìn)化過程中亦沒有明顯的變化規(guī)律。從屬水平上看(圖5B),泡菜母水發(fā)酵系統(tǒng)中的真菌群落結(jié)構(gòu)隨著泡菜母水代數(shù)的增加,其多樣性逐漸降低,群落結(jié)構(gòu)也發(fā)生改變。發(fā)酵前期的泡菜母水中的真菌以Kazachstania和Candida為主,Kazachstania的比例隨著泡菜發(fā)酵代數(shù)的增加逐漸升高,1~5代泡菜母水中其所占比例在91%~95%,7代及7代以后的泡菜母水中其所占比例上升至98%~99%;而Candida的比例隨著泡菜發(fā)酵代數(shù)的增加逐漸降低,1~5代泡菜母水中其所占比例在4%~9%,7代及7代之后的泡菜母水中其所占比例已經(jīng)低于1%。Liang Huipeng等[5]報道的傳統(tǒng)泡菜發(fā)酵1~31 d過程中Pichia始終為優(yōu)勢真菌屬,而本研究顯示Kazachstania是泡菜母水發(fā)酵系統(tǒng)中的優(yōu)勢真菌。Kazachstania在酸奶[29]、韓國泡菜[30]、日本泡蘿卜[31]等發(fā)酵食品中已有報道,本研究首次發(fā)現(xiàn)Kazachstania在四川泡菜中作為主要真菌屬,其在泡菜發(fā)酵過程中的作用特性有待進(jìn)一步探索。

        發(fā)酵前期泡菜母水中微生物多樣性高,細(xì)菌和真菌種類較多,發(fā)酵后期體系中微生物多樣性降低,但優(yōu)勢菌群始終不變,且在12代以后泡菜母水中微生物基本保持穩(wěn)定。整個泡菜體系中優(yōu)勢菌群主要是Lactobacillus、Cyanobacteria_norank和Kazachstania,說明在不同代數(shù)發(fā)酵泡菜中起主要作用的微生物是一致的。發(fā)酵過程中細(xì)菌Raoultella、Enterobacteriaceae_unclassifi、Lactococcus和Enterobacter等菌屬所占比例逐漸降低,最終所占比例不足2%。Cyanobacteria_norank屬細(xì)菌所占比例也逐漸上升,所占比例由0.4%上升到3%。真菌體系中Kazachstania最初所占比例為91%,到12代時基本保持穩(wěn)定,約為99%;而Candida的比例隨著泡菜發(fā)酵代數(shù)的增加逐漸降低,1~5代泡菜母水中其所占比例在4%~9%,7代及7代之后的泡菜母水中其所占比例已經(jīng)低于1%,到12代時含量極低。說明泡菜發(fā)酵前期微生物多樣性更豐富,隨著發(fā)酵代數(shù)增多,發(fā)酵體系中代謝產(chǎn)物增多,微生物之間競爭可能也更激烈,一些在泡菜體系中適應(yīng)能力相對較弱的微生物逐漸被淘汰。而適應(yīng)能力強的主要微生物則在后期發(fā)揮主要作用。

        2.5 不同發(fā)酵階段泡菜母水的微生物群落結(jié)構(gòu)的對比

        圖6 基于屬水平的泡菜母水細(xì)菌(A)和真菌(B)Heatmap圖Fig. 6 Heatmap analysis of microbiological diversity in Paocai brine

        圖7 不同發(fā)酵階段泡菜母水中主要細(xì)菌(A)和真菌(B)屬相對含量對比Fig. 7 Comparison of the relative contents of major bacteria and fungi in Paocai brine

        圖6 顯示,不同發(fā)酵階段泡菜母水的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和真菌群落結(jié)構(gòu)有明顯差異,其中7代以前(包含7代)的泡菜母水中細(xì)菌菌屬較多,優(yōu)勢細(xì)菌屬主要是Lactobacillus和Cyanobacteria_norank。優(yōu)勢真菌屬是Kazachstania,5代之后的泡菜母水中微生物真菌菌屬明顯減少,微生物種類多樣性顯著降低。分別根據(jù)不同發(fā)酵時期泡菜母水細(xì)菌和真菌屬水平上群落結(jié)構(gòu)對進(jìn)行聚類分析,將1、2、3、5代和7代聚為一類,命名為G Earlier;10、12、15、18代和20代聚為一類,命名為G Later,結(jié)果如圖7所示。從細(xì)菌多樣性來看,G Earlier泡菜母水中的細(xì)菌屬明顯多于G Later,其多樣性顯著優(yōu)于G Later。從細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)來看,G Later泡菜母水中的Lactobacillus和Cyanobacteria_norank相對含量高于G Earlier,而Raoultella、Citrobacter、Enterobacteriaceae_unclassifi、Lactococcus的相對含量明顯低于G Later,Lactobacillus和Cyanobacteria_norank是泡菜母水中優(yōu)勢菌屬,且含量逐漸提高。優(yōu)勢真菌屬主要是Kazachstania,發(fā)酵后期泡菜母水中Kazachstania含量略高于發(fā)酵前期,Candida和其他真菌的含量明顯低于發(fā)酵前期,Kazachstania的含量在整個發(fā)酵過程中始終為優(yōu)勢菌屬。

        3 結(jié)論與討論

        通過分析不同代數(shù)泡菜母水中微生物群落的變化,結(jié)果顯示,泡菜母水中的細(xì)菌群落主要包括7個門,其中Firmicutes和Proteobacteria分別占94.64%和2.73%,為優(yōu)勢菌門,這和Cao Jialu等[15]的研究一致。Liang Huipeng等[5]研究證明,泡菜中優(yōu)勢菌門也是Firmicutes和Proteobacteria,說明不同代數(shù)發(fā)酵泡菜和發(fā)酵母水中優(yōu)勢菌群是一致的;泡菜母水中真菌群落主要包括3個門和1個未分類種群,其中Ascomycota占99.93%,為優(yōu)勢菌門,Yang Hongyan等[32]的研究結(jié)果也證明Ascomycota在泡菜的發(fā)酵中有極大的作用。泡菜母水中細(xì)菌屬有7個,主要包括Lactobacillus、Raoultella、Citrobacter、Lactococcus等;泡菜母水中的真菌屬主要是Kazachstania,含量超過99%。對不同發(fā)酵階段泡菜母水中的微生物群落組成和多樣性的研究發(fā)現(xiàn),隨著發(fā)酵代數(shù)的增加,泡菜母水中的細(xì)菌與真菌多樣性呈下降趨勢,微生物群落構(gòu)成趨于穩(wěn)定:Lactobacillus和Cyanobacteria_norank是達(dá)到穩(wěn)態(tài)的泡菜母水中的主要細(xì)菌屬,Kazachstania是達(dá)到穩(wěn)態(tài)的泡菜母水中的主要真菌屬。發(fā)酵后期泡菜母水中微生物菌群結(jié)構(gòu)更為穩(wěn)定,也更單一,其風(fēng)味相對前幾代泡菜可能更為穩(wěn)定。不同代數(shù)發(fā)酵泡菜中風(fēng)味物質(zhì)與為微生物菌落結(jié)構(gòu)變化的關(guān)系有待進(jìn)一步研究。

        本研究在門水平上的結(jié)果與已有研究所報道的微生物菌群呈現(xiàn)出較高一致性,且較全面準(zhǔn)確地揭示了傳統(tǒng)四川泡菜的微生物菌群結(jié)構(gòu)。在屬水平上微生物菌群結(jié)構(gòu)與已有報道有所差異,Leuconostoc和Weissella在泡菜體系微生物多樣性分析中[5,32]中多有報道,本研究中卻未見檢出;本研究也首次發(fā)現(xiàn)Kazachstania在四川泡菜中作為主要真菌屬,其在泡菜發(fā)酵過程中的作用特性有待進(jìn)一步探索。一般認(rèn)為真菌與泡菜水中膜的形成、不良?xì)馕兜漠a(chǎn)生、泡菜質(zhì)地變軟等有關(guān)[33],也有學(xué)者認(rèn)為某些真菌有助于提高泡菜品質(zhì),有利于泡菜后熟和芳香物質(zhì)的形成[30,34]。真菌在四川泡菜中的具體菌群結(jié)構(gòu)、作用特性的相關(guān)報道較少,有待進(jìn)一步探索。

        猜你喜歡
        泡菜群落真菌
        韓國泡菜,不僅僅是辣白菜
        大學(xué)生牙齦炎齦上菌斑的微生物群落
        合成微生物群落在發(fā)酵食品中的應(yīng)用研究
        高等大型真菌與人類
        科學(xué)(2020年2期)2020-08-24 07:56:56
        雪花泡菜
        真菌造房子
        我只是想吃一碗泡菜
        艾滋病合并侵襲性真菌感染的診治
        春季和夏季巢湖浮游生物群落組成及其動態(tài)分析
        高效降解纖維素真菌的篩選與鑒定
        高清成人在线视频播放| 女同一区二区三区在线观看| 日本免费观看视频一区二区| 亚洲色偷偷综合亚洲avyp| 久久久av波多野一区二区| 依依成人精品视频在线观看| 亚洲国产精品悠悠久久琪琪| 一区二区三区四区亚洲综合| 亚洲一区丝袜美腿在线观看| 女人天堂av免费在线| 亚洲精品在线一区二区| 五月开心婷婷六月综合| 久久久久99人妻一区二区三区| 国产麻豆精品精东影业av网站| 久久精品欧美日韩精品| 国产亚洲av人片在线观看| 亚洲片在线视频| 久久精品国产亚洲片| 亚洲精品成人一区二区三区| 强d乱码中文字幕熟女免费| 国产精品天干天干| 国产亚洲午夜高清国产拍精品| 亚洲AV无码成人网站久久精品| 亚洲高清在线观看免费视频| 精品国产乱子伦一区二区三 | 国精品无码一区二区三区在线蜜臀| 综合无码一区二区三区四区五区| 日韩精品极品免费观看| 国产精品成年人毛片毛片| 亚洲中文字幕在线综合| 亚洲成a∨人片在线观看不卡| 久久久久亚洲av无码a片软件| 亚洲日本精品一区久久精品| 亚洲丰满熟女乱一区二区三区| 亚洲情综合五月天| 丁香五香天堂网| 色综合999| 国产av精选一区二区| 亚洲av乱码一区二区三区林ゆな | 人妻少妇进入猛烈时中文字幕| 亚瑟国产精品久久|