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        藻際微環(huán)境中藻體與微生物相互作用

        2019-01-05 21:51:42劉發(fā)龍王巧晗宮慶禮
        河北漁業(yè) 2019年3期
        關(guān)鍵詞:生長(zhǎng)環(huán)境研究

        李 蕓,劉發(fā)龍,王巧晗,宮慶禮

        (中國(guó)海洋大學(xué) 水產(chǎn)學(xué)院,山東 青島 266003)

        水生環(huán)境中主要初級(jí)生產(chǎn)力都是藻類貢獻(xiàn)的,其在水生環(huán)境的物質(zhì)循環(huán)和能量流動(dòng)等方面的作用都極為重要;藻類可作為養(yǎng)殖動(dòng)物餌料;可食用、藥用[1];而且其代謝產(chǎn)物如蝦青素[2]、巖藻黃素[3]、海藻多糖類化合物[4]等,都具有巨大的應(yīng)用價(jià)值;此外脂肪含量較多的微藻種類有望解決能源枯竭等問(wèn)題[5],有些藻類在去除重金屬方面也具有重要的生態(tài)學(xué)功能[6]。

        存在于水生生態(tài)系統(tǒng)的異養(yǎng)微生物對(duì)于自養(yǎng)藻類來(lái)說(shuō)具有極為重要的意義,其可以通過(guò)多種轉(zhuǎn)化途徑將有機(jī)物分解并供給藻類利用,因此對(duì)于藻類而言異養(yǎng)微生物是不可或缺的生產(chǎn)者。自然界中的微生物分布廣泛且種類極多,其生長(zhǎng)迅速、易突變,具有遺傳多樣性的特點(diǎn)[7],因此異養(yǎng)微生物在生態(tài)系統(tǒng)中的具體作用和功能也不盡相同。自然狀態(tài)下的藻類與異養(yǎng)微生物密不可分,特別是微藻[8]。藻類與微生物的互相作用途徑有共棲、共生、寄生等[9]。根據(jù)細(xì)菌在藻體生長(zhǎng)環(huán)境中的分布特點(diǎn),可以分為自由地在藻際環(huán)境中生活、 黏附在藻類細(xì)胞的表面、存在于藻類細(xì)胞內(nèi)的細(xì)菌[10]。

        在20世紀(jì)人們對(duì)根際微生態(tài)學(xué)的探索[11],開(kāi)啟了植物與微生物關(guān)系的研究。近些年來(lái),藻-菌關(guān)系的研究逐漸被人們重視。人們嘗試從大型海藻體表分離細(xì)菌、真菌,研究其對(duì)藻體的具體作用,從而降低藻體發(fā)病率,提高養(yǎng)殖藻類的產(chǎn)量[12];崔龍波等人利用微藻與共棲細(xì)菌聯(lián)合體處理廢水,且效果顯著[13];Luz E.Gonzalez等將小球藻與固氮細(xì)菌一起固定培養(yǎng)來(lái)提高小球藻的特定生長(zhǎng)率[14];張國(guó)海等利用益生菌與餌料微藻制成的膠球以調(diào)控養(yǎng)殖水體的水質(zhì)情況[15];Tadashi Toyama等人在其實(shí)驗(yàn)中利用廢水中的原生細(xì)菌促進(jìn)了三種微藻的生長(zhǎng)[16]。人們還通過(guò)一系列的研究實(shí)驗(yàn)證實(shí)了異養(yǎng)細(xì)菌通過(guò)多種多樣的方式對(duì)藻類的生長(zhǎng)、形態(tài)發(fā)育、孢子的萌發(fā)以及移植產(chǎn)生影響[17]。也正是因?yàn)樵?菌之間復(fù)雜關(guān)系的存在,才形成了更為復(fù)雜、穩(wěn)定的水生環(huán)境群落??傊?,藻-菌共棲體系具有多樣的存在形式和非常復(fù)雜的關(guān)系。研究藻-菌互作機(jī)制,并利用藻-菌互作機(jī)制造福人類已成為當(dāng)下人們研究的熱點(diǎn),本文重點(diǎn)總結(jié)了藻類和藻際微生物的關(guān)系,試圖為藻-菌關(guān)系的深入研究以及實(shí)際應(yīng)用與實(shí)踐提供理論依據(jù)。

        1 藻際微環(huán)境

        藻類在生長(zhǎng)過(guò)程中,產(chǎn)生的有機(jī)物不僅用于滿足自身需求,有一部分也會(huì)釋放到藻體表面及外界環(huán)境中,因此在藻體周?chē)鷷?huì)形成一種明顯區(qū)別于外界大環(huán)境的小環(huán)境,人們將其定義為“藻際微環(huán)境”[18]。由于藻際微環(huán)境中藻體分泌物的存在,勢(shì)必會(huì)吸引種類繁多的異養(yǎng)微生物在此生長(zhǎng)繁殖,于是自然而然地便會(huì)形成結(jié)構(gòu)復(fù)雜、功能多樣的微生物群落,稱為“藻際微生物[19]”。也正是因?yàn)榇罅坑袡C(jī)物的存在,使得藻際微環(huán)境中的疏水性信號(hào)分子得以濃縮富集,因此藻際微環(huán)境相對(duì)穩(wěn)定且復(fù)雜。因?yàn)樵咫H微環(huán)境的獨(dú)特性,許多人認(rèn)為其中可能蘊(yùn)藏著較為有價(jià)值的新物種。同時(shí),藻際微環(huán)境中的微生物也具有特異性和多樣性[20]。有很多研究都表明,存在于藻際微環(huán)境中的微生物群落組成明顯區(qū)別于水生大環(huán)境中的微生物群落結(jié)構(gòu)[21]。而且有研究發(fā)現(xiàn)不同藻類以及相同藻類不同生長(zhǎng)階段的微生物菌群結(jié)構(gòu)也是特異的[22]。因不同藻類對(duì)無(wú)機(jī)氮源、碳源等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的利用順序、轉(zhuǎn)化途徑及產(chǎn)等存在差異,種類各異的微生物也會(huì)通過(guò)硝化、氨化等不同的作用將有機(jī)物降解成不同的無(wú)機(jī)碳源、氮源等[23],如此,經(jīng)過(guò)長(zhǎng)時(shí)間的互相選擇、發(fā)展,藻體與存在于藻際微環(huán)境中的微生物既相互促進(jìn),又相互抑制、競(jìng)爭(zhēng),各取所需,并協(xié)同發(fā)展[24]。最終多樣的藻際微環(huán)境衍生了多樣的藻際微生物群落。

        有研究表明某些種類的藻體總是與確定的微生物存在聯(lián)系, 比如人們發(fā)現(xiàn)甲藻中的錐狀斯氏藻(Scrippsiellatrochoidea)和亞歷山大藻(Alexandriumcatenella),硅藻中的圓海鏈藻(Thalassiosirarotula)和中肋骨條藻(Skeletonemacostatum),藍(lán)藻原綠球藻(Porhcloorcocussp.)總是與玫瑰桿菌(Roseobacterlineage)和黃桿菌(Flavobacteriumcolumnare)之間存在密切關(guān)聯(lián)[25-26]。Riquelm等發(fā)現(xiàn)星桿藻(Asterionellajaponica)對(duì)假單胞菌(Pseudomonas)022有專一的吸引作用,推測(cè)是因?yàn)樵弩w能向外釋放溶解態(tài)氨基酸;Riquelm等還指出硼酸硅藻(Asterionellaglacialis)所產(chǎn)生的胞外產(chǎn)物對(duì)細(xì)菌的生長(zhǎng)也存在特異性的作用[27]。此外,藻際微生物的抑藻活性也有很顯著的種屬特異性,比如 Fukami等人研究發(fā)現(xiàn)黃桿菌(Flavobacteriumsp.)對(duì)長(zhǎng)崎裸甲藻(Gymnodiniumnagasakiense)具有明顯的抑制作用,而對(duì)在其實(shí)驗(yàn)中的其他藻類沒(méi)有表現(xiàn)出顯著的抑制作用[27],許多研究都發(fā)現(xiàn)與不同藻類相關(guān)的微生物都是特定的菌群,人們推測(cè)這些相應(yīng)的微生物群落有開(kāi)啟和維系藻-菌密切關(guān)系的機(jī)制。

        2 藻-菌的相互關(guān)系

        藻體與藻際微生物之間的關(guān)系是極為復(fù)雜的,藻際環(huán)境中的藻體和細(xì)菌,既互利共生,又有相互拮抗[28]。藻-菌關(guān)系不僅是營(yíng)養(yǎng)方式的互補(bǔ),我們可將其關(guān)系總結(jié)為以下幾點(diǎn):基本營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)依賴、活性物質(zhì)相互作用、信息交流。正是存在一系列的相互作用才使藻-菌聯(lián)系緊密,形成了復(fù)雜而穩(wěn)定的微生態(tài)系統(tǒng)。

        2.1 基本營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的互補(bǔ)

        營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的互補(bǔ)從根本上取決于藻細(xì)胞和藻際微生物營(yíng)養(yǎng)方式的互補(bǔ),因?yàn)樵?菌在生長(zhǎng)繁殖中所需的基本營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)相互依賴,這也是藻-菌最為基礎(chǔ)的關(guān)系[29],也正是因?yàn)檫@一基本的關(guān)系使得藻-菌的生存更為長(zhǎng)久。

        自然界中大部分藻類是光合自養(yǎng)型生物[30]。首先,藻類在生長(zhǎng)過(guò)程中會(huì)分泌大量胞外產(chǎn)物,其中部分可以被異養(yǎng)微生物生長(zhǎng)繁殖利用,異養(yǎng)微生物可將大分子的有機(jī)物質(zhì)分解為小分子物質(zhì)或微量元素重新被藻類利用。其次,藻類光合作用產(chǎn)生的大量的溶解氧會(huì)顯著增強(qiáng)藻類的光呼吸作用,對(duì)有益藻類的生長(zhǎng)來(lái)說(shuō)是不利的,但若有異養(yǎng)細(xì)菌的存在,因其生長(zhǎng)繁殖會(huì)消耗溶解氧并釋放CO2,使周?chē)纬梢环N還原性的微環(huán)境,有研究表明這種環(huán)境更加有利于藻類的生長(zhǎng)[31-32]。有研究指出在由根瘤菌屬(Rhizobiumsp.)和小球藻(Chlorellavulgaris)組成的共棲體系中,細(xì)菌能夠分解有機(jī)物并提供給小球藻合適的氮源,相應(yīng)的,藻體能為細(xì)菌提供可利用的碳源[33];另也有實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)固氮藍(lán)細(xì)菌UCYN-A可為定鞭藻類(Prymnesiumparvum)提供固定的碳源[34]。這一最基礎(chǔ)的藻-菌關(guān)系可能會(huì)影響到藻體群落的組成和生產(chǎn)力,同時(shí)也造就了藻際微環(huán)境中所形成的微生物優(yōu)勢(shì)種群。但是,不排除有些情況下某些共生菌可能會(huì)與異養(yǎng)藻細(xì)胞爭(zhēng)奪營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。例如微囊藻(MicrocystisKuetzing)死亡的藻體及分泌物均可被分解為可供自身利用的碳源,但由于芽孢桿菌(Bacillus)的大量生長(zhǎng)繁殖又會(huì)產(chǎn)生與藻體爭(zhēng)奪氮、磷營(yíng)養(yǎng)鹽的情況,以至于影響微囊藻(MicrocystisKuetzing)的生長(zhǎng)[35],另外也有一些種類的異養(yǎng)微藻可以通過(guò)攝食作用來(lái)捕殺細(xì)菌,如夜光藻(Noctilucascintillans)[36]。

        2.2 產(chǎn)生活性物質(zhì)作用于彼此

        藻類和細(xì)菌在生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中會(huì)分泌種類豐富的代謝產(chǎn)物,如酶類、多糖、多肽等,以及促生長(zhǎng)因子、抑制生長(zhǎng)因子等[37]。有研究表明,產(chǎn)生維生素類物質(zhì)的細(xì)菌能夠改善綠藻維生素缺乏的癥狀[38]。另有研究發(fā)現(xiàn)細(xì)菌可以利用藻類釋放的表面營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),轉(zhuǎn)化為酶類及生長(zhǎng)因子等來(lái)調(diào)節(jié)藻體的生長(zhǎng)狀況[39];藻類促生菌中的有些種屬能顯著改善藻體應(yīng)對(duì)脅迫的耐受程度,而且有些細(xì)菌能釋放抗菌物質(zhì)和水解酶殺死對(duì)藻體有害的生物[40]。在某些藻-菌共棲體系中,相比于單獨(dú)培養(yǎng)的藻和細(xì)菌,胞外酶、某些特異酶、生長(zhǎng)因子等物質(zhì)的分泌量會(huì)大大增加。有研究顯示赤潮藻類與某芽孢桿菌(Bacillus)共培養(yǎng)能顯著提高兩者胞外酶總活性[41]。其次,有些細(xì)菌還可將 Fe3+還原更容易被藻體利用的的 Fe2+[42]。相反有些細(xì)菌能夠釋放一些溶藻物質(zhì),如可直接分泌酶類溶解藻細(xì)胞,也可通過(guò)釋放一些非特異性的毒素來(lái)殺死藻類[43],細(xì)菌的這種溶藻行為就是典型的藻-菌拮抗的例子。同樣的,有些藻類產(chǎn)生的多種活性物質(zhì)可抑制細(xì)菌的生長(zhǎng)繁殖[44]。目前,研究人員已證實(shí)某些海洋微藻具備產(chǎn)生抗菌活性物質(zhì)的能力[45],該發(fā)現(xiàn)有望應(yīng)用于對(duì)有害微生物的生物防治中。

        2.3 藻-菌共棲體系中新物質(zhì)的生成

        有許多研究都發(fā)現(xiàn),藻際微環(huán)境的共生體系中會(huì)使藻-菌擁有合成其單獨(dú)不能合成的物質(zhì)的能力,即藻-菌相互作用可以共同合成新的物質(zhì)。有實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)當(dāng)玫瑰桿菌與顆石藻共培養(yǎng)時(shí)菌體會(huì)產(chǎn)生對(duì)顆石藻有毒性的玫瑰毒素[46],推測(cè)這可能與玫瑰桿菌排除異己,以獲得自身的最大生長(zhǎng)有關(guān)。Ashan等人發(fā)現(xiàn)巴西固氮螺菌(Azospirillumbrasilense)不僅能促進(jìn)藻體生長(zhǎng),而且對(duì)于藻體中脂質(zhì)含量及脂質(zhì)豐富度都有顯著影響[47]。在 Lin- Lan Zhuang設(shè)計(jì)的以 ssPBR為反應(yīng)器的實(shí)驗(yàn)組,用細(xì)菌及其產(chǎn)生的 EPS涂層的棉布載體上生長(zhǎng)的附著微藻的單細(xì)胞干重,細(xì)胞化學(xué)組成、放氧活性比起對(duì)照組都有顯著的變化[48]。Ya Wang等的數(shù)據(jù)表明,麥?zhǔn)辖惶鎲伟?AzospirillumMacleodii)對(duì)鹽生杜氏藻(D.salina)的培養(yǎng)系統(tǒng)中砷的毒性、吸收和形成有強(qiáng)烈的影響,且能將砷轉(zhuǎn)化為毒性較小的價(jià)位[49]。

        3 信息交流

        3.1 信號(hào)傳導(dǎo)

        頻繁的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)交換是菌藻共生的基礎(chǔ),而信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)是藻-菌互作的另一種方式。在這種情況下,相互作用的物質(zhì)不是作為營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),而是被用于觸發(fā)藻-菌彼此體內(nèi)的一系列反應(yīng)。這些相關(guān)化合物通常是一些是復(fù)雜、特定的分子;反應(yīng)發(fā)生以后,會(huì)改變?cè)?、菌的生活狀態(tài)及行為;在有些情況下還有利于兩者抵御不良的因素[50]。研究發(fā)現(xiàn)許多種類的微生物都能合成并釋放被稱為(autoinducer AI)的信號(hào)分子[51]。其濃度通常與微生物密度成正比,當(dāng)其達(dá)到一定濃度時(shí),菌體中相關(guān)基因會(huì)被信號(hào)分子啟動(dòng)并表達(dá),由此調(diào)控細(xì)菌的生物行為,如分泌毒素、建立生物膜 、產(chǎn)生抗生素、生成孢子、產(chǎn)熒光等,菌體的這種調(diào)控方式被稱為群體感應(yīng)調(diào)節(jié)(quorum sensing QS)[52]。因藻類與細(xì)菌長(zhǎng)期共存于同一環(huán)境,在漫長(zhǎng)的進(jìn)化過(guò)程中,細(xì)菌 QS信號(hào)分子也可以被真核植物宿主感應(yīng),因此其可能是植物與微生物跨界交流的重要途徑[53]。目前已有研究顯示微生物對(duì)藻類的作用受其QS信號(hào)的調(diào)節(jié)[54]。QS介導(dǎo)的菌群行為對(duì)藻類的影響主要是影響生態(tài)位的提供(生物膜的形成)、藻體孢子的成熟與釋放、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的加工與轉(zhuǎn)化(碳、氮、硫、鐵)、細(xì)菌的溶藻行為等[55]。例如,玫瑰桿菌(Roseobacter)的分離株魯杰氏菌屬(Ruegeria)TM1040會(huì)在費(fèi)氏藻(Feldmannia)上形成的生物膜,不僅能夠促進(jìn)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的富集,而且還有助于藻體的防御、抗污損作用[56]。相反,還有一些藻體可通過(guò)干擾細(xì)菌QS系統(tǒng),來(lái)抑制溶藻細(xì)菌的數(shù)量以減少對(duì)自身的傷害[57]?,F(xiàn)階段已有研究證明藻體能夠產(chǎn)生應(yīng)對(duì)微生物QS的物質(zhì),用以抑制QS信號(hào)的產(chǎn)生或者減弱QS信號(hào)的影響[58]。其中曾惠等也證明螺旋藻提取物是通過(guò)抑制信號(hào)分子誘導(dǎo)的群體感應(yīng)現(xiàn)象來(lái)抑制紫色色素的產(chǎn)生與生物膜的形成的[59]。其次,人們發(fā)現(xiàn)細(xì)菌大量增殖所引起的食物腐敗變質(zhì)也是由細(xì)菌的QS信號(hào)介導(dǎo)的,因此人們?cè)噲D從海洋藻體中提取QS抑制劑及類似物來(lái)預(yù)防食物的腐敗。

        3.2 基因交流

        藻-菌之間除了跨膜的信息傳導(dǎo)還有更深層次的基因上的交流。 由于藻-菌長(zhǎng)期共棲的優(yōu)勢(shì)促進(jìn)了彼此的共同進(jìn)化,使得藻-菌間的水平基因存在轉(zhuǎn)移,在代謝機(jī)制上也會(huì)出現(xiàn)補(bǔ)充和簡(jiǎn)化,使得藻-菌關(guān)系更為密切。研究已發(fā)現(xiàn)在亞硫酸桿菌(Sulfitobater)和硅藻(Diatom)的共生系統(tǒng)中,雖然兩者體內(nèi)都含有合成色氨酸的基因,但是根據(jù)轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果表明,共生體系中亞硫酸桿菌合成色氨酸的基因相比于單獨(dú)培養(yǎng)的菌株來(lái)說(shuō)會(huì)有所下調(diào),而硅藻中參與合成 IAA的色氨酸的相關(guān)基因上調(diào)[60]。Koester等采用基因組分析的方法,通過(guò)找到藻-菌進(jìn)化的分子證據(jù),證實(shí)布氏雙尾藻(Ditylumbrightwelli)中的基因數(shù)目有部分來(lái)自于細(xì)菌[61],其中最具代表性的基因元件是在參與光合作用的元件,包括捕光蛋白、光敏色素等[62]。造成這種結(jié)果的原因也許是藻類在正選擇壓力下的一種適應(yīng)機(jī)制;其次人們廣泛認(rèn)為大部分的真核藻類是由藍(lán)細(xì)菌通過(guò)原發(fā)性內(nèi)共生的方式進(jìn)化而來(lái)的[63],即藍(lán)細(xì)菌會(huì)影響真核藻類的進(jìn)化。還有研究證明藻類可以分泌能夠刺激細(xì)菌 DNA 合成的活性物質(zhì)[64],以上都屬于藻-菌在分子水平上的交流。

        4 總結(jié)

        自然界中,藻-菌共棲是極為普遍的。這種共棲關(guān)系根據(jù)人們的需求可以簡(jiǎn)單地區(qū)分為有價(jià)值的和無(wú)價(jià)值的。其中有價(jià)值的藻-菌關(guān)系可大體分為以下幾種:分離有益于經(jīng)濟(jì)藻類生長(zhǎng)的藻際微生物,實(shí)現(xiàn)更高效的藻類規(guī)?;囵B(yǎng);將微生物的溶藻作用應(yīng)用在治理赤潮藻類中;利用藻體與致病菌的競(jìng)爭(zhēng)作用實(shí)現(xiàn)養(yǎng)殖池塘的健康養(yǎng)殖,降低養(yǎng)殖動(dòng)物的發(fā)病率,提高養(yǎng)殖收益;利用藻-菌復(fù)合體改善養(yǎng)殖水體及城市廢水處理,減少繁瑣的污水處理環(huán)節(jié),節(jié)省成本,提高處理效率;將細(xì)菌的絮凝作用應(yīng)用于微藻收獲環(huán)節(jié),節(jié)省微藻培養(yǎng)成本,縮減收獲步驟,具有巨大的經(jīng)濟(jì)效益。綜上所述通過(guò)消除有價(jià)值藻-菌關(guān)系中的有害微生物的影響,擴(kuò)大有益微生物的作用,實(shí)現(xiàn)藻-菌關(guān)系的最大化應(yīng)用是近來(lái)的研究熱點(diǎn)。并且因藻、菌都是生物體,生長(zhǎng)繁殖較快,從實(shí)驗(yàn)階段到實(shí)際應(yīng)用階段周期較短,具有較強(qiáng)的現(xiàn)實(shí)意義。

        現(xiàn)階段值得人們深入研究的藻-菌關(guān)系很多,但是海洋藻類中藻體與藻際微生物的作用機(jī)理涉獵甚少。不可否認(rèn)該項(xiàng)研究工作繁重復(fù)雜,挑戰(zhàn)巨大,但不管是對(duì)于生態(tài)養(yǎng)殖以及環(huán)境保護(hù)來(lái)說(shuō)都可謂是巨大的機(jī)遇。現(xiàn)階段,分子生態(tài)學(xué)、生物信息學(xué)、高通量測(cè)序等方法的發(fā)展,使得人們可以在分子水平上探索細(xì)菌與藻體互作的化學(xué)信號(hào)物質(zhì)及作用機(jī)理,并通過(guò)系統(tǒng)發(fā)生分析探究藻際環(huán)境的微生物群落,使人們能對(duì)共棲藻-菌進(jìn)行原位分析;其次,日漸成熟的群落分析法和組學(xué)技術(shù),能更全面地較方便地揭示微生物的活動(dòng),以更好地理解藻類共生菌的結(jié)構(gòu)和成因。但就目前的條件來(lái)說(shuō),還有很多現(xiàn)實(shí)的困難,比如:游離在藻際環(huán)境中的微生物穩(wěn)定性較差,實(shí)際操作存在偶然性;野生條件下,細(xì)菌與藻體的關(guān)系不容易測(cè)定研究,而且如果單單是人工培養(yǎng)所形成的藻際微生物的群落結(jié)構(gòu)很可能不同于自然環(huán)境;雖然各種方法發(fā)展迅速,但可培養(yǎng)的異養(yǎng)微生物種類極其有限,因此對(duì)于微生物在藻際環(huán)境中的確切生理功能還不能較好地了解,想要更為準(zhǔn)確地研究藻際微環(huán)境中的微生態(tài)結(jié)構(gòu)還需要更為成熟的方法、工藝流程等。

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