亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        麗江油橄欖品種表型及SSR標(biāo)記的多樣性及聚類分析

        2018-12-27 11:23:00耿樹香楊生超寧德魯李勇杰
        西部林業(yè)科學(xué) 2018年6期
        關(guān)鍵詞:油橄欖等位基因表型

        耿樹香,楊生超,寧德魯,李勇杰

        (1.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650201;2.云南省林業(yè)科學(xué)院,云南 昆明 650201)

        油橄欖(OleaeuropaeaL.)是世界著名的優(yōu)質(zhì)木本油料樹種,主要為異花授粉植物,為二倍體植物(2n=46),全基因組約為2 200Mb。在長期引種馴化和人工選擇過程中,形成了遺傳變異豐富并具有優(yōu)良性狀的油橄欖品種,對這些品種的正確鑒定和特異性狀的鑒別,了解品種間遺傳變異和多樣性,是油橄欖品種資源利用和育種工作的重要前提[1-3]。油橄欖的栽培歷史悠久,種質(zhì)資源豐富,其中包含大量的野生種、半野生種和栽培種,而且不同地域間品種交換頻繁,導(dǎo)致同名異物或同物異名的現(xiàn)象十分普遍。油橄欖品種繁多,據(jù)統(tǒng)計(jì):世界各地油橄欖自產(chǎn)品種共計(jì)1 275個(gè),中國現(xiàn)有登記品種共158個(gè)[4]。在油橄欖長期引種馴化及人工栽培過程中,形成了遺傳變異豐富并具有優(yōu)良性狀的油橄欖品種,對現(xiàn)云南麗江引種的油橄欖品種進(jìn)行正確鑒定及特異性狀的鑒別,勢在必行。

        早先對油橄欖品種的鑒定都基于表型及農(nóng)藝性狀[5-6]。近年來,國外已有一些采用RAPD、AFLP、SSR和ISSR等分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行油橄欖品種鑒定和遺傳多樣性研究的報(bào)道[7-14]。雖然利用分子標(biāo)記可以準(zhǔn)確鑒定油橄欖品種并了解其遺傳信息,但難以與表型性狀相結(jié)合,缺乏分子標(biāo)記與表型性狀的驗(yàn)證分析。本研究利用已成熟的SSR分子標(biāo)記技術(shù),對收集保存麗江大具的19份油橄欖種質(zhì)(育成品種、地方種質(zhì))進(jìn)行表型性狀及遺傳分析,從DNA水平評估遺傳多樣性,并進(jìn)一步探究云南引種油橄欖種質(zhì)資源品種間的親緣關(guān)系,為今后的遺傳育種提供可靠的遺傳背景信息。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        試驗(yàn)材料采集于云南省麗江市金沙江低山河谷地帶,24°16′N,100°04′E,海拔1 766m,砂壤。擁有獨(dú)特的光熱、土壤等自然條件,具備優(yōu)越的油橄欖生長環(huán)境。年平均氣溫14-18℃,極端最低溫度-7℃至-9℃,平均年降雨量500-1 000mm,平均相對濕度61%-69%,日照2 000-2 700h。于2017-2018年連續(xù)進(jìn)行了表型性狀的測定。材料編號、名稱、起源和用途見表1。

        表1 油橄欖品種及其原產(chǎn)地

        1.2 油橄欖表型性狀的測定

        每個(gè)品種從樹冠南側(cè)齊肩高處,選取樹齡5年,一年生枝條8-10根,在枝條中部共取40片正常葉,參照國際植物新品種保護(hù)聯(lián)盟(UPOV)的《植物新品種DUS測試指南 油橄欖》TG/99/3 1985-11-13的相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)測定葉片長度、葉片寬度、葉形指數(shù)、葉片厚度、葉周長共5個(gè)性狀指標(biāo),其中葉形狀由葉形指數(shù)葉片長度(L)/葉片寬度(W)來確定:L/W<4為橢圓形;L/W=4-6為橢圓披針形;L/W>6為披針形。在果實(shí)成熟期,每株從同一部位最具代表性的結(jié)果枝的中部,選取發(fā)育正常并完成轉(zhuǎn)色的果共計(jì)40粒,測定果橫徑、果縱徑、單果重、果形狀、果肉率、果形指數(shù)共6個(gè)性狀指標(biāo),其中果形狀由果形指數(shù)果實(shí)長度(L)/果實(shí)寬度(W)來確定:L/W<1.25為球形;L/W=1.25-1.45為卵形;L/W>1.45為細(xì)長形。剝?nèi)ス夂?,將果核洗凈、晾干,測定果核橫徑、核縱徑、單核重、核形指數(shù)、核形狀共5個(gè)表型性狀指標(biāo),其中核形狀由核形指數(shù)核縱徑(L)/核橫徑(W)來確定:L/W<1.4為球形;L/W=1.4-1.8為卵圓形;L/W=1.8-2.2為橢圓形;L/W>2.2為細(xì)長形。

        1.3 SSR標(biāo)記

        2017年春季采集一年生枝條頂端幼嫩葉片,用植物基因組提取試劑盒(Tsingke生產(chǎn),貨號TSP101-200)提取基因組DNA。從已發(fā)表的SSR引物中篩選出能在19個(gè)樣品中穩(wěn)定擴(kuò)增、多態(tài)性好的20對SSR引物(UDO99-001、UDO99-004、UDO99-012、UDO99-014、UDO99-015、GAPU59、DCA04、DCA09、DCA11、DCA16、DCA18、EMO02、EMO30、EMO90、GAPU59、GAPU71B、GAPU89、GAPU101、UDO24、UDO36)用于遺傳分析[15-16]。反應(yīng)體系15μL,擴(kuò)增程序94℃預(yù)變性5min;94℃預(yù)變性30s,57℃退火30s,72℃延伸30s,35次循環(huán);72℃延伸5min;4℃保存。擴(kuò)增結(jié)束后,吸取2μLPCR產(chǎn)物,加入6μL 1×loading buffer(Tsingke生產(chǎn),貨號TSJ010)混勻,0.8%瓊脂糖凝膠(電壓:5V/cm,EB染色)電泳10-15min分離,電泳液緩沖液0.5×TBE。電泳結(jié)束后,凝膠成像儀紫外成像留影。

        1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與遺傳分析

        位點(diǎn)信息匯總在一個(gè)Excel表中,按照CONVERT 131軟件要求格式整理,轉(zhuǎn)換格式。用PopGene 32軟件計(jì)算各標(biāo)記的主要等位基因頻率、觀察等位基因數(shù)(na*)、有效等位基因數(shù)(ne*)、Shannon’s多樣性指數(shù)、期望雜合度(Nei**)和觀望雜合度。利用Population軟件計(jì)算遺傳距離因子,用鄰接法(NJ)繪制進(jìn)化樹。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 19個(gè)油橄欖品種表型性狀評價(jià)

        不同油橄欖品種的表型數(shù)量性狀變異豐富,其變異系數(shù)為7.6%-51.85%,所測的19個(gè)油橄欖品種中,果實(shí)2個(gè)球形,7個(gè)卵形,10個(gè)細(xì)長,大多品種皮孔較少;葉2個(gè)披針形,1個(gè)橢圓形,其余16個(gè)均為橢圓披針形,19個(gè)品種油橄欖葉片有一個(gè)向上,18個(gè)葉片縱向平展。

        表2 油橄欖14個(gè)表型數(shù)量性狀統(tǒng)計(jì)分析

        基于14個(gè)表型數(shù)量性狀計(jì)算品種間的Eudidean距離,對19個(gè)油橄欖品種的NJ聚類分析結(jié)果(圖1)表明,19個(gè)油橄欖品種聚為2個(gè)組,其中第1大組又包括3個(gè)小組,第1大組的第1小組包括佛奧、皮瓜爾、貝拉、城固、阿斯;第2小組包括柯基、豆果、米扎、阿波薩納、云雜;第3小組組包括皮削利、萊星、科拉蒂、鄂植8號、卡林、配多靈、坦彩、小蘋果;第2大組為白橄欖。

        圖1 油橄欖數(shù)量性狀分析聚類圖

        2.2 基于油橄欖SSR標(biāo)記的多樣性及聚類分析

        20個(gè)SSR位點(diǎn)在19個(gè)品種中的檢測結(jié)果(表3),共檢測到124個(gè)等位基因變異,平均每個(gè)等位基因數(shù)為6.2個(gè)。其中DCA09、UDO24位點(diǎn)產(chǎn)生10個(gè)等位基因變異,UDO99-001、UDO99-004產(chǎn)生3個(gè)等位基因變異,最大等位基因頻率為0.631 6,多態(tài)信息量平均為0.646 4,Shannon’s指數(shù)H’平均為0.693 3,Shannon’s指數(shù)H’范圍在0.513 9-0.831 8之間,表現(xiàn)出豐富的遺傳多樣性。

        根據(jù)SSR標(biāo)記計(jì)算品種間的Jaccard系數(shù),對19個(gè)油橄欖品種的NJ聚類分析結(jié)果(圖2)表明,19個(gè)油橄欖品種被分成3組,第1組包括阿波薩納、豆果、卡林;第2組包含坦彩、城固、貝拉等15個(gè)油橄欖品種;第3組為米扎。

        表3 20對SSR引物的多態(tài)性分析

        圖2 SSR標(biāo)記油橄欖聚類分析的無根NJ樹狀圖

        3 結(jié)論與討論

        本研究對云南麗江引種的19個(gè)油橄欖品種14個(gè)表型性狀和20個(gè)SSR標(biāo)記的多樣性分析表明,19個(gè)油橄欖品種具有較豐富的表型及遺傳多樣性,在本研究中選用的20對引物可完全把19個(gè)油橄欖品種區(qū)分開。表型性狀相似的品種需結(jié)合SSR標(biāo)記進(jìn)一步結(jié)合鑒定。

        19個(gè)油橄欖品種葉片表型數(shù)量性狀(除葉型指數(shù)和葉厚)在品種內(nèi)具有較大的差異,這說明葉片表型性狀是不穩(wěn)定的。本文并未對表型數(shù)量性狀進(jìn)行多年分析比較,但葉片的大小和形態(tài)會(huì)隨著樹齡而變化,果實(shí)和果核的大小在“大小年”也存在很大的差異,所以表型數(shù)量性狀僅能作為品種鑒定的參考。此外,數(shù)量性狀與豐產(chǎn)性、抗性和“童期”長短相關(guān),可以作為實(shí)生選優(yōu)早期鑒定的依據(jù)。

        19個(gè)油橄欖品種表型性狀和SSR分子標(biāo)記具有較豐富的遺傳多樣性,其表型性狀變異系數(shù)具有一定的差異性,表型性狀相似的品種,其不一定具有親緣關(guān)系,所以表型性狀在聚類分析上應(yīng)結(jié)合SSR標(biāo)記進(jìn)行油橄欖品種的鑒定。

        猜你喜歡
        油橄欖等位基因表型
        親子鑒定中男性個(gè)體Amelogenin基因座異常1例
        智慧健康(2021年17期)2021-07-30 14:38:32
        高速逆流色譜分離制備油橄欖葉中橄欖苦苷
        中成藥(2018年4期)2018-04-26 07:13:09
        建蘭、寒蘭花表型分析
        金堂縣開展油橄欖栽植管理技術(shù)培訓(xùn)
        綠色天府(2017年3期)2017-03-06 19:13:17
        WHOHLA命名委員會(huì)命名的新等位基因HLA-A*24∶327序列分析及確認(rèn)
        DXS101基因座稀有等位基因的確認(rèn)1例
        GABABR2基因遺傳變異與肥胖及代謝相關(guān)表型的關(guān)系
        油橄欖的速生早實(shí)豐產(chǎn)栽培技術(shù)
        綠色科技(2015年5期)2015-07-05 18:08:45
        慢性乙型肝炎患者HBV基因表型與血清學(xué)測定的臨床意義
        72例老年急性白血病免疫表型分析
        国产香蕉国产精品偷在线| 亚洲av熟女天堂久久天堂| 在线国产激情视频观看| 亚洲香蕉成人av网站在线观看| 236宅宅理论片免费| 久久国产精品老人性| av网站不卡的av在线| 久人人爽人人爽人人片av| 婷婷五月综合缴情在线视频| 欧美日韩亚洲国产无线码| 国产成人精品一区二区三区av| 亚洲av无码无限在线观看 | 亚洲av无码专区亚洲av| 最新福利姬在线视频国产观看| av免费观看网站大全| 亚洲av日韩综合一区二区三区| 国产亚洲精品aaaa片app| 亚洲国产高清在线视频| 国产精品亚洲二区在线看| 亚洲精品午夜无码专区| 国产香蕉尹人综合在线观| 美国又粗又长久久性黄大片 | 久久天天躁狠狠躁夜夜2020一| 亚洲色图在线观看视频| 美女被插到高潮嗷嗷叫| 熟妇高潮一区二区三区在线观看| 亚洲av成人一区二区三区| 亚洲国产欧美另类va在线观看 | 麻豆精品国产专区在线观看| 国产sm调教视频在线观看| 国产亚洲第一精品| 精品一区二区三区a桃蜜| 麻豆婷婷狠狠色18禁久久| 麻豆第一区MV免费观看网站| 亚洲高清av一区二区 | 高清不卡一区二区三区| 亚洲欧洲精品国产二码| 蜜桃视频一区视频二区| 成人无码av一区二区| 色丁香色婷婷| av是男人的天堂免费|