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        天津市錦鯉皰疹病毒PCR檢測與序列分析

        2018-12-21 09:30:00霍奕安劉榮榮胡秀彩呂愛軍孫敬鋒陳成勛
        中國動物檢疫 2018年12期
        關鍵詞:皰疹病毒錦鯉天津市

        霍奕安,劉榮榮,胡秀彩,呂愛軍,孫敬鋒,陳成勛

        (1. 天津農(nóng)學院水產(chǎn)學院,天津市水產(chǎn)生態(tài)及養(yǎng)殖重點實驗室,天津 300384;2. 天津農(nóng)學院創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)實驗室,天津 300384)

        錦鯉皰疹病毒(Koi herpesvirus,KHV)又稱為鯉科皰疹病毒3型(CyHV-3),是引起高度傳染性錦鯉皰疹病毒?。↘HVD)的病原[1-3]。1998年KHV首次在以色列和美國引發(fā)疫情,2002年在我國廣東省被發(fā)現(xiàn),隨后陸續(xù)到傳播到我國其他地區(qū)。至今已有30多個國家或地區(qū)陸續(xù)報道發(fā)生該病[4]。KHVD潛伏期長,突發(fā)性高,給鯉魚養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴重危害。目前來自不同國家的4個KHV DNA全基因序列已被測序[5]。病毒檢測和減毒疫苗免疫是KHVD最主要的控制措施[6]。

        錦鯉是我國觀賞魚的主要養(yǎng)殖品種之一,在國內(nèi)淡水養(yǎng)殖魚類中占很大比例,一旦暴發(fā)KHVD,往往帶來巨大經(jīng)濟損失,所以開展KHV相關研究十分重要。2017年6月,天津市濱海新區(qū)、北辰區(qū)等一些養(yǎng)殖場的錦鯉陸續(xù)大量發(fā)病死亡,3 d內(nèi)死亡率高達85%。病魚表現(xiàn)爛鰓、鰓絲發(fā)白、鱗片脫落等癥狀,以及內(nèi)臟器官出血、糜爛等剖檢病變,疑似感染KHV。本研究根據(jù)KHV基因序列分別設計合成TK、SphI-5、ORF25、ORF56和ORF81基因特異性引物,采用PCR技術檢測KHV相關功能基因,為KHVD診斷及流行病學分析提供技術參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗魚、試劑及儀器

        試驗魚:天津市濱海新區(qū)、北辰區(qū)等一些養(yǎng)殖場送檢的發(fā)病錦鯉,平均體長為(6±0.5)cm;試劑及儀器:DL 2 000 bp DNA Marker(天津生工生物公司),DNA提取試劑盒、PCR Master Mix(天根生化科技有限公司),Buffer藍DNA染料(北京鼎國昌盛生物技術公司),PCR擴增儀(德國Analytikjena公司)。

        1.2 引物設計與合成

        根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫登錄的KHV TK、SphI-5、ORF25、ORF56、ORF81基因序列(AP008984.1),利用Primer Premiers 5.0軟件設計特異性引物(表1)。引物由金唯智生物科技有限公司合成。

        1.3 基因PCR擴增

        表1 錦鯉皰疹病毒 TK、SphI-5、ORF25、ORF56、ORF81基因引物設計

        分別取患病錦鯉的鰓、腎臟、脾臟、肝臟、胰臟等組織勻漿,使用DNA提取試劑盒提取DNA,將所得DNA樣品通過瓊脂糖凝膠電泳檢測。PCR方法采用25 μL反應體系: Mix 10 μL,DNA模板 1 μL,上下游引物各 1 μL(10 μmol/L),加雙蒸水至25 μL。反應條件如下:95 ℃預變性5 min,94 ℃ 40 s,59.3 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,35個循環(huán)。其中,陰性對照加雙蒸水,引物加TK基因。

        1.4 序列比對與系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建

        選取錦鯉皰疹病毒3型J2株(CyHV-3/KHV-J2)、錦鯉皰疹病毒2型(CyHV-2)的ORF56蛋白為參考序列,應用GeneDoc軟件進行序列比對分析。從GenBank下載KHV的ORF56基因序列,通過MEGA5.0進行系統(tǒng)發(fā)育進化樹構(gòu)建,并分析進化親緣關系。

        2 結(jié)果

        2.1 發(fā)病錦鯉臨床癥狀及初診

        發(fā)病錦鯉大量死亡,死亡率高達85%以上。病魚呈現(xiàn)眼部凹陷、爛鰓、鰓絲發(fā)白、鱗片脫落、體表黏液增多等癥狀,以及鰓壞死、內(nèi)臟器官出血糜爛等剖檢病變(圖1)。

        圖1 錦鯉皰疹病毒病的臨床特征

        2.2 基因檢測與序列比對

        以錦鯉鰓和肝胰臟等組織器官的DNA為模板,分別對KHV TK、SphI-5、ORF25、ORF56、ORF81基因進行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)均為陽性(圖2);DNA測序獲得 TK、SphI-5、ORF25、ORF56、ORF81基因片段分別為 409、300、317、939、156 bp。經(jīng)BlastN檢索,發(fā)現(xiàn)與印度尼西亞毒株CyHV-3-J2的TK基因序列同源性為99.2%(AOO32620.1)、SphI-5為97.6%(AOO32619.1)、ORF25為97.8%(AP008984.1)、ORF56為 100%(KX544843.1)、ORF81為98.0%(AVL27853.1)。進一步選取錦鯉皰疹病毒3型J2株(CyHV-3/KHV-J2)、錦鯉皰疹病毒2型(CyHV-2)等進行序列比對,發(fā)現(xiàn)ORF56蛋白與KHV蛋白的151~253 aa為高保守區(qū)域(圖3)。

        2.3 ORF56基因系統(tǒng)發(fā)育樹分析

        選取11個KHV ORF56相關基因進行系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建分析,發(fā)現(xiàn)KHV天津流行株與CyHV-3型病毒親緣關系最近,并且與印度尼西亞CyHV-3-J2毒株自然聚為一支,最終確定天津市患病錦鯉感染的病毒為CyHV-3型(圖4)。

        圖2 KHV基因PCR檢測電泳圖

        圖3 ORF56相關蛋白的氨基酸序列比對分析

        圖4 基于KHV病毒ORF56基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹分析

        3 討論

        KHVD作為一種全國流行性魚類病毒病,其流行株主要為CyHV-3型病毒,已引起我國高度重視。近年來,雖然世界多地在KHVD臨床癥狀、檢測診斷、疫苗制備等方面進行了大量研究,但仍不足以有效控制該病,其依舊在威脅著我國錦鯉養(yǎng)殖業(yè)。

        PCR檢測技術具有簡便、快速,對標本純度要求低以及靈敏度高等特點,在水產(chǎn)病毒病診斷領域被廣泛應用[9-11]。自從Gilad等[12]應用PCR技術建立了CyHV-3檢測方法后,PCR及其延伸技術成為水生動物疾病檢測的常用方法。本試驗針對KHV的TK、SphI-5基因,以及ORF25、ORF56、ORF81等未知功能基因,建立特異性PCR方法進行檢測,最終確診為錦鯉皰疹病毒3型(CyHV-3)。分析顯示,其與已報道的印度尼西亞病毒株CyHV-3-J2親緣關系最近[13-15]。此外,建立的CyHV-3型病毒ORF25、ORF56、ORF81等未知功能基因PCR檢測方法,不僅有助于了解KHV的基因功能及致病機制,而且為KHV的分子診斷及流行病學調(diào)查奠定了基礎。

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