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        我國家禽H7N9和H9N2亞型流感流行病學(xué)調(diào)查

        2018-12-03 05:09:42陸勤勤蔣文明侯廣宇李金平莊青葉王素春費(fèi)榮梅陳繼明
        中國動(dòng)物檢疫 2018年11期
        關(guān)鍵詞:活禽家禽亞型

        陸勤勤,劉 朔,蔣文明,侯廣宇,李金平,莊青葉,王素春,費(fèi)榮梅,陳繼明

        (1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,江蘇南京 210095;2.中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心,山東青島 266032)

        禽流感(Avian influenza,AI)是由流感病毒引起的禽類傳染病[1]。近年來,H9N2亞型和H7N9亞型流感病毒在我國家禽中引起較為嚴(yán)重的疫情,H7N9亞型病毒在我國還引起較多的人間感染病例[2-3]。為有效了解H9N2亞型和H7N9亞型流感的流行態(tài)勢、疫情風(fēng)險(xiǎn)以及病毒變異情況,2018年3—5月,在上海、江蘇等11個(gè)省市,開展了H9N2和H7N9亞型流感流行病學(xué)調(diào)查。

        1 材料與方法

        1.1 主要試劑與耗材

        QIAxtractor高通量核酸提取儀配套相關(guān)試劑、QIAxcel Advanced全自動(dòng)毛細(xì)管電泳分析儀配套試劑:購自QIAgen公司;HiScript II One Step RTPCR Kit:購自Vazyme公司;植絨拭子:購自深圳麥瑞科林科技有限公司。

        1.2 樣品采集

        2018年3—5月,在上海、江蘇、湖北、江西、廣東、廣西、云南、貴州、西藏、寧夏、黑龍江等11個(gè)省份,隨機(jī)選擇17個(gè)活禽批發(fā)市場、37個(gè)活禽零售市場、11個(gè)養(yǎng)禽場、1個(gè)散養(yǎng)戶、1個(gè)屠宰場,共67個(gè)場點(diǎn),隨機(jī)采集4 792份樣品(每份樣品含1只禽的咽肛雙拭子樣品),其中雞3 736份、鴨703份、鵝131份、鴿222份,置于加有抗生素(259 mg/L慶大霉素、60 mg/L左旋氧氟沙星、60 mg/L阿奇霉素)的PBS-甘油采樣液中(pH7.2~7.6)保存,在4 ℃下運(yùn)輸和保存。

        1.3 RNA提取

        將采集的樣品10 000 r/min離心10 min,取上清液,用QIAxtractor高通量核酸提取工作站提取病毒RNA,?70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 HA和NA基因擴(kuò)增

        按農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T772-2013),用HiScript II One Step RT-PCR Kit,對(duì)流感病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(Neuraminidase,NA)基因進(jìn)行RT-PCR檢測。引物序列見表1。RT-PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為25 μL,包括2×RT-PCR Buffer 12.5 μL,上下游引物(10 μmol/L)各 1.0 μL,Enzyme Mix 1.25 μL、ddH2O 6.25 μL、RNA 模 板3.0 μL。RT-PCR反應(yīng)條件為:50 ℃反轉(zhuǎn)錄30 min,94 ℃預(yù)變性5 min,然后進(jìn)行35個(gè)循環(huán)(94 ℃變性30 s,57 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 2 min),最后 72 ℃延伸7 min[4]。按照QIAxcel全自動(dòng)毛細(xì)管電泳儀操作步驟,將RT-PCR的產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測,將陽性樣品送至青島睿博興科生物技術(shù)公司測序。

        表1 HA和NA基因擴(kuò)增引物序列

        1.5 序列分析

        利用MAGE 5.0軟件中的Clustal W方法,將本試驗(yàn)中檢測到的病毒HA基因序列與參考株基因序列進(jìn)行比對(duì),再選擇部分序列進(jìn)行譜系分析。譜系分析的參數(shù)設(shè)置如下:采用Neighbor-joining計(jì)算方法,核苷酸變異設(shè)為Kimura 2-parameter模式,各位點(diǎn)變異速率設(shè)為Gamma分布(α=1.0)。Bootstrap值的計(jì)算設(shè)置為1 000個(gè)重復(fù)。

        1.6 顯著性檢驗(yàn)

        對(duì)本次調(diào)查的陽性率,按照卡方檢驗(yàn)進(jìn)行顯著性分析,P<0.05判為差異顯著。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 H7N9病毒檢測

        在4 792份樣品中,未檢出H7N9亞型病毒。

        2.2 H9N2病毒檢測

        2.2.1 宿主分布 在4 792份樣品中,檢測出H9N2亞型病毒 1 208份,樣品總陽性率為32.34%(1 208/4 792),場點(diǎn)總陽性率為80.60%(54/67)。其中,雞樣品陽性率為29.18%(1 090/3 736),鴨為12.23%(86/703),鵝為1.53%(2/131),鴿為13.51%(30/22)。雞樣品H9N2亞型陽性率顯著高于其他宿主樣品(P<0.05,圖1)。

        圖1 各宿主樣品H9N2亞型病毒陽性率分布

        2.2.2 區(qū)域分布 11個(gè)省份中,除黑龍江省外,其余10省份均存在H9N2亞型病毒感染(圖2),其中江西、貴州、江蘇、西藏的樣品檢出率較高,分別為54.79%(263/480)、53.54%(257/480)、44.42%(191/430)、40.07%(199/297); 湖北和云南次之,分別為24.20%(98/405)和21.67%(104/480);寧夏、上海、廣東、廣西檢出率較低,分別為13.75(66/480)、11.33%(34/300)、10.21%(49/480)、5.63%(27/480)。

        圖2 各省樣品H9N2亞型病毒檢出率分布

        2.2.3 場點(diǎn)分布 活禽批發(fā)市場樣品陽性率為29.70%(605/2 037),場點(diǎn)陽性率為100%(17/17);活禽零售市場樣品陽性率為27.09%(592/2 185),場點(diǎn)陽性率為96.40%(35/37);養(yǎng)禽場樣品陽性率為2.29%(11/480),場點(diǎn)陽性率為18.20%(2/11);散養(yǎng)戶和屠宰場未檢測到陽性樣品(圖3)?;钋菔袌觯êl(fā)和零售的活禽市場)的場點(diǎn)陽性率為96.30%,顯著高于其他場點(diǎn)(含養(yǎng)禽場、散養(yǎng)戶、屠宰場)的15.38%(P<0.05)。

        圖3 各類場點(diǎn)H9N2亞型病毒陽性率分布

        2.2.4 時(shí)間分布 本實(shí)驗(yàn)室分別于每年的3—5月和10—12月,開展兩次全國禽流感流行病學(xué)調(diào)查(圖4)。結(jié)合這些調(diào)查監(jiān)測結(jié)果,可以看出H9N2亞型病毒在我國長期處于較高的流行態(tài)勢,上半年的感染率一般比下半年低。這估計(jì)是因?yàn)?—5月的溫度高于10—12月,不利于病毒傳播。值得注意的是,2018上半年H9N2亞型病毒檢出陽性率顯著高于往年同期檢測值(P<0.05),達(dá)到近年來最高點(diǎn),提示當(dāng)前我國家禽H9N2亞型病毒染風(fēng)險(xiǎn)有進(jìn)一步增大趨勢。

        圖4 2013—2018年H9N2亞型病毒流行變化趨勢

        2.3 基因序列分析

        本次調(diào)查檢出的H9N2亞型病毒的HA蛋白裂解位點(diǎn)處的氨基酸序列為PSRSSRGLF,為典型的低致病性流感病毒分子特征。這些序列第226位氨基酸都為酪氨酸(L),能夠結(jié)合人樣的α2,6-唾液酸受體。選取39株代表我國分離到的不同譜系H9N2亞型病毒序列和6個(gè)我國普遍使用疫苗毒株的HA基因序列作為參考序列,在檢出的1 208株H9N2亞型病毒中,隨機(jī)篩選出123條序列與參考序列進(jìn)行對(duì)比和遺傳進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)檢出的毒株均屬于h9.4.2.5分支。該分支為2007年以來我國H9亞型病毒主要流行分支,未表現(xiàn)出明顯的地域性差異。檢出的部分離株HA基因的遺傳進(jìn)化樹見圖5。

        3 討論

        本次調(diào)查未檢出H7N9亞型病毒。該病毒自2013年在我國家禽中出現(xiàn)后,持續(xù)流行于我國家禽群體中。在2016年下半年至2017年上半年期間,該病毒流行率上升顯著,引起的人間病例數(shù)也驟然增加,并且分化出高致病性H7N9亞型病毒。2017年秋季,我國開始使用H5和H7二聯(lián)雙價(jià)疫苗對(duì)各類家禽進(jìn)行強(qiáng)制免疫,使得該病毒引起的家禽感染率和人間病例數(shù)量迅速下降。本次調(diào)查未檢出該亞型病毒,也支持了疫苗免疫導(dǎo)致該亞型病毒流行率顯著下降之推斷[5]??紤]到2018年上半年僅發(fā)生2起H7N9家禽疫情,預(yù)計(jì)今后,該病毒將繼續(xù)維持較低的流行態(tài)勢,但存在不確定性:既可能因?yàn)橐呙缑庖咝Ч?、夏季病毒流行率低、野禽中病毒?chǔ)存數(shù)量有限等原因,導(dǎo)致該病毒被清除,也可能因?yàn)樵摬《境霈F(xiàn)逃避疫苗免疫的變異株,或者出現(xiàn)適應(yīng)水禽的變異株,導(dǎo)致該病毒繼續(xù)流行。

        與往年調(diào)查一致,本次調(diào)查繼續(xù)提示,我國H9N2亞型病毒分布廣泛,在家禽中感染率高,尤其是活禽市場,這與既往調(diào)查結(jié)果相符[6-9]。雞樣品的H9N2亞型陽性率最高,可能與該病毒發(fā)生更適應(yīng)于雞的突變有關(guān)[8-9]。本次調(diào)查顯示,江蘇、江西、貴州、西藏的H9N2病毒樣品陽性率較高,說明這些省份H9N2亞型病毒流行較為嚴(yán)重,當(dāng)然也可能與樣品在宿主、場所等方面存在差異有關(guān)。本次調(diào)查顯示,2018年的H9N2亞型病毒陽性率較往年顯著升高,說明近年來H9N2亞型病毒的防控效果不佳,也可能是與樣品在宿主、場所、采樣時(shí)間等方面存在差異有關(guān)。

        圖5 部分H9N2亞型病毒分離株HA基因進(jìn)化樹

        本次檢出的H9N2病毒都屬于h9.4.2.5分支,說明目前H9亞型病毒的流行分支還沒有發(fā)生改變,基因特征仍表現(xiàn)為低致病性[9]。

        基于以上調(diào)查結(jié)果,建議繼續(xù)加強(qiáng)活禽市場管理,大力推進(jìn)活禽集中屠宰和冷鮮上市[10],繼續(xù)使用H5和H7二聯(lián)雙價(jià)疫苗對(duì)各類家禽進(jìn)行免疫,同時(shí)加強(qiáng)病原的流行病學(xué)調(diào)查監(jiān)測。對(duì)于H9N2亞型病毒,需要研究改進(jìn)原有的防控策略,有效降低其流行率。

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